DS解决方案——抗体人源化设计/基于胰岛素肽的设计和筛选

来源:计算模拟平台 通过Discovery Studio中的Antibody Modelling, Predict Humanizing Mutations模块对鼠源抗体进行人源化。DS中的Predict Humanizing Mutations模块会寻找人的Germline序列,对比各位点氨基酸在人源中出现的频率给出相应的突变位点信息,结合抗体结构选择相应氨基酸进行设计改造。 方案详情 抗体人源化主要指异源单克隆抗体以基因克隆及DNA重组技术改造,重新表达的抗体,其大部分氨基酸序列为人源序列取代,基本保留亲本单克隆抗体的亲和力和特异性,又降低了其免疫源性,有利应用于人体。Discovery Studio中专门的抗体人源化模块可以快速准确的进行异源抗体人源化的设计。本项目即通过DS中的Antibody Modelling, Predict Humanizing Mutations模块对一条鼠源抗体进行人源化......阅读全文

DS解决方案——抗体人源化设计/基于胰岛素肽的设计和筛选

  来源:计算模拟平台   通过Discovery Studio中的Antibody Modelling, Predict Humanizing Mutations模块对鼠源抗体进行人源化。DS中的Predict Humanizing Mutations模块会寻找人的Germline序列,对比各位

抗体人源化设计/基于胰岛素肽的设计和筛选

实施效果来源:计算模拟平台通过Discovery Studio中的Antibody Modelling, Predict Humanizing Mutations模块对鼠源抗体进行人源化。DS中的Predict Humanizing Mutations模块会寻找人的Germline序列,

DS在药物设计领域基于阻碍FLFLT3相互作用的抑制剂筛选

  通过Discovery Studio软件和Pipeline Pilot软件虚拟筛选出针对FMS样酪氨酸激酶3受体(FLT3)的抑制剂小分子,该小分子结构新颖,并具有较强的抑制效果,其IC50为18 μM。   方案详情   外周神经性疼痛(PNP)是一种比较难治疗的慢性疾病。背脊髓相

人源化抗体的目的

主要目的是减少抗体的异源性,以利于临床应用。(一)嵌合抗体 从杂交瘤细胞中分离出功能性可变区基因,与人Ig恒定区的基因连接,构建鼠-人嵌合质粒载体,转染宿主细胞,表达鼠-人嵌合抗体。(二)改形抗体 将人抗体可变区中互补决定簇(CDR)序列改换成鼠源单抗CDR序列。重构成既具有鼠源性单抗的特异性又保持

人源化抗体嵌合抗体的基本介绍

  嵌合抗体是利用DNA重组技术,将异源单抗的轻、重链可变区基因插入含有人抗体恒定区的表达载体中,转化哺乳动物细胞表达出嵌合抗体,这样表达的抗体分子中轻重链的V区是异源的,而C区是人源的,这样整个抗体分子的近2/3部分都是人源的。这样产生的抗体,减少了异源性抗体的免疫原性,同时保留了亲本抗体特异性结

关于人源化抗体的改型抗体的介绍

  改型抗体也称CDR植入抗体(CDRgraftingantibody),抗体可变区的CDR是抗体识别和结合抗原的区域,直接决定抗体的特异性。将鼠源单抗的CDR移植至人源抗体可变区,替代人源抗体CDR,使人源抗体获得鼠源单抗的抗原结合特异性,同时减少其异源性。然而,抗原虽然主要和抗体的CDR接触,但

人源化抗体知识点

主要目的是减少抗体的异源性,以利于临床应用。(一)嵌合抗体 从杂交瘤细胞中分离出功能性可变区基因,与人Ig恒定区的基因连接,构建鼠-人嵌合质粒载体,转染宿主细胞,表达鼠-人嵌合抗体。(二)改形抗体 将人抗体可变区中互补决定簇(CDR)序列改换成鼠源单抗CDR序列。重构成既具有鼠源性单抗的特异性又保持

Discovery-Studio-在生物领域的应用解决方案

Discovery Studio 在生物药物领域的应用解决方案核酸、抗体、多肽等这些生物药物,因其有着药效高、副作用小、作用目标明确等等特点,一直受到国内外研究者的关注。基因工程、蛋白质工程的发展,极大地促进了生物药物的研究与开发,使之成为医药研究领域的一个重要方面,并代表着医药产品发展的方向。而

