共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能

lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了一种简单有效的方法。 研究背景 烟雾病(MMD)是一种原因不明、慢性进行性的脑血管闭塞性疾病,主要表现为单侧或双侧颈内动脉远端大脑中动脉和大脑前动脉近端狭窄或闭塞伴脑底部和软脑膜烟雾状、细小血管形成。临床表现主要有脑缺血、脑出血及癫痫等。目前对于MMD的发病机理还不清楚,因此,挖掘与MMD发病相关的功能基因有助于MMD的诊断与治疗。本研究从lncRNA和mRNA出发,运用共表达分析方法,挖掘了与MMD相关的lncRNA,为理解lncRNA在MMD中的作用提供了基础。 研究结果 1 MMD特异性差异基因筛选......阅读全文

LncRNA:从分子调控到临床应用的最新成果

  2009年,随着非编码RNA(ncRNA)研究进展的深入,一类新的ncRNA分子—lncRNA掀起科学界的热点话题,并逐渐成为分子生物学及临床医学研究的重要方向。康成生物与美国Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平台,率先开展lncRNA表达筛查服务。Arra

中国大豆基因组公布并发现该基因组组装错误

  大豆是重要的粮食经济作物,为人类提供了主要的油料和蛋白资源。大豆起源于中国,古称“菽”,约在5000年前由其野生种驯化而来,随后广泛传播于世界各地。大豆在引种和改良过程中产生了遗传瓶颈效应,使来自不同主产区的大豆品种间具有显著的遗传变异。目前,我们广泛采用的大豆参考基因组来源于美国品种“Will

关于HLA的生物学功能的介绍

  靶功能  HLAⅠ类抗原分布于所有有核细胞。其抗原特异性在于肽链抗原决定簇的特定氨基酸顺序。这些抗原可被外来物质例如某种病毒或化学物质加以改变,当这些基因产物被改变之后,便成为自身免疫原,成为免疫排除的靶子。可见,耙功能的实质在于“识别自我”,以保证机体的完整性。因此,分布于所有细胞及其多态性这

清华大学首席科学家Cell-Stem-Cell发布lncRNA重要发现

  来自清华大学、中科院动物研究所的研究人员揭示,在多能细胞中Divergent lncRNAs调控了基因表达和谱系分化。这一重要的研究发现发布在3月17日的《细胞干细胞》(Cell Stem Cell)杂志上。  清华大学973项目首席科学家沈晓骅(Xiaohua Shen)是这篇论文的通讯作者。

北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库

  随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构

tca循环生物学功能

tca循环生物学功能1.糖的有氧分解代谢产生的能量最多,是机体利用糖或其他物质氧化而获得能量的最有效方式。  2.三羧酸循环之所以重要在于它不仅为生命活动提供能量,而且还是联系糖、脂、蛋白质三大物质代谢的纽带。  3.三羧酸循环所产生的多种中间产物是生物体内许多重要物质生物合成的原料。在细胞迅速生长

lncRNA表达与RNA的延伸

LncRNA的火热研究已经有几年的时间了,关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后,今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。  长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN

lncRNA的概念及形成过程

 lncRNA,即Long non-coding RNA,你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如,它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外,仅从核苷酸水平上来看,可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC

Science:lncRNA究竟是大咖还是小角色?

  RNA曾被认为只是细胞中的信使分子,后来人们逐渐意识到,RNA具有许多不同的形态和出人意料的功能。近年来,神秘的长非编码RNA(lncRNA)受到了广泛关注,它们的存在是否有意义一直是相关领域的热点话题。  长非编码RNA是长达两百个核苷酸以上的RNA链,此前有研究指出lncRNA与发育、癌症、

LncRNA:从“转录噪声”到科研高地的逆袭

  2002年日本学者Okazaki在对小鼠cDNA文库进行测序时,第一次发现并鉴定了一类较长的转录产物,并将其命名为长链非编码RNA,也就是我们所知的LncRNA。然而在这种非编码RNA被发现后的很长时间里,由于它不参与蛋白质的编码,当时认为不具有生物学功能,科学家们都普遍认为lncRNA仅仅是基

LncRNA:从分子调控到临床应用的最新成果

  2009年,随着非编码RNA(ncRNA)研究进展的深入,一类新的ncRNA分子—lncRNA掀起科学界的热点话题,并逐渐成为分子生物学及临床医学研究的重要方向。康成生物与美国Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平台,率先开展lncRNA表达筛查服务。Arra

科学家发现长链非编码RNA作用新模式

  中国工程院院士、中国医学科学院院长曹雪涛带领课题组发现,长链非编码RNA(lncRNA)可通过直接结合细胞浆中的信号转导蛋白分子并影响其磷酸化的新方式而调控免疫细胞的分化发育与功能。该成果为研究lncRNA发挥生物学效应的作用机制提出了新观点,并为免疫细胞分化发育与功能调控研究提出了新方向。相关

长链非编码-RNA-测序案例分析

背景:人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加,因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的:利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析,探讨其对 mRNA 选择性剪接的

华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本,绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然

