cDNA的制备与检测
[实验原理]总RNA，经寡聚(d丁)纤维素亲和层析柱分离出mRNA，以寡聚(d丁)为引物，经反转录合成双链cDNA。先用反转录酶合成第一条cDNA链；经碱降解作用除去RNA模板后用大肠杆菌DNA聚合酶，以第一条链cDNA的3’末端结构为引物合成第二链，最后形成双链cDNA。[仪器、材料与试剂](一)仪器和材料紫外线透射仪、移液枪、琼脂糖凝胶电泳系统(二)试剂特异引物、逆转录试剂盒[实验步骤]（一）cDNA的合成1、取约9uL mRNA，依次加入：第一链缓冲液4uL，RNA酶抑制剂1 uL，Oligo(dT)引物2uL，dNTP混合液2uL AMV逆转录酶2uL，混匀，离心10min，42℃水浴1h。2、在冰上于第一链反应产物中，加入以下试剂：第二链缓冲液然40uL，RNA酶H 1uL，大肠杆菌DNA聚合酶5uL，DEPC处理过的水至100uL，混匀，离心10s，12℃、22℃、65℃水浴各1h。3、加入T4DNA聚合酶，振荡混匀......阅读全文
cDNA的筛选2
（三）免疫筛选制备Sepharose偶联细菌裂解液1.各用一个E.coli温度敏感溶源菌株（BTA 282（λgt11amp3）或BNN 97）单菌落接种于2×7.5ml培养基并于32℃生长过夜。2.过夜培养物用LB培养基稀释100倍，于32℃生长至OD600值为0.5。3.于45℃温育15min诱
丁酸的制备与生产
丁酸天然存在于香茅、肉豆蔻、奶油等，工业生产的方法有发酵法和丁醇(或丁醛)氧化。 发酵法：以淀粉或糖为原料，用丁酸菌发酵得丁酸。 丁醛氧化法：以醋酸锰或醋酸钴为催化剂，用空气或氧气氧化丁醛，反应结束后，经分馏得丁酸。 浓硝酸氧化法(实验室制备)：以正戊醇为原料，用浓硝酸将其氧化成正丁酸。将
cDNA合成技术
实验材料RNA试剂、试剂盒α32PdNTPmRNA甲基氢氧化汞β-巯基乙醇RNase抑制剂引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆转录酶EDTA酚-氯仿乙醇琼脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1仪器、耗材SephadexG-100离心柱层析离心管恒温水浴锅电泳仪低温离心机实验步骤
Library－cDNA－Synthesis
Library cDNA Synthesis1° cDNA SynthesisN.B: During 1° cDNA synthesis, all steps should be carried while wearing gloves and all solutions should either
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇 dNTP 随机引物 来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin 反转录缓冲液
cDNA文库构建
cDNA文库[原理]：cDNA文库不同于基因组文库，被克隆DNA是从mRNA反转录来源的DNA。CDNA组成特点是其中不含有内含子和其他调控序列。从而做cDNA克隆时应是先从获得mRNA开始，在此基础上，通过反转录酶作用产生一条与mRNA相互补的DNA链，然后除掉mRNA，以第一条DNA链为模板复制
CDNA文库筛选
（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1．用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2．将过夜培养物以3000×g离心5min。3．分别用2ml λ-dil（10 mmol/L tris-Cl,
cDNA/AFLP－Protocol
Preparation of Para-magnetic beads from Promega cat#Z5482:a) suspend magnetic particles in bottle - transfer 200 ul (200 ug) of beads per sampleof RNA
cDNA合成技术
实验材料 RNA 试剂、试剂盒 α32PdNTP mRNA 甲基氢氧化汞 β-巯
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品RNasin反转录缓冲液仪器、耗材PCR 管子热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物（20~40U/ml)(1034731，RocheApplied
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin反转录缓冲液仪器、耗材 PCR 管子 热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物（20~40U/ml)(1034731，RocheAp
如何获得cDNA
cDNA的获取方法：1.用亲和层析法得到 mRNA 后，根据 mRNA 分子的 3' 端有 poly (A) 尾结构的原理，用 12~20 个核苷酸长的 oligo 与纯化的 mRNA 混合， oligo （ dT ）会与 poly (A) 结合作为反转录酶的引物，随机引物法合成的产物也是
cDNA文库构建
cDNA文库构建 实验方法原理 cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部 mRNA 经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。
Screening－a－cDNA－Library
Screening a cDNA Libraryfor use with HybriZAP zebrafish cDNA librariesObjectivecDNA library screening allows detection of expressed genes for subseque
cDNA文库构建
实验方法原理 cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部 mRNA 经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。经典 cDNA 文库构建的基本原理是用 Oligo(dT) 作逆转录引物，或者用随机引物，给所合成的 cDNA 加上适当的连接接头，连接到适当的载体中获得文库。其基