HuTech—快速智能的抗体人源化解决方案

   传统的同源建模技术对抗体进行人源化改造,主要是基于蛋白质一级结构的相似性同时结合已有的蛋白质晶体结构进行同源模拟。现有的多种同源建模技术大部分都没有对已有的抗体序列数据进行分析,在人源化改造过程中存在突变位点不确定的问题,同时抗体特性如表达水平、关键氨基酸的后期修饰预测等无法提前预知。  

HuTech——快速智能的抗体人源化解决方案

传统的同源建模技术对抗体进行人源化改造,主要是基于蛋白质一级结构的相似性同时结合已有的蛋白质晶体结构进行同源模拟。现有的多种同源建模技术大部分都没有对已有的抗体序列数据进行分析,在人源化改造过程中存在突变位点不确定的问题,同时抗体特性如表达水平、关键氨基酸的后期修饰预测等无法提前预知。 利用噬菌体展

基因编辑鼠的构建-Guide-RNA设计和筛选

众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同

基于FPGA和TFT彩屏液晶的便携示波器设计

  本系统设计了以FPGA为核心采集模块,以单片机为显示控制核心,以TFT彩屏液晶为显示器件的便携数字存储示波器。    FPGA与高速A/D获取波形采样数据,通过单片机完成彩屏的初始化;    合理设计出单片机与FPGA通信的总线握手协议,配合异步FIFO作为数据缓冲模块,实现了边采集边显示的

详述单克隆抗体技术的类型人源化抗体

  1.改形抗体  1986年,Jones等人成功构建了第一个改形抗体,又称CDR移植抗体和人源化抗体,指将鼠单抗可变区中互补决定区(CDR)序列取代人源抗体相应CDR序列,重组构成既具有鼠源性单抗特异性,又保持人抗体亲和力的CDR移植抗体。迄今为止,已有100多种鼠单抗通过CDR移植得到了人源化。

蛋白质库的设计和筛选概率计算实验

在设计蛋白质库进行筛选时,在能够进行筛选的物理极限内我们必须尽一切可能产生出蛋白质变体的多样性。本章的目标是将概率的语言引入蛋白质工程实验中,进而来回答一些常见的问题。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验步骤此节主要分为两个子节。在 3.1 节中,我们提出

蛋白质库的设计和筛选—概率计算实验

此节主要分为两个子节。在 3.1 节中,我们提出与库的设计与表征相关的问题。在 3.2 节中,我们分析评价库的质量或者库的筛选结果的显著性。在前两节中,我 们给出了公式以及提供了数值范例,用示例来加以说明而没有给出详细的理论解释。完整的理论说明可以在注释(见 8.4 节)中找到。3.1 库表

蛋白质库的设计和筛选概率计算实验

蛋白质库的设计和筛选---概率计算             实验步骤 此节主要分为两个子节。在 3.1 节中,我们提出与库的设计与

关于人源化抗体的基本信息介绍

  人源化抗体主要指鼠源单克隆抗体以基因克隆及DNA重组技术改造,重新表达的抗体,其大部分氨基酸序列为人源序列取代,基本保留亲本鼠单克隆抗体的亲和力和特异性,又降低了其异源性,有利应用于人体。  人源化抗体就是指抗体的恒定区部分(即CH和CL区)或抗体所有全部由人类抗体基因所编码。人源化抗体可以大大

基于表位的疫苗设计的概念

中文名称基于表位的疫苗设计英文名称epitope-based vaccine design;EBVD定  义一种制备疫苗的新型策略。即基于已知核苷酸或氨基酸序列,利用计算机软件辅助分析,或利用噬菌体展示技术,确定和筛选可能的优势表位,然后人工合成或借助基因工程技术而制备含优势表位的多肽疫苗。应用学科

抗原肽设计的基本原则

为了使生产抗体获得最佳效果,仔细地设计抗原肽是很有必要的,设计应满足一个基本条件:在免疫过程中,该抗原既不会产生过强的免疫反应,同时又能产生出对感兴趣的蛋白有结合能力的抗体。尽管抗原肽设计是一个很复杂的课题,但是有几点关键的基本设计原则可以提供给大家参考:1、确定抗体的用途(应用)新开展一个研究项目

关于表面重塑抗体和全人源化抗体的介绍

  一、表面重塑抗体  表面重塑抗体是指对异源抗体表面氨基酸残基进行人源化改造。该方法的原则是仅替换与人抗体SAR差别明显的区域,在维持抗体活性并兼顾减少异源性基础上选用与人抗体表面残基相似的氨基酸替换;另外,所替换的区段不应过多,对于影响侧链大小、电荷、疏水性,或可能形成氢键从而影响到抗体互补决定

