增加RTPCR特异性的办法(提高逆转录保温温度和减少基...
第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法,各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火,产生短的,部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5'末端序列及从带有二级结构区域或带有逆转录酶不能复制的终止位点的RNA模板获得cDNA。为了获得最长的cDNA,需要按经验确定每个RNA样品中引物与RNA的比例。随机引物的起始浓度范围为50到250ng每20μl反应体系。因为使用随机引物从总RNA合成的cDNA主要是核糖体RNA,所以模板一般选用 poly(A)+RNA。Oligo(dT)起始比随机引物特异性高。它同大多数真核细胞mRNA 3'端所发现的poly(A)尾杂交。因为poly(A)+RNA大概占总RNA的1%到2%,所以与使用随机引物相比,cDNA的数量和复杂度要少得多。因为其较高的特异性,oligo(dT)一般不需要对RNA......阅读全文
增加RTPCR特异性的办法(提高逆转录保温温度和减少基...
第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法,各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火,产生短的,部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5'末端序列及从带有二级结构区域或带有逆转录酶不能复制的终止位点的RNA模
增加RTPCR特异性
第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法,各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火,产生短的,部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5'末端序列及从带有二级结构区域或带有逆转录酶不能复制的终止位点的RNA模
如何增加RTPCR特异性?
起始cDNA合成 第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法,各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。 随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火,产生短的,部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5'末端序列及从带有二级结构区域或带有逆
RNA提取与RTPCR(4)
2.8 小量RNA检测方法的提高 当仅有小量RNA时,RT-PCR尤其具有挑战性。在RNA分离过程中加入的作为载体的糖元有助于增加小量样品的产量。可以在加入Trizol的同时加入无RNase的糖元。糖元是水溶性的,可以同RNA保持在水相中以辅助随后的沉淀。对于小于50mg的组织或106个培养细胞
RNA提取与RTPCR(3)
2.3 RT-PCR的引物设计 RT-PCR引物设计和一般PCR引物设计可以遵循同样的原则。细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。设计理想的引物都有以下共同的特点,而设计失败的引物则各有各的缺
增加RTPCR灵敏度
分离高质量RNA成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。一般的RNA纯化方法是使用异硫氰酸胍/酸性酚的一步法。Trizol试剂法(见下图)将一步法加以提高,可以从多种
提高RTPCR特异性的方法总结
第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法,各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。 随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火,产生短的,部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5'末端序列及从带有二级结构区域或带有逆转录酶不能复制的终止位
RTPCR实验操作的注意事项
在做Northern等杂交实验、构建cDNA文库、获取能够编码真核生物蛋白的基因、获得RNA病毒基因时,会用到RNA提取和RT-PCR技术。真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是
RNA提取和RTPCR
真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉这些非编码区,才形成成熟的mRNA
RNA提取与RTPCR
1.RNA的提取 RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要注意,稍有疏忽就会前功尽弃。 1.1分离高质量RNA 成功的cDNA合成来
RTPCR常见问题分析及其解决方案
常见问题可能原因建议解决方案少量或没有RT-PCR产物RNA被降解分离无污染,高质量的RNA;提取RNA的材料要尽量新鲜,防止RNA降解;RT反应前,在变性胶上分析RNA的完整性;RNA提取后,应储存在100%甲酰胺中, 如果使用RNase抑制剂,加热时小于45℃;pH小于8.0,否则抑制剂会释放所
逆转录RTPCR常见问题分析
