UCSFDOCK6,AUTODOCK与AUTODOCKVINA对接准确率的探讨
以下是我司精选的微信群聊天记录,想加入微信学术交流群的朋友,请在公众号“殷赋科技”首页输入“加群”,验证后入群。 1 A:有没有关于主流对接软件的横评的综述啊,我看很多CNS级别的文章也在引用autodock还有vina,对接的准确与否一般是怎么定义的呢? 殷赋科技:这样的文章(文献)有很多,到pubmed搜一下就有了。之前群里有人发了一篇文章,说到vina的准确率比dock6高。我对此持怀疑态度。我只凭经验判断,没有重现过人家的结果,也没有去仔细研究人家的研究过程。 有两个方面,我认为dock6更好: 1、做过不少体系,dock6的结果更接近晶体构象或者能够解释实验现象,而vina则不太行。比如,我以前在做教程的时候,同一个PDB蛋白用dock6只产出少量(经常是一两个)pose结果,且第一个(也就是打分最好的)结果与实验晶体结构非常一致,而用vina则产生很多结果,没有一个好的。当然,并......阅读全文
新研究探讨人与农田鸟类的和谐共存之道
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505327.shtm
血小板平均体积与血小板计数关系的探讨
检验科分析仪器的不断更新换代为临床提供更准确地更可靠的依据,血细胞分析仪由过去三分类分析到今天的五分类仪器。分析仪器越来越精密,平均血小板体积(MPv)作为血液分析仪提供的一种参数,国内外学者已有多项研究。本文报道分析仪测定健康人lVlPV与年龄的关系。 1 材料和方法 1.1 仪器与试剂SF
探讨C反应蛋白与胎膜早破的关系
胎膜早破是指在临产前胎膜自然破裂,胎膜早破的原因有很多,最常见的原因是感染性因素,其次是胎膜发育不良、宫腔内压力异常、子宫颈功能不全、创伤和机械性**等。C-反应蛋白(C-reactive protein ,CRP)是在机体受到感染或组织损伤时血浆中一些急剧上升的蛋白质(急性蛋白)。在临床上,
血小板平均体积与血小板计数关系的探讨
孙立,李忠培,赵爱萍,刘美荣 (泰安市中心医院检验科 山东泰安271000)检验科分析仪器的不断更新换代为临床提供更准确地更可靠的依据,血细胞分析仪由过去三分类分析到今天的五分类仪器。分析仪器越来越精密,平均血小板体积(MPv)作为血液分析仪提供的一种参数,国内外学者已有多项研究。本文报道分析仪测定
北科院与通州区开展科技成果对接
近日,北京市科学技术研究院(以下简称北科院)与通州区人民政府召开科技成果对接会,双方旨在通过深化合作,进一步为科技成果落地通州区、服务北京城市副中心建设提供支撑。会上,双方签署了战略合作新协议。 北京市通州区区长张力兵表示,通州正在围绕三大主导功能,打造四大产业集群,构建高精尖产业结构,比以往
国家天文台兴隆基地实现与“墨子号”天地对接
量子科学实验卫星“墨子号”是中国科学院空间科学先导专项首批科学实验卫星之一,中科院国家天文台兴隆观测基地1米望远镜(图1)作为量子科学实验卫星重要通信地面站承担了多项测试实验和天地一体化实验任务。8月16日凌晨“墨子号”发射成功后,卫星进入了在轨测试阶段。对全国布站的5个量子通信地面光学站而言,
神八与天宫一号实现首次交会对接
今天(11月3日)1时36分,神舟八号与天宫一号在太空成功实现首次交会对接。从接触到最后锁紧,它们用了8分钟,组合体以优美的姿态飞翔在茫茫太空。 1时43分,中国载人航天工程总指挥、中央军委委员、总装备部部长常万全宣布:天宫一号、神舟八号首次交会对接圆满成功! 据了解,交会对接全过程分为远距
搭建供需对接桥梁-科技资源与需求面对面
——北京师范大学研发实验服务基地“百进千”对接会 分析测试百科网讯 2018年5月3日,首都科技条件平台北京师范大学研发实验服务基地“百进千”对接会在京师大厦举办,本次对接会是为了切实有效推动首都科技条件平台“百家实验室进千家企业”(以下简称“百进千”)活动的全面深入开展,实现由支持科技资源开放方
什么是分子对接?
