蛋白质三级机构（空间结构）预测－从头预测法
H-P模型是基于三种简化的，即蛋白质中各个氨基酸残基的α碳原子都位于二维网格或三维网格的格点上，疏水作用是蛋白折叠中唯一的重要因素，同时通过计算疏水残基接触的数目代替构象的能量计算。虽然这样的处理非常简单，但是，通过H-P模型的计算分析，能够发现蛋白质折叠的一些机制。如果在蛋白质模型中取消氨基酸定位于网格点的限制，那么蛋白模型就可以更真实地模拟出蛋白的实际构象。去网格模型的误差通常用预测构象和实际构象中 α碳原子的均方根偏差（RMSD）来计算。α碳原子的RMSD是指当预测构象和实际构象重叠在一起时，两种构象中每个α碳原子位置的Euclidean平方距离的总和。随着蛋白模型与实际情况越来越相符，模型的复杂性也越来越大。去网格蛋白折叠模型可以只考虑α碳原子，也可以考虑所有的骨架原子，甚至可以考虑所有的骨架原子和侧链原子。假如在模型中考虑侧链的话，那么侧链可以表示成刚性侧链、半柔性侧链和完全柔性侧链。对于刚性侧链，我们已经在X射线......阅读全文
发改委确定11日下调油价－机构预测降幅小于上次
就在此前多家机构预测7月11日国内成品油价格将下调时，发改委首度确认了这一消息。发改委价格司副司长周望军昨日首度明确表示，按照目前监测情况，国际油价三地变化率下降已经超过4%，按照现行的成品油定价机制，7月11日是新一轮调价时点，发改委将按机制下调国内成品油价格。这将是近年来国内油价首度
机构预测油价还将拉低CPI－专家称也有上涨可能
昨天，国家发改委下调国内汽柴油价格，全国多地油价重回6元时代。机构预测，这次下调将拉低7月份居民消费价格指数(CPI)0.1个百分点，考虑到对物流生产环节的影响，有机构甚至预测7月CPI可能降至2%以下。 国金证券在国家发改委公布调降成品油价格通知后发布报告指出，“此次油价下调将直接下移C
华大等机构发布强大的基因组预测工具
植入前遗传学诊断（PGD），被用来检测亲本传递给其体外受精（IVF）胚胎的大染色体异常或遗传突变。然而，这种技术不能全面扫描胚胎的基因组以检测自发突变。2月11日在《Genome Research》发表的一项研究中，来自华大基因科技、Complete Genomics、美国Reprogeneti
从预测进化－AI能“构想”新蛋白质结构
半个世纪以来，科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战，难倒了几代科学家。但现在，人工智能（AI）解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文，包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种升级的阿尔法折叠系统，该系统由深度思维（
直播预告－|－蛋白质结构与功能预测及设计
直播时间：2024年8月22日（周四）19:00——21:40 直播平台：科学网APP(科学网微博直播间链接)https://weibo.com/l/wblive/p/show/1022:2321325069047447289984科学网微博科学网视频号 【直播简介】8月22日（周四）晚19:0
预测蛋白质相互作用的计算方法
蛋白质相互作用研究能够从分子水平上揭示蛋白质的功能，帮助揭示生长发育、新陈代谢、分化和凋亡等细胞活动的规律。在全基因组范围内识别蛋白质相互作用对是解释细胞调控机制的重要一步。随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。
基于氨基酸组成的蛋白质预测软件
根据组成蛋白质的20种氨基酸的物理和化学性质可以辨析电泳等实验中的未知蛋白质，也可以分析已知蛋白质的物化性质。ExPASy工具包包涵的程序：http://www.expasy.ch/tools/AACompIdent：与把氨基酸序列在SWISS-PROT库中搜索不同，AACompIdent工具利用未
JCIM：计算提升蛋白质蛋白质相互作用的预测精度
蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展，但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋，相互作用区域比较明确，而蛋白质
胎儿血型的预测
