来自Science主编的一盆冷水

本月生物学最轰动的新闻莫过于ENCODE项目发布“DNA元件百科全书”,这项研究的影响力不下于当年人类基因组计划公布人类基因组序列。为此,Science主编Bruce Alberts专门在本期杂志中撰文,探讨了“大型科学”与“小型科学”的未来,这篇文章恰如一盆冷水给诸多进行得如火如荼的大型科学项目降了降温。 “小型科学”的黄昏? Science主编:Bruce Alberts 在 ENCODE项目历时十年的工程中,世界上442位科学家合作编写了“DNA元件百科全书”,广泛列出了人类基因组中的功能元件。本月ENCODE项目已经发表了30篇文章,极大的鼓舞了生命、健康和疾病领域的基础研究。ENCODE是“大科学”的一个典型项目,近来这样的项目几乎横扫了科研新闻的头版头条,大项目出成果的高效率也非常令人瞩目。这是否意味着曾在科研领域创造了无比辉煌的“小科学”即将过时?政府资金是否会更倾向于大型科学项目?我......阅读全文

Science专题:癌症基因组学

  在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以

大肠杆菌或将退出历史舞台?某繁殖最快细菌将取代之

  6月初,“从零开始合成整个人类基因组”的人类基因组编写计划(HGP-write)正式公开。这一庞大工程旨在从化学成分合成人类和其它物种的整个基因组,并让他们在活细胞中获得功能,主要团队负责人包括由纽约大学的合成生物学家Jef Boeke,哈佛医学院的遗传学教授George Church,Auto

人类基因组编写计划转向设计“超安全”细胞

人类基因组编写计划旨在使人类细胞对抗包括HIV在内的各种病毒。图中展示病毒感染了一个细胞系。 图片来源:《自然》杂志官网 2016年6月2日,美国纽约大学的杰夫·博伊科、哈佛大学的乔治·邱奇、耶鲁大学生物工程师法瑞恩·艾萨克等领衔的科学家在美国《科学》杂志上刊文宣布,将筹资1亿美

是否允许人工合成基因组?人类基因组编写计划引忧虑

  2016年5月,130名科学家、企业家和政界人士在哈佛大学举办了一场仅限受邀者参加的闭门会议,商讨打造合成人类基因组的雄伟计划。三周后,参与者在浪潮般的批评声中宣布,他们计划通过这一新项目显著降低合成基因组成本。这将是生物科技领域的一项革命性发展,使科学家能够人工培育移植所需的器官。   这项

《科学》:古老蛋白塑造细菌紧凑基因组

该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素  与人类相比,细菌不携带过多的“垃圾DNA”,它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA,而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现,细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R

科学家彻底改写细菌基因组成功减少大肠杆菌遗传密码子

科学家继续修补大肠杆菌基因组。  本报讯 合成生物学家日前报告了迄今为止意义最为深远的一项细菌基因组重写结果。这一进展包括重新利用了大肠杆菌3.8%的碱基对。  研究人员在8月18日出版的美国《科学》杂志上发表了这一研究成果。  研究人员换下了大肠杆菌64个遗传密码子(为氨基酸指定遗传代码的序列)中

人类基因组编写计划——让细胞“百毒不侵”

  美国纽约大学的杰夫·博伊科、哈佛大学的乔治·邱奇、耶鲁大学生物工程师法瑞恩·艾萨克等领衔的科学家在美国《科学》杂志上刊文宣布,将筹资1亿美元,启动历时10年的人类基因组编写计划(GP-write),从头开始在实验室中合成出人类基因组。   基因编辑 (4).jpg   消息一经发布,就引发了

Science综述专辑:皮肤细胞生物学

  早在四十年前,科学家们就已经在活检过程中培养人体皮肤细胞。自此之后,科学家们也对这种常见的细胞了解的越来越多,比如这个通常被称为人体最大器官的部位如何形成、如何修复、如何对疾病作出反应,又是如何进行触觉感知,以及与微生物沟通的。不过还是存在不少问题,如譬如状况,伤口形成,疾病关联等等。  11月

五篇Science聚焦生物学最新前沿

  说到对地球生命至关重要的生态系统,大多数人首先会想到热带雨林,其实浮游生物也同样重要。这些微小的生物漂浮在海洋上层,它们不仅是海洋食物链的基础,还生产了地球上一半的氧,可以作为碳汇(Carbon Sink)和影响气候。  本期Science杂志以封面形式重磅推出了生物学最新前沿,浮游生物学。Ta

Science封面6连发:人类最完整的基因组测序完成!

