研究揭示蓝细菌中赖氨酸甲基转移酶的作用机制

蛋白质翻译后修饰通过在一个或几个氨基酸残基上加上化学修饰基团而改变蛋白质的结构和功能,参与蛋白质的活性状态、定位、折叠以及蛋白质-蛋白质间相互作用。赖氨酸甲基化是常见的蛋白质翻译后修饰类型之一,其调控机制复杂,在生命调控过程中的地位较为重要,尤其在真核生物中的组蛋白上发生的甲基化修饰,对异染色质形成、基因印记和转录过程有重要的调控作用。目前在真核生物中已报道多种能够催化关键细胞因子发生赖氨酸甲基化的修饰酶,并对各种关键通路进行精确的调节。然而,对原核生物中的赖氨酸甲基化修饰的功能却知之甚少,特别是在蓝细菌中,是否存在赖氨酸单甲基化修饰和甲基转移酶,以及这些甲基化修饰与转移酶的功能尚不清楚。 中国科学院水生生物研究所水生生物蛋白质组学课题组证实赖氨酸单甲基化修饰在藻类和植物中普遍存在,通过发展赖氨酸单甲基化蛋白质丙酰化修饰技术,结合修饰肽段富集与质谱鉴定等方法,实现模式蓝细菌集胞藻PCC6803赖氨酸单甲基化修饰蛋白的系统性......阅读全文

研究揭示蓝细菌中赖氨酸甲基转移酶的作用机制

  蛋白质翻译后修饰通过在一个或几个氨基酸残基上加上化学修饰基团而改变蛋白质的结构和功能,参与蛋白质的活性状态、定位、折叠以及蛋白质-蛋白质间相互作用。赖氨酸甲基化是常见的蛋白质翻译后修饰类型之一,其调控机制复杂,在生命调控过程中的地位较为重要,尤其在真核生物中的组蛋白上发生的甲基化修饰,对异染色质

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

张锴:组蛋白赖氨酸修饰的鉴定和定量研究

天津医科大学 张锴老师  2014年8月29日第三届环渤海色谱质谱学术报告会在天津市万源龙顺庄园农业博览馆顺利召开。大会邀请到多位色谱质谱届专家学者做了精彩的报告。来自天津医科大学的张锴老师带来了《组蛋白赖氨酸修饰的鉴定和定量研究》的报告。  在组蛋白赖氨酸修饰的生物学意义中张锴老师表示赖

组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系

在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—

研究发现全新组蛋白修饰类型——赖氨酸乙酰乙酰化

  细胞代谢为生命过程提供能量。同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸)为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下,肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源,且与多种病理生理状态密

赖氨酸翻译后修饰及对蛋白质功能调控作用中期总结召开

  7月29日,科技部重大科学研究计划“赖氨酸翻译后修饰及对蛋白质功能的调控作用”项目中期总结会议在中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所学术报告厅召开。会议由项目首席科学家、健康所研究员秦樾主持。科技部基础研究管理中心朱庆平副处长和健康所主持工作的副所长孔祥银研究员出席会议并讲话。   孔祥银

简述基因沉寂的原理介绍

  基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染

基因沉寂的基本原理

基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染色质

基因沉寂的原理

基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染色质

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因

基因沉寂的定义和原理

定义RNAi与转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing and transgene silencing)在分子层次上被证实是同一种现象。原理基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶

上海药物所发现赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及其调控酶

  蛋白翻译后修饰是调控诸多生物学过程和疾病的主要生物学通路之一,因而,蛋白翻译后修饰通路研究正成为目前新药研发的重要热点之一。近日,中科院上海药物研究所联合美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室建立的中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心发现了细胞中赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及

组蛋白的合成修饰的相关介绍

  这是形成组蛋白各组分微不均一性的主要原因。修饰的方式有:  ①乙酰化。有两种:  一种是H1、H2A、H4组蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨酸,组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修饰。  另一种是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端区域的某些专一位置形成N6-乙酰赖氨酸。  ②

上海巴斯德所发现赖氨酸甲基化负调节IFITM3抗病毒功能

  10月16日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry在线发表了中科院上海巴斯德研究所李斌课题组题为Negative Regulation of Interferon-Induced Transmembrane Protein 3 by SET7-media

生物物理所解析线虫精氨酸对称双甲基化酶的晶体结构

   线虫PRMT5晶体结构示意图,其活性单位为同源二聚体   12月5日,美国《国家科学院院刊》(PNAS) 在线发表了中科院生物物理研究所许瑞明、龚为民、刘迎芳研究组以及遗传发育所鲍时来课题组合作的最新研究成果Structural Insights into Prote