羊水中存在ABH（O）血型物质，故可在妊娠期预测胎儿的血型，以便对母体胎儿血型不合者进行围生期监护、治疗和对新生儿的作好抢救准备。 一、ABH分泌型血型的预测 本试验是根据羊中分泌的血型物质可将相应抗血清中抗体中和原理设计的。将羊水与0.2毫升最适稀释度的抗A抗B抗H血清0.2毫升分别混匀，冯分
国际原子能机构发布20202050年核电走势预测
国际原子能机构(IAEA)最近的一项研究显示，预计到2030年，全球核电发电量将继续增长。该机构于日前发布了其年度出版物《能源、电力与核电预测(2050年前)》，同时刊登了国际原子能机构能源规划专家给出的分析。 国际原子能机构每年都会针对全球核电发电量做出低值和高值预测。今年的低
蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤
序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析，motif分析和功能预测等，结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构，二级结构目前预测还是比较准确的，三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swissmodel在线进行预测，也可以采用一些其他软件，如modeller和一些商业软件，主要原理是同源
一种血液“蛋白质时钟”可预测疾病风险
8月8日，一项发表于《自然-医学》的研究显示，一种基于血液中约200种蛋白质的年龄“时钟”可以预测18种慢性疾病的风险，包括心脏病、癌症、糖尿病和阿尔茨海默病等。对血液中200多种蛋白质的分析为死亡风险和十几种与衰老相关的慢性疾病提供了线索。图片来源：Vo Trung Dung/Look At Sc
蛋白质二级结构预测－最邻近方法－NearestNeighboringmethods
早期，由于数据的缺乏，预测方法多基于单条序列。随着序列和结构数据的增加，人们的研究转向同源序列分析，充分利用隐藏在同源序列中的结构信息，使得结构预测的准确率得到了较大的提高。同源分析的基础是序列比较，通过序列比较发现相似的序列，根据相似序列具有相似结构的原理，将相似序列（或者序列片段）所对应的二级结
Nature发布AlphaFold预测几乎所有已知蛋白质的形状
DeepMind的AlphaFold工具已经确定了地球上几乎所有已知生物体中约2亿种蛋白质的结构。从今天开始，确定科学上已知的几乎所有蛋白质的3D形状将变得和在谷歌搜索中输入一样简单。研究人员使用革命性的人工智能(AI)网络：AlphaFold来预测来自100万种物种的约2亿种蛋白质的结构，几乎覆盖
研究利用人工智能预测蛋白质“光学指纹”
蛋白质是生命的基石，生物的功能依赖于既稳定而又灵活可变的蛋白质结构。蛋白质的光谱响应信号，尤其是紫外光谱，可以称之为蛋白质骨架的“指纹”。这个“光学指纹”，经过理论模拟的解读，可以揭示出精确的蛋白质结构，为生命科学和医学诊断提供极其重要的信息。 然而，蛋白质的结构极其复杂多变，需要做大量的高精
蛋白质工程的结构、功能的设计和预测
根据对天然蛋白质结构与功能分析建立起来的数据库里的数据，可以预测一定氨基酸序列肽链空间结构和生物功能；反之也可以根据特定的生物功能，设计蛋白质的氨基酸序列和空间结构。通过基因重组等实验可以直接考察分析结构与功能之间的关系；也可以通过分子动力学、分子热力学等，根据能量最低、同一位置不能同时存在两个
瑞典开发出预测生物蛋白质同源关系研究平台
瑞典卡罗林斯卡医学院国家生命科学实验室开发了一种新的研究工具——InParanoiDB9，旨在增进对不同生物体之间蛋白质同源关系的理解。它预测了640个物种之间超10亿个直向同源群，为蛋白质结构域和全长蛋白质提供了直向同源预测。 该数据库使用尖端算法（如InParanoid DIAMOND、D
蛋白质二级结构预测(protein－secondary－structure－prediction)
蛋白质二级结构的预测开始于20世纪60年代中期。二级结构预测的方法大体分为三代，第一代是基于单个氨基酸残基统计分析，从有限的数据集中提取各种残基形成特定二级结构的倾向，以此作为二级结构预测的依据。第二代预测方法是基于氨基酸片段的统计分析，使用大量的数据作为统计基础，统计的对象不再是单个氨基酸残基，而
蛋白质二级结构(protein－secondary－structure)预测软件
蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步，二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全α蛋白、全β蛋白、α＋β蛋白和α/β蛋白等四个折叠类型。预测蛋白质二级结构的算法大多以已
开发出新型预测模型来预测HIV疗法的效果
艾滋病毒非常可怕，尤其是其自身非常好的自适应性，如果HIV对于某一个靶点药物产生了变异，那么就变相宣布了此疗法的失败。为了尽量降低HIV的防御机制，医生们会使用许多种药物联合的方法来治疗患者，这种方法就可以使得病毒对特定药物耐受之前经历相当长的变异过程。 近日，刊登在国际杂志PLoS Co
预测蛋白质3D结构，单条蛋白质序列就能实现
7月22日，华深智药对外宣布，公司在蛋白质结构预测方面开发出一项新技术OmegaFold，突破了已有计算机预测三维结构的模式，是人工智能（AI）和生命科学领域结合实现的一个突破。华深智药是由清华大学人工智能产业研究院孵化，是一家致力于使用AI重构药物开发流程来提高新药研发速度和效率的企业。日前，华深
疫情预测界的章鱼保罗，内地预测香港疫情3月受控！
第四波疫情以来，确诊数字时有反复，究竟什么时候能“清零”成了大家最关心的问题。近日，兰州大学研发出的全球疫情预测系统对香港疫情做出最新预测，该系统获得钟南山院士的肯定，曾两次登上微博热搜榜。 全球疫情预测系统是什么？ 兰州大学西部生态安全省部共建协同创新中心研发团队研发的世界上第一个「
2017诺贝尔奖预测：汤森路透预测名单，华人上榜
10月“诺贝尔奖月”即将来到，颁奖期正在临近，科学家们和各方面专家们又开始了一年一度的预测活动，尽管严肃的态度各异，焦点都只有一个：谁将赢得今年的诺贝尔奖项？ 从2002年汤森路透社发表诺贝尔奖预测到现在，“引文桂冠得主”中有43获了诺贝尔奖。虽然并不总是在预测的当年获奖，也存在多个的“打靶”
临床物理检查方法介绍父母身高预测法介绍
父母身高预测法介绍: 父母身高预测法是欧洲一位科学家以父母的身高与子女身高的关系创造出一个预测身高的公式: 儿子身高(厘米)=父亲身高+母亲身高×1.08÷2 女儿身高(厘米)=父亲身高×0.923+母亲身高÷2 这个公式基本上符合“高加高生高”,“矮配矮生矮”,“高加矮生高”的遗传法则。这个
临床物理检查方法介绍现时身高预测法介绍
现时身高预测法介绍: 现时身高预测法是瓦尔克尔氏预测法,这种身高预测法是根据孩子现在的身高,利用下面的公式来预测孩子未来的身高:Hm=A+B×C。公式中的Hm为孩子未来成人时的身高,A为固定的数值,B为相应年龄的系数,C为孩子当时的身高。由于世界各地的差异,误差在3厘米。现时身高预测法正常值: 预测
法德将开发太空量子传感器预测地震
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多家能源分析机构预测:节后汽油或升回至8时代
节后汽油或将升回至8元时代。昨日，国内多家能源分析机构预测，伴随三地原油变化率已达4.29%，国内成品油上调窗口已经打开。本次上调幅度预计将在每吨350元至400元之间，折合93号汽油每升上调0.27元到0.31元，0号柴油每升上调0.3元到0.34元。
成品油调价窗口今日开启－机构预测搁浅或微跌(图)
国内新一轮成品油调价窗口将于11月2日24时开启。从国际油价走势来看，机构预测本次油价调整将出现搁浅或微跌。 据卓创资讯测算，截至10月31日收盘，国内第9个工作日参考原油变化率为-1.22%，对应汽柴油下调40元/吨。隆众资讯测算的原油综合变化率为-1.52%，预计对应下调幅度30元/吨。
国内油价今迎调价窗口－多机构预测将二次搁浅
根据现行成品油定价机制，国内油价新一轮调价窗口将于今日24时打开。由于本周期内国际油价震荡起伏令原油变化率不断缩小，多机构预测国内油价或迎来年内第二次搁浅。 油价或迎年内二度搁浅 3月10日，中国2月出口大降引发市场对经济的担忧且利比亚油田恢复生产，国际原油期货价格同步走低。纽约商品
远紫外CD－预测蛋白质二级结构的方法
利用圆二色光谱仪获得蛋白质CD 主要的工作包括:溶剂体系的选择,蛋白质溶液样品的制备[14 ] ,圆二色光谱仪实验参数的选择与调整等。对此,Kelly 等[15 ] 已经作了较为全面的综述。正确的蛋白质CD 图谱是预测蛋白质结构的基础与关键。在正确获得蛋白质CD 后,主要的工作是如何从CD 图谱