RNA琼脂糖变性胶电泳分析
一、原理RNA分子是以单链形式存在的,但在局部仍有双链结构形成。由于这种局部双链结构的干扰,使得在非变性凝胶上对RNA分子完整性的鉴定及其分子量大小的检测,变得不十分可靠。通过加入乙二醛一二甲基亚砜、氢氧化甲基汞、甲醛等变性剂进行变性处理,使其局部双链变为单链。再进行电泳,RNA的泳动距离与其片段大小的对数值就形成良好的线性关系,从而可对RNA的分子大小及完整性程度作准确的分析。二、目的了解琼脂糖变性胶电泳的原理和用途,掌握利用变性凝胶分析RNA的基本方法。三、材料、试剂和仪器1、已制备的植物RNA或其他RNA样品。2、10×MOPS:0.4M MOPS, 100mM 醋酸钠,10mMEDTA,pH 7.0。3、电极缓冲液:1×MOPS。4、甲醛。5、去离子甲酰胺。6、加样缓冲液:50%(W/V)甘油,1mM EDTA(pH 8.0), 0.25%(W/V)溴酚蓝,0.25%(W/V)二甲苯青。7、分子量标准参照物。8、琼脂糖。......阅读全文
电泳分析法琼脂糖凝胶电泳的应用
琼脂糖凝胶电泳是分离蛋白质,DNA或RNA的常规方法。 DNA分子大小的估计 分析PCR产物,例如在分子遗传学诊断或遗传指纹分析中 在进行Southern分析之前,先对限制性基因组DNA进行分离,在进行Northern分析之前,先对RNA进行分离。 琼脂糖凝胶电泳广泛用于评估限制酶消化后
一种快速鉴定RNA-质量的方法
提 要: 目的 建立一种快速鉴定RNA 完整性的方法。方法 在常规琼脂糖凝胶电泳的基础上,结合甲醛变性琼脂糖凝胶电泳加以改进而成。结果 提取的总RNA 用此方法电泳后可得到28S、18S、5. 8S(5S) 三条清晰的rRNA 条带。结论 此方法可以达到对RNA 完整性进行快速鉴定的目的。 随着分子
植物总RNA的提取实验原理和操作步骤
一、实验目的通过本实验学习从植物组织中提取RNA的方法二、实验原理RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的RNA,必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。高浓度强变性剂异硫氰酸胍,可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,失活RNA酶,所以RNA从细胞中释放出来时不
rna电泳实验的目的
可以参考如何做RNA电泳实验,RNA容易降解所以操作中有很多要注意的细节。。。实验基本原理RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。在非变性电泳中,可以分离混合物中不同分子量的RNA分子,凡是无法确定分子量。只有在变性情况下,RNA分子完全伸展,其泳动率才与分子量成正比。判断RNA提取物的完整性是
RNA的琼脂糖凝胶电泳实验
RNA的琼脂糖凝胶电泳实验可用于:(1)检测提取的RNA样品的完整性;(2)测定RNA分子量。实验方法原理RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%~1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系
总RNA-的非变性电泳检测
总 RNA 的电泳检测,原来我使用 Lambda DNA/EcoR I (或者 Hind III)酶切 Marker,现在基本上不再用 Marker 了。指示剂一定是溴酚蓝加二甲苯氰,胶浓度 1-1.2%。加样后,开始电泳 (电压的选择的唯一依据是,我后面的时间安排。)。 溴酚蓝出孔 2-3cm 后
RNA的琼脂糖凝胶电泳实验
实验方法原理 RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普
用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针对RNA作图
核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理核糖核酸酶保护分析用于度量特
RNA-Markers的使用方法(适用于RNA-Marker-RL1,000、RL6,000、RL1
RNA Marker ( RL1,000; RL6,000; RL10,000)可以进行一般琼脂糖凝胶电泳和变性琼脂糖凝胶电泳。以RL10,000为例,具体使用方法如下:普通琼脂糖凝胶电泳时1.按下列组份配置RNA Marker样品。2.均匀混合后65℃加热10分钟,迅速冷却至室温(最好用PCR仪)
RNA的琼脂糖凝胶电泳实验
实验方法原理 RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%~1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量时,一定要
植物总RNA的提取实验技术
一、实验目的 通过本实验学习从植物组织中提取RNA的方法 二、实验原理 RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的 RNA,必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。高浓度强变性剂异硫氰酸胍,可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,失活RNA酶,所以RNA从细胞中释
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验 试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇 甲醛MOPS 缓冲液乙二胺四乙酸MOPS乙酸钠酚 氯仿(3:1) 溶液氯仿液体酚Tris-HCl电泳缓冲液仪器、耗材 离心机和转头离心管配胶板微波炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂变性(甲醛)琼脂糖凝胶(配制过程见第 18步)
电泳分析法琼脂糖凝胶电泳的要求/仪器
