PNAS将破译所有真核生物基因组,极大改善物种保护工作

深圳特区报讯 昨日,《美国科学院院刊》正式发布“地球生物基因组计划”(以下简称“EBP”)的科研展望文章。该项目是一个全球范围的基因组测序项目,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务提供新的基因资源。深圳企业华大基因是该项目的发起单位之一。 “EBP项目是继人类基因组计划之后,生命科学领域又一件大事,目标是破译地球上所有真核生物的基因组。”项目负责人介绍说,这一具有里程碑意义的项目吸引了全球科学家的关注,可以让世界上数千名科学家和数百万民众参与,所产出的数据超过1EB(相当于1亿部高清电影,播放2.3万年),将推动全新计算算法、分析方法和模型的创立,革新对生物学的理解,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务提供新的基因资源。 根据项目计划,科学家将对所有真核生物的基因组内容进行全面编目,并免费公开共享数据,作为未来科学发现的基础。 相关新闻 ......阅读全文

基因组所种属特异性小蛋白功能和进化研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所(以下简称基因组所)于军研究员和肖景发副研究员及其团队参与完成的国家自然基金和国家重点基础研究发展计划项目——种属特异性小蛋白的功能和进化研究取得新进展,相关研究论文被《生物化学与生物物理进展》网络版接收。  小蛋白(小于个100氨基酸长度的蛋白

基因库的物种形成机制介绍

  遗传系统和基因组本身被认为是一种关系整体,是适应和各种调节的中心:遗传单位与其说是基因组本身,毋宁说是某一“种群”的“基因库”或基因组聚合的相互作用;反过来,基因库也要适应和整合,并成为全部调节和不断再平衡的源泉,因此,它构成(或如某些著名理论家所说)个体与物种之间结合的中间水平(皮亚杰1989

科研人员开发“内源驱动”真核生物多顺反子表达系统

  中国农业科学院生物技术研究所微生物智能设计与合成创新团队联合国内外研究机构开发出一种在真菌中实现多顺反子表达的系统,提升了真核细胞工厂合成工农业高价值化学品的原创设计能力。近日,相关研究成果发表在《自然通讯(Nature Communications)》上。  合成生物学能够重新编程细胞,构建细

南京土壤所土壤真核微生物海拔分布研究取得进展

  大型真核生物(如宏观动植物)的多样性一般随海拔升高而降低,而土壤原核微生物(如细菌)却并不一定呈现出明显的海拔分布模式。因此,细胞结构与生物尺寸大小的差异可能对生物多样性随海拔的分布模式产生重要的影响。  中国科学院南京土壤研究所褚海燕研究员课题组通过454高通量测序技术深入研究了长白山土壤真核

我国科学家解析真核生物基因表达调控新机制

  中科院上海植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组发现,染色质修饰与mRNA转录起始及加工有着相互依存关系,两者协同作用,以提高成熟mRNA及基因表达的水平。相关成果2月29日在线发表于《自然—植物学》杂志。  据了解,mRNA前体的转录起始在表观遗传学水平上受到多种转录因子以及染色质修饰与重塑的调控

上海生科院解析真核生物基因表达调控的新机制

  2月29日,Nature Plants 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组(植物环境表观遗传学实验室)题为Coupling of histone methylation and RNA processing by the nuclear mRNA Cap

中科院大连化物所揭示真核生物tRNA加工成熟分子机制

   近日,大连化物所分子反应动力学国家重点实验室李国辉研究员团队与上海交通大学精准医学研究院雷鸣教授团队,以长文的形式在国际学术期刊《科学》(Science)在线发表了两个课题组作为共同通讯作者单位合作完成的最新研究成果——“Structural insight into precursor tR

燕山地区发现迄今最早的多细胞真核生物化石

1月24日,中国科学院南京地质古生物研究所研究员朱茂炎带领的地球-生命系统早期演化团队,在《科学进展》(Science Advances)上,报道了在华北燕山地区16.3亿年前地层发现的多细胞真核生物化石。这些保存精美细胞结构的微体化石被认为是迄今全球发现最早的多细胞真核生物化石记录。这是继2016

南京古生物所等元古代微体真核生物化石研究获进展

  新元古代大冰期前的有机质壁微体化石是研究真核生物起源和早期真核生物的重要材料,它们也为该时期地层的划分与对比提供了重要的生物地层学依据。最近,中国科学院南京地质古生物研究所研究员袁训来领导的早期生命研究团队对我国山西永济古-中元古代汝阳群和华北地台新元古代沟后组中的有机质壁微体化石进行了深入研究

基因组的不同类型

病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA,也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成,但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成   。原核基因组原核生物和真核生物基因组由

华中农大:利用I型及III型CRISPRCas系统实现基因组编辑

  CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,近年来科学家们针对它们的分子机制开展研究促使开发出了基于II型系统的一些基因编辑技术(延伸阅读:中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果 )。然而,却未有研究报道利用I型及III型系统来实现基因组编辑。  来自华中农业大学的研究人员报告称

全部脊椎动物基因组测序再上路

  为了获得更多的关注和支持,研究人员迫切希望对所有脊椎动物的基因组进行测序。近日,科学家正式启动了脊椎动物基因组计划(VGP),发布了14个物种的15个高质量基因组。但该计划仍远未筹集到所需资金,以记录地球上约6.6万种脊椎动物的基因组。  这个项目已经进行了3年,其前身是2009年启动的基因组1

《Cell》揭示基因组周期性的起源!

  巴塞罗那生物医学研究所(IRB Barcelona)的科学家发现,从酵母到人类,所有真核生物的基因组序列都具有周期性。这项发表在《细胞》杂志上的研究结果为基于自然选择的相关研究提供了另辟蹊径的新解释。  研究人员证明,真核生物基因组序列周期性的生成对DNA损伤和修复过程具有重要意义。在细胞核内,

水生所完成模式硅藻的蛋白质组精细图谱

  硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物,分布广泛,提供了地球上约20%的初级生产力,对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物,其基因组序列于2008年公布,但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

PNAS:为什么线粒体保留自身基因组

  这听起来像科幻小说,认为人体内的每一个细胞都是由一个具有基因组的微小细胞器所占据,我们与其存在共 生关系。但是在现实中,真核生物的生命依赖于线粒体,它以三磷酸腺苷的形式给细胞提供能量(ATP)。几 千年来,线粒体的基因组是在最小基因含量的选择下进化的,但是研究者们一直无法确定“为什么有些线粒体基

瞬时转染真核基因表达调控技术

调节瞬时转染基因的表达l      四环素作为哺乳动物细胞中可诱导基因表达的调控物阶段一:pTet-tTAk稳定转染成纤维细胞培养和转染细胞1.      在DMEM完全培养液中培养贴壁细胞。转染前一天,把细胞换到含有0.5μg/ml四环素-HCl(四环素)的DMEM完全培养液中。每个10 cm培养

分子遗传学词汇真核基因

中文名称:真核基因定    义:真核细胞核基因组DNA编码的基因,以及感染真核细胞的DNA病毒和反转录病毒基因组编码基因。释    义:真核基因:真核细胞核基因组DNA编码的基因,以及感染真核细胞的DNA病毒和反转录病毒基因组编码基因,统称真核基因。

瞬时转染真核基因表达调控技术

调节瞬时转染基因的表达*四环素作为哺乳动物细胞中可诱导基因表达的调控物阶段一:pTet-tTAk稳定转染成纤维细胞培养和转染细胞1. 在DMEM完全培养液中培养贴壁细胞。转染前一天,把细胞换到含有0.5μg/ml四环素-HCl(四环素)的DMEM完全培养液中。每个10 cm培养皿中加入足量细胞,使转

真核起始因子的相互作用

  真核起始因子之间与核糖体之间存在着大量的相互作用,构成了一个相互作用网络。其中,eIF3是介导这一相互作用网络的中心点,它的一个或多个亚基可以与eIF1、eIF1A、eIF2、eIF4B、eIF4G、eIF5以及核糖体40S亚基相互作用。这些相互作用可能是稳定的,从而可以形成稳定的复合物参与翻译

真核基因转录水平的调控1

一、真核生物的RNA聚合酶有三种RNA聚合酶:RNA聚合酶Ⅰ;RNA聚合酶Ⅱ;RNA聚合酶Ⅲ。二、真核基因顺式作用元件(一)、顺式作用元件概念指DNA上对基因表达在调节活性的某些特定的调控序列,其活性仅影响其自身处于同一DNA分子上的基因。(二)、种类启动子、增强子、静止子1、启动子的结构和功能启动

真核基因转录水平的调控2

(3)增强子的位置可在基因5′上游、基因内或其3′下游的序列中,而其作用与所在基因旁侧部位的方向似无关系,因为无论正向还是反向,它都具有增强效应;(4)增强子所含核苷酸序列大多为重复序列,其内部含有的核心序列,对于它进入到另一宿主之后重新产生增强子效应至关重要;(5)增强子一般都具有组织和细胞特异性

真核基因的基本结构有哪些

真核基因的基本结构真核基因:编码序列(外显子)非编码序列:单个编码序列间隔序列(内含子)调控序列(顺式作用元件):启动子,增强子,沉默子

小须鲸全基因组图谱获破译

  11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等

我科学家破译龙眼基因组

  记者11日从福建农林大学获悉,该校赖钟雄科研团队的论文于牛津大学出版社出版的《Giga  Science》杂志上在线发表。这是首次在国际公布的龙眼全基因组数据库,也是无患子科植物第一个全基因组数据库,标志着我国在相关领域的研究处于国际领先水平。  据赖钟雄研究员介绍,龙眼与近缘属果树荔枝、红毛丹

植物所等破译构树基因组

  构树(Broussonetia papyrifera)又称纸皮树、肥猪树,为桑科构属多年生阔叶乔木,自然分布于我国大部分地区和东南亚,是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株,种子数量多,易繁殖,生长快,表型性状和遗传多样性丰富,基因组紧凑,可作木本植物研究的模式材料。同时,构树有着悠久的开

“万种脊椎动物基因组计划”宣布启动

  拟两年解码101种物种 建立遗传信息数据库   深圳华大基因研究院与“万种脊椎动物基因组计划”联盟(G10KCOS)的科学家联合宣布启动万种脊椎动物基因组一期计划。该计划将依托华大基因先进的新一代测序技术平台、前沿的信息分析和数据处理能力,在未来两年内完成对101种脊椎动物的全基因组测序,解析

科学家构建新的生命树

   4月11日在《Nature Microbiology》发表的一项研究中,科学家们构建了了一种新的生命之树,显示了所有已知生物之间的关系,通常分类学家们分成三个领域:真核生物、细菌和古生菌。这个新的生命树的最大分支,是由对科学界来说全新的细菌组成。延伸阅读:首个包含230万种物种的生命之树发布;

真核生物18S核酸检测试剂盒使用说明

说明物种鉴定系列可针对食品、饲料等样品中动物源性成分的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于真核生物18S的检测,检出限为0.1%。◆ 产品组成(96测试) 021162LⅡ 试剂

关于染色质免疫沉淀法—真核生物的基本介绍

  是由内源和外源因素共同影响的,所有信号传递途径的终点都是DNA。DNA通过核蛋白复合物组成染色质,染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制--“组蛋白密码”,其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋白磷酸化、乙酰化、甲基化、AD