来自Science主编的一盆冷水
本月生物学最轰动的新闻莫过于ENCODE项目发布“DNA元件百科全书”，这项研究的影响力不下于当年人类基因组计划公布人类基因组序列。为此，Science主编Bruce Alberts专门在本期杂志中撰文，探讨了“大型科学”与“小型科学”的未来，这篇文章恰如一盆冷水给诸多进行得如火如荼的大型科学项目降了降温。 “小型科学”的黄昏? Science主编：Bruce Alberts 在 ENCODE项目历时十年的工程中，世界上442位科学家合作编写了“DNA元件百科全书”，广泛列出了人类基因组中的功能元件。本月ENCODE项目已经发表了30篇文章，极大的鼓舞了生命、健康和疾病领域的基础研究。ENCODE是“大科学”的一个典型项目，近来这样的项目几乎横扫了科研新闻的头版头条，大项目出成果的高效率也非常令人瞩目。这是否意味着曾在科研领域创造了无比辉煌的“小科学”即将过时?政府资金是否会更倾向于大型科学项目?我......阅读全文
DNA重组广泛存在人类基因组中
科技日报北京7月26日电 （记者张梦然）日本理化学研究所综合医学科学中心科学家主导的国际合作研究发现，在人类每个细胞的基因组中，重复数百万次的特定基因组序列重组普遍存在于正常细胞和疾病状态的细胞中。确定这种曾被认为是“垃圾”的DNA序列的重组机制，对于了解人体细胞如何发育以及是什么导致它们“生病”至
美推出人类基因组编写计划
大约1个月前，科学家在一次秘密会议中提议，通过政府与私人企业合作，从头合成一个完整的人类基因组，这项研究大约需要10年的时间，并且相关的技术开发也将花费数以亿计的美元。6月2日，他们正式对外公布了这一计划。 这项名为“人类基因组编写计划”（HGP-write）的研究的倡议者在美国《科学》杂志上
首个完整人类基因组序列公布
由美国国家人类基因组研究所、加利福尼亚大学圣克鲁斯分校、华盛顿大学等机构研究人员领衔的国际科研团队3月31日公布了首个完整、无间隙的人类基因组序列。与这项重大成果相关的6篇论文当天发表在美国《科学》杂志上。美国国家人类基因组研究所在一份公报中表示，人类基因组含有约30亿个DNA（脱氧核
结核病如何影响人类基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454759.shtm 今年3月，一项利用古人类DNA的最新研究揭示了过去2000年里结核病如何影响欧洲居民免疫系统，特别是结核病对人类基因组的影响。 该研究的重点是TYK2基因的一个变种——P11
《Science》揭示大肠杆菌与癌症的神秘关联
十多年来，科学家们一直致力于研究大肠杆菌素（一种由某些大肠杆菌菌株产生的化合物）与结直肠癌之间的联系，但由于他们无法分离出这种化合物，这种联系受到了阻碍。 所以Emily Balskus决定把注意力集中在大肠杆菌素留下的“烂摊子”上。 Balskus是化学和化学生物学教授，她和同事们是一项新
院士Science解开长期生物学谜题
最近，澳大利亚莫纳什大学的研究人员，与日本、德国和瑞士的同事合作的一项研究，以原子级的分辨率解析了线粒体外膜转运蛋白复合物（TOM）的分子结构。这一研究是由澳大利亚科学院院士、澳大利亚桂冠院士Trevor Lithgow指导完成，解开了生物学中一个长期的谜题，于九月二十五日发表在国际著名期刊《S
叶克穷：改写大肠杆菌基因组的科学意义究竟几何
合成生物学家日前报告了迄今为止意义最为深远的一项细菌基因组重写结果：他们成功换下了大肠杆菌64个遗传密码子中的7个，并通过在55个片段中合成脱氧核糖核酸（DNA）从而减少了遗传密码子的数量，科学家们还将这些碎片组装到了另一个有功能的大肠杆菌中。 有人认为这项发表在美国《科学》杂志上的研究成果
人类基因组测序或将只需数分钟
来自伦敦帝国理工学院的科学家正在开发一种技术，它能够在几分钟内完成个人基因组的测序，且费用比目前的技术要低得多。研究人员已经将这项原型技术申请专利，其研究成果发表在近期的《纳米快报》（Nano Letters）杂志上。 在这个新研究中，研究人员证明能在50nm孔中利用电荷高速推动DNA
Nature：巧借CRISPR技术解读人类基因组
每个人都是由先天与后天：DNA以及环境共同塑造而成。相比于其他人的基因组，存在于你的基因组中的一些差异如何影响了你成为什么样的人？在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇新论文中，来自华盛顿大学的研究人员巧妙地结合CRISPR/Cas9基因组编辑技术和深度基因测序技术，让我们朝着解答这一重要
利用CRISPR筛查人类基因组“垃圾”DNA
在几个研究小组正致力将CRISPR/Cas9系统应用于临床的同时，另一些研究团队则在利用这一工具来解决有关生物学的基础问题。近期，荷兰癌症研究所遗传学教授Reuven Agami与和同事们应用CRISPR搜寻了整个基因组中的调控增强子元件。 他们将Cas9核酸酶靶向了从前鉴别出的两个转录因子p
人类基因组测序或将只需数分钟
来自伦敦帝国理工学院的科学家正在开发一种技术，它能够在几分钟内完成个人基因组的测序，且费用比目前的技术要低得多。研究人员已经将这项原型技术申请专利，其研究成果发表在近期的《纳米快报》(Nano Letters)杂志上。 在这个新研究中，研究人员证明能在50nm孔中利用电荷高速推动DN
新便携仪器可对人类基因组高效测序
新一期英国《自然·生物技术》杂志刊登报告说，一个国际团队用一种手机大小、方便携带的基因测序装置，对完整的人类基因组进行了测序。这意味着基因测序技术在市场上应用的门槛大大降低。 对人类基因组测序曾是一项非常难的工作，２００３年发布的第一份人类基因组图谱是由全球多国科学家合作十多年、耗资约３０亿
迄今最详细人类基因组分析数据出炉
迄今最详细的人类基因组分析数据出炉。图片提供：ENCODE计划 一项大型国际计划显示，与青少年在学校掌握的知识相比，人类基因组—— 一个人的遗传信息总和——包含有更多的蛋白质编码基因。当研究人员决定在上世纪90年代晚期对人类基因组进行测序时，他们专注于寻找那些用来确定全部生
PNAs：人类基因组中藏着病毒的“灵魂”
研究者们发现，从远古时期开始，我们的祖先的DNA中就藏有病毒的"灵魂"。其中一些病毒一旦被唤醒，将会是十分危险的。最近一项研究中，科学家们找到了新的藏在我们DNA中的病毒"灵魂"。 通过筛查2500份人类基因组，研究者们发现有36种病毒随着进化过程在不断地累积。其中有19种病毒此前从未见过，其