概述小胶质细胞的生物学功能

  小胶质细胞具有多突触及可塑性的特点,为中枢神经系统内固有的免疫效应细胞,在中枢神经系统的生理过程中发挥着极其重要的作用。首先,小胶质细胞对于神经系统的正常发育是必需的。在大脑发育的早期阶段,约20%~80%具有长投射轴突的神经元发生凋亡并迅速被清除,激素、神经递质或分泌的蛋白质等细胞外信号可与神

关于γ氨酪酸的生物学功能介绍

  GABA在动植物以及微生物中有较多的发现,其中在1949年首先在马铃薯的块茎中发现,在1950年又在哺乳动物的中枢系统中发现其存在,同时被认为是哺乳动物、昆虫或者某些寄生蠕虫神经系统中的神经抑制剂,对神经元的兴奋程度有着重要的影响。 [2] 研究发现 , GABA 是在人脑能量代谢过程中起重要作

γ氨基丁酸的生物学功能介绍

  GABA在动植物以及微生物中有较多的发现,其中在1949年首先在马铃薯的块茎中发现,在1950年又在哺乳动物的中枢系统中发现其存在,同时被认为是哺乳动物、昆虫或者某些寄生蠕虫神经系统中的神经抑制剂,对神经元的兴奋程度有着重要的影响。 研究发现 , GABA 是在人脑能量代谢过程中起重要作用的活性

概述乳糖酶的生物学功能

  乳糖酶广泛存在于动物、植物和微生物中,根据不同来源可分为胞外酶和胞内酶。乳糖酶的主要功能将人体内过多的乳糖分解成葡萄糖和半乳糖。葡萄糖是人体各部分代谢的能量来源,半乳糖则是人大脑和黏膜组织代谢时必需的结构糖,是婴幼儿脑发育的必要组织,与婴儿大脑的迅速成长有密切联系。再者,乳糖酶还可在人体内通过转

关于冈崎片段的生物学功能介绍

  新合成的DNA,即冈崎片段,由DNA连接酶结合,形成新的DNA链。当DNA合成时,会产生两条链。前导链是连续合成的,并在此过程中被延长,以便用于后滞链(冈崎片段)复制的模板能够暴露出来。在DNA复制过程中,后滞链中的DNA和RNA引物会被去除,方便与冈崎片段的结合。由于这个过程很常见,冈崎片段在

T淋巴细胞的生物学功能

  T细胞是淋巴细胞的主要组分,它具有多种生物学功能,如直接杀伤靶细胞,辅助或抑制B细胞产生抗体,对特异性抗原和促有丝分裂原的应答反应以及产生细胞因子等,是身体中为抵御疾病感染、肿瘤而形成的英勇斗士。T细胞产生的免疫应答是细胞免疫,细胞免疫的效应形式主要有两种:与靶细胞特异性结合,破坏靶细胞膜,直接

T淋巴细胞的生物学功能

T细胞是淋巴细胞的主要组分,它具有多种生物学功能,如直接杀伤靶细胞,辅助或抑制B细胞产生抗体,对特异性抗原和促有丝分裂原的应答反应以及产生细胞因子等,是身体中为抵御疾病感染、肿瘤而形成的英勇斗士。T细胞产生的免疫应答是细胞免疫,细胞免疫的效应形式主要有两种:与靶细胞特异性结合,破坏靶细胞膜,直接杀伤

ATP的基本结构和生物学功能

ATP由3个磷酸基团,一个腺嘌呤核苷组成,在生物体内作为能量货币,主要功能是为细胞的生命活动(DNA复制、转录、翻译等等)提供能量

生物学术语转录物组的功能

转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。

细胞外基质的生物学功能

与细胞外基质有关的信号通路可大致分为两类,从里到外(inside out)及从外到里(outside in)。其中,一种从外到里的信号通路已被证实与细胞增殖有关(Miranti and Brugge, NCB, 2002)。对人类细胞的研究表明,细胞外基质中的纤粘蛋白主要由成纤维细胞、上皮细胞等分泌

简述钙防卫蛋白的生物学功能

  研究显示, 钙卫蛋白具有许多生物学功能:  (1)参与细胞信号传递, 钙卫蛋白是S-100样蛋白;它与细胞骨架的结合依赖于, 这提示它具有细胞内信号传递的功能;  (2)抗微生物活性,Leher [7] 通过动物实验证明钙卫蛋白能够抑制老鼠体内白色念珠菌生长;  (3)免疫调节作用 [8] ; 

核苷酸的主要生物学功能

一类由嘌呤碱或嘧啶碱基、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物,又称核甙酸。五碳糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,4种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷(ATP)、脱氢辅酶等。某些核苷酸的类似物能干扰核苷酸代谢,可

T淋巴细胞的生物学功能

  T细胞是淋巴细胞的主要组分,它具有多种生物学功能,如直接杀伤靶细胞,辅助或抑制B细胞产生抗体,对特异性抗原和促有丝分裂原的应答反应以及产生细胞因子等,是身体中为抵御疾病感染、肿瘤而形成的英勇斗士。T细胞产生的免疫应答是细胞免疫,细胞免疫的效应形式主要有两种:与靶细胞特异性结合,破坏靶细胞膜,直接

为国产优异大豆品种培育奠定基础-中黄13基因组发布

  中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《

中国大豆“中黄13”基因组发布

  中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《

大豆“中黄13”基因组发布-为国产优异大豆品种培育定基础

中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《中国