基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果
近日,国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据,并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基因组计划”之后国际科学界在生命科学研究领域取得的又一重大进展。以往研究者常关注与编码蛋白质相关的基因,但它们只占整个基因组的约2%。ENCODE研究团队完成了解析基因组非编码区域的工作,人类基因组中约80%的区域都被确定拥有某种确定的功能。ENCODE项目从近期看有利于测序产业,基因组会成为更热的研究方向,而从长远来看,其影响深远,对疾病诊断、药物研发等都将具有积极的推动作用,新增市场价值当以万亿美元计算。 中科院北京基因组研究所“百人计划”方向东研究员项目组利用与美国华盛顿大学基因组学系建立多年的合作关系,选派该组青......阅读全文
什么是人类基因组计划
人类基因组计划简介人类基因组计划(human genome project, HGP)是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动的.美国、英国、法兰西共和国、德意志联邦共和国、日本国和我国科学家共同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划.这一计划旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因
《自然》:重新认识人类基因组
“DNA元件百科全书”首批成果出炉,人类生物学再树里程碑 继“人类基因组计划”后最大的国际合作计划之一——“DNA元件百科全书”计划(Encyclopedia of DNA Elements,简称ENCODE)日前发表了一系列重要文章,挑战了关于人类基因组的传统理论,即人类基因蓝图不是由孤
北京基因组所解释了细胞在热刺激反应中染色质构象改变
热刺激是细胞经常面对的环境刺激,热刺激反应是所有细胞普遍具有的刺激反应机制。热刺激诱导的广泛的转录调控是热刺激反应的重要组成部分。近年来,科学家从表观遗传学的各层面对其机制开展了研究。当前,针对染色质空间构象这一重要的表观遗传学层次,是否在热刺激反应中发挥作用以及可能的具体作用形式存在争议。此外
北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库
DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记,在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用,不同物种所采用的机制亦各不相同。因而,整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析,可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异,并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。
研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一,通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因
单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究获进展
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN
基因组DNA甲基化分析方法
早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基
北京基因组所RNA-m6A甲基化调控mRNA剪切研究获进展
6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最为丰富的甲基化修饰形式之一,发生于保守序列RRACH(R=G ,A; H=A,C or U)中,富集在mRNA的外显子编码区及3’-非编码区。类似于DNA甲基化修饰,RNA的m6A甲基化修饰也是可逆的,由
北京基因组所等首次精准解析结核分枝杆菌复合群甲基化
结核病是全球最常见的传染病之一,据WTO“2015年全球结核病年报”报告,2014年全球新增感染人数960万,死亡150万,新增耐多药结核(MDR)病例48万(其中我国新增结核感染病例93万,居全球第三位),其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberc
北京基因组所揭示半甲基化在基因表达调控中的作用
DNA甲基化是最早发现的表观遗传标记之一,在真核细胞基因表达调控中发挥重要作用。随着DNA甲基化检测技术的进步,研究发现DNA甲基化具有完全甲基化和半甲基化两种状态,以及可以稳定遗传的半甲基化修饰。关于DNA半甲基化是否具有独特的生物学功能仍有争议,因而需要对DNA半甲基化进行研究。此外,传统的
北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-
Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响
染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神疾病的患病风险息息相关,但这一研究领域仍存在许多未解之谜。来自西
解读“生命之书”--新发现填补人类基因组图谱空白
美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的研究人员制作了一份人类基因组的单细胞染色质图谱,确定了240种多基因特征和与疾病特征相关的细胞类型,并注释了非编码DNA变异的风险,有利于更好地理解遗传学与疾病之间的联系。这一发现发表在12日的《细胞》杂志在线版上。 此前,科学家在公布最新的被称为“生命之
DNA重组广泛存在人类基因组中
科技日报北京7月26日电 (记者张梦然)日本理化学研究所综合医学科学中心科学家主导的国际合作研究发现,在人类每个细胞的基因组中,重复数百万次的特定基因组序列重组普遍存在于正常细胞和疾病状态的细胞中。确定这种曾被认为是“垃圾”的DNA序列的重组机制,对于了解人体细胞如何发育以及是什么导致它们“生病”至
美推出人类基因组编写计划
科学家在赞赏该项目雄心的同时认为其缺乏合理目标 大约1个月前,科学家在一次秘密会议中提议,通过政府与私人企业合作,从头合成一个完整的人类基因组,这项研究大约需要10年的时间,并且相关的技术开发也将花费数以亿计的美元。6月2日,他们正式对外公布了这一计划。 这项名为“人类基因组编写计划”(H
结核病如何影响人类基因组
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454759.shtm 今年3月,一项利用古人类DNA的最新研究揭示了过去2000年里结核病如何影响欧洲居民免疫系统,特别是结核病对人类基因组的影响。 该研究的重点是TYK2基因的一个变种——P11
美推出人类基因组编写计划
大约1个月前,科学家在一次秘密会议中提议,通过政府与私人企业合作,从头合成一个完整的人类基因组,这项研究大约需要10年的时间,并且相关的技术开发也将花费数以亿计的美元。6月2日,他们正式对外公布了这一计划。 这项名为“人类基因组编写计划”(HGP-write)的研究的倡议者在美国《科学》杂志上
人类基因组计划与医学模式
摘要:人类基因组计划将为医学科学的发展提供广泛的可能性,并给生物医学带来革命性的变化,但是人的社会性,疾病产生的非生物因素以及社会及伦理的限制都决定了任何生物医学上的成就,包括人类基因组计划都不能改变生物社会心理医学模式的深刻内涵。 中图分类号:R-02;R394 文献标识码:A 文章编号:
美推出人类基因组编写计划
本报讯 大约1个月前,科学家在一次秘密会议中提议,通过政府与私人企业合作,从头合成一个完整的人类基因组,这项研究大约需要10年的时间,并且相关的技术开发也将花费数以亿计的美元。6月2日,他们正式对外公布了这一计划。 这项名为“人类基因组编写计划”(HGP-write)的研究的
首个完整人类基因组序列公布
由美国国家人类基因组研究所、加利福尼亚大学圣克鲁斯分校、华盛顿大学等机构研究人员领衔的国际科研团队3月31日公布了首个完整、无间隙的人类基因组序列。与这项重大成果相关的6篇论文当天发表在美国《科学》杂志上。美国国家人类基因组研究所在一份公报中表示,人类基因组含有约30亿个DNA(脱氧核
Science发文探讨人类基因组编辑
2015年4月,来自中山大学的科学家们报告称他们首次完成了对人类胚胎的基因组编辑工作,这一爆炸性新闻一经发布便受到了国内外科学界的广泛关注,并引发了支持者和反对者激烈的辩论。 12月,美国科学院、英国皇家学会和中国科学院联合主持在美国的华盛顿召开了人类基因编辑国际峰会。峰会经过三天的热烈讨论终
最新Science公布人类基因组重组图谱
来自美国国立卫生研究院NIH,美国健康科学统一服务大学等处的研究人员发表了题为“Recombination initiation maps of individual human genomes”的文章,构建出了一张人类基因组中染色体交换遗传信息的详细图谱,这将有助于解析这些位点如何影响人类基因
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
何新建等拟南芥叶酸多聚谷氨酰基化研究获进展
2013年7月23日,北京生命科学研究所何新建实验室在《The Plant Cell》杂志在线发表题为“Folate polyglutamylation is involved in chromatin silencing by maintaining global DNA methyl
中国学者连发Science,GenomeRes参与国际基因组项目
生物通报道:在2001年,人类基因组计划产生了近乎完整的人类DNA。但是研究人员还希望了解这些GS,CS,和TS是如何利用,控制或组织,比它们少得多的编码区域,造就活生生的人。9月,一个聚集了422位科学家的国际团队,在经过十年的努力后,完成了解析基因组剩余部分(非编码区域)的工作,宣布了
中科院发表Cell-Res文章:三维基因组组装重要新机制
来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心,中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章,阐明了染色质架构蛋
测序技术再现新进展,已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术
单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面(例如基因组、表观基因组和转录组)的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系,有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年,Nature Me
单细胞测序技术(single-cell-sequencing)-综述(一)
单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞,得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是,就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样,没有两个细胞是完全相同的。所以,单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以
华东师范大学Nature子刊发布表观遗传重要成果
来自华东师范大学、中科院生物物理研究所等机构的研究人员,提供了令人信服的证据证实H3K9甲基化促进了哺乳动物中的DNA维持性甲基化,但并非是其必要条件。研究结果发布在8月24日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 华东师范大学的翁杰敏(Jiemin Wong)教