分子对接是通过受体的特征以及受体和药物分子之间的相互作用方式来进行药物设计的方法。主要研究分子间(如配体和受体)相互作用,并预测其结合模式和亲合力的一种理论模拟方法.近年来,分子对接方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术。
女性的尿路感染与妇科炎症的关系探讨
尿路感染是指病原体在尿路中生长繁殖,并侵犯泌尿道黏膜或组织而引起的炎症,是细菌感染中最常见的一种感染,尿路感染分为上尿路感染和下尿路感染,上尿路感染指的是肾盂肾炎,下尿路感染包括尿道炎和膀胱炎。 对于女性来讲,由于尿道短、没有自然弯曲、靠近**口等解剖学因素,更容易出现尿路感染的情况
青岛能源所发明简易高效的单细胞分选与测序对接技术
为了满足考察自然界中细胞“原位功能”这一共性科学需求,“现场”、“实时”的单细胞分选与测序已成为生命科学装备研制领域的一个重要发展趋势。尽管第三代测序技术已实现仪器微型化,但与测序对接的单细胞精准分选装备却仍然相当笨重和昂贵,难以支撑各种科学考察中针对微生物组功能的现场分析。最近,中国科学院青岛
UCSF建立新的中心,将整合基因组技术到医疗保健项目中
该中心叫做UCSF下一代精密医学诊断中心,其从Sandler和William K. Bowes, Jr.基金会获得了240万美元,同时还从加州促进精密医学协会,一个由Gov. Jerry Brown今年4月份宣布建立的公私合作协会的120万美元作为启动资金。 在中心,一个由科学家,临床医学和卫
分子对接技术的主要方法
各种分子对接方法对体系均有一定的简化,根据简化的程度和方式,可以将分子对接方法分为三类。刚性对接:刚性对接方法在计算过程中,参与对接的分子构像不发生变化,仅改变分子的空间位置与姿态,刚性对接方法的简化程度最高,计算量相对较小,适合于处理大分子之间的对接。半柔性对接:半柔性对接方法允许对接过程中小分子
英国愿与中国探讨更多低碳合作机会
——访英国驻华大使吴思田 英国国家统计局2月9日公布的数据显示,2010年中英贸易额达380.4亿英镑,较2009年增长28.1%。其中,英国对华出口76.1亿英镑,同比增长40.9%;英国自华进口304.3亿英镑,同比增长25.2%。中英两国政府希望到2015年实现双边贸易1000亿美元。同
国内专家探讨肿瘤代谢与肿瘤营养支持治疗
日前,来自国内肿瘤学研究的120多位专家相聚江南大学无锡医学院,探讨肿瘤代谢与肿瘤营养支持治疗,对采用新抗肿瘤与治疗方法形成共识。 记者了解到,在首届“肿瘤代谢与肿瘤营养支持治疗” 江南论坛上,专家围绕肠道微生物菌群与肿瘤放射治疗研究、大剂量维生素C的抗肿瘤作用及分子机理、线粒体营养素研究、
新能源国际峰会成都探讨机遇与挑战
11日,2012中国(成都)新能源国际峰会暨展览会在成都开幕。政府部门、行业协会、龙头企业及科研机构的近700名代表赴川参会。 中国(成都)新能源国际峰会暨展览会已连续举办四届,已具备一定品牌影响力,搭建起了高层次、高规格、专业化、国际化的交流合作平台,有效推动了成都新能源产业的跨越式发展
香山会议探讨激光与X射线期待完美相遇
在人类科技史上,激光和X射线都是物理学上伟大的发明和发现。激光源自物质“受激”辐射,具有亮度高、准直性和相干性好等特点,但一般处于红外线和可见光波段。而来自于高速电子强烈加速或撞击的X射线,特别是硬X射线,具有很高的能量和原子尺度的波长,其穿透力和分辨率都大大增强,但准直性和相干性远不如激光。
高校实验废弃物分类与安全处置探讨
随着高校办学规模的不断扩大,各类实验室教学、科研任务日趋繁重,实验室废弃物如不及时、有效、安全处置,必将对实验室安全造成较大的隐患,更可能造成对人员、环境的重大威胁,本文对实验室废弃物的分类、危害及安全处置进行了探讨。 引言 高校实验室多为相对独立的单位,特别是随着许多高校多校区办学的实际情况
不容忽视的基因诊断准确率
基因检测技术曾多次被评为全球颠覆性技术,但是其混乱的商业应用也一直为业内所诟病。随着个体化医疗的发展和“精准医学”概念的提出,基因检测被越来越多地应用于临床肿瘤诊断与治疗中。同时,随着高通量测序技术的发展,基因检测市场愈加火爆。在被称为“无创产前基因检测后的下一块大蛋糕”的肿瘤诊断与治疗市场,出
