GenomicSouthernBlotAnalysis
This chapter describes a detailed protocol for genomic Southern blot analysis which can be used to detect transgene or endogenous gene sequences in cereal genomes. The protocol follows a standard approach that has been shown to generate high-quality results: size fractionation of genomic DNA; capillary transfer to a nylon membrane; hybridization with a digoxigenin-labelled probe; and detection using a che......阅读全文
Genomic-Southern-Blot-Analysis
This chapter describes a detailed protocol for genomic Southern blot analysis which can be used to detect transgene or endogenous gene sequences i
Genomic-Southern-Blot
SolutionsProtocol:Digest 5-10 μg genomic DNA overnight with restriction enzyme of choice.Run digested gDNA on 0.8% TAE gel with marker (with no ethidi
Southern-Blot
1. Run gel (0.8 -1.0% agarose is best). For yeast chromosomal Southerns, digest 20 μg DNA. Use 50 ml minigel for most purposes. Photograph gel, but mi
Southern-blot实验
实验方法原理 具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线
Southern-blot实验
实验方法原理 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA 或总RN
Southern-blot实验
Southern blot可应用于:(1)检测重组DNA;(2)分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段;(3)验证检测片段的分子量大小。实验方法原理具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶
SOUTHERN-BLOT的步骤
1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a ruler adjacent
Southern-blot杂交鉴定
1)取10ul待测DNA,于一定浓度的琼脂糖凝胶上进行电泳。(20mL,1.0%凝胶,)2) 凝胶用溴化乙锭染色,切掉凝胶四周多余部分,并在凝胶的一角作一记号, 拍照记录电泳结果(拍照时, 凝胶旁放一尺子)。3) 杂交用胶的制备 (做以下步骤两组合一)A.将凝胶浸没入30mL 0.25mol/L H
Screen-ES-cells-by-Southern-Blot
Digest DNA in 96-well plateTo each well add:4ul 10Xbuffer4ul Enzyme0.4ul Spermidine(0.4M)31.6ul H2O37‡C 19h, then add 4ul loading dye to each well. Lo
DNA(基因)检测-Southern-Blot
DNA(基因)检测-Southern BlotDNA吸印转移1.室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中,摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟,使DNA双链碱变性。溶液A:5M NaCl 300.0ml10M NaOH 50.0mlH2O 650.0
DNA印迹(Southern-Blot)实验
【实验原理】DNA印迹是1975年由英国Southern创建的。其基本原理是:DNA分子经限制性核酸内切酶酶切后,由琼脂糖凝胶电泳将所得 DNA片段按分子质量大小分离,然后将DNA片段变性,并使凝胶中的单链DNA片段转移到尼龙膜、硝酸纤维素膜(NC)或其他固相支持物上,此法中DNA 片段
Southen杂交
Southern杂交One important thing for transfer:the weight of the object resting on top of the blotting apparatus should not exceed the weight equal to a 5
Southern-Blot实验原理及方法
实验原理:Southern Blot是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,
核酸杂交技术(Northern-Blot、Southern-Blot和探针标记)
(一)Southern Blot原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进
Southern-blot实验方法与步骤
用于检测重组DNA,也可分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段。用于基因诊断,也可验证检测片段的分子量大小。将基因组DNA经限制性内切酶酶切,进行琼脂糖电泳,把分离后定位在凝胶上的不同分子量的DNA经碱变性处理,将凝胶中变性的DNA转移至一固相支持滤膜。利用标记的某一DNA、RNA或寡核苷
Southern-Blot原理及操作方法
原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进行结合,游离探针洗涤后用自显影或
Southern-blot实验方法与步骤
用于检测重组DNA,也可分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段。用于基因诊断,也可验证检测片段的分子量大小。将基因组DNA经限制性内切酶酶切,进行琼脂糖电泳,把分离后定位在凝胶上的不同分子量的DNA经碱变性处理,将凝胶中变性的DNA转移至一固相支持滤膜。利用标记的某一DNA、RNA或寡核苷
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...1
一、DNA Southern Blot及杂交 本技术可用于基因组DNA特定序列定位,尤其可分析某些基因的限制性内切酶长度多态性,对遗传性疾病的早期基因诊断、产前诊断或基因变异等方面的研究有应用价值,其过程包括:样品DNA内切酶水解、水解片断的琼脂糖凝胶电泳分离、分离后水解片断的转移(固定)、特异
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...2
(10)倒去预杂交液,加入含探针的杂交液封口,42℃ 6h或过夜。 (11)取出转移膜,按以下条件洗膜 1×SSC,0.1%SDS室温2×15分钟 0.25SSC,0.1%SDS,42℃ 2×15分钟,气中干燥。 (12)将杂交后的膜曝光于X光片,暗盒中放射自显影2~
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)2
)标记探针检测取标记产物和普通PCR扩增产物各1μl,1.0%的琼脂糖凝胶电泳。由于大分子量的DIG掺入,标记产物泳动速度比普通PCR产物要慢。所以根据电泳图就可以判断是否标记上和有没有非特异标记!其余标记产物-20℃保存。如果要准确检测标记效率(一般不必),取标记产物1μl和Dig标记的对照DNA
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)3
3)杂交:排尽预杂交液,在8.0ml 新Hyb 高效杂交液(Hyb-100)加入4.0μl 新变性好的探针(1-3ul/膜,5-20ng/ml杂交液),混匀。65℃杂交仪中杂交过夜(8-15转/分)。4)杂交完成后,将杂交液回收置于一可耐低温又可耐沸水浴的管中,贮存于-70℃以备重复使用。重复使用时
Southern-blot实验方法和操作步骤
第一天 (restriction enzyme digestion)1.取待測的genomic DNA,用二次水稀釋10倍(30μl的DNA 加270μlddH2O→ 300μl)2.換算genomic DNA濃度(OD260),再換算取10μg所需的體積。3.取10μg DNA,用限制酵素EcoR
Southern-Blot杂交的原理、步骤及应用
原理Southern印迹杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原 则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方 法的灵敏性,综合凝胶电泳和 核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)1
一、DNA 的提取人和哺乳动物细胞基因组DNA的分离通常是在有EDTA、Sarkosye等一类去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞,随后用酚、氯仿抽提,经RNase 处理和纯化来提取DNA。(1)取单层细胞,经无钙、镁PBS洗一次,用0.25%胰蛋白酶消化,细胞悬液经PBS洗2次,弃上清,取细胞沉淀。(
转基因
DNA PreparationGene TransferEmbryo TransferTransgenic IdentificatioinOthersTransgenic Outline (University of Michigan Transgenic Animal Model Core)Thi
Southern-blot检测技术在模式动物制备中的应用
哈喽,小伙伴们!走过不要错过,又到了科普知识的时间了,喜欢做分子实验的小伙伴一定听说过Southern blot这门检测技术,但大家知道为什么叫Southern吗?今天小编就为大家科普一下这门实验技术。 Southern Blot是最早出现的blot(印迹)技术,它是检测DNA的一种方法。
Southern-blot检测技术在模式动物制备中的应用
哈喽,小伙伴们!走过不要错过,又到了科普知识的时间了,喜欢做分子实验的小伙伴一定听说过Southern blot这门检测技术,但大家知道为什么叫Southern吗?今天小编就为大家科普一下这门实验技术。 Southern Blot是最早出现的blot(印迹)技术,它是检测DNA的一种方法。
Southern杂交技术
SOUTHERN BLOT1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a r
Genomic-Libraries
Genomic DNA libraries Size of some genomes and chromosomes:Comparative Sequence Sizes(Bases)(yeast chromosome 3)350 ThousandEscherichia coli (bacteriu