刘默芳组:LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能

在较高等的真核生物中,大部分基因都含有内含子,在转录完成后需经过剪接(splicing)从mRNA前体移除内含子,以产生成熟、有翻译活性的mRNA,这个过程由剪接体(spliceosome)催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA(small nuclear RNA),即U1、U2、U4、U5和U6及与它们相互作用的蛋白因子【1】。其中,U6 snRNA处于核心地位,其保守性最强,且位于剪接体催化中心、为剪接体催化活性必需【2】。同时还发现,U6在后生动物中被高度修饰,包括末端的5 γ-单甲基化加帽和3 寡聚尿嘧啶化修饰,中间的2-O-甲基化、假尿嘧啶、m2G和m6A修饰等【3,4】。经过近40年的研究,研究者虽然已较为全面地揭示了U6生物生成的过程及其在剪接中的功能机制,但目前对U6修饰的调控机制及其在mRNA剪接中的功能还不甚了解。 之前的研究发现,在哺乳动物成年个体中,睾丸是转录活性最高、可变剪接最为丰富的组织【5】......阅读全文

刘默芳组:LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能

  在较高等的真核生物中,大部分基因都含有内含子,在转录完成后需经过剪接(splicing)从mRNA前体移除内含子,以产生成熟、有翻译活性的mRNA,这个过程由剪接体(spliceosome)催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA(small nuclear RNA),即U1、U2、U4、U5和

研究揭示LARP7在生精细胞mRNA精准剪接和精子发生中的功能

  2月3日,国际学术期刊Molecular Cell 在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组的最新研究成果“LARP7-Mediated U6 snRNA Modification Ensures Splicing Fidelity and Sperm

刘默芳小组肝癌细胞糖代谢调控机制研究获进展

  缺氧是实体瘤普遍存在的现象,对肿瘤生物学特性具有重要影响。已有证据表明,缺氧可调控多个Warburg效应关键基因,是诱导癌细胞能量代谢“重编程”的关键因素之一,也是调控肿瘤进程的一个重要病理因素,但目前对缺氧诱导癌细胞糖代谢转换的分子生物学机制还不完全清楚。中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞

Nature:U6-snRNP在premRNA剪接中的作用

  前体信使RNAs (pre-mRNAs) 被剪接体(它由五个被称为snRNPs的子复合物组成)和其他辅助因子处理。每个snRNP含有一个由7个成分构成的蛋白环结构和一个相关的RNA分子。   施一公及同事获得了U6 snRNP的Lsm蛋白环在有和没有一个包含U6 snRNA的3′端的

历时7年发《科学》论文,审稿人为延迟发表道歉

2021年5月,中科院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)的刘默芳团队向知名学术期刊《科学》递交了一份投稿。不久,编辑部就反馈了第一轮修改意见。看过之后,他们倒吸了一口凉气。其中一位审稿人的意见长达25页,里面密密麻麻的,全是质疑和问题。这位审稿人非常坦率地表示,他对论文里提到的一

刘默芳施惠娟发表Cell文章-发现人Piwi基因突变致男性不育

  国际著名学术期刊《细胞》(Cell)于5月26日在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组与上海市计划生育科学研究所施惠娟研究组合作的最新研究成果“Ubiquitination-deficient Mutations in Human Piwi Cause Male Infert

何川、贾桂芳研究组发文:植物mRNA化学修饰m6A去甲基酶

  近期,北京大学化学学院的何川、贾桂芳课题组在在高等植物N6-甲基腺嘌呤(m6A)动态可逆调控的研究中取得重要进展,相关工作以“ALKBH10B is An RNA N6-Methyladenosine Demethylase Affecting Arabidopsis Floral Transi

精子发育过程中蛋白质翻译激活机制被发现了

  据不完全统计,全球约有15%~20%的不孕不育夫妇,其中近50%是男性因素导致。环境污染、生活压力、遗传病等因素是造成男性不育的重要原因,但目前有一半以上不育男性无法明确其病因。中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所,简称“分子细胞中心”)刘默芳研究组与国内外多家实验室合

