如何确定RNA质量的经验谈
1)检测RNA溶液的吸光度 280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris作为缓冲液检测吸光度时,R值可能会大于2(一般应该是<2.2的)。当 R<1.8时,溶液中蛋白或者时其他有机物的污染比较明显,你可以根据自己的需要决定这份RNA的命运。当R>2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。 2)RNA的电泳图谱 一般的,RNA的电泳都是用变性胶进行的,但是根据我的经验,如果你仅仅是为了检测RNA的质量是没有必要进行如此麻烦的实验的,用普通的琼脂糖胶就可以了。 电泳的目的是在于检测28S和18S条带的完整性和他们的比值,或者是mRNA smear的完整性。一般的,如果28S......阅读全文
如何确认RNA的质量?
1)检测RNA溶液的吸光度280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris作为缓
如何改善RNA提取质量
1.在收获组织及细胞死亡之后,应立即灭活内源的RNA酶,以防止RNA降解。以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活:1)用含离液(如胍盐)的细胞裂解液收获样品,并立即匀浆。2)用液氮瞬间冻结样品。值得特别注意的是:组织块必须保证足够小,在浸入液氮的瞬间就能冻结,以确保瞬间令RNA酶失活3)立即将样品置
RNA质量检测与鉴定
方法一、检测RNA溶液的吸光度280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris作为缓冲
如何确认RNA的质量
1、RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。2、凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。3、RNA-seq
高质量RNA的标准
real time RT-qPCR 是检测样本中特定基因表达量的有效方法,包含逆转录步骤和定量PCR步骤。好的开始是成功的一半,获得高质量的、能正确反应样品中转录情况的RNA,对于其后的定量结果,自然是非常重要的。Mikael Kubista,教授, R&D TATAA Biocenter主任:RN
如何评价总RNA或mRNA的质量?
一个细胞有很多种的RNA,如mRNA,rRNA,tRNA总RNA指的是一个细胞(一种生物)里面所有种类的RNA平时说的提取总RNA指的就是提取一个细胞里面的所有种类的RNA 。 mRNA的功能:把DNA模板链上的 碱基 序列 转录 为RNA分子上的碱基序列(mRNA),再从mRNA上
如何确定RNA质量的经验谈
如何确定RNA质量的经验谈 1)检测RNA溶液的吸光度 280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注
如何确定RNA质量的经验谈
1)检测RNA溶液的吸光度 280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris
如何检测、评价提取的DNA、RNA质量
4.如何检测、评价提取的DNA、RNA质量,计算提取的DNA、RNA浓度:一般通过OD260/OD280来判断他们的含量,纯DNA的比值一般在1.8,大于1.8,小于2时可能有RNA污染,在1.9到2.0时RNA纯度高,小于1.8时可能有蛋白质污染,大于2.0时可能在提取过程中的化学物质残留。提取原
从土壤中轻松获取高质量RNA
详细介绍:从土壤中轻松获取高质量RNA众所周知,从土壤中提取DNA已非易事,而想从中再提取RNA可说是难上加难。DNA不容易提取是因为本身土壤中富集的材料就少,提取过程相对复杂,造成操作损失;而RNA不容易提取除了以上所提到的原因外,还有一个很关键的原因——无处不在的RNA酶,对RNA的稳定存在构成
一种快速鉴定RNA-质量的方法
提 要: 目的 建立一种快速鉴定RNA 完整性的方法。方法 在常规琼脂糖凝胶电泳的基础上,结合甲醛变性琼脂糖凝胶电泳加以改进而成。结果 提取的总RNA 用此方法电泳后可得到28S、18S、5. 8S(5S) 三条清晰的rRNA 条带。结论 此方法可以达到对RNA 完整性进行快速鉴定的目的。 随着分子
Northern杂交试验指导手册(2)-RNA质量检测
二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1ml
琼脂糖凝胶电泳检测RNA质量
一.原理带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。其中,凝胶电泳由于其操作简便、快速、灵敏等优点,使它成为分离、鉴定和提纯核酸的首选标准方法。与蛋白质分子类似,核酸分子也是两性解离分子。在pH3.5时,碱基上的氨基基团解离,而三个磷酸基团中只有第一个磷酸解离,整个分子带正电荷,在电场中向负极泳动;在p
获得高质量土壤RNA的10个建议
前面的文章我们介绍了如何提取土壤DNA。大篇幅详细讲解了影响DNA得率和纯度的研磨均质、化学试剂(重点是裂解缓冲液)等问题。做DNA远没有做RNA压力大。不用太担心降解,得率还挺高。RNA就不一样。。。提取土壤RNA是环境分子生物学研究最难的研究方法之一。RNA提取本身就是件艰巨的任务,提取土壤的R
改善RNA提取质量的十大要点
RNAse的无处不在导致了RNA的脆弱敏感。要改善RNA提取的质量,专家为你介绍在RNA纯化过程中要特别注意的10个问题。 在收获组织及细胞死亡之后,应立即灭活内源的RNA酶,以防止RNA降解。以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活:1)用含离液(如胍盐)的细胞裂解液收获样品,并立即匀
如何从细胞中提取高质量RNA?必看!
