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PYRO测序用于SNP基因分型原理

其实是一种段片段焦磷酸测序技术,在测序引物的引导下,完成段片段(含snp)的测序,从而实现基因分型。缺点:不能检测长片段,对于重复序列没有办法。原理简介1.测序引物与单链,PCR扩增的DNA模板相结合。然后将其与DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶,以及底物APS和荧光素一起孵育。2.四种dNTP之一被加入反应体系,如与模扳配对,此dNTP与引物的末端形成共价键,dNTP的焦磷酸基团(PPi)释放出来。而且释放出来的 Ppi的量与和模板结合的dNTP的量成正比。3.ATP sulfurylase在adenosine 5´ phosphosulfate存在的情况下催化PPi形成ATP,ATP驱动luciferase介导的Luciferin向oxyluciferin的转化,oxyluciferin发出与ATP量成正比的可见光信号。光信号由CCD摄像机检测并由pyrogram™反应为峰。每个光信号的峰高与反应......阅读全文

PYRO测序用于SNP基因分型原理

其实是一种段片段焦磷酸测序技术,在测序引物的引导下,完成段片段(含snp)的测序,从而实现基因分型。缺点:不能检测长片段,对于重复序列没有办法。原理简介1.测序引物与单链,PCR扩增的DNA模板相结合。然后将其与DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶,以及底物APS和荧光素一起孵

SNP基因分型(SNP genotyping)的几个常用数据库

做SNP genotyping应该常看的几个database:1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe Int

SNP分子标记的原理及其分型方法的比较

美国学者Eric S. Lander于1996年正式提出单核苷酸多态性(SNP)为第三代分子标记以后,SNP已经广泛应用于经济性状关联分析、生物遗传连锁图谱构建、人类致病基因筛选、致病风险诊断及预测、个体化药物筛选等生物、医学研究领域。在经济作物育种领域,检测SNP可实现对所需性状的早期选择。这

Affymetrix推出AxiomBiobank芯片,用于基因分型研究

  2012年11月1日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)今日宣布推出 Axiom® Biobank 芯片,一种内容灵活且性价比很高的功能生物学方案,能够经济地对大样品集合进行基因分型,如生物样本库、基因组中心及核心实验室筛查的样品。   A

乙肝HBV基因分型检测原理

1、全面型别分析    采用Sanger测序法对乙肝病毒进行分型基因检测。通过提取慢性乙型肝炎患者血液中的病毒DNA,利用特异性引物对HBVDNA中的基因进行PCR扩增。通过对扩增后的目的基因进行测序,将测序信息与NCBI中标准株的序列信息进行比对,可一次性检出慢性乙型肝

MD应用文章下载:SNP基因分型高通量检测方法新思路

MD应用文章下载:SNP基因分型高通量检测方法新思路SNP基因分型高通量检测方法新思路单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以

SNP分型技术在临床检测市场的应用前景

SNP(Single nucleotide polymorphism)即单核苷酸多态性,它是由基因组DNA某一特定核苷酸位置上单个碱基的转换、颠换、插入或缺失引起的点突变, 使得群体之间和个体之间产生了差异。   SNP的检测方法很多,它们主要基于以下4种基本原理:(1

SNP检测技术(测序、taqman探针和snp芯片)

snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼

高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享

重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答.1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些?我们要求所提交的序列长度至少为目标位点上下游各50bp。请注意序列来源,尽量保证序列准确,多态性位点BLAST结果证明为

高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享

  重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答.   1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些?   我们要求所提交的序列长度至少为目标位点上下游各50bp。请注意序列来源,尽量保证序列准确,多态性位点