UCSFDOCK6,AUTODOCK与AUTODOCKVINA对接准确率的探讨
以下是我司精选的微信群聊天记录,想加入微信学术交流群的朋友,请在公众号“殷赋科技”首页输入“加群”,验证后入群。 1 A:有没有关于主流对接软件的横评的综述啊,我看很多CNS级别的文章也在引用autodock还有vina,对接的准确与否一般是怎么定义的呢? 殷赋科技:这样的文章(文献)有很多,到pubmed搜一下就有了。之前群里有人发了一篇文章,说到vina的准确率比dock6高。我对此持怀疑态度。我只凭经验判断,没有重现过人家的结果,也没有去仔细研究人家的研究过程。 有两个方面,我认为dock6更好: 1、做过不少体系,dock6的结果更接近晶体构象或者能够解释实验现象,而vina则不太行。比如,我以前在做教程的时候,同一个PDB蛋白用dock6只产出少量(经常是一两个)pose结果,且第一个(也就是打分最好的)结果与实验晶体结构非常一致,而用vina则产生很多结果,没有一个好的。当然,并......阅读全文
探讨船舶氢能应用与发展
9月25日,由大连海事大学和大连市氢能发展促进协会共同主办,中科院大连化学物理研究所、信德海事协办,大连市新能源船舶技术创新中心、大连海事大学轮机工程学院承办的第二届大连船舶氢能国际研讨会顺利举办。会议采取线上和线下相结合的形式举行,并全程进行网络直播。 此前,中国海事局发布了《氢燃料电池动力船
对于“子宫肌瘤与妊娠关系”的再探讨
今天在中华妇产科杂志2018年8月第53卷第8期上看到一篇文章,题目是:DDI在预测子宫肌瘤剔除术后自然妊娠结局中的应用。文章的探讨目是:分析“子宫肌瘤腹腔镜剔除术手术难度评分系统(DDI)”在预测子宫肌瘤剔除术后自然妊娠结局中的应用价值;结果是:随访1~10年,共入组118例患者,术后自然妊娠率为
探讨“哲学与科技”的未来发展方向
近日,由曲阜师范大学政治与公共管理学院与华南理工大学哲学与科技高等研究所联合主办的第七届哲学与科技高层学术论坛在曲阜师范大学日照校区举行,论坛以“当代科技诠释学与科技前沿的哲学问题”为主题,旨在对当代科技诠释学与其他科技哲学前沿问题凝聚共识、推动理论创新,探讨“哲学与科技”的未来发展方向,为新时代的
人体尿液中管型的检验与探讨
作者:1朱东,2陈红芸 作者单位:1、新疆和田地区皮山县疾病预防控制中心2、新疆和田地区皮山县人民医院 关键词 尿液,管型,检验 人体尿液管型是临床上常规检验项目之一,它是反映人体肾脏病变严重程度的重要指标,其镜检结果具有重要的临床意义。尿管型是由德国学者Vigla和Rayer首先发现
新型金属材料研发与产业对接报告
理财周报材料科学实验室主要关注新型金属材料,包括特种金属材料和高端金属材料。 “金属”会使人条件反射地联想到金光闪闪的“金子”,总是会招人喜欢的,更甚是具备某种特种功能的金属,资本市场也从来不缺乏对于金属的关注度。 而理财周报材料科学实验室主要关注新型金属材料,包括特种金属材料和高端金属材料
天宫与神九手控交会对接成功
神舟九号航天员6月24日驾驶飞船与天宫一号目标飞行器顺利对接,我国首次空间手控交会对接试验成功。 这一操作是由43岁的航天员刘旺实施的。12时许,他通过手柄控制飞船的姿态、速度和方向,使神舟九号从140米外向天宫一号缓缓接近,最终成功捕获天宫一号。 24日早上刚刚分开的神舟九号与天
俄货运飞船与空间站成功对接
俄罗斯地面飞行控制中心4日发布消息说,日前与国际空间站对接失败的俄“进步M-06M”货运飞船当天晚间与空间站成功实现对接,飞船为国际空间站送去多种给养及设备。 该中心发言人伦金介绍说,莫斯科时间4日20时17分(北京时间5日零时17分),“进步M-06M”货运飞船与国际空间
分子对接计算中如何确定对接口袋?