《科学》一项新研究为男性不育提供希望

我国近20年不孕不育率从6.9%增长到17.1%,其中男性病因约占40%。遗传突变和基因表达异常是男性不育的重要病因。然而,精子形成过程中仍有许多谜题尚未破解。 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)刘默芳研究组联合上海交通大学医学院附属新华医院黄旲研究组及国内外多家实

Cell:出人意料的mRNA修饰

Cell:出人意料的mRNA修饰  根据分子生物学的中心法则,遗传信息是从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,其为活体生物中遗传信息的解码和翻译提供了一种简单的解释。  当然在现实中,这一过程比近60年前DNA双螺旋结构的共同发现者、诺贝尔奖得主Francis Crick

我国学者发现导致男性不育的基因突变

  中科院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组与上海市计划生育科学研究所施惠娟研究组合作,首次发现人类Piwi基因突变可导致男性不育,并深入揭示了其致病机理,为相关男性不育症的早期分子诊断及精准医疗提供了理论依据。近日,《细胞》在线发表了该项研究成果。  据悉,在我国的不孕不育夫妇中,男性因素约占

科学家发现人类Piwi基因突变导致男性不育

  中科院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组与上海市计划生育科学研究所施惠娟研究组合作研究,首次发现人类Piwi基因突变可导致男性不育,并深入揭示了其致病机理,为相关男性不育症的早期分子诊断及精准医疗提供了理论依据。5月26日凌晨,国际著名学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了该项研究成果。刘默

小鼠粗线期piRNA指导精子形成

piRNA是新近在动物生殖系细胞中发现的一类与PIWI家族蛋白相互作用的小分子非编码RNA,在哺乳动物的精子发生过程先后出现两次表达高峰,分别被称为前粗线期piRNA与粗线期piRNA。学者对在早期生精细胞中表达的前粗线期piRNA的作用已有所了解,而在减数分裂前后大量表达的粗线期piRNA的功能还

2024年,西湖大学施一公团队合作再取进展

  U2小核核糖核蛋白(snRNP)对pre-mRNA分支位点(BS)的选择对于剪接前体 (A complex)的组装至关重要。RNA解旋酶PRP5校对BS选择,但其潜在机制尚不清楚。  2024年1月9日,西湖大学施一公及中国科学技术大学张晓峰共同通讯在Nature Structural & Mo

Cell:表观遗传新关注点—mRNA修饰

  表观遗传学研究关键点是修饰DNA及其蛋白质支架的化学标记,越来越多的研究表明这些化学标记能告诉细胞,哪些基因是表达,哪些是沉默的,因而也决定了个体的表型性状。  mRNA即信使RNA,在中心法则中扮演了重要角色,但此前一些科学家们认为这种RNA只是完成传递的作用,把细胞核中编码的信息传递给蛋白翻

上海生科院发现小鼠粗线期piRNA在精子发育中的重要功能

  不同于卵子含有大量母源mRNA和蛋白质支持早期胚胎发育,成熟精子中仅残留微量的mRNA,但目前还不清楚精子细胞中大量的mRNA是如何在形成精子前被大规模降解清除的。piRNA 是新近在动物生殖系细胞中发现的一类与PIWI家族蛋白相互作用的小分子非编码RNA,在哺乳动物的精子发生过程先后出现两次表

生化与细胞所等研究发现小鼠PIWI/piRNA代谢调控机制

  国际知名学术期刊Developmental Cell于1月13日发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘默芳组、王恩多组关于piRNA在精子发生后期触发小鼠PIWI(MIWI)蛋白经 APC/C-泛素途径降解的最新研究成果。该工作与李劲松研究员、上海计划生育研究所施惠娟研究员、美国路

