Southernblot实验方法和操作步骤
第一天 (restriction enzyme digestion)1.取待測的genomic DNA,用二次水稀釋10倍(30μl的DNA 加270μlddH2O→ 300μl)2.換算genomic DNA濃度(OD260),再換算取10μg所需的體積。3.取10μg DNA,用限制酵素EcoRI、BamHI各2μl切O/N,將total體積調成400μl。(最好用1.5mL eppendorf)第二天 (precipitation with ethanol)1.取酵素作用後的DNA 2μl run 0.8% Gel,確認DNA是否有切動。(成帶狀,RFLP)2.若DNA有被切動,則進行酒精鹽沉澱法將DNA沉澱出來。i.加入總體積1/10的3M NaOAc(40μl)ii.再加入1μl的glycogeniii.最後加入兩倍體積的100% EtOH(800μl)iv.放入-20℃中一至二小時以上Ps要搖晃均勻,否則會結冰3.自......阅读全文
Southern-blot实验方法和操作步骤
第一天 (restriction enzyme digestion)1.取待測的genomic DNA,用二次水稀釋10倍(30μl的DNA 加270μlddH2O→ 300μl)2.換算genomic DNA濃度(OD260),再換算取10μg所需的體積。3.取10μg DNA,用限制酵素EcoR
Southern-blot实验方法与步骤
用于检测重组DNA,也可分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段。用于基因诊断,也可验证检测片段的分子量大小。将基因组DNA经限制性内切酶酶切,进行琼脂糖电泳,把分离后定位在凝胶上的不同分子量的DNA经碱变性处理,将凝胶中变性的DNA转移至一固相支持滤膜。利用标记的某一DNA、RNA或寡核苷
Southern-blot实验方法与步骤
用于检测重组DNA,也可分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段。用于基因诊断,也可验证检测片段的分子量大小。将基因组DNA经限制性内切酶酶切,进行琼脂糖电泳,把分离后定位在凝胶上的不同分子量的DNA经碱变性处理,将凝胶中变性的DNA转移至一固相支持滤膜。利用标记的某一DNA、RNA或寡核苷
SOUTHERN-BLOT的步骤
1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a ruler adjacent
Southern-blot实验
实验方法原理 具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线
Southern-blot实验
Southern blot可应用于:(1)检测重组DNA;(2)分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段;(3)验证检测片段的分子量大小。实验方法原理具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶
Southern-blot实验
实验方法原理 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA 或总RN
Southern-Blot实验原理及方法
实验原理:Southern Blot是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,
Southern-Blot原理及操作方法
原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进行结合,游离探针洗涤后用自显影或
DNA印迹(Southern-Blot)实验
【实验原理】DNA印迹是1975年由英国Southern创建的。其基本原理是:DNA分子经限制性核酸内切酶酶切后,由琼脂糖凝胶电泳将所得 DNA片段按分子质量大小分离,然后将DNA片段变性,并使凝胶中的单链DNA片段转移到尼龙膜、硝酸纤维素膜(NC)或其他固相支持物上,此法中DNA 片段
Southern-Blot
1. Run gel (0.8 -1.0% agarose is best). For yeast chromosomal Southerns, digest 20 μg DNA. Use 50 ml minigel for most purposes. Photograph gel, but mi
Southern印迹技术原理和操作步骤
实验原理:Southern印迹是将DNA片断从电泳凝胶上直接转移至膜支持物(如硝酸纤维素膜、尼龙膜)上,使DNA片断固定的技术。先将DNA经限制性内切酶消化成一系列片段,进行琼脂糖凝胶电泳,各片段因分子量不同而彼此分开,然后经碱处理凝胶,使DNA的片段被变性、中和并通过毛细作用在高盐缓冲液中在原位将
Northern-blot实验操作步骤(1)
一、经乙二醛和二甲基亚砜变性处理后进行的RNA电泳这一方法原于McMaster和Carmichael(1977)。含有乙二醛-DMSO的凝胶比含有甲醛的凝胶更难于进行电泳,因为前者泳动速率较慢而且需将电泳液时行循环以避免电泳过程中形成过高的H+梯度。尽管上述两种凝胶具有近乎相等的分辨率(Miller
Northern-blot实验操作步骤(2)
二、将变性RNA转移至硝酸纤维素滤膜电泳完毕后,可立即将乙醛酰RNA自琼脂糖凝胶转移至硝酸纤维素滤膜,有以下几种转移方法:毛细管洗脱法、真空转移法和电印迹法。毛细管洗脱法如下所述, 真空转移法和印迹法则按有关仪器生产厂家产品说明书进行。尽管有人认为在转移前对琼脂糖凝胶进行预处理实属不必(Th
Western-Blot-Protocol实验操作步骤
一、提取抗原蛋白 将提取RNA途中留存的样品,加入150μl100%酒精充分混匀,静置 5min(RT),2000×g,4℃离心5min,吸取上清至新管中,加入750μl异丙醇,混匀,静置10min(RT),12000×g,4℃离心 10min,弃上清,加入1ml0.3mol/L盐酸胍/95%酒
Southern-Blotting实验原理、操作步骤和注意事项2