古人类基因组数量超万个
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499340.shtm
人类基因组计划完成十五年
科学技术进步有多快？当我们今天大谈基因测序与健康话题时，别忘了人类基因组计划才完成不过15年。 2000年6月26日，时任美国总统克林顿在白宫举行的记者招待会上郑重宣布，由来自美国、英国、德国、日本、中国和法国的上千名科学家共同参与的“人类基因组研究计划”已经完成人类基因组草图。他在评价这一历
ENJM：人类基因组测序速度实现新突破
近期，斯坦福大学的科研人员完成了利用人工智能计算加速工作流程的DNA巨量测序技术，把人类基因组测序时间缩短至5小时2分钟，创造了新的世界纪录。研究成果发表在《The New England Journal of Medicine》期刊，标题为“Ultrarapid Nanopore Genome
最新测序的完整的人类基因组图谱
最新测序的完整的人类基因组图谱。 图片来源：英国《新科学家》网站 20年前，科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸（DNA），其实，他们漏掉了少许。现在，由于读取DNA方法的改进，科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了！据生物预印本网站（biorxiv）近日报道，美国科学家对全部
ENCODE：人类基因组计划的后时代
21世纪初，人类基因组计划(HGP)完成了第一个人类基因的谱图，发现基因组中仅有1.5%的序列是给蛋白质编码的，其余98.5%的序列以前被认为是“垃圾”，这些“垃圾”也被称作基因之间的“荒漠”。然而，它们真就是多余的吗? ENCODE是“DNA组成元素百科全书
用超声波处理人类基因组DNA
Purpose:To break up high molecular weight human placental DNA into fragment sizes of 500 bp or less which can be used as competitor DNA in Southern an
人类基因组DNA提取的原理和方法
实验目的: 1.熟悉分子生物学实验的操作特点。2.掌握人类基因组DNA提取的基本原理。3.熟悉人类基因组DNA提取的基本方法。4.熟悉琼脂糖凝胶电泳的原理和操作。实验原理:用细胞裂解液裂解细胞膜,收集细胞核,加入SDS破裂核膜,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并从DNA上解离下来,经苯酚﹑氯仿抽提去
3篇Science文章：大规模人类基因表达差异图谱
在美国国立卫生研究院基因型-组织表达（GTEx）项目的资金资助下，研究人员构建出了一个万众期待的新数据资源，它可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。借助于这一新资源，科学家们可以同时探究许多不同人类组织和细胞的潜在基因组学，并有望为研究和了解人类生物学开辟新途径
Science解析热点基因组编辑工具
近来，Cas9酶作为一种有力的新基因组编辑工具，引起了人们极大的研究热情。现在加州大学伯克利分校的研究人员，首次成像了这种酶的精细三维结构，这一成果无疑会进一步提高Cas9的应用价值。文章于二月六日发表在Science杂志上。 加州大学的生化学家Jennifer Doudna和生物物
Science揭示基因组的捍卫者
从细菌到人类，生物体都必须要保护自身对抗称作为转座子的寄生遗传元件，并且赌注下得很大。这些DNA片段可在基因组中四处跳跃破坏基因，其可以造成极大的破坏因此细胞有专门的监视机制来抑制它们。 为了保护后代对抗基因组破坏，这些天然防御系统发生缺陷通常会导致不育不孕。在动物中，对抗捣乱转座子的主要防御
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现，人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异（CNV）。在此之前人们对CNV的了解并不多，因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序，全面分析了基因组中的SN
Science公布最新基因组测序结果
来自法国农业科学研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人员发表了题为“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现，人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异（CNV）。在此之前人们对CNV的了解并不多，因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序，全面分析了基因组中的SN
Science揭示古老基因组的秘密
马克斯•普朗克研究所的研究人员描述了丹尼索瓦人(Denisovans)的基因组，阐明了丹尼索瓦人与现代人类之间的关系。相关研究发表在8月30日的《科学》(Science)杂志上。 由德国马克斯•普朗克进化人类学研究所的Svante Pääbo领导的一个国际研究人员小组在新研究中证实了丹
Science专题：癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后，许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近，越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向，测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异，以
大肠杆菌或将退出历史舞台？某繁殖最快细菌将取代之
6月初，“从零开始合成整个人类基因组”的人类基因组编写计划(HGP-write)正式公开。这一庞大工程旨在从化学成分合成人类和其它物种的整个基因组，并让他们在活细胞中获得功能，主要团队负责人包括由纽约大学的合成生物学家Jef Boeke，哈佛医学院的遗传学教授George Church，Auto