在一般的分子对接计算中,一个不可或缺的步骤是定义配体分子(通常为有机小分子)的结合位置,即对接口袋。对于蛋白-小分子复合物X-ray晶体结构,口袋内就有一个配体,它为我们指示了对接口袋的位置。但还有很多X-ray晶体结构、NMR解析的结构没有配体结构,我们该如何确定对接口袋呢?更一般地,对于核酸
主体分子β环糊精(βCD)与客体分子cinnarizine的对接研究
1.项目说明 研究主体分子β-环糊精(β-CD)与客体分子cinnarizine的结合模式、相互作用力和结合位点。 图1.cinnarizine 2.计算方法 从Crystallography Open Database(http://www.crystallograp
主体分子β环糊精(βCD)与客体分子cinnarizine的对接研究
1.项目说明研究主体分子β-环糊精(β-CD)与客体分子cinnarizine的结合模式、相互作用力和结合位点。图1.cinnarizine2.计算方法从Crystallography Open Database(http://www.crystallography.net/) 下载β-环糊精(CO
新技术精准区分肿瘤与正常组织,准确率超97%
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510436.shtm
《大学大城》:探讨大学与城市的互相赋能
高等教育、城市建设是社会各界普遍关注的话题。卢晓梅新著《大学大城》将二者结合起来进行研究,探讨城市与大学如何协同发展、互相赋能。作者发挥长期聚焦高等教育研究的学术积累,同时凭借自身理工科功底,捧出扎实数据和精到分析,给读者以启发。 作者作为工学博士,曾在复旦大学等国内外多所大学学习、工作和访问
人体尿液中管型的检验与探讨(2)
人体尿液中管型的正常参考范围 因为在不同的地区和不同的实验室是否使用同样的技术和手段,检验技术人员是否具有一定的临床经验其对检验结果值的差异影响很大,用低倍显微镜来观察视野和表述的方法并不精确,用定量法德报告方式也因个体差异其结果差别很大。如Wenk于1981年提出正常人应少于1~2个/ml,而
检验试剂集中采购模式的探讨与实践体会
作者单位:225001 江苏扬州,江苏省苏北人民医院 【摘要】 医疗机构医用耗材集中招标采购是医药卫生体制改革的重要内容。根据三级医院具体采购需求,我院从2007年起对检验试剂实行了集中采购配合竞价谈判方式。整个过程操作规范,监管严格,堵塞采购中可能出现的漏洞,避免不必要的浪费,最大限度降低采购
血流变中血沉测定方法的比较与探讨
血流变分析仪目前为了方便检测血流中的血沉常采用温氏法或动态血沉仪法,但均采用魏氏法正常参考值。其结果经常与临床表现不符,对疾病的诊断不能提供及时正确的参考。现将我室动态血沉仪法和温氏法结果做一比较,旨在说明两者的差异,阐明原因,以资探讨。血沉测定在一定程度上可以反映红细胞的聚集性,红细胞聚集性是非牛
锂电池快充技术的研究与探讨
当前,全球车辆趋于向电动化发展,以及国家“碳达峰、碳中和”政策的目标下,无论是国际上,还是中国本土,车辆电动化已经进入快速发展阶段。得益于电池技术的不断突破,材料方面:三元高镍,硅碳负极,高压电解液等的开发利用,使得电芯的能量密度在缓慢的突破;结构方面,比亚迪的刀片电池,蜂巢的短刀片电池,宁德时代的
分子对接计算中如何确定对接口袋?(二)
3、从返回的结果中找到Output files,下载我们需要的pdb文件文件①是输入的pdb文件(我们输入了PDB ID,POCASA自动从RCSB PDB库中下载蛋白文件),文件②是我们需要的输出结果,包含了若干潜在口袋的位置信息。将两者下载下来,然后使用PyMOL或其他分子图形软件观察分析。(P
分子对接计算中如何确定对接口袋?(一)
在一般的分子对接计算中,一个不可或缺的步骤是定义配体分子(通常为有机小分子)的结合位置,即对接口袋。对于蛋白-小分子复合物X-ray晶体结构,口袋内就有一个配体,它为我们指示了对接口袋的位置。但还有很多X-ray晶体结构、NMR解析的结构没有配体结构,我们该如何确定对接口袋呢?更一般地,对于核酸、多
广东举办场景机会项目供需对接与路演活动
