揭秘m6A修饰新功能－－调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所韩大力和同济大学高亚威教授合作在顶级国际期刊Science上首次揭示了关于RNA的m6A甲基化修饰调控染色质状态和转录活性的重要机制，不仅刷新了我们对m6A功能的认识，而且为研究m6A作用方式提供了新的思路与研究视角，具有重要科研意义。 发表期刊：Science 影响因子：41.037 实验方法：m6A MeRIP-seq、RNA-seq、m6A整体修饰水平、ChIP-seq（云序生物可提供以上服务） 实验样本：小鼠胚胎干细胞 文献链接：http://sci-hub.shop/10.112......阅读全文
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
肿瘤免疫治疗有望：促使T细胞功能失调的新机制被发现
肿瘤免疫治疗为癌症患者带来新的治疗手段和希望，在多种肿瘤类型中得到了成功应用。一部分病人可以响应免疫治疗并取得理想的治疗效果，但大部分病人对免疫治疗无法产生响应。其中一个重要原因是其肿瘤微环境中T细胞的功能已经处于不可逆的失调状态。研究表明，肿瘤相关巨噬细胞是诱导T细胞功能失调的主力军之一。作为
中国科学家9月参与发表多篇Nature文章
9月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中包括首次揭示m6A甲基化修饰的新作用，表观遗传调控核心复合物PRC2招募到基因组上重要位点的分子机制，以及兰花基因关键演化机制。 来自中科院动物研究所，北京基因组研究所的研究人员通过m6A测序技术（m6A-Seq），首次揭示m
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
揭示肿瘤相关巨噬细胞调控CD8+－T细胞命运新机制
肿瘤免疫治疗为癌症患者带来新的治疗手段和希望，在多种肿瘤类型中得到了成功应用。一部分病人可以响应免疫治疗并取得理想的治疗效果，但大部分病人对免疫治疗无法产生响应。其中一个重要原因是其肿瘤微环境中T细胞的功能已经处于不可逆的失调状态。研究表明，肿瘤相关巨噬细胞是诱导T细胞功能失调的主力军之一。作为
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucle
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucle
华人学者Nature－Methods揭示RNA甲基化的复杂性
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
上海生科院发现转录中介体在表观遗传学调控新功能
生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”，首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”，即将DNA分子“转录”产生RNA分子，进而将RNA分子“翻译”为蛋白质，才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中，有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的
广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展
9月8日，中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研
我国学者在驱动肿瘤发生和转移的表观遗传机制新进展
图 HRAS m6A修饰调控肿瘤细胞命运 在国家自然科学基金项目（82203348、82103230、82025029、82150114）等资助下，东南大学高山教授课题组在驱动肿瘤发生和转移的表观遗传机制研究方面取得进展。研究成果以“N6-甲基腺苷对HRAS的表观转录调控驱动肿瘤进展（Epitra
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化（一）
文章导读m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucleic Aci
2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总
感恩有你，一路同行！2019年末，云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候！光阴如梭，一年转瞬又将成为历史，新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战，决心再接再厉，更上一层楼。回首即将过去的2019，云序生物不断创新，硕果累累；展望2020，任重道远却信心倍
中山大学团队研究发现诱发癌症发展新机制
中山大学肿瘤防治中心教授林东昕、研究员郑健团队研究发现，心理压力应激可通过激活交感神经系统释放去甲肾上腺素，作用于肿瘤细胞ADRB2受体，介导肿瘤RNA m6A去甲基化酶ALKBH5表达降低，引发肿瘤细胞表观转录组紊乱和微环境神经重塑的正反馈促癌环路。5月26日，相关成果发表于《自然-细胞生物学》（
SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育
文章导读： 胚胎干细胞作为一种全能性细胞，通过增殖和分化，产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明，胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化，大多与细胞增殖[1-2]，免疫应答[4]关系密切。然而，对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天，分享一
Cell综述：染色质和转录动力学
组蛋白能帮助古细菌和真核生物维持其基因组的紧凑性和稳定性，形成类似核小体之类的结构也能调控DNA结合转录调控元件，以及顺式调控DNA元件的作用方式。不同类型的蛋白，比如ATP依赖性重塑酶能促进组蛋白与转录因子之间的动态竞争，从而调控染色质的组装，结合以及编辑。 5月14日最新一期Cell杂志发
研究发现激酶解锁异染色质的“递进修饰”模式
