基因芯片与RNAseq的比较分析
<p> 最近几年二代测序（又叫NGS）很火，而且价格越来越便宜，原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的，好像不少都换用RNA-seq了。那么，到底选择哪种更好呢？今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。</p><p> 常见误区一：</p><p> 测序的准确性高，获得的信息更丰富</p><p> 对，但又不对。 </p><p> 首先，大家需要明确，检测到和准确分析基因表达量的概念是不同的，只有mapping到基因上的reads达到一定数量，才能得到相对准确的分析结果。因此RNA-Seq能检测到多少可靠的信息完全取决于测序深度，测序深度，测序深度！不同于芯片的杂交法，RNA-seq是通过读数来检测，读数多（即测序深度深）代表着RNA-seq的采样率高。采样率低了准确度自然就低了。</p......阅读全文
RNAseq综述（二）
短读长cDNA测序短读长已经成了在整个转录组范围内对基因进行检测和定量的事实方法(de facto method)，部分原因是这种方法比芯片成本更低，操作更方便，但是其主要原因还是因为这种方法能生成更全面，更高质量的数据，这种方法能够 对整个转录组中的基因表达水平进行定量。使用Illumina短读长
RNAseq综述（八）
使用核糖体分析方法检测活跃的翻译RNA-seq的主要用途在于研究样本中的mRNA的种类与数量，但是mRNAs的存在与否并不直接关系到蛋白质的合成。现在有两种方法可以研究转录以外的翻译情况，可以让研究者们更好的理解翻译组(translatome)：一种是多核糖体表达谱(polysomal pr
RNAseq综述（七）
动态RNA-seq分析(Beyond steady-state RNA analysis)DGE分析是使用RNA-seq来检测稳态下的mRNA表达水平，这一表达水平是通过mRNA的转录，加工和降解速度来决定的。但是，RNA-seq也可以用于研究涉及转录，翻译所涉及的过程与动力学特征，这些研究为基因表
RNAseq综述（三）
改良RNA-seq建库方法RNA-seq最初用于分析多聚腺苷酸化的转录本，使用的方法源于早期的表达序列标签(expressed-sequence tag)和芯片研究。然而，下一代测序的使用指出了这些方法的局限性，而这些局限性在芯片数据中并不明显。因此，在RNA-seq首次报道后不久，就有研究
用于基因芯片分析的血液样品的准备
用于基因芯片分析的血液样品的准备可用于：（1）基因表达分析；（2）分析血液中白细胞的基因表达情况。实验方法原理基因芯片(genechip)（又称DNA芯片、 生物芯片）的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是 杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片
电子分析天平与电子秤的比较说明
一般我们会以精度来区分电子分析天平和电子秤‚电子分析天平精度在1/10000以上的我们一般称之为天平比如zui大称量100克‚精度0.001克。 电子分析天平与电子秤传感器的结构不一样‚电子分析天平要复杂一些‚这也造成了电子分析天平的精度要高于电子秤。 电子分析天平高精度的电子分析天平一般采用电
电子分析天平与电子秤的比较说明
一般我们会以精度来区分电子分析天平和电子秤‚电子分析天平精度在1/10000以上的我们一般称之为天平比如zui大称量100克‚精度0.001克。 电子分析天平与电子秤传感器的结构不一样‚电子分析天平要复杂一些‚这也造成了电子分析天平的精度要高于电子秤。 电子分析天平高精度的电子分析天平一般采
多种方法校准血液分析仪结果比较与分析
引言：目前血细胞分析仪在各检验科的血常规测定中已非常普及，它大大地提高了血细胞分析的效率。但由于仪器的种类繁多，性能差异较大，而且各种仪器的工作原理也不完全相同，完成一个项目测定要受到仪器、试剂、校准品、操作程序以及操作人员等因素影响。因此，如何避免不同仪器之间测定结果的差异，如何提高测定结果的
