水生所完成模式硅藻的蛋白质组精细图谱
硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物，分布广泛，提供了地球上约20%的初级生产力，对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因组序列于2008年公布，但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)是利用蛋白质组学数据，尤其是高精度的串联质谱数据，结合基因组和转录组数据对基因组进行深度注释。中国科学院水生生物研究所研究员葛峰学科组前期采用蛋白基因组学的研究策略和方法，完成了模式蓝细菌的基因组深度解析 (PNAS，2014，111（52）：E5633-E5642)并开发了针对原核生物的蛋白基因组学专业分析软件GAPP（Molecular & Cellular Proteomics. 2016；15(11):3529-3539）。在这些工作的基础上，葛峰学科组对三角褐指藻的基因组进行了深度解析并构建了蛋白质组精细图谱。 该......阅读全文
水生所完成模式硅藻的蛋白质组精细图谱
硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物，分布广泛，提供了地球上约20%的初级生产力，对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因组序列于2008年公布，但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)
迄今最精细黑猩猩脑图谱——黑猩猩脑网络组图谱发布
近期，中国科学院自动化研究所脑网络组研究团队联合国内外科研机构，发布了迄今为止最精细的黑猩猩脑图谱——黑猩猩脑网络组图谱（ChimpBNA）。这一成果为比较神经科学研究提供了重要工具，并为探讨人脑演化提供了新视角。黑猩猩是人类最亲近的灵长类亲戚之一，与人类共享约600万至800万年前的共同祖先。尽管
科学家完成糜子全基因组精细图谱
1月25日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组和朱健康研究组题为The genome of broomcorn millet 的研究论文。该研究完成了糜子基因组精细图
研究团队合作发布白木香基因组精细图谱
近日，中国热带农业科学院热带生物技术研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所崔鹏团队合作发布了白木香基因组精细图谱，相关研究结果已发表在GigaScience期刊。该基因组精细图谱的发布将为野生白木香种群保护生物学、沉香结香机制和香味基因及树种的进化研究奠定良好基础，也为进一步基于基因组的白木
我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制
日前，中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制，探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等，在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物，进化学家推测这些双侧对称动物可能起
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日，中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作，破译了褐牙鲆全基因组序列，通过与半滑舌鳎全基因组比较分析，初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日，中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作，破译了褐牙鲆全基因组序列，通过与半滑舌鳎全基因组比较分析，初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
从20世纪70年代开始，云南省怒江州就开始种植草果，到2020年，种植面积已达111万亩，不仅是全国草果的核心产区，也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。 为了加快提高草果遗传改良效率，培育高产、抗病、优质、安全新品种，对从源头创新保障草果产业健康可持续发展，2019年9月，怒江州联合华南农业
Genome－Biology：普通小麦精细表观组图谱绘制成功
7月15日，Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱，以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定，并初步探索
中国启动十万人基因组计划：绘制国人精细基因组图谱
科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱，来研究疾病健康和基因遗传的关系。 此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区，涉及人群除汉族外，还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。 基因是DNA上有遗传效应的片断，人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和
科研人员首绘小黄鱼全基因组精细图谱
17日，记者从浙江省农科院获悉，该院水生生物研究所小黄鱼科研团队与美国奥本大学、厦门大学合作，首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制，为建立小黄鱼基因组选择育种、培育高产抗病优质良种提供了基因资源和技术手段，相关研究论文近日在线发表于学术期刊《分子生态学资源》上。 小黄鱼是中国重要的海产经
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位，共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱，为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源，也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。 植物的所有组织、器官中都富含蛋白质，它是构成
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位，共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱，为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源，也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质，它是构成细胞和生
Cell重要成果：绘制凋亡蛋白质组图谱
斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱，揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。 磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。
斜纹夜蛾精细基因图谱绘出
28日，记者从西南大学获悉，该校家蚕基因组生物学国家重点实验室联合法国、日本、美国等多国研究机构，在全球首次绘制出斜纹夜蛾精细基因图谱，并于25日发表于国际权威期刊《自然·生态学与进化》上。该研究成果揭示了斜纹夜蛾的高质量基因组精细图谱，以及群体变异图谱和基因表达图谱，可为其防治提供科学依据。
我国学者成功完成小麦A基因组的测序和精细图谱绘制
小麦是全球最重要的粮食作物，养活了世界上40%的人口，提供了人类所需热能和蛋白质的20%。我国是世界上小麦生产和消费大国，常年种植面积为2,400万公顷左右，年产量近1.3亿吨。生产上广泛种植的普通小麦是一个经两次自然杂交而形成异源六倍体，含有A、B和D三个亚基因组，其基因组大（约17 Gb，是
蛋白质组学牛人利用新技术分析蛋白质图谱
蛋白质组(proteomics)分析是针对不同条件下细胞中蛋白的功能和特性进行研究的统称，这一领域的研究一直以来都落后于基因组研究，后者在技术创新方面取得了不少成果，一些令人眼花缭乱的快速基因组图谱绘制技术，还有无需借助核心实验室设备就能完成实验的技术，都令我们印象深刻。 但是与基因组研究
首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布
近日，中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位，绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱，揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用，并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》（Cell Genomics）上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息，但不足以阐
单细胞蛋白质组学：让细胞个体研究更加精细
细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。 在组织、器官或个体中，细胞具有非常大的异质性，而传统的研究手段针对大量细胞进行分析，得到的是大量细胞的平均结果，无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值，从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异，不
第一张人类器官蛋白质组图谱
在广州南方医科大学举行的第五届中国蛋白质组学大会暨首届粤港蛋白质组学学术交流会上，由中国科学家领衔的“人类蛋白质组计划”有望实现肝癌诊治突破性进展。 据了解，该计划实施3年来，围绕人类肝脏蛋白质组的表达谱等九大科研任务，我国科学家成功测定出6788个高可信度的中国成人肝脏蛋白质，系统构建了国际上
破解了香气之谜－蜡梅的染色体水平精细基因组图谱公布
“一花香十里，更值满枝开。”凌寒怒放的蜡梅，是万花凋零的寒冬里一道亮丽的风景，其香味浓郁而独特，成为历代文人墨客挥笔高歌的对象。蜡梅为何冬季开花？其独特香味由何而来？蜡梅 华中农大供图 近日，华中农业大学刘秀群、赵凯歌研究组和金双侠研究组联合西南林业大学陈龙清研究组，在《基因组生物学》在线发表
B染色体精细图谱和功能研究
早在一个多世纪前发现B染色体在很多植物、动物和真菌基因组中广泛存在。B染色体对于个体的生命活动来说不是必需的，但它们仍然通过不同的机制存在于种群中。例如玉米B染色体不与任何A染色体配对，其传递不遵循孟德尔遗传定律，花粉第二次有丝分裂B染色体会发生不分离 (nondisjunction)，包含B染
猪胚胎骨骼肌染色精细图谱开放
猪胚胎骨骼肌染色体开放区分布及其对基因表达的影响 中国农科院供图 近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所猪遗传育种科技创新团队成功绘制了猪胚胎发育全期骨骼肌基因组染色质开放区域精细图谱，鉴定出了调节肌肉发育的顺式调控元件及相关基因，为进一步研究猪胚胎骨骼肌发育相关基因的调控动力学奠定了基
科学家全面绘制人类健康与疾病蛋白质组图谱
复旦大学附属华山医院教授郁金泰、毛颖团队与复旦大学类脑智能科学与技术研究院研究员程炜、教授冯建峰团队合作，全面绘制了人类健康与疾病蛋白质组图谱，并结合人工智能大数据分析方法构建了疾病诊断预测模型以及发现了26个药物治疗新靶点，为精准医学的实施提供了重要科学依据。11月22日，相关研究发表于《细胞》。
用蛋白质组学方法绘制磷酸化位点图谱
方案1 用带有 Fe(Ⅲ) 和 Ga(Ⅲ)的 IMAC 纯化磷酸化多肽 方案2 在 MALDI 分析之前或之后对磷酸化多肽进行碱性磷酸酶处理 方案3 结合固定化金属离子亲和介质和 MALDI-TOF-MS 直接分析方法对磷酸化多肽进行特征分析实验 方
最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前，由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学
迄今为止最精细的黑猩猩脑图谱发布
1月14日，《中国科学报》从中国科学院自动化研究所（以下简称自动化所）获悉，该研究所脑网络组研究团队联合国内外多个科研机构，发布了迄今为止最精细的黑猩猩脑图谱——黑猩猩脑网络组图谱（Chimpanzee Brainnetome Atlas, ChimpBNA）。为了促进全球科研人员的合作研究，研究团
人类血浆蛋白质组遗传图谱公开－有助鉴定新的治疗靶点
英国《自然》杂志6月6日发表了一项遗传学最新成果：剑桥大学研究团队量化了人体血浆中的3000多种蛋白质，成功绘制出人类血浆蛋白质组遗传图谱，其中89%前所未知。该研究发现的遗传变异与个体蛋白水平之间的联系，或意味着可以借此鉴定出新的治疗靶点，并将现有药物用于治疗新的疾病。 血浆蛋白是指血浆中的
十年大型项目，绘制人类蛋白质组图谱
由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集（Human Protein Atlas，HPA）项目，在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体，将其应用于保存组织的薄切片，观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体，研究人
高绍荣Cell－Reports：小鼠植入前胚胎蛋白质组动态图谱
近日，同济大学高绍荣课题组与华东师范大学廖鲁剑课题组合作在Cell子刊《Cell Reports》杂志在线发表题为“Protein Expression Landscape of Mouse Embryos during Pre-implantation Development”的文章。首次报道