双向电泳(twodimensionalelectrophoresis,2DE)2

2.[操作步骤] 1. 将研磨管离心一分钟(不低于12000×g)弃上清。 2. 加入裂解液(200-300ul)充分vortex. 3. 再加入样品鼠脑组织(低于100mg)充分研磨。然后可以再加入裂解液至1ml.. 4. 将组织悬液离心5-10min(高于12000g)去除树脂和细胞碎片。 5. 收集上清。 3.[试剂准备] 1.研磨管 2.裂解液:称取尿素4.8g、CHAPS0.4g、PMSF100mg,用纯水溶解至10ml,分装成500μl 于-20℃储存,使用时,每500μl液体加DTT5mg,IPGbuffer10μl。 三、蛋白质定量 1.[基本原理]定量作为生物实验室的日常工作之一,具有非常重要的意义。在蛋白质组学研究中,我们常常需要对蛋白质进行快速定量。无论是对蛋白质表达谱的定量比较还是蛋白质理化性质的分析,都建立在准确的定量这一基础之上。蛋白质的......阅读全文

DNA酶切及凝胶电泳(gel-electrophoresis)2

三、试剂 1、5×TBE电泳缓冲液:配方见第一章。 2、6×电泳载样缓冲液:0.25% 溴粉蓝,40%(w/v) 蔗糖水溶液,贮存于 4℃。 3、溴化乙锭(EB)溶液母液:将EB配制成10mg/ml,用铝箔或黑纸包裹容器,储于 室温即可。 第三节 操作步骤 一、

Analysis-of-Proteins-using-Small-Format-2D-Gel-Electrophoresis

Preparation of protein samplesIntracellular virus proteinsThe following method has been developed principally for the analysis of intracellular protei

Delta2D-和-Proteomweaver:两款2DE分析工具的性能评估

电泳学杂志《Electrophoresis》于2010年31卷发表了一篇Decodon公司的2-DE(2D凝胶电泳)分析软件Delta2D (D2D)与另一款同类分析软件Proteomweaver (PW)性能比较的文章,题目是:《Delta2D 和 Proteomweaver:两款2-DE

Capillary-Electrophoresis

Capillary electrophoresis is a very sensitive analytical technique. Sample components are separated within a fused silica capillary using one of sever

electrophoresis-of-DNA

Agarose Gel Electroporesis of DNA Making the gel: 1.  Place casting platform with well former sideways in gel stand where you wish to  pour 

Protein-Electrophoresis

DefinitionAmino acids, nucleotides, polypeptides, and other compounds in a colloidal state can be separated by the application of external voltages wh

Chromatin-Electrophoresis

Dr. William H. Heidcamp, Biology Department, Gustavus Adolphus CollegeExercise 10.4 - Chromatin ElectrophoresisLEVEL IIMaterials 14 M Urea6 M NaCl0.05

RNA-Electrophoresis

Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th

DNA-Electrophoresis

What is Electrophoresis?Electrophoresis is a technique used in the laboratory that results in the separation of charged molecules. DNA is a negatively

血红蛋白电泳(hemoglobin-electrophoresis)(HbA2定量)

实验原理血红蛋白电泳(hemoglobin electrophoresis)目的是检出和确认各种正常和异常的血红蛋白。根据不同的血红蛋白带有不同的电荷,等电点不同,在一定的pH缓冲液中,血红蛋白的等电点小于缓冲液的pH时带负电荷,电泳时在电场中向阳极泳动,反之,Hb带正电荷向阴极泳动。在一定电压下,

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验

仪器、耗材DBMS实验步骤3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验

实验步骤:3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作。因此,

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

1. 前言提取蛋白质是蛋白质组学研究的第一步。植物组织的蛋白质含量较低,并且存在多种非蛋白质成分,如细胞壁及贮藏多糖、脂质和酚类化合物,使蛋白质的提取难度增大 。植物蛋白质的可溶性与它们的细胞内定位关系密切,传统的蛋白质提取方法是用水合缓冲液、去垢剂或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA

peptide-fingerprint-mapping

Polyacrylamide gel electrophoresis is a widely used technique to separate proteins from biological samples. Moreover, the development of two-dimension

Ingel-digestion-of-proteins-for-peptide-fingerprint-mapping

Polyacrylamide gel electrophoresis is a widely used technique to separate proteins from biological samples. Moreover, the development of two-dimension