进行琼脂糖凝胶电泳所需的设备和用品相对简单,包括:电泳仪和电源 凝胶浇铸托盘,有各种尺寸,由紫外线透明塑料制成。在浇铸凝胶时,用胶带封闭托盘的开口端,然后在电泳之前将其除去。 样品梳子,将熔融的介质倒在梳子周围,以在凝胶中形成样品孔。 电泳缓冲液,通常是Tris-acetate-EDTA(
电泳分析法琼脂糖凝胶电泳的优缺点
琼脂糖凝胶电泳的优点 对于大多数应用,仅需要单组分琼脂糖,不需要聚合催化剂。因此,琼脂糖凝胶制备简单,快速。 凝胶易于倒入,不会使样品变性。 样品也可以回收。 琼脂糖凝胶电泳的缺点 凝胶在电泳过程中会融化。 缓冲区可能耗尽。 不同形式的遗传物质可能以不可预测的形式运行。
电泳分析法琼脂糖凝胶电泳涉及的步骤
为了制备凝胶,将琼脂糖粉与电泳缓冲液混合至所需浓度,并在微波炉中加热使其熔化。 琼脂糖凝胶浓度 所用琼脂糖的百分比取决于要分离的片段的大小。 琼脂糖的浓度是指琼脂糖相对于缓冲液体积的百分比(w / v),琼脂糖凝胶通常在0.2%至3%的范围内。 琼脂糖浓度越低,DNA片段迁移越快。 通
用琼脂糖凝胶电泳分析核酸有哪些影响因素
核酸电泳中所用到的eb能用sybrgreen,goldview替代。GoldViewⅠ是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型DNA染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外灯下双链DNA呈现绿色荧光,而单链DNA呈红色荧光。通过小鼠皮下注射实验,尚未发现GoldViewⅠ有致癌作用;而溴化乙
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
为了进行 FDD 基因表达的分析,以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术,在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前,必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒变性(甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇甲醛MOPS
原位杂交(In-Situ-Hybridization,ISH)与荧光原位杂交(四)
(2)硝酸纤维素滤膜吸印。①将胶切成合适大小,切去右上角作为记号。②将胶放进盛有变性缓冲液(1.5mol/l NaCl, 0.5mol/L NaOH)的盘中轻摇动15min。③换到中和缓冲液(1mol/L Tris·HCl , pH8.0, 1.5mol/L NaCl)中轻摇动30min。④裁一张硝
甲醛变性凝胶电泳鉴定RNA实验_凝胶电泳法
本实验旨在学会甲醛变性凝胶电泳鉴定RNA 的方法。琼脂糖凝胶电泳作为鉴定大分子物质经常被使用, 但含有RNase 酶活性, 因此要使RNase 变性而不使RNA 变性的, 故采用甲醛变性凝胶电泳鉴定RNA。实验方法原理琼脂糖凝胶电泳作为鉴定大分子物质经常被使用, 但含有RNase 酶活性, 因此要使
RNA实验和方案新手必读(八)
不同来源的核糖体RNA大小来源rRNA大小(kb)E. coli16S 23S1.5 2.9S. cerevisiae18S 26S2.0 3.8小鼠18S 28S1.9 4.7人18S 28S1.9 5.0RNA分析:分析凝胶变性凝胶分析的原理利用RNA在甲醛琼脂糖凝胶中的电荷迁移效应,可对RNA
乙二醛/DMSO-变性琼脂糖凝胶电泳
试剂、试剂盒 10XBPTE 电泳缓冲液 二甲基亚砜(DMSO) 去离子乙二醛 乙一醛反府混合液 上样缓冲液
乙二醛/DMSO-变性琼脂糖凝胶电泳
试剂、试剂盒 10XBPTE 电泳缓冲液 二甲基亚砜(DMSO) 去离子乙二醛 乙一醛反府混合液 上样缓冲液仪器、耗材 水平电泳装置实验步骤 (一)村料与设备1)10XBPTE 电泳缓冲液:100 mmol/LPIPES,300 mmol/LTris,lOmmol/LEDTA(pH8.0)2) 二甲
甲醛变性电泳检测RNA完整性
一、材料、试剂和仪器1、材料:植物总RNA 5-10μg2、试剂:1)加样运载缓冲液(Loading buffer)50% 甘油1mmol/L EDTA (pH 8.0)0.25%溴酚蓝25%二甲苯氰FF2)10×TAE Buffer3)5×甲醛凝胶电泳缓冲液:0.1mol/L MOPs (pH7.
RNA甲醛变性电泳实验原理和操作
[原理] 用溴化乙锭等荧光染料示踪的核酸电泳结果可用于判定核酸的纯度。由于DNA分子较RNA分子大许多,电泳迁移率低;而RNA中以rRNA最多,占到80%~85%,tRNA及核内小分子RNA占15%~20%,mRNA占1%~5%。故总RNA电泳后可呈现特征性的三条带。在原核生物为明显可见的23S
3.1.1-RNA-标准转录反应
利用 DNA 聚合酶 I 的大片段(Klenow 酶)的 3'— 5'外切酶活性将 3'黏性末端转化成平末端。具体方法是在体外转录体系尚未加入核苷酸和 RNA 聚合酶时,加入 Klenoow 片段 (终浓度为 5U/ug),于 22℃ 孵育 15mim, 然后再加入核苷酸混合物和RNA 聚合酶实验材
琼脂糖凝胶电泳,做胶加EB目的
染色啊。你agarose胶电泳跑DNA,根据大小不同电泳速度不同,可是最后你需要看啊,怎么看呢?可见光下看不见DNA的。所以加EB也好,SYBRgreen也好,我们实验室用的genefinder也好,都是将DNA染色,用特殊的化学分子与DNA结合,并且在特殊波长的激发光下发射荧光,荧光强度与DNA含
琼脂糖凝胶电泳,做胶加EB目的
在搜搜上找的同一问题的答案:“染色啊。你agarose胶电泳跑DNA,根据大小不同电泳速度不同,可是最后你需要看啊,怎么看呢?可见光下看不见DNA的。所以加EB也好,SYBR green也好,我们实验室用的genefinder也好,都是将DNA染色,用特殊的化学分子与DNA结合,并且在特殊波长的激发
RNA-标准转录反应
实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN
RNA-标准转录反应
实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc