基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果
近日，国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据，并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基因组计划”之后国际科学界在生命科学研究领域取得的又一重大进展。以往研究者常关注与编码蛋白质相关的基因，但它们只占整个基因组的约2%。ENCODE研究团队完成了解析基因组非编码区域的工作，人类基因组中约80%的区域都被确定拥有某种确定的功能。ENCODE项目从近期看有利于测序产业，基因组会成为更热的研究方向，而从长远来看，其影响深远，对疾病诊断、药物研发等都将具有积极的推动作用，新增市场价值当以万亿美元计算。 中科院北京基因组研究所“百人计划”方向东研究员项目组利用与美国华盛顿大学基因组学系建立多年的合作关系，选派该组青......阅读全文
人类基因组计划完成十五年
科学技术进步有多快？当我们今天大谈基因测序与健康话题时，别忘了人类基因组计划才完成不过15年。 2000年6月26日，时任美国总统克林顿在白宫举行的记者招待会上郑重宣布，由来自美国、英国、德国、日本、中国和法国的上千名科学家共同参与的“人类基因组研究计划”已经完成人类基因组草图。他在评价这一历
利用CRISPR筛查人类基因组“垃圾”DNA
在几个研究小组正致力将CRISPR/Cas9系统应用于临床的同时，另一些研究团队则在利用这一工具来解决有关生物学的基础问题。近期，荷兰癌症研究所遗传学教授Reuven Agami与和同事们应用CRISPR搜寻了整个基因组中的调控增强子元件。 他们将Cas9核酸酶靶向了从前鉴别出的两个转录因子p
PNAs：人类基因组中藏着病毒的“灵魂”
研究者们发现，从远古时期开始，我们的祖先的DNA中就藏有病毒的"灵魂"。其中一些病毒一旦被唤醒，将会是十分危险的。最近一项研究中，科学家们找到了新的藏在我们DNA中的病毒"灵魂"。 通过筛查2500份人类基因组，研究者们发现有36种病毒随着进化过程在不断地累积。其中有19种病毒此前从未见过，其
Science：“复活”人类基因组中的古老DNA
尽管尼安德特人(Neanderthal)已经在三万年前灭绝，但其基因组片段仍在现代人群中延续。科学家们通过新分析法，研究了665名欧洲和东亚人的全基因组测序数据，这些数据来自于千人基因组计划。研究显示，显示超过20%的尼安德特人基因组仍存在于现代人群中。文章于一月二十九日发表在Science杂志
Nature：巧借CRISPR技术解读人类基因组
每个人都是由先天与后天：DNA以及环境共同塑造而成。相比于其他人的基因组，存在于你的基因组中的一些差异如何影响了你成为什么样的人？在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇新论文中，来自华盛顿大学的研究人员巧妙地结合CRISPR/Cas9基因组编辑技术和深度基因测序技术，让我们朝着解答这一重要
专家解读《人类基因组编辑研究伦理指引》
究伦理指引》 7月8日，科技部官网公布《人类基因组编辑研究伦理指引》（以下简称《指引》），意在规范人类基因组编辑研究行为，促进人类基因组编辑研究健康发展。《指引》明确了开展人类基因组编辑研究的目的、基本原则、一般要求和特殊要求。这份由国家科技伦理委员会医学伦理分委员会研究制定的文件，旗帜鲜明地划出红
人类基因组测序或将只需数分钟
来自伦敦帝国理工学院的科学家正在开发一种技术，它能够在几分钟内完成个人基因组的测序，且费用比目前的技术要低得多。研究人员已经将这项原型技术申请ZL，其研究成果发表在近期的《纳米快报》（Nano Letters）杂志上。 在这个新研究中，研究人员证明能在50nm孔中利用电荷高速推动DNA链。当
用超声波处理人类基因组DNA
Purpose:To break up high molecular weight human placental DNA into fragment sizes of 500 bp or less which can be used as competitor DNA in Southern an
最新测序的完整的人类基因组图谱
最新测序的完整的人类基因组图谱。 图片来源：英国《新科学家》网站 20年前，科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸（DNA），其实，他们漏掉了少许。现在，由于读取DNA方法的改进，科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了！据生物预印本网站（biorxiv）近日报道，美国科学家对全部
新便携仪器可对人类基因组高效测序
新一期英国《自然·生物技术》杂志刊登报告说，一个国际团队用一种手机大小、方便携带的基因测序装置，对完整的人类基因组进行了测序。这意味着基因测序技术在市场上应用的门槛大大降低。 对人类基因组测序曾是一项非常难的工作，２００３年发布的第一份人类基因组图谱是由全球多国科学家合作十多年、耗资约３０亿
ENJM：人类基因组测序速度实现新突破
近期，斯坦福大学的科研人员完成了利用人工智能计算加速工作流程的DNA巨量测序技术，把人类基因组测序时间缩短至5小时2分钟，创造了新的世界纪录。研究成果发表在《The New England Journal of Medicine》期刊，标题为“Ultrarapid Nanopore Genome
古人类基因组数量超万个