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(三)

2. 质谱鉴定命令单个蛋白质点可能被命名为几个名称或代码,如检测点数、匹配数、采集数等。因此,用一个质谱图去关联一个适当的蛋白点没有多大意义。为了避免错误, PROTICdb 的工作流程之一是生成一个携带单一的,送去做质谱鉴定的蛋白点质谱仪 ID 的文件 ( 相当于一个命令)。质谱仪就可以将

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(一)

仪器、耗材 DBMS实验步骤 3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(五)

( 10 ) 鼠标左键点击同一个点(342 号)(见注释 20) ,激活蛋白点信息框。蛋白点的数据按以下 4 个条目排列:概要、关系、鉴定和量化。每个条目对应的信息可被不断充实。其中鉴定包括质谱的详细数据。( 11 ) 开发鉴定、质谱详细数据和下一个子目录。从质谱数据分析得到了每个匹配结果,首先得到

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(六)

( 18 ) 当移动鼠标到两个链接的蛋白点之一上时,与这个点链接的每个点的十字标记的颜色都变成橙色 (在另一块胶上有一个匹配的蛋白点)。当鼠标点到这些点中的一个时,只有包括在同一个网络中的点显示橙色( 图 23-12)。你可以通过声明一个新的关系,确认这些数据,这样就可以扩大点的网络。( 1

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(二)

4. 梅拉尼生成的输出文件的上传( 1 ) 由梅拉尼软件生成一个检测报告,并把它输出到一制表分隔的文本格式文件 ( 见注释 9)。 文件扩展名为 “ txt.  ” 。 本演示中,使用 PROTICdb  Demo,   zip 中的 detections /DV02121001. txt 文件

2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(四)

4. 质谱鉴定报告文件上传PROTICdb 兼容以制表分隔的文本格式输出的 Sequest 鉴定报告(见注释 13) 。( 1 ) 为演示,访问 http: //location 一 of/your/proticdb/home/demo. php。点击  “formto  obtain  the

常用电泳法

 1、醋酸纤维素薄膜电泳(电泳法测定)醋酸纤维素是提纤维素的羟基乙酰化形成的纤维素醋酸酯。由该物质制成的薄膜称为醋酸纤维素薄膜。电泳时经过膜的预处理、加样、电泳、染色、脱色与透明即可得到满意的分离效果。此电泳特点是分离速度快、电泳时间短、样品用量少。因此特别适合于病理情况下微量异常蛋白的检测。2、纸

常用电泳法

1、醋酸纤维素薄膜电泳(电泳法测定)醋酸纤维素是提纤维素的羟基乙酰化形成的纤维素醋酸酯。由该物质制成的薄膜称为醋酸纤维素薄膜。电泳时经过膜的预处理、加样、电泳、染色、脱色与透明即可得到满意的分离效果。此电泳特点是分离速度快、电泳时间短、样品用量少。因此特别适合于病理情况下微量异常蛋白的检测。2、纸电

常用电泳法

1、醋酸纤维素薄膜电泳(电泳法测定)醋酸纤维素是提纤维素的羟基乙酰化形成的纤维素醋酸酯。由该物质制成的薄膜称为醋酸纤维素薄膜。电泳时经过膜的预处理、加样、电泳、染色、脱色与透明即可得到满意的分离效果。此电泳特点是分离速度快、电泳时间短、样品用量少。因此特别适合于病理情况下微量异常蛋白的检测。2、纸电

Gel-Electrophoresis-of-DNA

What is Electrophoresis?Electrophoresis is a technique used in the laboratory that results in the separation of charged molecules. In this CyberLab we

Pulse-Field-Electrophoresis

Manipulating and analyzing DNA are fundamentals in the field of molecular biology. Indeed, separating complex mixtures of DNA into different sized fra

RNA-gel-electrophoresis

实验概要RNA gel electrophoresis主要试剂DEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide sol

Agarose-Gel-Electrophoresis

实验概要Separating nucleic acid fragments by agarose gel electrophoresis.实验原理 Agarose  gel electrophoresis remains the most widely used technique for  sep

Agarose-gel-electrophoresis

General ProcedureCast a gelPlace it in gel box in running bufferLoad samplesRun the gelImage the gelCasting Gels0.7% agarose gel with 1kbp ladder in U

RNA-gel-electrophoresis

MaterialsDEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide solutions should also be