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511989.shtm
山西与中科院举办科技成果对接会
“我去化学所老师在的会议室,了解一下绿色制版技术。”“过程所的技术能把煤热效率从40%提升到70%,我得去他们在的会议室进一步沟通。”“我们已经和理化所建立了战略合作关系,我直接去所里调研,就不去分院会议室了。” 7月6日,山西省人民政府与中国科学院科技成果对接会在中科院北京分院举行。太重集团、
神八与天宫一号明晨交会对接
据央广《中国之声》报道 昨日(11月1日)5时58分07秒,酒泉卫星发射中心载人航天发射场,中国“长征二号F”遥八运载火箭点火起飞,将“神舟八号”飞船发射升空。中国载人航天工程总指挥常万全宣布,“神舟八号”飞船已进入预定轨道,发射圆满成功。 根据轨道计算结果,神舟八号飞船于昨日6时7
安徽工业大学与企业实现人才“空中对接”
4月15日,安徽工业大学党委书记陆林在线参加了该校材料学院与江苏申源集团有限公司、苏州昀冢电子科技股份有限公司、晶澳(扬州)新能源有限公司、天华院(南京)智能制造有限公司等四家企业专场“空中双选会”。 参会企业介绍了企业发展概况、市场前景和企业
安徽工业大学与企业实现人才“空中对接”
4月15日,安徽工业大学党委书记陆林在线参加了该校材料学院与江苏申源集团有限公司、苏州昀冢电子科技股份有限公司、晶澳(扬州)新能源有限公司、天华院(南京)智能制造有限公司等四家企业专场“空中双选会”。 参会企业介绍了企业发展概况、市场前景和企业的核心竞争力,详细宣讲了岗位需求、薪资待遇和发
能源所发明简易高效的单细胞分选与测序对接技术
为了满足考察自然界中细胞“原位功能”这一共性科学需求,“现场”、“实时”的单细胞分选与测序已成为生命科学装备研制领域的一个重要发展趋势。尽管第三代测序技术已实现仪器微型化,但与测序对接的单细胞精准分选装备却仍然相当笨重和昂贵,难以支撑各种科学考察中针对微生物组功能的现场分析。最近,中国科学院青岛
分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式--一
【前言】从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果,看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6,是典型的“实验+计算”模式,比较接近大多数
循环硫化床锅炉燃烧控制研究与探讨
引言 CFB锅炉燃烧技术具有氮氧化物排放低,可实现在燃烧过程中直接脱硫、燃料适应性广、燃烧效率高和负荷调节范围大等优势,已成为当前煤炭洁净燃烧节能环保的炉型。 CFB锅炉在运行过程中也有缺点,尤其是投运初期,例如受热面磨损严重,排渣问题突出,风室漏灰严重,启动锅炉时间长等。但只要了解
基因检测的准确率是多少?
基因检测的准确率通常依赖于多种因素,包括检测平台、技术参数、实验操作等。 一代测序技术(如Sanger测序)以其高度的准确性被广泛使用于临床验证和检测,其结果直观且准确。二代测序技术(如Illumina平台)则通过大量并行分析提高了检测效率,但在数据处理和分析上面临挑战,需要专业的生物信息学工
UCSF建立新的中心,将整合基因组技术到医疗保健项目中
该中心叫做UCSF下一代精密医学诊断中心,其从Sandler和William K. Bowes, Jr.基金会获得了240万美元,同时还从加州促进精密医学协会,一个由Gov. Jerry Brown今年4月份宣布建立的公私合作协会的120万美元作为启动资金。 在中心,一个由科学家,临床医学和卫
新研究探讨人与农田鸟类的和谐共存之道
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505327.shtm
血小板平均体积与血小板计数关系的探讨
孙立,李忠培,赵爱萍,刘美荣 (泰安市中心医院检验科 山东泰安271000)检验科分析仪器的不断更新换代为临床提供更准确地更可靠的依据,血细胞分析仪由过去三分类分析到今天的五分类仪器。分析仪器越来越精密,平均血小板体积(MPv)作为血液分析仪提供的一种参数,国内外学者已有多项研究。本文报道分析仪测定