李斌研究组JBC发现赖氨酸甲基化负调节IFITM3的抗病毒功能

  10月16日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry在线发表了中科院上海巴斯德研究所李斌课题组题为Negative Regulation of Interferon-Induced Transmembrane Protein 3 by SET7-media

多肽稳定标同位素记技术与甲基化修饰技术

1. 多肽稳定标同位素记技术     随着多肽在生物医药领域越来越广泛和深入的应用,标记和修饰性的多肽种类的需求越来越多,质量需求也越来越高。稳定同位素标记(同位素示踪法)就是其中典型的一种。稳定同位素标记多肽是指用稳定同位素标记的氨基酸合成的多肽。与标准氨基酸相比,同位素标记是指用2H,13C或1

最新进展:RNA的甲基化与去甲基化修饰

  德国慕尼黑的路德维希-马克西米利安大学(LMU)研究人员发现了细菌RNA中一种新型的化学修饰形式。显然,只有当细胞处于应激状态时,这种修饰才会附着在分子上,并且在恢复过程中会迅速去除。  核糖核酸(RNA)在化学形式上与DNA密切相关,而DNA是所有细胞中遗传信息的载体。实际上,RNA本身在将遗

我国学者在组蛋白修饰领域取得进展

图 Menin在核小体环境下识别H3K79me2的示意图  在国家自然科学基金项目(批准号:21922708)资助下,香港大学李祥教授团队在表观遗传领域取得新进展,破解了组蛋白H3赖氨酸79二甲基化(H3K79me2)修饰的表观遗传密码,相关成果以“Menin在核小体环境中‘读取’H3K79me2标

我国科学家揭示人类早期胚胎发育中的组蛋白修饰重编程

  在真核生物中,组蛋白与带负电荷的双螺旋DNA组装成核小体。因氨基酸成分和分子量不同,组蛋白主要分成5类:H1,H2A,H2B,H3和H4。除H1外,其他4种组蛋白均分别以二聚体形式相结合,形成核小体核心。DNA便缠绕在核小体的核心上。而H1则与核小体间的DNA结合。  组蛋白修饰(histone

甲基化的类型介绍

甲基化包括DNA甲基化和蛋白质甲基化。(1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富含胞嘧

关于甲基化的类型介绍

  甲基化包括DNA甲基化和蛋白质甲基化。  (1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如

关于甲基化的类型的介绍

  甲基化包括DNA甲基化或蛋白质甲基化  (1)DNA甲基化。脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富

生物物理所等在神经细胞凋亡领域取得新进展

  3月9日,中科院生物物理研究所袁增强研究组等在分子生物学杂志EMBO reports在线发表了题为Lysine methylation of FOXO3 regulates oxidative stress-induced neuronal cell death的论文,报道了转录因

北京大学癌症研究刊登国际期刊

  β-连环蛋白(β-Catenin)是一种多功能蛋白,是无翅型整合位点(Wnt)/β-catenin信号通路的一个关键中介物,通过调节许多不同的靶基因表达,在细胞增殖、细胞命运决定和肿瘤发生的过程中,发挥着重要的作用。虽然各种翻译后修饰参与β-连环蛋白的活性,但是,赖氨酸甲基化在β-连环蛋白活性中

甲基化的主要类型

(1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富含胞嘧啶和鸟嘌呤的CpG岛则未被甲基化。这与

赖氨酸的化学性质

  赖氨酸相关修饰:其ε-氨基的甲基化是一种通常的翻译后修饰,形成一甲基,二甲基和三甲基赖氨酸。三甲基赖氨酸会发生在钙调蛋白中。另外,赖氨酸残基还能进行乙酰化和泛素化等修饰。胶原蛋白中含有的羟基赖氨酸是由赖氨酸经赖氨酸羟化酶羟基化而来。内质网或高尔基体中,羟基赖氨酸残基的O-糖基化可用来标记特定蛋白

研究揭示叶绿体核糖体RNA甲基化修饰的机制和功能

  核糖体RNA(rRNA)的甲基化修饰是生物界中普遍存在的一种转录后修饰机制,可以改变rRNA分子的局部空间结构,从而优化核糖体的蛋白翻译效率。不同物种之间的rRNA甲基化程度存在明显差别,是rRNA进化的标志性事件之一。叶绿体是高等植物中重要的细胞器,由蓝细菌经过内共生过程演化而来,具有自己的核

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化

亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较

生物物理所等在组蛋白甲基化修饰识别方面取得新进展

  10月17日,《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)在线发表了生物大分子国家重点实验室许瑞明、饶子和课题组和北京生命科学研究所(NIBS)朱冰课题组合作的最新研究成果Distinct mode of