基于序列的药物设计新方法

  20世纪90年代以来,基于蛋白质结构的药物设计(SBDD)一直是创新药物发现的主流方法,在针对具有明确靶标的疾病治疗方面取得了进步。这种方法一般涉及多个步骤的复杂流程,包括建立蛋白质的三维(3D)结构,识别潜在的配体结合位点,并通过虚拟筛选或全新设计发现活性化合物等。SBDD流程中的每个步骤都有

基于Zigbee的土壤墒情监控系统设计

0 引言随着全球水资源供需矛盾的日益加剧, 节水农业已成为当今具有世界意义的焦点问题之一,世界各国都十分重视发展节水农业。以色列、日本、美国等国家都已采用先进的节水灌溉制度。通过采用遥感、 遥测监测土壤墒情和作物生长等新技术, 对灌溉区用水进行监测预报, 实现灌溉区水资源的动态管理, 不但成功地提高

基于DSP和ARM的激光粒度仪关键电路设计

激光粒度仪是一种最先进的、最具有广泛发展前景的粒度测量仪器,它的测量原理基于米氏(Mie)散射理论。Mie散射理论是一个经典的光散射理论,它最大的特点是可用于任何尺寸段颗粒的测量,但它的计算相当复杂限制了数据处理速度及精度。DSP技术实现MIE散射算法有很多优点:它是专为算法计算而设计的专用CPU,

基于DSP和ARM的激光粒度仪关键电路设计

   激光粒度仪是一种最先进的、最具有广泛发展前景的粒度测量仪器,它的测量原理基于米氏(Mie)散射理论。Mie散射理论是一个经典的光散射理论,它最大的特点是可用于任何尺寸段颗粒的测量,但它的计算相当复杂限制了数据处理速度及精度。  DSP技术实现MIE散射算法有很多优点:它是专为算法计算而设计的专

DS在抗体-人/鼠PD1交叉反应抗体的发现和结合机制的研究

  实施效果   通过Discovery Studio软件预测了人/鼠PD-1交叉反应抗体的结合模式,并辅助以实验验证,从而精细解释了具有人/鼠交叉反应抗体的交叉反应性机制,为后续PD-1抗体研发做出指导。   方案详情   程序性死亡受体1(PD-1)是一种重要的免疫抑制受体分子,以

大剂量热天平基于DSP的设计浅谈

 大剂量热天平是在程序温度控制下测量试样的重量随温度变化的一种热分析仪器。其结构简洁,安装调试方便,主要由天平主机、加热炉、微机温控单元、天平放大单元、微分单元、接口单元、气氛控制单元和微机、打印机组成。  大剂量热天平可用来测定金属络合物的降解、煤的成分、物质脱水、分解和聚合物的氧化诱导期、催化剂

大剂量热天平基于DSP的设计浅谈

  大剂量热天平是在程序温度控制下测量试样的重量随温度变化的一种热分析仪器。其结构简洁,安装调试方便,主要由天平主机、加热炉、微机温控单元、天平放大单元、微分单元、接口单元、气氛控制单元和微机、打印机组成。  大剂量热天平可用来测定金属络合物的降解、煤的成分、物质脱水、分解和聚合物的氧化诱导期、催化

基于自编程功能的MCU-Bootloader设计(一)

       Bootloader是在单片机上电启动时执行的一小段程序。也称作固件,通过这段程序,可以初始化硬件设备、建立内存空间的映射图,从而将系统的软硬件环境带到一个合适的状态,以便为最终调用应用程序准备好正确的环境。  Boot代码由MCU启动时执行的指令组成。这里的loader指向MCU的F

基于自编程功能的MCU-Bootloader设计(二)

  3)复位启动后,MCU看到交换标志位被清零。又从交换引导簇0处开始执行。这样就完成了boot程序自身的升级。即使在升级过程中遇到断电等异常情况,在重新上电后也能重新完成Boot程序升级。有效地防止在升级过程中出现断电等等异常情况而导致升级失败,MCU无法启动的问题,使Boot程序的升级变

仪器仪表设计的现代化和智能化研究

   随着智能化、数字化仪器仪表的发展,以及我国改革开放政策的深化,近年来我们引进了大批的国际上高水平的仪器仪表,进口数量也在逐年增加。这不仅对国内测量仪器的设计研制、元器件、生产工艺带来很大的冲击,更是对我国仪器仪表的设计理论和制造方法的巨大震动。事实上,对比我国的仪器仪表现状,国外许多先进的智能