从表达谱至海绵机制完美进阶环状RNA测序加机制研究!
禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我们对ALV-J诱导的肿瘤发生机制仍不清楚,导致根除ALV-J带来的损害仍然是一项重大挑战。 近日,云序客户华南农业大学的谢青梅研究团队利用云序生物提供的环状RNA测序、RIP和RNA pull down等技术手段首次揭示了感染了逆转录病毒ALV-J的家禽鸡显著上调的circ-Vav3通过海绵吸附gga-miR-375的作用来上调靶基因YAP1的表达,从而促进肝肿瘤的发生。该研究成果以“Circular RNA Vav3 sponges gga-miR-375 to promote epithelial-mesenchymal t......阅读全文
从表达谱至海绵机制完美进阶-环状RNA测序加机制研究!
禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)
从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(二)
3.gga-miR-373 通过与YAP1的3’UTR区结合负调控YAP1的表达,并且过表达gga-miR-375可减弱EMT生信预测揭示YAP1是gga-miR-375的潜在靶基因,进一步的双荧光素酶报告基因证实了gga-miR-375可通过结合YAP1的3’UTR区抑制YAP1的表达;在体外细胞
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章,影响因子高达7.8分! 文章导读: 在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m
Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制!
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
环状RNA研究文章汇总(一)
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20
又传喜讯云序客户一次测序两项成果影响因子合计10分!
感恩有你,一路同行,新年快乐! 感恩有你,一路同行!2019年伊始,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!一元复始,万象更新!转眼间我们迎来了2019年,站在新时代新的历史起点,回望刚刚过去的2018年,不断创新收获硕果丰盈;展望2019,任重道远却
云序生物环状RNA研究文章汇总
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
文章导读:在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作
云序生物客户发表的首篇吉西他滨耐药胰腺导管癌环状RNA
本篇文章主要研究的药物是吉西他滨,其主要应用于晚期胰腺癌病人的治疗,可是若病人对此类药物产生了耐药反应,那势必会影响患者的生活质量,甚至生命。目前,对于吉西他滨对胰腺癌耐药机制研究尚不明朗。作者首先构建了对吉西他滨耐药细胞系,并通过全转录组测序比较了耐药与正常细胞系之间环状RNA的表达谱。通过生
红斑狼疮性肾炎环状RNA表达及疾病相关性研究
云序生物连续数周频频收到客户捷报,各领域工作全面开花。在10分RNA甲基化文章刚刚发表后,环状RNA研究又陆续有优秀文章发表,我们已连续两周为大家解析云序客户环状RNA研究,包括世界第一篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA研究以及世界第一篇非洲爪蟾环状RNA研究。这周我们为大家带来中国医科大学附属第一
红斑狼疮性肾炎环状RNA表达及疾病相关性研究
在10分RNA甲基化文章刚刚发表后,环状RNA研究又陆续有优秀文章发表,我们已连续两周为大家解析云序客户环状RNA研究,包括世界第一篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA研究以及世界第一篇非洲爪蟾环状RNA研究。这周我们为大家带来中国医科大学附属第一医院周华教授课题组最新工作,环状RNA—CircHLA-C
红斑狼疮性肾炎环状RNA表达及疾病相关性研究
云序生物连续数周频频收到客户捷报,各领域工作全面开花。在10分RNA甲基化文章刚刚发表后,环状RNA研究又陆续有优秀文章发表,我们已连续两周为大家解析云序客户环状RNA研究,包括世界第一篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA研究以及世界第一篇非洲爪蟾环状RNA研究。这周我们为大家带来中国医科大学附属第一
环状RNA研究方法(二)
在此基础上,哪些环状RNA分子发生了差异表达?在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准,一共发现42个环状发生上调,47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章,差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另
环状-RNA-测序案例分析
案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA
1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模
基因表达RNA加工的机制介绍
原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中
非洲爪蟾环状RNA研究成果
作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界第
环状RNA研究文章汇总(二)
4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究(影响因子:3.0)胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%,电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的
环状RNA研究深度剖析(一)
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀青年基金,两
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表!
作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)
2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表!
作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世
外泌体研究深度剖析(二)
案例2:外泌体lncRNA促进肾癌肿瘤细胞耐药性肿瘤学顶级期刊Cancer Cell(IF:27.409)发表文章,阐述了疾病相关lncRNA参与肾癌耐药性及通过外泌体传播的生理机制,将外泌体lncRNA的研究又一次带到了大众视野中。首先作者通过高通量手段检测了野生型细胞和耐药型细胞中差异表达的
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前
环状RNA(circRNA)功能研究又一利器——过表达载体
circRNAs 环状 RNA(circular RNAs,circRNA)是一类具有闭合环状结构的 RNA 分子,早在 20 世纪八十年代即有研究报道,但由于其表达丰度低,文献报道较少,一直被认为是 RNA 转录剪切的罕见错误而被忽视。直到 2012 年开始有研究者开始大批量鉴定 circRN
RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制
环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转