共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能

lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了一种简单有效的方法。 研究背景 烟雾病(MMD)是一种原因不明、慢性进行性的脑血管闭塞性疾病,主要表现为单侧或双侧颈内动脉远端大脑中动脉和大脑前动脉近端狭窄或闭塞伴脑底部和软脑膜烟雾状、细小血管形成。临床表现主要有脑缺血、脑出血及癫痫等。目前对于MMD的发病机理还不清楚,因此,挖掘与MMD发病相关的功能基因有助于MMD的诊断与治疗。本研究从lncRNA和mRNA出发,运用共表达分析方法,挖掘了与MMD相关的lncRNA,为理解lncRNA在MMD中的作用提供了基础。 研究结果 1 MMD特异性差异基因筛选......阅读全文

lncRNA在农业领域的研究成果

  miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦   你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题

如何研究lncRNA?三位科学家现身说法

  人生如戏,相信长链非编码RNA(lncRNA)也体会到了。之前一直遭冷遇,如今却是万人迷。其实,人类及其他哺乳动物的基因组转录了数万条lncRNA。根据GenCode数据库中最新版本的数据,人类基因组中包含16,000条lncRNA,产生了近28,000条转录本。再加上其他数据库的数据,目前已知

著名遗传学家Nature发表lncRNA重要发现

  长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生

著名遗传学家Nature发表lncRNA重要发现

长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学

源资信息科技:数据挖掘和通路分析专家

  2010年全国质谱大会暨第三届世界华人质谱研讨会于2010年7月30日~8月1日期间在吉林长春顺利召开,源资信息科技(上海)有限公司在此次大会上主要向与会者介绍了高级化学分析软件(ACD/labs)及系统生物学中的GeneGo软件,引起了与会专家、参会代表及各大仪器厂商的极大兴趣。

同济大学Nature子刊揭示驱动蛋白作用机制

  来自同济大学生命科学与技术学院,法国国家科研中心LEBS实验室的研究人员发表了题为“Structure of a kinesin–tubulin complex and implications for kinesin motility”的文章,首次精确阐明了驱动蛋白与微管蛋白的相互作用

我国学者利用SMRT、HiC等技术破解大豆Gmax_ZH13基因组

  大豆是重要的粮食经济作物,为人类提供了主要的油料和蛋白资源。大豆起源于中国,古称“菽”,约在5000年前由其野生种驯化而来,随后广泛传播于世界各地。大豆在引种和改良过程中产生了遗传瓶颈效应,使来自不同主产区的大豆品种间具有显著的遗传变异。目前,我们广泛采用的大豆参考基因组来源于美国品种“Will

多物种转录图谱综合数据库已对用户免费开放

  随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构

挖掘玉米“高产基因”

玉米的单株产量由玉米的每穗籽粒数目和穗粒重共同决定,挖掘控制玉米产量的“高产基因”,解析穗行数调控网络,可使玉米单产得到大幅度提高,对保障国家粮食安全有重大价值和现实意义。在国家自然科学基金重大研究计划“主要农作物产量性状的遗传调控网络解析”支持下,在山东农业大学教授张宪省等责任专家指导下,研究人员

要说糖蛋白的生物学功能

  (1)糖蛋白携带某些蛋白质代谢去向的信息。糖蛋白寡糖链末端的唾液酸残基,决定着某种蛋白质是否在血流中存在或被肝脏除去的信息。  A.脊椎动物血液中的铜蓝蛋白。肝细胞能降解丢失了唾液酸的铜蓝蛋白,唾液酸的消除可能是体内“老”蛋白的标记方式之一。  B.红细胞。新生的红细胞膜上唾液酸的含量远高于成熟

植酸酶的生物学功能

2.1、促进植酸在机体内的分解,提高营养物质的利用率植酸酶具有水解植酸的功能,在机体内首先通过把植酸分解成肌醇磷酸酯,然后经酸性磷酸酶再将肌醇磷酸酯彻底地分解成肌醇和磷酸。具体的作用过程为将植酸分子上的磷酸基团逐个切下,形成中间产物IP5、IP4、IP3、IP2、IP,最终产物为肌醇和磷酸。植酸酶在

核苷酸的生物学功能

核苷酸类化合物具有重要的生物学功能,它们参与了生物体内几乎所有的生物化学反应过程。现概括为以下五个方面:① 核苷酸是合成生物大分子核糖核酸 (RNA)及脱氧核糖核酸(DNA)的前身物,RNA中主要有四种类型的核苷酸:AMP、GMP、CMP和UMP,这四种类型的核苷酸从头合成前身物是磷酸核糖、氨基酸、

核苷酸的生物学功能

核苷酸类化合物具有重要的生物学功能,它们参与了生物体内几乎所有的生物化学反应过程。现概括为以下五个方面:① 核苷酸是合成生物大分子核糖核酸 (RNA)及脱氧核糖核酸(DNA)的前身物,RNA中主要有四种类型的核苷酸:AMP、GMP、CMP和UMP,这四种类型的核苷酸从头合成前身物是磷酸核糖、氨基酸、

