斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD......阅读全文
COL22A1基因的结构特点及主要作用
该基因编码胶原家族成员,被认为有助于在收缩活动中稳定肌腱膜连接和加强骨骼肌附着。它属于胶原超家族中具有间断三螺旋(facit)亚群的纤维相关胶原,通过其c端胶原结构域与胶原纤维结合,并通过其n端非胶原结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。编码蛋白沉积在肌腱连接的基膜区,仅存在于肌肉、肌腱、心脏、关节软骨
中科院华南植物园通过斑马鱼快速检测水源毒性
近期,记者从中科院华南植物园获悉,由该园研究员陈峰完成的“斑马鱼测试水质及其毒性的用途和方法”获得国家发明ZL授权。 据介绍,对日益恶化的水源污染问题,自来水厂所采取的方式是加入大量超过标准的氯(漂白粉)来消毒杀菌。加氯虽然能够杀死水中的各种病菌,但它一旦与水中的有机物结合,会产生大量如三氯甲
斑马鱼背腹轴形成和Wnt通路调控机制研究获新进展
经典Wnt信号通路是细胞内的主要信号传导机制之一,在脊椎动物早期胚胎发育和器官形成中起着重要作用,其活性的非正常变化与多种人体疾病密切相关。该通路的激活可促进b-catenin在细胞核内积累,调节多种下游基因的转录表达。然而,对该通路在脊椎动物重要器官发育与形成中作用的研究刚刚起步
新进展:科学家利用斑马鱼研究阿片类药物成瘾
阿片类药物危机逐渐升高,然而科学家对于成瘾的机制了解仍然不多。为了解决这个需求,犹他大学的研究者设计了一个系统让斑马鱼可以自行摄取一种用于治疗人类疼痛的氢可酮。一个星期以后,斑马鱼就呈现出对药具有依赖性,即使这样对它们来讲非常危险;48小时后,斑马鱼在撤药后表现出焦虑的反应。这项研究发表在《Be
斑马鱼睾酮(T)酶联免疫分析试剂盒使用说明
检测范围: 96T0.4nmol/L - 12nmol/L 使用目的:本试剂盒用于测定斑马鱼血清、血浆及相关液体样本中睾酮(T)含量。实验原理本试剂盒应用双抗体夹心法测定标本中斑马鱼睾酮
科学家:“4条斑马鱼目前在空间站状态良好”
5月19日,2024年度“天地共播一粒种——青少年与航天员一起养斑马鱼”科学教育活动在中国科学院空间应用工程与技术中心启动。该活动由中国科学院学部工作局、教育部基础教育司主办,中国科学院空间应用工程与技术中心承办。活动面向全国青少年,来自北京中关村中学、北京一零一中学双榆树校区的40名学生代表现场与
解析Cu2+通过表观调控影响斑马鱼肌原纤维分化机制
近日,华中农业大学水产学院鱼类逆境发育遗传学团队通过研究,发现了Cu2+通过表观调控影响斑马鱼肌原纤维分化机制。相关研究论文以 “Copper ions impair zebrafish skeletal myofibrillogenesis via epigenetic regulation”
斑马鱼5羟色胺(5HT)ELISA试剂盒说明书
斑马鱼5羟色胺(5-HT)ELISA试剂盒.已知待测物质浓度的标准品、未知浓度的样品加入微孔酶标板内进行检测。先将待测物质和生物素标记的抗体同时温育。洗涤后,加入亲和素标记过的HRP。再经过温育和洗涤,去除未结合的酶结合物,然后加入底物A、B,和酶结合物同时作用。产生颜色。颜色的深浅和样品中待测物质
斑马鱼全脑转录图谱揭示神经元表型分子调控规则
12月13日,eLife在线发表题为The landscape of regulatory genes in brain-wide neuronal phenotypes of a vertebrate brain的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经
中国科学家建立斑马鱼非感染性肠道炎症模型
斑马鱼是肠道发育和疾病研究的理想模型 PI3P缺失导致上皮细胞连接破坏,最终招募中性粒细胞,发生急性炎症 北京时间7月6日17时,国际学术期刊Nature Communications(《自然-通讯》)在线发表中国科学院广州生物医药与健康研
Nature:CRISPR基因编辑技术助力破解重要生物学谜题
鱼类的后代变成可以在陆地上行走的动物必须发生的一个重大转变就是,要用手指和脚趾来替代长长的鳍条(fin rays)。在8月17日的《自然》(Nature)杂志上,来自芝加哥大学的科学家们证实,在鱼类中构成鳍条的细胞也在四条腿动物手指和脚趾的形成过程中发挥重要作用。 采用新型的基因编辑技术和敏感
斑马鱼模型对天然产物的生物活性和安全性评价的应用
近日,中国农业科学院都市农业研究所、成都大学、美国中佛罗里达大学、四川省自然资源科学研究院和中山大学的研究人员,在国际食品Top期刊《Critical Reviews in Food Science and Nutrition》(中科院JCR一区,影响因子7.862)上发表题为“Recent d
基因敲除动物实验揭示不孕之谜
有数据表明,中国平均每8对夫妇中就有一对面临不能自然受孕的问题,而不少采用试管婴儿技术的夫妻,胚胎仍无法正常发育,究竟是什么原因造成的呢?近日,美国《科学》杂志上发表了一篇来自浙江大学生命科学院范衡宇教授和中国科学院动物研究所孙青原研究员团队的论文。论文说,一个名为CRL4的蛋白质复合体对维持卵
基因敲除技术最新研究进展
基因敲除技术最新研究进展—|基因敲除技术|转基因研究|基因克隆|基因靶向操作|基因敲除技术是建立在基因同源重组技术以及胚胎干细胞技术的基础上而发展起来的一种分子生物学技术。1987年Thompsson建立了完整的ES细胞基因敲除的小鼠模型 。近年来新兴起了ZFNs、TALENS、Cas9等多
crispr-cas9基因敲除原理
基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR
crispr-cas9基因敲除原理
基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR
基因敲除技术最新研究进展
基因敲除技术最新研究进展—|基因敲除技术|转基因研究|基因克隆|基因靶向操作| 基因敲除 技术是建立在基因同源重组技术以及胚胎干细胞技术的基础上而发展起来的一种分子生物学技术。1987年Thompsson建立了完整的ES细胞基因敲除的小鼠模型 。近年来新兴起了ZFNs、TALENS、Cas9
miR1423p调控脊椎动物造血干细胞的形成和分化
过去关于造血发生的研究主要集中在信号和转录因子,然而近期的研究热点主要是包括microRNAs的表观遗传调控。本文研究者发现在斑马鱼和小鼠中,miR-142-3p在造血干细胞(HSCs)中特异性表达。敲除斑马鱼的miR-142a-3p基因导致主动脉-性腺-中肾(AGM)区的HSCs数量降低,同时
落锤冲击试验是怎么做的
落锤冲击试验又称落重试验,是一种冲击试验方法。原理是利用重锤从不同高度落到试样(片、薄膜、制品)上,求取落下高度与试样破坏率的关系。用破坏率为50%时的落下高度来表示试样的抗冲击能力。用以测定钢材无塑性转变(NDT)温度的一种特殊冲击试验。上海华龙生产的NDT落锤冲击试验机是完全能实现落锤冲击试验效
DSC熔点分析是怎么做的
测熔点,首先会有一个向下的吸热峰,国际热分析协会International Confederation for Thermal Analysis(ICTA)规定前基线延线与峰前沿斜率最大处切线交点代表熔点,前基线就是指熔化前接近水平的基线,峰前沿就是指峰达低点前的那段曲线。
水生所等发现转透明颤菌血红蛋白可提高斑马鱼低氧耐受力