  全世界科学家近40年的努力,今天终于圆满了!Science连发6篇封面文章,宣布人类完整基因组测序计划正式完成。  据路透社、Science等报道,这项成果填补了前人几十年努力后仍然存在的空白,为全球 79 亿人中寻找有关致病突变和遗传变异的线索提供了新的希望。  算起来,距离人类最早讨论基因组

Science封面6连发:人类最完整的基因组测序完成!

  全世界科学家近40年的努力,今天终于圆满了!Science连发6篇封面文章,宣布人类完整基因组测序计划正式完成。  据路透社、Science等报道,这项成果填补了前人几十年努力后仍然存在的空白,为全球 79 亿人中寻找有关致病突变和遗传变异的线索提供了新的希望。  算起来,距离人类最早讨论基因组

研究人员发现:霍乱正改变人类基因组

  生命演化到今天,人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明,当代人类也在进化,而引发这种进化的,竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明:在霍乱流行的孟加拉国,人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案

人类基因组计划对医学的贡献介绍

基因诊断、基因治疗和基于基因组知识的治疗、基于基因组信息的疾病预防、疾病易感基因的识别、风险人群生活方式、环境因子的干预。

人类基因组计划对人类疾病贡献介绍

人类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。对于单基因病,采用“定位克隆”和“定位候选克隆”的全新思路,导致了亨廷顿氏舞蹈症、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。对于心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病(老年性痴呆

Cell:DNA重组在人类基因组中广泛存在

日本理化研究所综合医学科学中心的科学家与世界各地的其他研究人员合作发现,在我们每个细胞的基因组中重复数百万次的特定基因组序列重组,在正常和疾病状态下都普遍存在。确定导致这种无数次重组的机制,包括曾经被认为是“垃圾”的DNA序列,可能对理解我们的细胞如何发育以及什么会使它们不健康至关重要。随着DNA的

最广泛的人类基因组相互作用图谱

  最近,英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员,开发并使用了一种新的技术,将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图,需要完成才能看到整幅图片,研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来,并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确

迄今最连续的人类基因组组装完成

  英国《自然·生物技术》杂志29日在线发表了一项基因组学研究成果:英国科学家团队利用一个口袋大小的纳米孔测序装置,从头组装出人类基因组,这是迄今为止最连续的人类基因组组装,而且只用了单一测序技术。这项研究同时成功地分析了过去最先进的测序方法也分析不出的人类基因组区域。  理解和解读人类基因组是现代

《科学》杂志精选:人类基因组蛋白产物仍是谜

  几近完成的普通小麦基因组测序  研究人员已经展示了普通小麦基因组的序列草图,从而在通往创制世界上种植最广泛谷物作物之一的完整参考序列的道路上到达了一个主要的里程碑。他们的工作给了科学家们一个可在小麦个体染色体上快速定位特定基因的工具,这一资源可帮助他们改良小麦育种以满足从未有过的对食物的更高需求

专家称人类基因组编辑研究必不可少

  在今年五月份,中山大学的研究人员,利用基因编辑系统除去了人类胚胎中的一个突变基因,引发了科学界关于道德伦理的广泛争论。  最近,在全球第一次针对有争议的新技术的讨论会议上,专家指出,涉及人类基因组编辑的研究,包括人类胚胎研究,对于生物学和生殖细胞的基本理解,是至关重要的,并应该是被允许的。  这