比较FPLC与HPLC
1、二者原理相同：都是由经典的液体柱层析引入气相色谱理论，并且对相体进 行了改革，配用高压输液泵，采用高灵敏检测器、梯度洗脱装置、自动收集装置和微机等发展起来的现代液相色谱。 2、特点：二者均具有快速、分辨率高、检测灵敏度高、分离效能高等特点，而且FPLC还具有柱容量大、回收效率高及不易使生物大
电子分析天平与电子秤比较说明
一般我们会以精度来区分电子分析天平和电子秤‚电子分析天平精度在1/10000以上的我们一般称之为天平比如zui大称量100克‚精度0.001克。 电子分析天平与电子秤传感器的结构不一样‚电子分析天平要复杂一些‚这也造成了电子分析天平的精度要高于电子秤。 电子分析天平高精度的电子分析天平一般采
原子吸收—石墨管纵向加热与横向加热的分析比较
自原苏联科学家 LOV`V 发明石墨坩埚分析方法并经马斯曼改为石墨炉以来，原子吸收无火焰分析——石墨炉分析方法一直采用的是纵向加热的石墨管，这种方法已发展到高级阶段，使石墨炉方法成为元素分析最灵敏的检测方法。到 1980 年以后，美国 P-E 公司发明了纵向 Zeeman 效应的扣背景方法，由于需要
差示扫描量热法与差热分析(DTA)的比较
与保持样品和参比物温度一致测量热流的差示扫描量热法不同，差热分析是保持热流速率一致，测量样品和参比物的温度差。两者相比，差示扫描量热法的优点是可以得到较好的定量数据，缺点是温度较高时基线会变坏，无法继续测量。今日的大多数差热分析的生产厂家比如已经不再生产单独的DSC或DTA设备，而是生产包括热重
土壤水分各种测量方法的比较与分析
农田作物生长需要zui佳的水、肥、气、热环境,水是zui重要的调节因子。适宜的农田土壤水分状况,可达到节水增产的功效。因此,适时、方便、准确地监测农田土壤水分对农业生产有着重要的指导意义。目前,农田土壤水分测量方法层出不穷,如烘干法、张力计法、中子法或射线法、介电常数法或电磁波法、传感器法、电阻
基因芯片
基因芯片(genechip)（又称DNA芯片、生物芯片）的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG，与基因芯片上对应位置的
比较细菌与病毒的区别
病毒(virus)是一类个体微小，无完整细胞结构，含单一核酸（DNA或RNA)型，必须在活细胞内寄生并复制的非细胞型微生物。病毒比细菌还小、没有细胞结构、只能在活细胞中增殖的微生物。由蛋白质和核酸组成。多数要用电子显微镜才能观察到。细菌（英文：germs；学名：bacteria）广义的细菌即为原核生
TOC与TOD之间的比较
TOC与TOD都是利用燃烧法来测定水中有机物的含量。所不同的是,TOC是以碳的含量表示的,TOD是以还原性物质所消耗氧的数量表示的,且TOC所反映的只是含碳有机物,而TOD反映的是几乎全部有机物质。根据TOD对TOC的比例关系,可以大体确定水中有机物的种类。对于只含碳的化合物而言,因为一个碳原子燃烧
SPM与SEM的图像比较
SPM(扫描探针显微镜)与SEM(扫描电子显微镜)相比，SEM历史更长且在各方面的发展已日渐成熟。而SPM正处在方兴未艾的发展之中，软件/硬件不断开发升级，应用技术也在不断开拓。更重要的是，SPM并非是在溯寻SEM的发展历史，而是朝着一个崭新的方向在发展。虽然从名称上看二者类似，但从本质来讲，“扫描
多种方法校准血细胞分析仪结果比较与分析
目前血细胞分析仪在各检验科的血常规测定中已非常普及，它大大地提高了血细胞分析的效率。但由于仪器的种类繁多，性能差异较大，而且各种仪器的工作原理也不完全相同，完成一个项目测定要受到仪器、试剂、校准品、操作程序以及操作人员等因素影响。因此，如何避免不同仪器之间测定结果的差异，如何提高测定结果的准确性，全
尿液分析仪与显微镜检验尿液潜血的比较分析
当患者要进行尿液检测时，尿液潜血检查是必查内容之一，在临床医学中，尿液分析仪与显微镜检查尿液潜血是两种常见的检验方式。在科学技术快速发展的今天，尿液分析仪已经将传统的显微镜检测尿液潜血所取代，但是尿液分析仪也有不好的地方，例如，与传统的显微镜检测相比，其结果的精准度就没有传统的高。本篇文章就是将
尿液分析仪与显微镜检验尿液潜血的比较分析