尿红细胞MCV与RDW测定对血尿来源的探讨
作者:宋红宝 贾向新 作者单位:130011吉林大学第四医院 【摘要】 目的:探讨尿红细胞平均体积(MCV)与红细胞体积分布宽度(RDW)测定在血尿来源诊断的价值。方法:测定68例血尿患者的MCV与RDW来判别血尿来源。结果:显示肾小球性血尿的MCV明显较非肾小球性血尿的MCV要低;肾小球性血
MERS疫情不同城市风险的回顾性评估与探讨
2015年5月20日, 韩国报告了首例实验室确诊的中东呼吸综合征(MERS)病例, 并发生了中东地区之外最大规模的MERS暴发疫情, 导致中国出现了由韩国传入的首例MERS病例. 为了解中国不同城市的MERS疫情传入风险, 来自中国疾病预防控制中心传染病预防控制处等处的和研究人员分析了全球和韩国
探讨突发事件中安全输血与POCT的应用
从医学检验发展到检验医学, 随着生命科学的发展, 一种小型、快速、即时简易的检验手段( POCT), 得到突飞猛进的发展, 并且其许多检测项目在临床上广泛应用。通过大量文献报道, 证实临床血液领域中除了止血和凝血应用外, 安全输血方面的检测并未有POCT方面的报道。笔者就其在安全输血中的
香山科学会议探讨物理与生命的交叉学科
“有人把小虫子放在一定强度的静磁场里,虫子怎么都不动,这个用物理原理很容易解释,动的时候虫子体内的带电粒子在磁场中移动,可能会因为电磁效应觉得难受,就不跑了。”中科院院士、物理学家张裕恒用几句话,解释了一种看不见、摸不着的力对生命体的影响。 磁场的影响可不可能用于医学治疗?4月11日—12
探讨火焰探测器的应用领域与工作原理
火焰探测器(flamedetector)是探测在物质燃烧时,产生烟雾和放出热量的同时,也产生可见的或大气中没有的不可见的光辐射。火焰燃烧辐射光波段火焰探测器又称感光式火灾探测器,它是用于响应火灾的光特性,即探测火焰燃烧的光照强度和火焰的闪烁频率的一种火灾探测器。根据火焰的光特性,目前使用的火
浅析变电运行中的隐患问题与解决方法探讨
随着我国经济建设步伐的不断加快,作为电网安全前沿的变电运行安全管理工作越来越得到企业、社会和研究人员的关注。变电运行的一大特点是设备多、危险点或隐患出现的几率大,而且隐蔽性强,变电运行作业中任何不规范的工作程序都会影响电力的正常运行甚至整个电网的安全和重大人身事故的发生。所以,如何寻找设备运行状况的
超低排放改造与脱硫废水处理的优化探讨
1、概述河南华润电力首阳山有限公司位于河南省偃师市首阳山镇,南依陇海铁路,北临连霍高速,背靠邙岭,面向洛河,东距郑州108公里,西距洛阳市22公里。公司成立于2004年11月11日,公司规划建设4×600MW国产超临界燃煤发电机组。一期工程2×600MW国产超临界燃煤发电机组一年双投,#1机组于20
广州分院与连南县召开“百千万工程”工作对接会
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506747.shtm8月14日,中国科学院广州分院与广东省清远市连南瑶族自治县(以下简称连南县)就推进广东省百校联百县助力“百县千镇万村高质量发展工程”(以下简称“百千万工程”)行动在广州进行工作对接。会
多项技术助力神舟九号与天宫一号对接成功
在神舟九号与天宫一号成功对接后,记者获悉,包括航天测控可视化系统、交会对接微波雷达、高精度加速度计等在内的多项技术成果,保障了神舟九号与天宫一号的对接成功。 在北京飞控大厅前方的巨幅显示屏上,三维动画把飞行器在太空中飞行的姿态实时展现出来。北京飞控中心软件室主任孙军介绍,针对此次任务“载人
太空对接海底深潜-神九与蛟龙填补空白
航天员庆贺对接成功 6月24日拍摄的北京航天飞控中心大屏幕显示,神舟九号与天宫一号再次形成组合体,首次手控交会对接成功。三位试航员走出“蛟龙”号载人潜水器后手举国旗挥手致意 6月24日,“蛟龙”号载人潜水器结束7000米级海试第四次下潜试验,安全返回试验母
昆明分院与贵州省联合开展合作项目专项对接
对接会现场 6月28日至29日,贵州省科技厅、中科院昆明分院和贵州省复合改性聚合物材料工程技术中心,邀请中科院长春应用化学研究所的化工、材料等专业技术专家,在贵阳举办了“中科院长春应用化学研究所科研成果推介会”。贵州省科技厅副厅长苟渝新出席推介会并讲话。贵州省16家相关专业领域的企