专家称人类基因组编辑研究必不可少

  在今年五月份,中山大学的研究人员,利用基因编辑系统除去了人类胚胎中的一个突变基因,引发了科学界关于道德伦理的广泛争论。相关阅读:Nature爆炸性新闻:中山大学人类基因组编辑引发科学界大动作。  最近,在全球第一次针对有争议的新技术的讨论会议上,专家指出,涉及人类基因组编辑的研究,包括人类胚胎研

人类基因组DNA甲基化数据分析

  近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。  DNA甲基化是表观

Mol-Bio-Evo:人类基因组研究揭示“古老”信号

  利用新的基因组分析工具,科学家们在我们对现代人类起源和古代迁徙的理解方面取得了重大进展。  分子生物学和进化学(MBE)的一项新研究通过重建人工基因组增加了这种理解,通过分析565当代南亚个体的基因组来提取古老的信号,重现人类迁徙和该地区混合的悠久历史。(图片来源:Www.pixabay.com

Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱

  来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了,我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究,将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件,最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。  这些变异存在于非直接负责编码基因,而是发

-人类基因组的军备竞赛-不断自我进化

  北京时间9月30日消息,科学日报报道,近日美国加州大学圣克鲁斯分校的科学家们进行的最新发现表明,灵长类动物的基因组内竞争元素的进化军备竞赛驱动了复杂调控网络的进化,这一网络协调了人类内每个细胞的基因活动。  人类基因组的军备竞赛  这场军备竞赛是在名为逆转录转座子(retrotransposon

研究证实细菌DNA可整合至人类基因组

  日前,马里兰大学医学院(University of Maryland School of Medicine)的科学家们找到了细菌基因可偶然性地整合至人类基因组中的强力证据。研究发现,大约 1/3 的健康基因组中含有细菌 DNA 序列,而癌细胞中则更高。从而证实了来自细菌的侧向基因转移(L

-Nature:回顾人类基因组计划的25年

   25年前,人类基因组计划启动了,时至今日,它所提供的经验仍旧指引着由它开启的,以团队协作为基础的科学研究。  1989年,人类基因组计划启动前,纽约冷泉港实验室举行的的班伯里会议。弗朗西斯·柯林斯与詹姆斯·沃森位于前排。  25年前,新落成的美国国家人类基因组研究中心(即现在的国立人类基因组研

中国人类基因组研究有望“弯道超车”

  我国科学家首次完全自主实施国家级人类全基因组项目。   属于中国人自己独特的基因“密码”有望被精准破译。近日,由哈尔滨工业大学牵头的国家重点研发计划精准医学研究重点专项之“中国十万人基因组计划暨中国人群多组学参比数据库与分析系统建设”项目正式启动,并进入为期4年的项目实施阶段。  “这是我国科学

精准医学计划——人类基因组计划的“续集”

  最新一期《福布斯》展望了未来15年影响世界的五大技术——新型计算机架构、基因组学、纳米技术、储能技术以及机器人技术。文章说,随着这些技术相辅相成,共同发展,人类将开始掌控物理世界。其中关于“基因组学”的解释为:2003年人类基因组首次被解码,其相关开支超过30亿美元。到2030年,人类基因组测序

大肠杆菌微生物学检查法

(一)细菌的分离鉴定1.标本:肠道外感染取中段尿、血液、脓液、脑脊液等,腹泻者取粪便。2.分离培养与鉴定:粪便标本直接接种肠道杆菌选择性培养基。血液需先经肉汤增菌,再转种血琼脂平板。其他标本可同时接种血琼脂平板和肠道杆菌选择性培养基。37℃孵育18~24小时后,观察菌落并涂片染色镜检。采用一系列生化

肠出血性大肠杆菌的生物学特性

  大肠杆菌是人和动物肠道中的正常菌群,一般对人无害。它有三种抗原结构,即菌体抗原(又叫O抗原)、包膜抗原(又叫K抗原)和鞭毛抗原(又叫H抗原)。  O抗原是对大肠杆菌进行分型的基础,已发现有170多种。其中一些特殊的血清型具有致病性,可引起人类感染性腹泻。引起人类感染性腹泻的大肠杆菌又可被分为5类