cDNA－LIBRARY－SCREENING
PREPARE SOLUTIONS1. 10mM MgSO4, 0.2% Maltose LB (100 mL):Mix 1.0 g of Bacto-Tryptone, 1.0 g of NaCl, 0.5 g of Yeast Extract, and 1.0 mL of 1M MgSO4. A
cDNA合成技术
实验材料 RNA试剂、试剂盒 α32PdNTPmRNA甲基氢氧化汞β-巯基乙醇RNase抑制剂引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆转录酶EDTA酚-氯仿乙醇琼脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1仪器、耗材 SephadexG-100离心柱层析离心管恒温水浴锅电泳仪低温离心机实
CDNA文库筛选
CDNA文库筛选（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1．用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2．将过夜培养物以3000×g离心5min。3．分别用2ml λ-dil（10 mmol/L
cDNA文库构建
cDNA文库构建可以：（1）用于分离全长基因进而开展基因功能研究；（2）筛选目的基因并直接用于表达；（3）提供构建分子标记连锁图谱的所用探针。实验方法原理cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部 mRNA 经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。经典 cDNA 文库构建
cDNA文库组标准流程三:cDNA双链合成
1. Superscipt II—RT合成第一链:1. 在一RNase-free的0.2ml PCR管中,加入 xul mRNA(大约500ng) 1ul Xho I Primer(1.4ug/ul) (5’ GAGAGAGAGAGAGAG
cDNA文库组标准流程八:pBlueScript－cDNA库扩增
1．试剂及配方：2 x LB （1升）： 20g 氯化钠 20g 蛋白提取物 10g 酵母提取物 加入蒸馏水至1升，用NaOH调pH值至7.0，高压灭菌2 x LB－甘油（12.5%）（200ml）175ml 2 x LB液体2
cDNA文库的构建3
接头-衔接子与cDNA的连接8.将下列试剂加入到已削成平末端的DNA中：10×T4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液 2μl800~1000 ng 的磷酸化接头或衔接子 2μlT4噬菌体DNA连接酶（105 Weiss单位/ml） 1μl10 mmol/L ATP 2μl混匀后，在16℃温育8~12h。9
cDNA文库的构建2
10. Sephadex G-50用含有10 mmol/L NaCl的TE(pH7.6)溶液进行平衡，然后通过离子柱层析将未掺入的dNTP和 cDNA分开。11. 加入0.1倍体积的3mol/L乙酸钠（pH5.2）和2倍体积的乙醇，沉淀柱层析洗脱下来的cDNA，将样品置于冰上至少15分钟，然后在微量
cDNA－文库的构建（二）
7. 尽可能快地进行 cDNA 合成的下一步骤阶段 2:cDNA 第二链的合成材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿EDTA(0.5mol/LpH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)(NH4)2SO4(1mol/L)将 1.3 g 固体硫酸铵溶解于终体积为 10 ml 的水中，溶液经滤膜过滤
cDNA－文库的构建（一）
实验材料 λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒 放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶RNase 抑制剂用于 cDNA 合成的寡核苷酸引物poly(A)+RNA[a-32P]dCTPEDTA乙醇(NH4)2SO4β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸T4
cDNA－文库的构建2
阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液（选用)如希望，可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)
cDNA文库的构建1
分为六个阶段：阶段1：反转录酶催化合成cDNA第一链阶段2：cDNA第二链的合成阶段3：cDNA的甲基化阶段4：接头或衔接子的连接阶段5：Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA阶段6：cDNA与λ噬菌体臂的连接 [阶段1：反转录酶催化合成cDNA第一链] 1.在置于冰上的无菌微
cDNA－文库的构建3
阶段 5:SepharseCL-4B 凝胶过滤法分离 cDNA材料缓冲液和溶液乙醇乙酸钠（3 ml/L,pH5.2)TE(pH7.6)含 0.1mol/LNaCl 的 TE(pH7.6)Tris-HCl(1mol/L,pH8.0)凝胶琼脂糖凝胶（1%)见步骤 8。核酸和寡核苷酸cDNA阶段 4 中步
关于cDNA文库的简介
cDNA文库（cDNA library）：是指某生物某一发育时期所转录的mRNA全部经反转录形成的cDNA片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。 cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板，逆转录形成的互补DNA（cDNA）与适当的载体（常用噬菌体或质粒载体）连接后转化受体菌形成重组DNA
cDNA文库的物化方法
基因工程初始阶段所用的方法，已不用。利用核酸双螺旋之间存在着碱基G C，A T配对特性，分离目的基因。 例如：海胆rDNA分子内其G C含量可以达63%（其稳定性高，溶解温度高），通过热变性和S1酶解处理可得到提纯50倍的rDNA，最后经氯化铯平衡梯度离心，得到相对分子量为1.9X107Dal