定量PCRTaqman探针设计要领1

自90年代Taqman探针诞生以来,虽然荧光探针(引物)不断有新的技术出现,但是作为一种经典的定量PCR技术,Taqman探针技术仍然是许多实验研究人员进行定量检测的首选,这主要是因为相对于SYBR荧光染料,Taqman探针具有序列特异性,只结合到互补区,而且荧光信号与扩增的拷贝数具有一一对应的关系,因此特异性强灵敏度高,而且条件优化容易;而相对于杂交探针,Taqman探针只要设计一条探针,因此探针设计较便宜方便,而且也能完成基本的定量PCR要求。当然Taqman定量方法由于还是要合成探针,也给实验操作带来了挑战。一般Taqman定量PCR实验过程为:目的基因查找比对→探针与引物设计→探针与引物合成→配置反应体系→反应参数→重复实验,优化条件→获得曲线数据,比对标准曲线→再重复验证。 第一步:在第一步目的基因查找比对过程中可以利用NCBI genbank序列以及DNAstar等软件完成目的DNA或者RNA的查找与比对——这在......阅读全文

定量PCR-Taqman探针设计要领1

自90年代Taqman探针诞生以来,虽然荧光探针(引物)不断有新的技术出现,但是作为一种经典的定量PCR技术,Taqman探针技术仍然是许多实验研究人员进行定量检测的首选,这主要是因为相对于SYBR荧光染料,Taqman探针具有序列特异性,只结合到互补区,而且荧光信号与扩增的拷贝数具有一一对应的关系

定量PCR-Taqman探针设计要领2

第三步:寻找一家信赖的公司合成引物和探针,一般引物合成大家比较熟悉,而且价格也比较便宜(特别是这两年便宜了许多),而探针则相对来说贵了许多,一般 Taqman探针合成在1000到5000元不等(不同的合成要求价钱不同)——而这只是标记价钱,序列合成基本上和引物合成价钱相似。 第四、五、六步:一般

实时荧光Taqman-探针设计的几个要点

实验室很多同学都要做Real time PCR实验,实验室的师兄师姐都会有很多宝贵意见,不过也有实验室前没有做过的,查找了下资料和大家分享下关于实时荧光 Taqman 探针设计、实时荧光PCR探针的选择、引物的设计及评价。荧光探针法是用序列特异的荧光标记探针来检测产物,探针法的出现使得定量PCR技术

TaqMan探针设计的基本原则

  1、TaqMan探针位置尽可能靠近扩增引物,但不能与引物重叠。  2、长度一般为18~40碱基。  3、G+C含量控制在40%~80%左右。  4、避免连续相同碱基的出现,特别是要避免GGGG或更多G出现。  5、在引物的5'端避免使用G。  6、选用比较多的碱基C。  7、退火温度Tm

实时荧光定量PCR检测方法SYBR-Green-I-法与TaqMan-探针法

来自美国Azure Biosystems公司的Azure Cielo™实时荧光定量PCR系统,融合了高品质Pilter温度模块和基于光纤传输的光学检测系统,为您的科学研究提供高精准、高灵敏的可靠结果。北京深蓝云生物科技有限公司已经为您准备好了仪器,期待您的试用哦~既然仪器已经备好了,那么该怎样选

荧光定量PCR引物探针的设计总体原则

1. 先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的靠近探针。    2. 所选序列应该高度特异,尽量选择具有最小二级结构的扩增片段——这是因为二级结构会影响反应效率,而且还会阻碍酶的扩增。建议先进行二级结构检测,如果不能避免二级结构,那么就要相应提高退火温度。    3. 扩增长度应不超过400bp,理想

实时定量PCR技术综述(原理、荧光标记、TaqMan-Probes和...1

一.实时定量PCR基本原理1.PCR反应动力学右图为PCR反应曲线(横坐标为循环数,纵坐标表征产物量),不同的曲线代表初始模板量不同的 PCR反应。PCR反应的动力学公式为:Cn=C0(1+E)n其中C0和Cn分别为初始模板和n循环的拷贝数,n为循环数,E为扩增效率(0≤E≤1),理想状态下(即每个

实时荧光定量PCR仪-采购要领!