植酸酶的生物学功能

促进植酸在机体内的分解,提高营养物质的利用率植酸酶具有水解植酸的功能,在机体内首先通过把植酸分解成肌醇磷酸酯,然后经酸性磷酸酶再将肌醇磷酸酯彻底地分解成肌醇和磷酸。具体的作用过程为将植酸分子上的磷酸基团逐个切下,形成中间产物IP5、IP4、IP3、IP2、IP,最终产物为肌醇和磷酸。植酸酶在水解植酸

Wnt信号通路的生物学功能

多细胞生物体轴分化过程中起重要作用经典的Wnt-β-catenin信号通路是这样的:在没有Wnt配体,通路中的每一种蛋白都正常表达时,Axin 会结合β-catenin , Axin同时已结合有GSK3和APC ,于是GSK3就可以磷酸化β-catenin ,β-catenin接着能够被APC复合物

寡糖链的生物学功能

  糖链作为撮合蛋白质的辅基,一般都少于15个单糖,因此也称为寡糖链。寡糖链的结构非常多,其可以与核酸和蛋白质相比较。糖链是由人体细胞中各种糖连接而成的链状物质,是糖脂质和糖蛋白质的组成部分,人体内共有数百种糖链。  寡糖链对糖蛋白的抗原性、生物活性、溶解性、热稳定性和抗蛋白水解酶的能力均有很大影响

植酸酶的生物学功能

1、促进植酸在机体内的分解,提高营养物质的利用率植酸酶具有水解植酸的功能,在机体内首先通过把植酸分解成肌醇磷酸酯,然后经酸性磷酸酶再将肌醇磷酸酯彻底地分解成肌醇和磷酸。具体的作用过程为将植酸分子上的磷酸基团逐个切下,形成中间产物IP5、IP4、IP3、IP2、IP,最终产物为肌醇和磷酸。植酸酶在水解

寡糖链的生物学功能

  寡糖链对糖蛋白的 抗原性、生物活性、溶解性、热稳定性和抗蛋白水解酶的能力均有很大影响,其让我们分出了A,B,AB,O血型 细胞外基质 糖蛋白,含水丰富,润滑,细胞附着。 细胞膜上的糖蛋白可以起到抗原的作用 识别,如MHC抗原,柱头与花粉。

乳糖酶的生物学功能

乳糖酶广泛存在于动物、植物和微生物中,根据不同来源可分为胞外酶和胞内酶。乳糖酶的主要功能将人体内过多的乳糖分解成葡萄糖和半乳糖。葡萄糖是人体各部分代谢的能量来源,半乳糖则是人大脑和黏膜组织代谢时必需的结构糖,是婴幼儿脑发育的必要组织,与婴儿大脑的迅速成长有密切联系。再者,乳糖酶还可在人体内通过转糖苷

糖蛋白的生物学功能介绍

  携带蛋白质代谢去向信息  糖蛋白寡糖链末端的唾液酸残基,决定着某种蛋白质是否在血流中存在或被肝脏除去的信息。  A.脊椎动物血液中的铜蓝蛋白。肝细胞能降解丢失了唾液酸的铜蓝蛋白,唾液酸的消除可能是体内“老”蛋白的标记方式之一。  B.红细胞。新生的红细胞膜上唾液酸的含量远高于成熟的红细胞膜。用唾

白三烯的生物学功能

【生物学功能】:使毛细血管和微静脉通透性增加,造成局部水肿。

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(二)

2. GC细胞中FOXD2-AS1富集高的患者预后较差在芯片数据GSE51575基础上,以正常组织作为对照,来评估FOXD2-AS1的诊断效果。ROC曲线下面积为0.919(95%置信区间[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001);特异性和敏感性分别为0.885和0.885。

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)

近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu

lncRNA在农业领域的研究成果(三)

【结论】①通过lncRNA测序,在上万条白菜中候选的lncRNA中挑出了1,300余条与花粉授粉相关的lncRNAs。分析结果显示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整个发育过程中持续表达,其余的部分为阶段、部位特异性表达。lncRNA在白菜不同发育阶段花蕾种的表达呈现出较明显的差异,在V级花蕾中特异

第二军医大Nature子刊发表lncRNA新发现

  长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。  在测序技术的帮助下人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的

ncRNA在精子发生过程中的关键作用研究

Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage comp

第二军医大学Hepatology聚焦lncRNA

  来自第二军医大学的研究人员在新研究中证实,在肝再生过程中一种称之为lncRNA-LALR1(Long noncoding RNAs associated with liver regeneration 1)的长链非编码RNA通过激活Wnt/β-Catenin信号促进了肝细胞增殖。相关论文

长链非编码RNA与淋巴瘤

  类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废

墨兰花朵性状分子标记和功能基因挖掘研究获进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/511088.shtm

Genome-Research丨lncRNA在精子发生过程中的关键作用

  Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用   一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage co