海洋所等在海洋生物对逆境适应进化研究中取得重要进展
9月20日,由中国科学院海洋研究所联合华大基因、美国新泽西州立大学等多家单位完成的牡蛎对潮间带逆境适应机制的研究成果,由《自然》(Nature)杂志以长篇论文(Article)形式在线发表。 该研究利用新一代测序技术和全新的组装策略,构建了牡蛎全基因组序列图谱,证实了牡蛎基因组序列具有极高的多态性、较高比例的重复序列和活跃的转座子。结合转录组、蛋白谱等最新组学技术,研究人员发现一系列与牡蛎抗逆能力相关的基因发生明显扩张,这可能是牡蛎适应潮间带逆境适应的主要分子基础。研究还揭示了在逆境适应中发挥重要作用的贝壳的复杂形成机制。 此成果的发表,标志着基于短序列的复杂基因组拼接和组装技术获得重大突破,在国际上填补了牡蛎为代表的冠轮动物基因组和海洋生物潮间带逆境适应机制研究的空白,这也是我国海洋生物及水产经济生物相关研究成果以研究论文形式第一次登上Nature杂志。 牡蛎隶属于动物界第二大门-......阅读全文
日本研究人员数字化定位海洋生物食物链
“大鱼吃小鱼、小鱼吃虾米”,这种“吃”与“被吃”的关系形成了海洋食物链,但是给各种生物在食物链中准确定位并非易事。日前,日本研究人员开发出利用数字使海洋生物食物链关系一目了然的新方法,从而给它们编排出“数列号”。 在食物链中,通过光合作用获得能量的植物位于底端,而肉食动物位于上层,呈金字塔
研究人员绘出苹果基因组草图
一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上报告说,他们绘出了苹果的基因组草图,这将有助于从基因水平上分析苹果性状,培育更多苹果新品种。 意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说,他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果
中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序
中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果,至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序,为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。 中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚,但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前,人类完成全基因组测序的
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
研究人员破译香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm广东省农业科学院研究员易干军领衔的香蕉遗传改良团队与广西大学教授陈玲玲团队合作,破译了香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组,首次在国际上组装染色体级别的异源三倍体香蕉栽培种(AAB)参考基因
研究人员成功构建首个圭亚那柱花草基因组
在国家自然科学基金等项目的资助下,华南农业大学副教授陈曙团队成功完成首个圭亚那柱花草染色体水平基因组组装,从基因组、转录组及表观遗传组多维度解析其抗逆分子机制,为热带牧草分子育种与抗逆研究提供关键理论支撑与基因资源。相关成果近日发表于《植物杂志》(The Plant Journal)。圭亚那柱花草比
研究人员发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物,是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短(约6周),饲养成本低,单胎产仔数较高(每胎2-5只)等特点,在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前,树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建,是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组
新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说,该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制,寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。 相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说,艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖
研究人员构建人类阴道微生物基因组库
6月21日,深圳市宝安中医院(集团)副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统,各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系,其间的平衡关乎女性生殖健康及胎
研究人员发现:霍乱正改变人类基因组
生命演化到今天,人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明,当代人类也在进化,而引发这种进化的,竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明:在霍乱流行的孟加拉国,人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日,西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料,整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
安捷伦授予临床基因组研究人员Peter-Robinson“思想领袖奖”
分析测试百科网讯 2016年11月29日,安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC,以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候,中国中医科学院中药研究所所长陈士林(详见本网报道:中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”)和癌症研究