   目前购买荧光定量PCR仪系统,一般包括:   实时荧光定量PCR仪 +实时荧光定量PCR仪 开机检测试剂+通用电脑+自动分析软件   荧光定量PCR仪 组成:温控模块、光学系统(光源、检测器、光路传导)  采购要领   1 温控模块/Peltier:   普通的Peltier加热方式具有明显边

实时荧光定量PCR仪-采购要领!

   目前购买荧光定量PCR仪系统,一般包括:   实时荧光定量PCR仪 +实时荧光定量PCR仪 开机检测试剂+通用电脑+自动分析软件   荧光定量PCR仪 组成:温控模块、光学系统(光源、检测器、光路传导)  采购要领   1 温控模块/Peltier:   普通的Peltier加热方式具有明显边

实时定量PCR探针概述

实时定量PCR (qPCR)的优势•实时检测PCR反应过程•精确计算出每个循环的PCR产物量•扩增和检测同时进行•消除后续PCR的干扰在实时定量PCR反应中,杂交探针与插入染料如SYBR Green相比是更好的选择。荧光标记探针可以提高实时定量PCR结果的效率、灵敏度和特异性。而且定量PCR可以在一

TaqMan探针法的操作

在之前发表的文章《实时荧光定量PCR检测方法,你选对了吗?》中提到,实时荧光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探针法、分子信标、荧光共振能量传递(FRET)和LUX Primers等。那么应用最为广泛的则是SYBR Green染料法和TaqMan探针法,两者各

荧光定量pcr-taqman为什么要用两步法

你这个结论并不对。两步法,三步法并没有本质区别,信号的读取都是在每一个延长结束后读取。定量PCR一开始的时候也是三步法的。两步法,是因为设计引物的时候把退火温度设为酶的工作温度,而且定量PCR的产物都很短,需要的时候都短,所以两步法更方便。三步法的话,花的时间长,不利于快速实验。

荧光实时定量PCR引物设计

靶的选择和试验设计1.针对目的基因序列选择合适的扩增片断查看以下三个网站是否有合适的已经证实的QRT-PCR的扩增引物,探针以及反应条件.RTPrimerDB (http://medgen.ugent.be/rtprimerdb), 相对物种较多PrimerBank (http://pga.mgh.

荧光实时定量PCR引物设计

  靶的选择和试验设计   1.针对目的基因序列选择合适的扩增片断   查看以下三个网站是否有合适的已经证实的QRT-PCR的扩增引物,探针以及反应条件.   RTPrimerDB (http://medgen.ugent.be/rtprimerdb), 相对物种较多   PrimerBa

荧光定量PCR实验设计

 设置对照组:荧光定量PCR检测一般流程如下图,选择检测靶标基因,进行引物筛选及体系构建,后续进行样本处理核酸提取,检测分析结果。对照组是实验的监控系统,监测实验是否有存在异常,也是排除实验异常关键所在;实验对照设置: 通常有阳性对照,阴性对照组等。      具体可根据实验类型进行对照组的设置;对

荧光实时定量PCR引物设计

   靶的选择和试验设计   1.针对目的基因序列选择合适的扩增片断   查看以下三个网站是否有合适的已经证实的QRT-PCR的扩增引物,探针以及反应条件.   RTPrimerDB (http://medgen.ugent.be/rtprimerdb), 相对物种较多   PrimerB

TaqMan探针基因表达分析全面升级

TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了,然而你知道吗,对于部分降解的RNA,如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样品中的RNA,TaqMan引物探针的设计有更多的讲究,你知道这是为什么吗?FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化,RNA片段的大小在50-300 nt,大部分片段在100 n

普通pcr引物设计和荧光定量pcr引物设计的区别

一、方法不同1、普通pcr引物设计:引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。2、荧光定量pcr引物设计:通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,标记跟踪PCR产物进行实时监测反应,利用与之相适应的软件对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度二、原理不同1、普通pcr引物设计:为了找到一对合适的核

实时定量PCR技术综述(原理、荧光标记、TaqMan-Probes和...2

下表列出了部分文献报道的TaqMan Probes技术所使用的酶和其它相关参数。   Target P1 P2 Probe Enzyme 退火温度 延伸温度 HCV 19

深蓝云qPCR知识小课堂TaqMan探针法的操作

  在之前发表的文章《实时荧光定量PCR检测方法,你选对了吗?》中提到,实时荧光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探针法、分子信标、荧光共振能量传递(FRET)和LUX Primers等。那么应用最为广泛的则是SYBR Green染料法和TaqMan探针法,两者各有所

解决荧光定量PCR引物探针问题

荧光实时定量 PCR 技术 (real-time quantitative PCR,qPCR) 几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量 PCR 实验离不开精准的实验设计和操作流程。    实时荧光定量 PCR 分析的部分实施需要经过优化以确保所有反应参数均设置精确

实时荧光定量PCR原理和实验(二)

  归一后的荧光信号再扣除本底,就得到DRn:DRn = Rn,样本- Rn,空白。DRn是最后构建PCR实时扩增曲线的纵坐标。   无论绝对定量还是相对定量,在得到实验结果后,还要考虑数据之间的可比性问题。在实验操作中,取样都是以体积或重量为单位的,但是同样体积或重量的样本所来源的细胞数目并不一样

就这样做-轻松搞定实时-PCR-探针设计

除了为克隆基因、预测编码蛋白而需要研究基因的构成外,当前在基因组学上的努力也包括对基因组构成的研究,以分析具有结构和调控因子插入的基因。近源物种分析成为比较基因组学的主要内容,被认为是研究进化、基因功能和人类疾病的重要方法。 利用该方法分析微生物,特别是细菌的基因组,早在 1996 年就已开始

肠道病毒EV71-TaqMan荧光定量RT-PCR法快速检测

  肠道病毒(EV)属于小RNA病毒科,根据血清学可以分为脊灰病毒、柯萨奇、埃可病毒和肠道病毒68~71型,共67个血清型。肠道病毒可引发众多疾病,并可暴发流行,导致死亡,严重危害人类健康。浙江省近几年由肠道病毒引起的无菌性脑炎〔1,2〕、手足口病〔3〕、急性出血性结膜炎和新生儿急性心肌炎等暴发疫情

第五篇:-就这样做-轻松搞定实时-PCR-探针设计

除了为克隆基因、预测编码蛋白而需要研究基因的构成外,当前在基因组学上的努力也包括对基因组构成的研究,以分析具有结构和调控因子插入的基因。近源物种分析成为比较基因组学的主要内容,被认为是研究进化、基因功能和人类疾病的重要方法。利用该方法分析微生物,特别是细菌的基因组,早在 1996 年就已开始识别出细

荧光定量PCR试剂盒

荧光定量PCR试剂盒 荧光定量PCR又可以分为TaqMan探针和SYBR Green I荧光染料两种方法。比较而言,探针杂交技术在原理上更为严格,所得数据更为精确;荧光染料技术则成本更为低廉,实验设计更为简便。在选择实验方案时要根据实验目的和对数据精度的要求来决定。1. TaqMan探针法是高度特异

做-realtime-PCR之前,你应该如何着手设计引物

正在着手做 real-time PCR 的朋友们,我想最开始肯定要考虑引物设计的问题。看完下面的文字,我保证你得到想要的引物设计方法和引物序列。第一步:拿到你所要研究的基因的序列。不要告诉我你不会找序列。如果真的不会,请参考丁香园内其他版块,如NCBI使用,序列查找等。第二步:确定你想用哪种方法。T

定量PCR实验技术分享1

1.  如果扩增曲线ct值比较靠后的话,32左右,一般有什么方法解决没有 ct值比较靠后,对实验有一定的影响,因为经过那么多次的循环,酶的活性有可能有所下降,这时候扩增效率会有所改变(而定量PCR的理论基础就是每次循环的扩增效率我们认为是确定的一个值)。因此zui好能够把ct值往前移。 解决办法可以

荧光定量PCR实验指南1

第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备; 二、技术关键: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;

定量PCR技术基本原理和方法以及PCR产物的检测与定量3

1) 特异性捕获检测法(非探针杂交捕获)本法是非特异性检测PCR产物的一种方法,用生物素标记引物和地高辛标记duTP或用生物素和地高辛分别标记其引物。经PCR扩增后,PCR产物中同时掺入了生物素和地高辛。用生物素包被孔捕获PCR产物,用酶(AKP)标抗地高辛和产物反应,加底物显色进行定量,此法是非序