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499340.shtm
人类基因组DNA提取的原理和方法
实验目的: 1.熟悉分子生物学实验的操作特点。2.掌握人类基因组DNA提取的基本原理。3.熟悉人类基因组DNA提取的基本方法。4.熟悉琼脂糖凝胶电泳的原理和操作。实验原理:用细胞裂解液裂解细胞膜,收集细胞核,加入SDS破裂核膜,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并从DNA上解离下来,经苯酚﹑氯仿抽提去
测序技术再现新进展，已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术
单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面（例如基因组、表观基因组和转录组）的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系，有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年，Nature Me
华东师范大学Nature子刊发布表观遗传重要成果
来自华东师范大学、中科院生物物理研究所等机构的研究人员，提供了令人信服的证据证实H3K9甲基化促进了哺乳动物中的DNA维持性甲基化，但并非是其必要条件。研究结果发布在8月24日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 华东师范大学的翁杰敏（Jiemin Wong）教
甲基化的基因组直接测序法
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定，但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来，科学家们开发出多种新方法，试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说，全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组，但它还是面临技
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（一）
单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中，最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞，得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是，就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样，没有两个细胞是完全相同的。所以，单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
研究发现植物DNA主动去甲基化新机制
近期《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i
何厚胜/卫功宏/任善成合作发现调控前列腺癌的新机制
Nature子刊 | 既往众多的大规全基因组关联研究（GWAS）在人类基因组上发现了 269 个与前列腺癌发病风险密切相关的风险区域，其中包含了大量单核苷酸多态性 (SNP) 位点，但是其中约 98% 的 SNP 位点位于基因组上的非编码区。 这些非编码区的位点与前列腺癌之间究竟仅仅是统计
人类首张黄种人基因组图谱有望在深面世
人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深面世，并计划在今年高交会期间向全世界发布。目前，深圳华大基因研究院近百位科学家已进驻盐田。市区两级政府正着手将沙头角海山街道辖区的恩上村整体搬迁改造成“生物研发加速器”，作为该项目基地。 人们对基因工程技术应用于制药和医学治疗的信心在不断增强。2006年底，
Cell：两项研究解析胚胎干细胞的表观遗传机制
在干细胞研究领域中，表观遗传调控，尤其是细胞核内染色体高级组织形式一直是当前的前沿和热点领域。近日，两个研究小组在《细胞》(Cell)杂志上发表文章，分别报道了人类胚胎干细胞的转录和表观遗传动态机制 以及 多向分化胚胎干细胞的表观遗传作用机制。 在第一项研究中，来自哈佛麻省Broad研
朱健康院士团队揭示植物DNA主动去甲基化的完整调控途径
近日，PNAS杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidops
是否允许人工合成基因组？人类基因组编写计划引忧虑
2016年5月，130名科学家、企业家和政界人士在哈佛大学举办了一场仅限受邀者参加的闭门会议，商讨打造合成人类基因组的雄伟计划。三周后，参与者在浪潮般的批评声中宣布，他们计划通过这一新项目显著降低合成基因组成本。这将是生物科技领域的一项革命性发展，使科学家能够人工培育移植所需的器官。 这项
基因组所等在RNA甲基化表观遗传新机制研究中获重要进展
11月21日，中国科学院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室 “百人计划”研究员杨运桂研究组，与美国芝加哥大学何川教授实验室和奥斯陆大学Arne Klungland教授合作完成的“RNA甲基化表观遗传新机制研究项目”取得重要进展，相关学术论文在《细胞》子刊《分子细胞》