11月24日，《细胞死亡&分化》（Cell Death & Differentiation）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国/裴端卿/陈可实团队的最新研究成果MAP2K6 Remodels Chromatin and Facilitates Reprogramming by A
上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展
中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作，基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究，首次获得了对核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制
活性氧作为重要的信号分子，在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中，过氧化氢具有较长的半衰期，可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程，但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用，共同调控植物发育过程却不甚清楚。中
揭秘神经发育过程中m6ARNA甲基化与组蛋白修饰间的关系2
（3）Mettl14缺失导致晚期出生神经元数量减少在P0小鼠中，作者通过特定标记识别相应的神经元亚型，在六个不同的皮层中发现了RGCs分化的神经元。其中，Cux1在晚期出生的神经元中表达，是II-IV的标记物，对标记信号进行定量结果表明相比于CK小鼠而言Mettl14-cKO小鼠中Cux1+的信号值
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物，HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA，circRNA作为一种新型环状RNA，具有共价闭合环状结构，在组织和血液中具有
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
PTMab直播预告－|－组蛋白新型酰化修饰ChIP介绍
基因组信息以染色质的形式存储在细胞核中，147bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成染色质最小单元核小体。核心组蛋白的柔性 N 末端以及球状核心结构域存在大量共价修饰，如乙酰化、甲基化和磷酸化等。组蛋白赖氨酸乙酰化中和了赖氨酸的正电荷，削弱了组蛋白和DNA的相互作用，从而形成更开放的染色质状态，更高的D
科学家揭示生物钟调控代谢新方式
近日，南京农业大学动物科技学院教授王恬团队与芝加哥大学合作在《细胞—报告》上在线发表研究论文，揭示了生物钟调控代谢的新方式，拓展了人们对生物钟、m6ARNA甲基化修饰和代谢相互关系的认识。 N6-甲基腺嘌呤（m6A）是真核生物RNA上最丰富的一种转录后修饰，在基因表达、RNA剪切、mRNA运输
曹雪涛Nature子刊再发文－揭示m6A修饰促进树突状细胞活化
近日，曹雪涛院士在Nature子刊再发文章，首次揭示了m6A修饰通过改变mRNA翻译水平调节DC的功能活化，对于深入理解RNA表观修饰调控免疫基因表达的机制，进一步阐明m6A修饰在免疫应答及炎症反应中的功能具有重要意义。 免疫应答的表观调控机制是近年来免疫学研究的前沿热点。RNA的N6-甲基腺
活性染色质的概念和特征
活性染色质是指具有转录活性的染色质。活性染色质的核小体发生构象改变，具有疏松的染色质结构，从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合酶在转录模板上滑动。活性染色质主要特征活性：染色质具有DNase I超敏感位点（DNase I hypersensitive site）；活性染色质很少有组蛋
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇
一个月发表30多篇10分以上的文章，到底是何方神圣？答案：RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。 m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰，在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答，母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个
我国研究院揭示m6A修饰对AtoI－类RNA编辑的调控作用
A-to-I类型的RNA编辑是一种基本的生物学现象，广泛存在于哺乳动物中，目前被认为是一种能够产生分子多样性的转录后修饰机制，通过重新编码来调节蛋白质翻译，大大丰富了遗传信息。A-to-I类型的RNA编辑不仅对基因表达调控具有重要影响，而且还与很多疾病的发生发展过程密切相关。m6A 修饰对 A-
Nature－Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制
m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰，其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶（writer）、结合蛋白（reader）以及去甲基化酶（eraser）的动态可逆调控。研究表明，m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动，参与调控机体的诸多生理或病理进程，包
染色质修饰如何调控基因表达？－中国学者提出新见解
中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心的研究人员最新发表两篇Nature Genetics文章，利用生化、分子、遗传、组学及结构生物学等研究方法，分别揭示了植物特有染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的SHL和EBS形成BAH-EMF1复合体而介导植物基因沉默