在实验室中,尤其是分子生物类的实验室中不可避免的会遇到细胞总RNA提取实验,所提RNA样品的质量和纯度直接影响下一步的实验,如逆转录,RT-PCR, microarray 等。下面我们来介绍如何提取细胞中的总RNA 。首先,我们要知道什么是总RNA。总RNA包括mRNA和miRNA等,其中mRNA也
RNA质量不好-请问能继续做定量PCR吗
RNA质量不好 请问能继续做定量PCR1.其实反转录要求不是很高,所有器具消毒操作带手套口罩就行,没必要加RNaseInhibitor2.OD260/280实际上反应的是蛋白质杂质的比例,可以间接的反应有没有RNA酶污染,所以这个比值低了有可能是RNA酶污染,也可能是提取操作或者试剂问题导致蛋白质残
从革兰氏阴性菌中分离高质量RNA
实验材料 大肠杆菌培养物或 蓝细菌培养物试剂、试剂盒 DEPC 处理的水 终止缓冲液 STET 裂解液 酚 氯仿 3mol L 乙酸钠缓冲液 0.2mol L 和 l0 mmol L 氧钒核苷复合物 氯化铯 CsCl 塾层 冰冷的无水乙醇 乙醇仪器、耗材 离心机超速离心机实验步骤 一 材料与设备1)
从革兰氏阴性菌中分离高质量RNA
实验材料 大肠杆菌培养物或 蓝细菌培养物 试剂、试剂盒 DEPC 处理的水 终止缓冲液 ST
2.7.1-从革兰氏阴性菌中分离高质量RNA
从大胗杆菌或蓝细菌屮制备的高质量RNA适 于 Northern印迹法、S1 核酸酶作图和引物延伸试验。实验材料大肠杆菌培养物或 蓝细菌培养物试剂、试剂盒DEPC 处理的水终止缓冲液STET 裂解液酚氯仿3mol L 乙酸钠缓冲液0.2mol L 和 l0 mmol L 氧钒核苷复合物氯化铯CsCl
DNA--RNA-寡聚核苷酸的准确分子质量测定(一)
1. 前言随着人们对核酸结构和功能的深入了解,特异性结合或者裂解致病基因的核酸药物也逐渐成为了药物研究的新热点, 核酸药物的作用效率高、应用范围广,可以对传统药物进行补充,并且在前期的临床诊断中也可以起到重要的指示作用。核酸药物主要是指各种具有不同功能的寡聚核糖核苷酸(RNA)或者寡聚脱氧核糖核
NA--RNA-寡聚核苷酸的准确分子质量测定(二)
3. 结果与讨论3.1 低分辨 LTQ 质量检测器测定寡聚核苷酸的分子质量3.1.1 原始色谱质谱图 采用 5 min 的梯度分析,离子阱采集数据,寡聚核酸主要在 3.53 min 出峰。 3.1.2 原始质谱图 将上图中 3.53 min 附件的寡聚核苷酸谱图信号平均后,得到该寡聚核苷酸的平均
NA--RNA-寡聚核苷酸的准确分子质量测定(三)
与低分辨的实验相比,在保持上样量和色谱条件不变的前提下,仅仅改变质谱采集的分辨率,可以看到寡聚核苷酸的色谱保留时间不变,基本在 3.52 min 出峰,不过随着质谱检测器分辨率的提高,原始质谱图发生了显著的变化,如下所示,当使用线性离子阱 LTQ 作为质量检测器时,只检测到一个大包峰,无法分
研究发现评估IVF中精子质量的小RNA分子标志物
4月9日,国际学术期刊Cell Discovery 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚研究组、上海市计划生育科学研究所施惠娟实验室和复旦大学附属妇产科医院上海集爱遗传与不育诊疗中心陈国武实验室的合作研究成果“Identification of small noncoding R
Cell-Discovery:评估IVF中精子质量的小RNA分子标志物
国际学术期刊Cell Discovery在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚研究组、上海市计划生育科学研究所施惠娟实验室和复旦大学附属妇产科医院上海集爱遗传与不育诊疗中心陈国武实验室的合作研究成果“Identification of small noncoding RNAs as
非编码RNA准确预测精子质量,有望提高试管婴儿成功率
近几十年来,辅助生殖技术(ART)已广泛用于治疗人类不孕症。然而,只有大约30%的体外受精(IVF)和卵胞浆内单精子注射(ICSI)能够成功怀孕。经典的精液质量参数,如精子密度、形态和运动性,不足以有效评估精子的生育能力。 因此,非常需要一种用于从具有正常精液参数的样品中区分高质量精子样品的方
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存
RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育