2DE蛋白质组学的PROTICdb数据库实验(一)
仪器、耗材 DBMS实验步骤 3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作。因此,网页上包含受控词汇或以前加载到数据库的其他数据的组合框。当建立一个新的 PROTICdb 数据库时,受控词汇库是空的,用户可根据需要填充。这将确保一个公认的,如果可能的话,尽可能标准化的词汇表。这对于查询非常重要,因为这可以减少同义词的使用以及错误拼写。网络界面包括以下 3 个主要内容:主菜单,弹出菜单和工作空间(图 23-1)。“ 用户登录”和当前项目的名称( 之前选中的项目)显示在 PROTICdb 徽标下方。数据必须加载到一个 PROTICdb 项目中。不过,有可能要建立一个或多个项目,来满足你......阅读全文
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(一)
仪器、耗材 DBMS实验步骤 3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验
仪器、耗材DBMS实验步骤3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验
实验步骤:3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作。因此,
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(三)
2. 质谱鉴定命令单个蛋白质点可能被命名为几个名称或代码,如检测点数、匹配数、采集数等。因此,用一个质谱图去关联一个适当的蛋白点没有多大意义。为了避免错误, PROTICdb 的工作流程之一是生成一个携带单一的,送去做质谱鉴定的蛋白点质谱仪 ID 的文件 ( 相当于一个命令)。质谱仪就可以将
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(五)
( 10 ) 鼠标左键点击同一个点(342 号)(见注释 20) ,激活蛋白点信息框。蛋白点的数据按以下 4 个条目排列:概要、关系、鉴定和量化。每个条目对应的信息可被不断充实。其中鉴定包括质谱的详细数据。( 11 ) 开发鉴定、质谱详细数据和下一个子目录。从质谱数据分析得到了每个匹配结果,首先得到
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(六)
( 18 ) 当移动鼠标到两个链接的蛋白点之一上时,与这个点链接的每个点的十字标记的颜色都变成橙色 (在另一块胶上有一个匹配的蛋白点)。当鼠标点到这些点中的一个时,只有包括在同一个网络中的点显示橙色( 图 23-12)。你可以通过声明一个新的关系,确认这些数据,这样就可以扩大点的网络。( 1
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(二)
4. 梅拉尼生成的输出文件的上传( 1 ) 由梅拉尼软件生成一个检测报告,并把它输出到一制表分隔的文本格式文件 ( 见注释 9)。 文件扩展名为 “ txt. ” 。 本演示中,使用 PROTICdb Demo, zip 中的 detections /DV02121001. txt 文件
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验(四)
4. 质谱鉴定报告文件上传PROTICdb 兼容以制表分隔的文本格式输出的 Sequest 鉴定报告(见注释 13) 。( 1 ) 为演示,访问 http: //location 一 of/your/proticdb/home/demo. php。点击 “formto obtain the
蛋白质组学常用数据库一览
一蛋白质数据库 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 网址:http://www.uniprot.org/ http://www.ebi.ac.uk/uniprot/ 简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(瑞
实质等同性(蛋白质组学)实验(一)
实验材料 ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒 提取缓冲液仪器、耗材 SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤 众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小
蛋白质组学实验技术大全
每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与
植物蛋白质组学和糖基化实验(一)
实验材料 链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒 DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤 3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白
iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程(一)
大家好,我是黄博,吉凯一小兵,蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男(我一直是这么定位自己的)是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事,真的是有血、有泪、有shi!情节需要,中间可能会穿插一些技术方面的内容,请各位自动忽略。那是一个月黑风高的晚上,本人和大尾巴狼(我实在不想
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
质谱在蛋白质组学中的应用实验
实验材料 冷冻干燥样品试剂、试剂盒 校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材 MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤 1.吸取 0.5ul 的基质溶液,加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中(为了准确起见,请使用2ul 的移液器)。2.在基质干燥之前,迅速加入 0.5ul 的标准品或样品
质谱在蛋白质组学中的应用实验
方案1 蛋白质和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型层析柱的制备实验 方案3 固定化酶微型层析柱的制备 方案4 用于蛋白质组分析的微毛细管 HPLC 色谱及 ESI —体化装置的制备和使用 方案5 利用 Nano-LC
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学与多组学的融合
本次分论坛以“Proteomics Marries Other Omics(蛋白质组学与多组学的融合)”为主题,围绕蛋白质组学在疾病机制研究、代谢重编程、肿瘤学与免疫学中的最新应用展开。会议旨在探讨蛋白质组学与代谢组学、转录组学等多组学技术的深度融合与交叉创新,为精准医学与系统生物学的发展提供新
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料:ESI-MS MALDI - MS 试剂、试剂盒:提取缓冲液仪器、耗材:SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳 实验步骤:众所周知,在实验室内和实验室间难
GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘
盐城4公分厚外墙岩棉板报价 岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(一)
试剂、试剂盒 尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材 等电聚焦仪 IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤 3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG (
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术
2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享
HBFP数据库:人类体液蛋白质组研究又添一利器
人体体液是疾病相关蛋白的丰富来源,这些蛋白质从全身的病理组织中分泌或泄漏,许多可通过非侵入性方法获得。近些年来,研究者通过检查体液蛋白质组发现大量生物标志物,通过创新的高通量技术,现代蛋白质组学研究已经成功地在各种体液(如血浆、血清、唾液和尿液)中鉴定出大量蛋白质,成果显著。吉林大学教育部符号计
Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学驱动的精准医学(A)
2025年10月13–14日,在第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会上,以“蛋白质组学驱动的精准医学(Proteomics-Driven Precision Medicine)”为主题的分会于梅州厅举行。会议由中国人民解
最先进的蛋白质组学实验室建立
赛默飞世尔科技公司与英国癌症研究院合作建立最先进的蛋白质组学实验室 2009年7月20号,英国赫默尔亨普斯特德—服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技公司在英国的癌症研究院(ICR)宣布一项整合生物网络的合作。癌症研究院是世界上新型、先进的蛋白质组学实验室,配有完整的Thermo Scientif
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究实验
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验材料植物组织 试剂、试剂盒苯酚
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表