按先将水和DNA 按反应体系所需的量取至一1.5毫升离心管中,混匀,短暂离心至管底,放至100℃干浴中变性10 min,变性探针迅速置于冰浴上 5 min,按反应体系将反应混合液(dNTP,Random primer,Klenow )加入变性DNA中,在同位素操作台上,加入32P 标记的dN
Southern-Blotting实验原理、操作步骤和注意事项1
对于大的基因组,DNA酶切图谱凭肉眼是分辨不开的(EB染色),因为大小不等的分子呈现弥散分布,只有借助灵敏的放射性同位素(或其他化学发光物质),将靶DNA在凝胶上(膜上)的带型通过特定的探针与之杂交,转换成X光片上直观的带型,才能进行相关分析。另外如果需要鉴定或寻找与已知DNA同源的 DNA片段
Southern-Blot杂交的原理、步骤及应用
原理Southern印迹杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原 则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方 法的灵敏性,综合凝胶电泳和 核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图
Genomic-Southern-Blot
SolutionsProtocol:Digest 5-10 μg genomic DNA overnight with restriction enzyme of choice.Run digested gDNA on 0.8% TAE gel with marker (with no ethidi
Southern杂交技术的方法和步骤
Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下列步骤:(1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使DNA原位变性。(2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上。(3) 预杂交滤膜,掩盖滤膜上非特异性位点。(4) 让探针与
核酸杂交技术(Northern-Blot、Southern-Blot和探针标记)
(一)Southern Blot原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进
Northern-Blot实验方法步骤
实验概要本文介绍了Northern Blot实验仪器试剂和方法步骤。实验原理在变性条件下将待检的RNA样品进行琼脂糖凝胶电泳,继而按照同Southern Blot相同的原理进行转膜和用探针进行杂交检测。用途:检测样品中是否含有基因的转录产物(mRNA)及其含量。主要试剂1. NorthernMax
Western-Blot操作步骤
背景: 蛋白质印迹的发明者是斯坦福大学George Stark。Neal Burnette于1981年所著的AnalyticalBiochemistry中首次被称为Western Blot。最开始做印迹的是一个叫Southern的科学家,但印迹的对象是DNA链,他把这种技术称为Southe
Western-Blot操作步骤
背景: 蛋白质印迹的发明者是斯坦福大学George Stark。Neal Burnette于1981年所著的AnalyticalBiochemistry中首次被称为Western Blot。最开始做印迹的是一个叫Southern的科学家,但印迹的对象是DNA链,他把这种技术
Northern-Blot实验仪器试剂和方法步骤(1)
[仪器、试剂、材料](一)仪器恒温水浴箱,电泳仪,凝胶成像系统,真空转移仪,真空泵,UV 交联仪,杂交炉,恒温摇床,脱色摇床,漩涡振荡器,分光光度计,微量移液器,电炉(或微波炉),离心管,烧杯,量筒,三角瓶,等。(二)材料总RNA样品或mRNA样品,探针模板DNA(25 ng),尼龙膜(三)试剂No
Northern-Blot实验仪器试剂和方法步骤(2)
7.探针的制备1.在1.5ml离心管中配制以下反应液:模板DNA(25 ng) 1ulRandom Primer 2ul灭菌水 11ul总体积:14ul2.95°C加热3分钟后,迅速放置于冰冷却5min。3.在离心管中按下列顺序加入以下溶液:10×Buffer 2.5uldNTP Mixtu
Genomic-Southern-Blot-Analysis
This chapter describes a detailed protocol for genomic Southern blot analysis which can be used to detect transgene or endogenous gene sequences i
Southern-blot杂交鉴定
1)取10ul待测DNA,于一定浓度的琼脂糖凝胶上进行电泳。(20mL,1.0%凝胶,)2) 凝胶用溴化乙锭染色,切掉凝胶四周多余部分,并在凝胶的一角作一记号, 拍照记录电泳结果(拍照时, 凝胶旁放一尺子)。3) 杂交用胶的制备 (做以下步骤两组合一)A.将凝胶浸没入30mL 0.25mol/L H
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)3
3)杂交:排尽预杂交液,在8.0ml 新Hyb 高效杂交液(Hyb-100)加入4.0μl 新变性好的探针(1-3ul/膜,5-20ng/ml杂交液),混匀。65℃杂交仪中杂交过夜(8-15转/分)。4)杂交完成后,将杂交液回收置于一可耐低温又可耐沸水浴的管中,贮存于-70℃以备重复使用。重复使用时
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)1
一、DNA 的提取人和哺乳动物细胞基因组DNA的分离通常是在有EDTA、Sarkosye等一类去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞,随后用酚、氯仿抽提,经RNase 处理和纯化来提取DNA。(1)取单层细胞,经无钙、镁PBS洗一次,用0.25%胰蛋白酶消化,细胞悬液经PBS洗2次,弃上清,取细胞沉淀。(