上海生科院等揭示缺氧诱导肝癌细胞糖代谢转换新调控机制

  国际学术期刊《欧洲分子生物学学会会刊》(The EMBO Journal)于9月7日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳组关于miR-199a介导缺氧诱导肝癌细胞糖代谢转换的最新研究成果。该工作与上海胸科医院教授娄加陶、东方肝胆医院教授高春芳、瑞金医院教授李彪、

科研人员发现精子细胞发育的代谢调控机制

  国际知名学术期刊Developmental Cell(《发育细胞》)1月15日发表了中科院上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳组、王恩多组的合作研究成果,揭示了piRNA在精子发生后期触发MIWI/piRNA“机器”清除的代谢调控机制,为代谢异常导致的男性不育症的发生提供了潜在的分

Cell颠覆传统认知:出人意料的mRNA修饰

  根据分子生物学的中心教条(又称中心法则),遗传信息是从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,其为活体生物中遗传信息的解码和翻译提供了一种简单的解释。  当然在现实中,这一过程比近60年前DNA双螺旋结构的共同发现者、诺贝尔奖得主Francis Crick首次提出的要远远复杂得多。其一,有多

premRNA中存在的修饰及其对剪接影响

  2018年10月7日 讯 /生物谷BIOON/--日前,作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授(致敬Joan Steitz!2018年拉斯克特别成就奖获得者),以表彰她在生物医学领域,尤其是RNA生物学领域中所发挥

用siRNA或其生物合成前体RNAi诱导

  通过转染外源siRNA进行的基因敲低通常是不令人满意的,因为该效应仅是短暂的,特别是在快速分裂的细胞中。这可以通过产生siRNA的表达载体来克服。修饰siRNA序列以在两条链之间引入短环。得到的转录物是短发夹RNA(shRNA),其可以通过Dicer以其通常的方式加工成功能性siRNA。典型的转

上海生科院等揭示miR155在乳腺癌发生发展中的新功能

  国际学术期刊Oncogene 于4月11日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组关于miR-155调控ErbB2-介导的乳腺上皮细胞恶性转化的最新研究成果,揭示了miR-155在乳腺癌发生发展中的一种新功能和作用机制。  ErbB2是乳腺癌的一个重要致癌基因

细胞凋亡mRNA检测

研究者们发现了很多在细胞凋亡时表达异常的基因,检测这些特异基因的表达水平也成为检测细胞凋亡的一种常用方法。据报道,Fas 蛋白结合受体后能诱导癌细胞中的细胞毒性T细胞(cytotoxic T cells)等靶细胞。Bcl-2 和bcl-X (长) 作为抗凋亡(bcl-2 和bcl-X)的调节物,它们

小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切

  最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是

小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切

最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工

原发性生精功能衰竭的简介

  原发性生精功能衰竭是指各种下丘脑垂体疾病所致的生精功能改变,不同病因所致的原发性生精功能衰竭的程度类型不同,临床上统称非梗阻性无精子症。  无精子症的发病率在一般人群中约占2%,在男性不育中高达10-20%,睾丸组织学显示从小管损伤到生精功能低下各种不同程度的生精功能改变。甚至在唯支持细胞综合症

复旦大学,中科院Cancer-Res发现癌症转移的新机制

  生物通报道:来自中科院生物化学与细胞生物学研究所,复旦大学中山医院等处的研究人员发表了题为“KRAS-NFκB-YY1-miR-489 signaling axis controls pancreatic cancer metastasis”的文章,发现KRAS通过激活NF-κB炎症信号通路激活

上海生科院合作揭示炎症促非小细胞肺癌发生的新机制

  国际学术期刊Cancer Research 于6月23日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳组与上海市胸科医院娄加陶教授、中国科学院上海生命科学信息中心李党生研究员等合作完成的关于miR-101/Lin28B介导炎症促非小细胞肺癌(NSCLC)发生的最新研究成果

何川教授新发Nature综述:mRNA修饰介导的基因调控

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m6A)是真