小鼠睾丸中MIWI／piRNA介导了mRNA的剪切
最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文，报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能，可以指导MIWI对于mRNA的剪切，保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是由中科院北京动物研究所何顺明实验室、上海生物化学及细胞生物学所刘默芳实验室以及加州大学圣地亚哥分校付向东实验室共同完成。 背景介绍： PIWI(P-element-induced wimpy testis)蛋白在动物生殖系细胞中特异性表达,为动物生殖细胞发育分化所必需。piRNA(PIWI-interacting RNAs)是最近在动物生殖系细胞中发现的一类非编码小分子RNA,这类小RNA特异性地与PIWI家族蛋白相互作用。PIWI/piRNA"机器"通过沉默转座元件和调控编码mRNA等方式在动物生殖细胞发育分化过程中......阅读全文
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究
刘默芳组：LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能
在较高等的真核生物中，大部分基因都含有内含子，在转录完成后需经过剪接（splicing）从mRNA前体移除内含子，以产生成熟、有翻译活性的mRNA，这个过程由剪接体（spliceosome）催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA（small nuclear RNA），即U1、U2、U4、U5和
研究揭示LARP7在生精细胞mRNA精准剪接和精子发生中的功能
2月3日，国际学术期刊Molecular Cell 在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组的最新研究成果“LARP7-Mediated U6 snRNA Modification Ensures Splicing Fidelity and Sperm
华裔牛人Cell子刊：至关重要的干细胞调控因子
来自耶鲁大学医学院的研究人员证实，在果蝇睾丸中Piwi是成体干细胞和生殖干细胞两者的关键调控因子。这一重要的研究发现发布在6月25日的《Cell Reports》杂志上。 领导这一研究的是现任美国耶鲁大学终身教授林海帆( Haifan Lin)。其长期从事干细胞研究，曾证实人体干细胞微环境存在
科学家发现富集于成熟精子的新型小分子RNA
近日，中科院动物研究所段恩奎、韩春生和周琪三个实验室联合发现了一类大量存在于成熟精子中、源于tRNA的小分子RNA。相关研究成果日前发表于《细胞研究》。 成熟精子中RNA的发现让科学家意识到精子不仅仅是运输父源DNA的载体。过去的研究已证实，成熟精子所携带的一些miRNA能够影响早期胚胎发
何川教授新发Nature综述：mRNA修饰介导的基因调控
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
研究发现纤毛和鞭毛中PDCD5促进TRiC复合物的底物释放
蛋白质需要正确折叠以发挥其生物学功能。TRiC（CCT）是真核生物中特有的II型分子伴侣素，负责协助折叠约10%的胞质蛋白。TRiC在ATP的驱动下通过“开放—闭合”的构象循环，完成底物蛋白的招募、折叠与释放。但是，TRiC在完成底物折叠后如何释放底物，一直是该领域内悬而未决的问题。有研究发现，程序
动物所发现一类高度富集于成熟精子的新型小分子RNA
成熟精子中RNA的发现让科学家意识到精子不仅仅是运输父源DNA的载体。过去的研究已证实，成熟精子所携带的一些miRNA能够影响早期胚胎发育及后代的性状。然而，目前尚不清楚成熟精子中是否还携带除miRNA之外其他种类的小RNA；对各种小RNA的生成及在成熟精子中的富集过程也知之甚少。
Cell子刊：piRNA，DNA的贴身保镖
生殖细胞的DNA一直处于严密的保护之下，欧洲分子生物学实验室EMBL的研究团队日前为人们揭示了这个至关重要的保护机制，相关论文发表在七月九日的Cell Reports杂志上。 转座子又称为跳跃基因，是一种“自私”的DNA链。转座子能够进行自我复制，还能在染色体不同位点之间跳跃，会导致基因失活甚
中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能
来自中科大的消息，中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT，并发现在灵长类中，5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的
植物miRNA及piRNA的逆转录
miRNA在植物的发育、抗病、和应激反应中发挥着重要作用。一般认为，这些小的非编码RNA通过靶向mRNA剪切，在后转录水平调节植物的基因表达。这些基因表达中的靶向变化由数百个成熟miRNA的差异表达所调控，每个成熟miRNA结合在靶mRNA的特定序列上。因此，对植物的成熟miRNA调控和表达进行分析
我国学者首次发现了被子植物中水介导的受精机制
在最早期的植物类群绿藻中，受精过程是在水中实现的。苔藓植物和蕨类植物虽然登上了陆地，但是受精过程依然离不开水。水介导的受精系统因此也被认为是早期陆生植物特有的受精系统，但这种受精系统在演化过程中限制了植物的扩张，对于其陆生生境是不适应的。相比之下，种子植物不再直接传递精子，而是演化出利用动物和风
从一个全新的角度调控了活体剪切化学
近日，北大-清华生命科学联合中心、北京大学化学与分子工程学院应用化学系刘志博课题组在《德国应用化学》（Angewandte Chemie International Edition）上发表研究论文，与经典活体化学调控策略不同，刘志博课题组通过引入阳离子胶束作为“活体催化剂”，选择性的上调了肿瘤内
Genes－－Development：USTC复合物在piRNA转录中的功能