尿液检验中，尿液潜血检查是一项必查内容，常用的检验方法有尿液分析仪潜血检验和显微镜检查尿液红细胞两种。传统方法为后者，但随着科技的进步，被尿液分析仪法逐渐以其简单、高效的特点所取代，但尿液分析仪也有其不够精确的缺点。本文通过对两种方法的切实比较，找出它们的优缺点，提出合理的使用建议。1 资料与方
基因芯片合成后点样法的优缺点分析
主要优点是:保持探针长度均一,成本低用途广泛。缺点是:密度达不到原位合成法的水平,点之间重复性差。但经过改进,已可在6.5cm2 的范围内容纳100000个核酸位点已为从事基础研究的实验室广泛采用。
基因芯片的应用
DNA芯片技术就是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接将大量的DNA探针以显微打印的方式有序地固化于支持物表面，然后与标记的样品杂交，通过对杂交信号的检测分析，即可获得样品的遗传信息。是伴随“人类基因组计划”的研究进展而快速发展起来的一门高新技术。通俗地说，基因芯片是通过微加工技术，将数以万计、
基因芯片的原理
基因芯片（gene chip）的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，可以用图11-5-1来说明。在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG，与基因芯片上对应位置
基因芯片的应用
1998 年底美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一，足见其在科学史上的意义。现在，基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达检测、突变检测、基因组多态
基因芯片的应用
1998 年底 美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一，足见其在科学史上的意义。现在，基因芯片这一时代的宠儿已被应用到 生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计 基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括 基因表达检测、突变检测
PLC与DCS、－FCS比较
PLC是由早期继电器逻辑控制系统与微机计算机技术相结合而发展起来的，它是以微处理器为主的一种工业控制仪表，它融计算机技术、控制技术和通信技术于一体，集顺序控制、过程控制和数据处理于一身，可靠性高、功能强大、控制灵活、操作维护简单。近几年来，可编程序控制器及组成系统在我国冶金、电厂、轻工石化、矿业、水
农药残留速测法与气相色谱法的验证与比较分析
一、材料与方法 1.材料和仪器 抽取白菜类、甘蓝类、绿叶菜类、瓜类、茄果类、豆类等6类共48个样品,样品均从无公害基地、农户生产基地中随机抽取。仪器采用台湾产农药残留快速检测仪(绿辉牌96通道)、日本岛津GC-2010气相色谱仪(配FPD、NPD、ECD检测器)。 2.方法 (
元素分析仪与凯氏定氮仪的综合比较
元素分析仪的测试结果比凯氏定氮仪略高，但二者无显著差异。偏高的原因在于，元素分析仪具有特殊的燃烧系统。 它将样品用铝铂杯在精度为0的分析天平上称量，连同铝铂杯一起放入燃烧管将其燃烧之后，所有形式的氮都转变成自由氮形式而被自动测试分析，并被记录下来。凯氏定氮仪是在催化剂作用下
气相色谱仪静态与动态顶空分析的比较
气相色谱仪顶空分析是对液相或固相中的挥发性成分进行气相色谱分析的方法，有静态顶空分析和动态顶空分析。一、平衡： 1、静态顶空分析的两相间存在平衡问题。 2、动态顶空分析没有两相间的平衡问题。二、吹扫： 1、静态顶空分析不需要用气体吹扫。 2、动态顶空分析要用气体吹扫液相或固相。三、顶空样品：
气相色谱仪静态与动态顶空分析的比较
气相色谱仪顶空分析是对液相或固相中的挥发性成分进行气相色谱分析的方法，有静态顶空分析和动态顶空分析。一、平衡：1、静态顶空分析的两相间存在平衡问题。2、动态顶空分析没有两相间的平衡问题。二、吹扫：1、静态顶空分析不需要用气体吹扫。2、动态顶空分析要用气体吹扫液相或固相。三、顶空样品：1、静态顶空分析