2011年4月,Marine Biotechnology刊登了中科院水生生物研究所鱼类基因工程学科组与北京大学生命科学院合作的封面研究论文:Vitreoscilla Hemoglobin (VHb) Overexpression Increases Hypoxia Toleranc
研究使用CRISPR寻找肌肉营养不良的治疗方法
CRISPR-Cas9基因编辑技术以其在纠正遗传疾病中的潜在作用而闻名。但是它也可以用作寻找特定基因的工具,从而使疾病变得更好或更加恶化。这些基因可能成为新疗法的良好靶标。 由波士顿儿童医院的Louis Kunkel博士和研究员Angela Lek博士领导的一项新研究表明。CRISPR-Cas
让斑马鱼的鳍变成“手臂”,科学家复制了这个关键步骤
通过调整单个基因,美国哈佛大学的科学家改造了斑马鱼,使其显示出开始形成类似四肢的附肢。研究人员在筛选各种基因突变及其对鱼类发育的影响时,偶然发现了这种突变,这可能会为脊椎动物从海洋到陆地的转变提供线索。该发现于 2 月 4 日在《细胞》(Cell)上发表。 研究人员发现,四足动物和硬骨鱼类
西南大学将CRISPR用于鱼类遗传学研究
与哺乳动物不同的是,鱼类的性别决定基因在物种之间有所差异,但是,是否有一个共同的分子通路调节着硬骨鱼的 性腺性别决定,目前尚不明确。十一月二十日,来自西南大学、日本爱媛大学和美国马里兰大学研究人员,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》发表题为“A Tandem Duplicate
基因敲除,rna干扰,基因沉默有什么关系
基因敲除一般指永久的、不可逆转的敲除/失活靶基因,目前其中一种热门的,常见的基因敲除方法是CRISPR/Cas9,利用gRNA靶向靶基因并指导cas9切割基因双链,形成移码突变或片段敲除来完成基因敲除。基因沉默与基因敲除不同的地方在于,沉默可以是暂时性的、可逆转的失活基因/抑制基因表达,基因可以是存
Nature头条:基因编辑技术开启新篇章
斑马鱼是脊椎动物生物学和人类疾病研究的一个重要的参与者。其胚胎透明、体外受精、短繁殖周期和快速生长等特点意味着可对活体动物开展紧密地胚胎发育研究,斑马鱼可作为研究基因行为和功能的一种有用模型。 现在来自梅奥医学中心(Mayo Clinic)的分子生物学家Stephen Ekker领
Nature头条:基因编辑技术开启新篇章
斑马鱼是脊椎动物生物学和人类疾病研究的一个重要的参与者。其胚胎透明、体外受精、短繁殖周期和快速生长等特点意味着可对活体动物开展紧密地胚胎发育研究,斑马鱼可作为研究基因行为和功能的一种有用模型。 现在来自梅奥医学中心(Mayo Clinic)的分子生物学家Stephen Ekker领导研
TetraOne-KO——基因敲除技术的重大突破
近日,赛业生物科技(Cyagen Biosciences)宣布推出其全球ZL技术TetraOne基因敲除,一种不仅在速度上媲美TALEN、CRISPR/Cas9(把ES打靶基因敲除/敲入鼠的定制周期降低至6个月),而且避免了TALEN、CRISPR/Cas9脱靶效应困扰的革命性技术。TetraO
RNAi——双链RNA引起的基因敲除(2)
在构建双链RNA的表达载体时,使用RNA多聚酶Ⅲ来指导RNA的合成。这是因为RNA多聚酶Ⅲ有明确的启始和终止序列,而且合成出的RNA不会带有polyA尾。当RNA多聚酶Ⅲ遇到连续5个胸腺嘧啶时,它指导的转录就会终止,并且转录产物在第二个尿嘧啶处被切下来。U6启动子能被RNA多聚酶Ⅲ识别, 合
TetraOne-KO——基因敲除技术的重大突破
TetraOne KO——基因敲除技术的重大突破 近日,赛业生物科技(Cyagen Biosciences)宣布推出其全球ZL技术TetraOne基因敲除,一种不仅在速度上媲美TALEN、CRISPR/Cas9(把ES打靶基因敲除/敲入鼠的定制周期降低至6个月),而且避免了TALEN、