研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组
密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅,密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目,旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因,以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测序进行了比较。他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚桃子的基因组序列进行比较。
远古海洋生物身份敲定
最新的化石研究表明,在十多年前曾被描述的一个神秘的海底居民不但穿着“铠甲”,而且比它们现代的亲属更为庞大。石莲桦属分枝花柱(Cotyledion tylodes)拥有高脚杯状的外形,杯体外环绕着U型消化道(图左化石的黑色特征,箭头表示流动的食物),这种动物往往将自己锚定在
研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”
人类对基因组变异的认识又向前推进一大步:西安交通大学日前传出消息,该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构,通过开发新的计算机算法和分析处理流程,分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异,其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异,即基因组中的“暗物质”。 据介
研究人员解析人类基因组计划的赢利奥秘
人类基因组计划(genome project)为美带来1万亿美元经济增长。 美国巴特尔纪念研究所6月12日发布的一份颇具争议的报告指出,解码人类基因组项目的经济收益持续增长。该项目结束10年后,目前其带来的收益已接近1万亿美元。 1988~2003 年进行的人类基因组计划(genom
火山喷发阻碍海洋生物生长
据美国科学促进会(AAAS)科技新闻共享平台EurekAlert!近日报道,科学家已发出警告,即便是二氧化碳浓度保持在工业化前水平的西北太平洋海域,也面临着因火山爆发导致的排放浓度加剧、热浪和海洋酸化等重重危机,本被寄予希望向北增长的珊瑚礁和海藻森林,命运堪忧。 日本式根岛火山地处于温带和热
全球研究人员致力于创造首个合成真核生物基因组
10年前,当遗传学家Ronald Davis首次提出,他的同事正在尝试创造人工酵母染色体,并将其放入活细胞时,Jef Boeke并没有太多想法。Davis就职于美国加州斯坦福大学医学院,是一个有远见的人。他提出,实验室酵母是当时合成生物学领域的下一个发展方向。不过,Boeke并不理
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
海洋所等在海洋生物对逆境适应进化研究中取得重要进展
9月20日,由中国科学院海洋研究所联合华大基因、美国新泽西州立大学等多家单位完成的牡蛎对潮间带逆境适应机制的研究成果,由《自然》(Nature)杂志以长篇论文(Article)形式在线发表。 该研究利用新一代测序技术和全新的组装策略,构建了牡蛎全基因组序列图谱,证实了牡蛎基因组序列具有极
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
海洋生物酶研究取得突破
由中国水产科学研究院黄海水产研究所研究员孙谧主持的2011年度国际科技合作与交流专项项目——海洋酶可逆抑制剂分子库构建及酶稳定化技术联合研发项目,日前在海洋生物酶稳定化和抑制剂研究方面取得突破性进展。 项目组初步获得了液体酶的稳定剂,其稳定性在5个月后仍保留92%的活性,并研发了
海洋生物多糖材料研究获进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物医用材料工程组在海洋生物多糖材料的应用研究方面取得新进展,科研人员在对海洋多糖材料深入研究的基础上,首次发现了海藻酸钠形成的聚合物具有抑制胰蛋白酶酶解这一新的生物学特性。 据介绍,以海藻酸钠为代表的海洋生物多糖材料来源广泛、生物安全性高、可降解,并且具有抗
福建海洋生物加工专项验收
日前,福建省科技重大专项海洋生物综合利用及活性物质提取技术研究与应用项目通过专家验收。 该专项由福建农林大学、厦门大学、集美大学、福州大学、国家海洋三所及四家企业共同承担,是福建首个立项的海洋生物加工技术领域的重大专项。项目组以海藻为原料,研发出高纯度的天然藻红素食品添加剂,开发并生产了5
海洋生物“霸主”易位之谜获揭示
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508329.shtm在三叠纪以前的海洋里,腕足类动物在温暖的浅海中繁衍生息,是海洋中最常见的底栖生物,比体型相似的双壳类繁盛得多。但在二叠纪—三叠纪之交(2.52亿年前)生物大灭绝后,双壳类迎头赶上并超越
中科院:海洋生物cDNA分析
造礁石珊瑚为珊瑚礁生态系统中的框架生物, 研究其重要功能基因对于理解造礁石珊瑚对环境变化的响应有重要指示意义,近期来自中国科学院南海海洋研究所的研究人员提取了澄黄滨珊瑚(Porites lutea)的总RNA, 通过RT-RCR得到 cDNA, 并以 cDNA为模板设计引物进行 test
海洋生物“霸主”易位之谜获揭示
在三叠纪以前的海洋里,腕足类动物在温暖的浅海中繁衍生息,是海洋中最常见的底栖生物,比体型相似的双壳类繁盛得多。但在二叠纪—三叠纪之交(2.52亿年前)生物大灭绝后,双壳类迎头赶上并超越腕足动物,遍布全球海洋的每个角落,而此时腕足类却全面衰败,成为海洋的边缘分子,是什么原因导致两者统治地位的转换?
探秘海洋生物-赋能蓝色产业
谈到我国海洋生物学的发展,不能不提位于青岛黄海之畔的中国科学院海洋研究所(以下简称海洋所)。它是发源于70年前新中国第一个海洋生物研究机构。 今天,海洋所已为我国海洋生物研究练就一支生力军,培育了一个完整的链条。从探秘生命奥秘到建设“蓝色粮仓”,从发展海洋生物高技术到开发利用蓝色基因资源,从这