高通量快速验证miRNA靶基因

尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译,具体作用机制可分为两种:一种是降解目标mRNA从而达到阻止其翻译的目的,另一种则是直接抑制mRNA的翻译过程。为了了解细胞中基因的真正生物学意义,研究人员往往会使用很多microRNA分子来沉默细胞中大量的mRNA表达,有时候这些被沉默基因的数目甚至比所使用的microRNA数目还要多。而现在使用的计算机预测靶基因技术还不够成熟,非常容易出错。鉴于此,去年人们开始使用一种新型的大规模验证方法,即在硅片上进行microRNA靶基因验证的“湿试验(真正的试验而不是用计算机模拟的“干”试验)”。由于采用了这种方法,研究人员在2008年取得......阅读全文

快速灵敏-让-miRNA-无处可逃

miRNA 是一种既可爱又可恨的小东西,它们深居简出,它们飘忽不定,它们似乎总是在和我们捉迷藏,当我们费尽力气以为即将要将它们掌控的时候,它却又顽皮的从我们的指缝中溜走,而我们却又毫无办法。同学莫怕,TIANGEN 即将上市的最新产品 miRcute 增强型 miRNA cDNA 第一链合成试

世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表!

  作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(三)

2) miRNA的靶基因预测方法 miRNA的研究意义之重大是毋庸置疑的。然而,与新的miRNA的频频发现相比,miRNA的功能研究相对缓慢。到目前为止,在发现的4449多个miRNA中,确定功能的miRNA仅有几十个。导致miRNA功能研究进展缓慢的非常重要的原因是miRNA的作用靶标难以确定。事

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

  在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另

江苏农科院:miRNA调控茄科抗盐胁迫

  茄科包括许多重要的蔬菜作物,它们经常遭受盐胁迫。microRNA(miRNA)已被发现参与调控植物的基因表达来应答盐胁迫。然而,几乎没有关于茄科植物miRNA参与此类应答的报道。由江苏省农业科学院蔬菜研究所庄勇副研究员领衔的课题组采用小RNA测序技术对此展开了深入分析,研究成果发表在近期的Int

如何设计miRNA-mimics

miRNA mimic能模拟细胞中内源性成熟miRNA的高水平表达,以增强内源性miRNA的调控作用,是miRNA功能研究的一大利器。miRNA mimic是一种简单高效的miRNA研究工具,只需用转染试剂包裹即可转染进入细胞,无需构建载体的繁琐操作,无需病毒防护方面的担忧,用转染对照即可观察其转染

miRNA调控植物对镉的应激反应

土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题,主要是由于一些人为活动,如采矿,工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉(Cd)可以很容易地被植物吸收,从而导致各种中毒症状,如降低生物量,叶片失绿,抑制根系生长,发生形态学改变,甚至植株死亡。大量研究表明,在植物中,microRNA(miRNA)参与

华南农大:miRNA调控植物对镉的应激反应

   土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题,主要是由于一些人为活动,如采矿,工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉(Cd)可以很容易地被植物吸收,从而导致各种中毒症状,如降低生物量,叶片失绿,抑制根系生长,发生形态学改变,甚至植株死亡。大量研究表明,在植物中,microRNA(miRNA

BBRC.:RNA干扰白细胞介素推进癌症治疗新研究

        近日,中山大学第一附属医院研究者采用锐博生物的siRNA(RiboBio)沉默白细胞介素表达的新研究中,揭示了调控白细胞介素,能提升乳腺癌细胞存活率,并能显著增加癌细胞对多烯紫杉醇化学药物的敏感性,提升抗癌药物疗效。相关研究发表在Biochemical and Biophysical

小分子RNA(miRNA)简介

一、什么是小分子RNA( MicroRNA)?    MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary transcrip

miRNA-mimics-miRNA-inhibitor

miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已经成功应用于沉默预期靶

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

RIP技术简介

由于miRNA被发现在癌症机理中起重要的作用,尤其是与肿瘤转移相关联,因此对于miRNA的研究来说,最让人兴奋的是有希望应有于癌症治疗中的RNA 抑制疗法或模拟miRNA表达疗法,尤其是对于出现肿瘤转移的癌症病人的治疗。但是miRNA具有成百上千个靶标,所以要完全理解一个miRNA和靶标的特异性反应

芯片和降解组测序揭示掌叶半夏miRNAs新信息

掌叶半夏(Pinellia pedatisecta)是中医中最重要的中草药之一,可治肿毒,具有止呕,化痰,消肿,止痛等功能。MicroRNAs(miRNAs)是内源性非编码小RNA,在植物基因表达调控中发挥关键作用。但目前在miRBase上仍没有掌叶半夏的microRNAs信息,并且对其相关生物学功

有关化合物靶点的活性验证探讨

1A:我设计的靶点化合物已经测完细胞活性,除了需要买蛋白回来测活性以外,还有没有什么替代的方法来验证活性?B:你可以用生物物理的方法做亲和力测试,或者生物化学的方法做酶的抑制率和IC50(如果你是要研究抑制剂的话)。C:你要明确你的靶点,最好有这个靶点现有药物的构效关系或者药效团,然后再做结构改造,

有关化合物靶点的活性验证探讨

  1   A:我设计的靶点化合物已经测完细胞活性,除了需要买蛋白回来测活性以外,还有没有什么替代的方法来验证活性?   B:你可以用生物物理的方法做亲和力测试,或者生物化学的方法做酶的抑制率和IC50(如果你是要研究抑制剂的话)。   C:你要明确你的靶点,最好有这个靶点现有药物的构效关系