这一研究在线虫中发现了一个参与piRNA转录过程的上游序列转录复合物（USTC复合物）。 piRNA是一类在动物中保守的非编码小RNA，在转座子沉默、生殖发育、基因表达调控和性别决定等过程中发挥重要作用。 来自中国科学技术大学生命科学学院光寿红课题组与剑桥大学的Eric Miska课题组合作
精子发育过程中蛋白质翻译激活机制被发现了
据不完全统计，全球约有15%~20%的不孕不育夫妇，其中近50%是男性因素导致。环境污染、生活压力、遗传病等因素是造成男性不育的重要原因，但目前有一半以上不育男性无法明确其病因。中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所，简称“分子细胞中心”）刘默芳研究组与国内外多家实验室合
Nature：寨卡病毒导致小鼠睾丸体积缩小结构破坏
大部分针对寨卡病毒（Zika Virus）的研究发现，寨卡病毒感染的影响主要集中在孕妇和出生缺陷。但在小鼠中，新的研究发现了寨卡病毒对于小鼠雄性生殖系统的严重损伤，引起了人们对人类男性可能遭受得到的威胁的严重关切。美国华盛顿大学医学院的研究人员们，通过在《Nature》上的研究文章，报道了寨卡病
小鼠中的黄金矿脉RenMabTM小鼠
前几天有“砖家”同学写了两篇《鼠年说鼠》（一）和（二）。为了留作永久的学习材料，小编在经过原作者同意后，现进行转载。本文将两部分内容融在一起，并对（一）和 （二）顺序进行了调换。 抗体药发现的两大矿场 抗体药主要有两个大矿场，一个是依赖于体外展示技术的全合成/半合成/天然抗体
上海生科院完整染色体敲除研究获进展
11月25日，中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组与北京大学胡家志实验室合作完成的研究论文，以《CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术敲除目标染色体》为题，发表在《基因组生物学》上。该研究介绍了CRISPR/Cas9技术的新型应用，即在细胞、胚胎或
新冠疫苗的成功给mRNA疫苗提供了良机
基于mRNA的新冠疫苗在预防COVID-19的临床试验中展现出接近95%的防护效力，并且已经在全球被上亿人使用。mRNA技术在新冠疫苗开发方面的成功也让人们对基于mRNA的疗法开发充满了兴趣。近日，BioNTech公司首席执行官Uğur Şahin博士在Nature Reviews Drug D
图文看懂|导精子发育过程中蛋白质翻译激活重要机制
《科学》（Science）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）刘默芳研究组与国内外多家实验室合作完成的以LLPS of FXR1 drives spermiogenesis by activating translation of stored mRNAs为题的
新发现！精子发育过程中蛋白质翻译激活重要机制
据不完全统计，近20年我国不孕不育率从6.9% 升至17.1%，其中近50%是男性因素导致，目前有一半以上不育男性无法明确其病因。在精子细胞演变为精子的过程中，细胞核内的基因转录活动将完全停止，为后期精子细胞发育所需的基因提前转录为信使核糖核酸（mRNA），然后以抑制状态储存在精子细胞中，直到特
Cell发布piRNA重要发现
来自东京大学的一个研究小组鉴别出了一种叫做“Trimmer”酶，其参与生成了保护生殖细胞基因组免遭不必要遗传重写的一类小RNA。 “跳跃基因”（又称转座子）是可以在基因组中四处移动的DNA小片段。它们可以破坏宿主基因，与癌症和其他一些疾病有关联。因此，生物体需要控制它们，尤其是在生成动物精子和
小鼠中的黄金矿脉RenMabTM小鼠（一）
抗体药发现的两大矿场 抗体药主要有两个大矿场，一个是依赖于体外展示技术的全合成/半合成/天然抗体文库矿，比较耳熟能详的是剑桥抗体技术公司（药王阿达木单抗）、后来的Dyax和现在的MorphoSys（特诺雅®古塞奇尤单抗注射液）。著名的矿主有2018年诺贝尔化学奖得主温特爵士（噬菌体展示平台）和MIT
小鼠中的黄金矿脉RenMabTM小鼠（二）
RenMabTM小鼠的免疫系统发育 人源化抗体鼠的主要用途是用在新药研发上的全人源抗体发现，如果RenMabTM鼠的免疫系统发育缺陷，不能正常地产生抗体，或者是不能以正常的方式产生抗体（比如AlivaMab鼠），那就失去了其存在的意义。 RenMabTM鼠目前来看是个六能鼠，能吃、能喝、能拉、能睡、
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据
文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一：非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表
小RNA领域牛人Science发表重要研究成果
来自奥地利科学院分子生物技术研究所（IMBA）的研究人员，揭示出了细胞利用来生成一类生殖细胞特异性的小分子调控RNAs——piRNAs的分子机制。他们的研究结果发表在5月15日的《科学》（Science）杂志上。 领导这一研究的是IMBA的分子生物学家Julius Brennecke，这位学者
心理所发现青少期应激导内侧前额叶BDNF表观修饰改变
精神疾病发病是环境因素和遗传因素交互作用的结果。应激，尤其是发生在生命早期的应激会影响脑的发育过程，显著增加个体成年后罹患精神疾病的风险。这种早期环境因素导致的长期效应，其具体机制目前尚不明确。近年来，越来越多的临床及基础研究表明，早期应激导致表观遗传指标发生持久性变化，进而改变基因的表达，这种
Nature发表表观遗传学重要发现－决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白，但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章，揭示了m6A
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表文章最多的RNA甲基化测
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白，但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章，揭示了m6A在Sxl