RT-PCR常见问题(一)RT-PCR灵敏度:在琼脂糖凝胶分析中看到少量或没有RT-PCR产物。可能原因解决方案RNA被降解在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA。使用良好的无污染技术分离RNA。在将组织从动物体取出后立刻处理。RNA中包含逆转录抑制剂通过乙醇沉淀RNA除去抑制剂。用70%(体积
逆转录PCR(RTPCR)
实验四 逆转录PCR (RT-PCR )【实验目的】1.了解用逆转录PCR 法获取目的基因的原理。2.学习和掌握逆转录PCR 的技术和方法。【实验原理】聚合酶链式反应(PCR)过程利用模板变性,引物退火和引物延伸的多个循环来扩增DNA序列。因为上一轮的扩增产物又作为下一轮扩增的模板,是一个指数增长的
如何提高RTPCR反应体系的灵敏度
如何提高RT-PCR反应体系的灵敏度:1、分离高质量RNA成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂如EDTA或SDS等,以及尽可能减少基因组DNA污染。RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上的序列信息量的大值。2、使用无RNaseH活性的逆转录酶在逆转
RTPCR成功的几个要素
1、高质量RNA成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离 poly(A)+RNA。不管起始模板是总RNA还是poly(A)
聚氨酯保温管保温常规温度
聚氨酯保温管保温常规温度聚氨酯保温管概述:聚氨酯保温管能在0.6-1.2米冻土层内直埋(所以人们习惯称它为直埋式保温管或是预制保温管),热损失比普通的管道可降低40%以上,工作使用寿命比其它绝热防腐材料提高3-5倍以上,寿命可以达到30-50年;质量均符合或高于中国行业标准。其完善的保温系统,具有工
聚氨酯保温管保温常规温度
聚氨酯保温管保温常规温度 聚氨酯保温管概述:聚氨酯保温管能在0.6-1.2米冻土层内直埋(所以人们习惯称它为直埋式保温管或是预制保温管),热损失比普通的管道可降低40%以上,工作使用寿命比其它绝热防腐材料提高3-5倍以上,寿命可以达到30-50年;质量均符合或高于中国行业标准。其完善的保
聚氨酯保温管保温常规温度
聚氨酯保温管概述:聚氨酯保温管能在0.6-1.2米冻土层内直埋(所以人们习惯称它为直埋式保温管或是预制保温管),热损失比普通的管道可降低40%以上,工作使用寿命比其它绝热防腐材料提高3-5倍以上,寿命可以达到30-50年;质量均符合或高于中国行业标准。其完善的保温系统,具有工程整体造价低、工期短、寿
RT-PCR技术及RNA提取策略3
成功的RT PCR的要素1、高质量RNA 成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离poly(A)+RNA。不管起始模
提高RTPCR的灵敏度和产物长度
RT-PCR 已经成为研究者确定感兴趣的器官、组织或细胞中mRNA 转录本出现、结构和表达水平的基本方法。RT-PCR的基本步骤包括:首先对样品中出现的所有mRNA 合成一个cDNA拷贝,接着扩增感兴趣的基因。因为两个步骤中使用的反应缓冲液不能兼容,所以这两个步骤(RT 和PCR)通常分别进行。即使
RT-PCR反应原理
RT- PCR反应原理从细胞或特定组织中提取总RNA。逆转录实验。扩增内参和目的基因并比较基因表达差异。RT-PCR反应受多个因素影响,如硫酸镁的浓度, 引物退火的温度,扩增的循环数等。 ◇建议选择0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸镁作初步实验。 ◇对于具有较高Tm的引物,增加
增加PCR特异性
引物设计 细心地进行引物设计是PCR中zui重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点: 1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性,并降低序
增加PCR特异性
增加PCR特异性(一)引物设计细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点:1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性
分子生物学相关实验步骤及注意事项(二)——反转录篇
——反转录篇——反转录PCR(Reverse Transcription, RT-PCR)又称为逆转录PCR,是指扩增mRNA的一种实验技术。先将mRNA反转录成cDNA,然后再以cDNA为模板,用PCR方法加以扩增。(一)逆转录酶的种类AMV:有较强的聚合酶活性和RNA酶H活性。最适42℃。在高反
PCR仪常见问题及回答
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*
PCR仪常见问题及回答
PCR仪常见问题及回答1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是R
PCR仪常见问题及回答
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反
PCR实验操作常见问题及解决方法
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反
逆转录PCR(RTPCR)扩增基因特异片段
逆转录PCR(RT-PCR)扩增基因特异片段 一、实验原理RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中R
逆转录RTPCR实验仪器及条件
实验器具的准备:RT-PCR所用的500μl和200μl薄壁EP管、移液器吸嘴最好用进口的,因为进口EP管、移液器吸嘴已经去除了RNasin,也已经灭菌处理过,可以直接用。实验前用干净的镊子夹取出EP管、移液器吸嘴插好备用,注意镊子不要碰到EP管内壁和吸嘴的尖部。如果用国产500μl和200μlEP