浙理工大:芯片和降解组测序揭示掌叶半夏miRNAs新信息

  掌叶半夏(Pinellia pedatisecta)是中医中最重要的中草药之一,可治肿毒,具有止呕,化痰,消肿,止痛等功能。MicroRNAs(miRNAs)是内源性非编码小RNA,在植物基因表达调控中发挥关键作用。但目前在miRBase上仍没有掌叶半夏的microRNAs信息,并且对其相关生物

高通量基因点样仪

  高通量基因点样仪是一种用于基础医学领域的医学科研仪器,于2016年11月17日启用。  技术指标  1.X 轴移动速度:50-250mm/s;Y 轴移动速度:100mm/s;Z 轴移动速度:100mm/s;X,Y,Z轴移动精度:± 0.2mm;划线头定位精度:± 0.2mm。2.划头最小间距:

miRNA怎样蹭上m6A热点发高分?(二)

 图3. CSC通过降低METTL3启动子区甲基化促进其表达4.METTL3通过调控m6A修饰介导pri-miR-25成熟为进一步探索了METTL3是否影响miR-25-3p成熟,作者首先通过m6Apri-miRNA甲基化测序(云序可提供此服务)分析了pri-miR-25上的m6A位点,发现m6A的

双荧光素酶报告基因检测(二)

双荧光素酶报告基因检测(二)双荧光素酶实验通常被用来评估miRNA是否与其潜在的靶基因发生相互作用。实验中,预测的miRNA靶标基因的3’-UTR序列被克隆到含有萤火虫荧光素酶的报告基因载体的3’-UTR位置。如果miRNA与插入到质粒中的目标序列发生结合,miRNA将通过抑制该序列的翻译来降低萤火

中山一院:RMVD患者左右心耳miRNA表达谱比较

  心房颤动(Atrial fibrillation ,AF)是临床上最常见的持续性心律失常,其发病率和死亡率十分高。目前, AF相关的microRNA(miRNA) 已在患风湿性二尖瓣病(RMVD)患者的右心房(RA)和左心房(LA)中发现。然而,大多数的研究只关注RA;与LA相关的miRNA在R

Nature-Medicine:miRNA有助于对抗抑郁症

  随着生活压力不断增大,越来越多的人群患上了心理疾病,重度抑郁症(Major depressive disorder,MDD)就是一类常见的情绪障碍疾病。目前已经不少药物用于治疗这种疾病,但是不同患者对于药物的反应却不尽相同,个体间的差异会对治疗效果产生很大影响。在6月8日出版的Nature Me

江苏疾控:循环miRNA可作为噪声性聋的标志物

  循环microRNAs(miRNAs)作为生理和病理条件下的无创标志物受到广泛关注,其可能可作为噪声性聋(Noise-Induced Hearing Loss, NIHL)的标志物。然而,目前还没有流行病学研究调查过NIHL或是噪声暴露对miRNA表达谱的潜在影响。  为此,江苏省疾病预防控制中

RMVD患者左右心耳miRNA表达谱比较

  心房颤动(Atrial fibrillation ,AF)是临床上最常见的持续性心律失常,其发病率和死亡率十分高。目前, AF相关的microRNA(miRNA)已在患粉丝性二尖瓣病(RMVD)患者的右心房(RA)和左心房(LA)中发现。然而,大多数的研究只关注RA;与LA相关的miRNA在

GEN:miRNA检测行业热度不减

  MicroRNAs (miRNAs)是一种存在于真核生物的内源性非编码小RNA,具有抑制靶向mRNA转录、翻译或者剪切靶向mRNA并促使其降解的功能。它会组装进入沉默复合体(RISC),识别并与靶向mRNA互补配对,从而降解或者阻止mRNA翻译。  miRNAs负责调控多种生理过程,包括细胞周期

miRNAs检测技术

MicroRNAs (miRNAs)是一种存在于真核生物的内源性非编码小RNA,具有抑制靶向mRNA转录、翻译或者剪切靶向mRNA并促使其降解的功能。它会组装进入沉默复合体(RISC),识别并与靶向mRNA互补配对,从而降解或者阻止mRNA翻译。miRNAs负责调控多种生理过程,包括细胞周期(发育、

使用miRNA的芯片及定量PCR数据研究超急性期脑梗...(一)

使用miRNA的芯片及定量PCR数据研究超急性期脑梗死(HACI)的新颖标志物循环血miR-16研究背景全世界范围内,卒中严重降低其患病者的生存质量。而缺血性卒中占整个卒中的70-85%。快速诊断对超急性期脑梗死的临床决策非常重要。人们逐渐把寻找生物标志物的方向投向循环血的miRNA。但脑梗死病因复

双萤光素酶报告基因检测

  萤光素酶报告基因系统广泛应用于真核生物基因表达和细胞生理学研究,包括受体活性、转录因子、细胞信号转导、mRNA加工和蛋白质折叠等。萤光素酶是理想的报告基因,因为哺乳动物细胞中不含内源性萤光素酶,一旦转录完成立刻就生成功能性的萤光素酶。单萤光素酶报告基因实验往往会受到各种实验条件的影响,而双萤光素

河科大附医:通过比较SHEE和SHEEC细胞系构建ceRNA网络图

  长链非编码RNA(lncRNA)在调节各种生物过程中发挥着关键和复杂的作用,包括染色质修饰,转录和转录后加工。更有趣的是,一些lncRNAs可以作为吸引miRNA的“海绵”,在转录后调控中抑制其与miRNA靶基因的相互作用。这意味着它们可以被认为是竞争内源性RNA(ceRNA)。  在这项研究中