3篇Science文章：大规模人类基因表达差异图谱
在美国国立卫生研究院基因型-组织表达（GTEx）项目的资金资助下，研究人员构建出了一个万众期待的新数据资源，它可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。借助于这一新资源，科学家们可以同时探究许多不同人类组织和细胞的潜在基因组学，并有望为研究和了解人类生物学开辟新途径。 GTEx的研究人员将他们为期两年研究的初步结果发布在5月7日《科学》(Science)和其他期刊的多篇研究论文中。这些研究工作使人们重新认识了在不同的组织中基因组变异是如何控制基因的开启和关闭方式与时间，表达和沉默基因的数量，以及如何使得人们容易罹患癌症、心脏病和糖尿病一类的疾病的。 在一篇主要的Science文章中，研究人员分析了来自175名个体和43个不同组织类型的1,600多个组织样本的基因活性读值。研究人员通过测量RNA来评估了基因的活性。他们致力分析了9种最容易获得的组织类型的样本，包括脂肪、心脏、肺、骨骼肌、皮肤、......阅读全文
研究人员绘出苹果基因组草图
一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》（Nature Genetics）杂志上报告说，他们绘出了苹果的基因组草图，这将有助于从基因水平上分析苹果性状，培育更多苹果新品种。 意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说，他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
研究人员成功构建首个圭亚那柱花草基因组
在国家自然科学基金等项目的资助下，华南农业大学副教授陈曙团队成功完成首个圭亚那柱花草染色体水平基因组组装，从基因组、转录组及表观遗传组多维度解析其抗逆分子机制，为热带牧草分子育种与抗逆研究提供关键理论支撑与基因资源。相关成果近日发表于《植物杂志》（The Plant Journal）。圭亚那柱花草比
研究人员破译香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm广东省农业科学院研究员易干军领衔的香蕉遗传改良团队与广西大学教授陈玲玲团队合作，破译了香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组，首次在国际上组装染色体级别的异源三倍体香蕉栽培种（AAB）参考基因
研究人员发现：霍乱正改变人类基因组
生命演化到今天，人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明，当代人类也在进化，而引发这种进化的，竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明：在霍乱流行的孟加拉国，人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案
研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组
新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说，该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制，寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。 相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说，艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖
研究人员构建人类阴道微生物基因组库
6月21日，深圳市宝安中医院（集团）副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统，各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系，其间的平衡关乎女性生殖健康及胎
研究人员发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短（约6周），饲养成本低，单胎产仔数较高（每胎2-5只）等特点，在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前，树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建，是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道，日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合，人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片，对大量切片同时
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日，西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
安捷伦授予临床基因组研究人员Peter－Robinson“思想领袖奖”
分析测试百科网讯 2016年11月29日，安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候，中国中医科学院中药研究所所长陈士林（详见本网报道：中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”）和癌症研究
研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组
密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅，密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目，旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因，以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测序进行了比较。他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚桃子的基因组序列进行比较。
研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”
人类对基因组变异的认识又向前推进一大步：西安交通大学日前传出消息，该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构，通过开发新的计算机算法和分析处理流程，分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异，其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异，即基因组中的“暗物质”。 据介
研究人员解析人类基因组计划的赢利奥秘
人类基因组计划(genome project)为美带来1万亿美元经济增长。 美国巴特尔纪念研究所6月12日发布的一份颇具争议的报告指出，解码人类基因组项目的经济收益持续增长。该项目结束10年后，目前其带来的收益已接近1万亿美元。 1988~2003 年进行的人类基因组计划(genom
基因组所小鼠组织新转录本鉴定研究取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所胡松年项目组利用新一代测序数据，运用生物信息学方法，在小鼠的几个组织中发现了几千个新的转录本。该研究成果的完成拓宽了转录组数据分析的思路，有利于更全面地认识小鼠的转录组组成，并进一步补充了其基因组的注释，相关成果论文在frontiers in genetics
从动物组织提取基因组DNA
实验概要本实验以哺乳动物新鲜组织为材料，学习基因组DNA提取的一般方法。实验原理基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀
植物组织制备基因组DNA实验
实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部， 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤 收取1
植物组织制备基因组DNA实验
氯化铯法 CTAB法 实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则
日研究人员制成细绳状机体组织
日本东京大学一个研究小组报告称，他们开发出了一种直径只有约0.1毫米、但是长度达到1米以上的细绳状机体组织，这一成果有望应用于移植医疗领域。 东京大学生产技术研究所的研究人员在凝胶状的细管中装入混合有实验鼠神经细胞和骨胶原等的溶液，经过一两周时间的培养后，细胞开始增殖，到了一定阶段研究人员
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
全球研究人员致力于创造首个合成真核生物基因组
10年前，当遗传学家Ronald Davis首次提出，他的同事正在尝试创造人工酵母染色体，并将其放入活细胞时，Jef Boeke并没有太多想法。Davis就职于美国加州斯坦福大学医学院，是一个有远见的人。他提出，实验室酵母是当时合成生物学领域的下一个发展方向。不过，Boeke并不理
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA.真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
日本研究人员培养出类胰岛组织
日本横滨市立大学的研究小组日前宣布，他们通过在模拟微重力环境下培养胰腺β细胞，最终制造出具有立体结构的类胰岛组织。 研究人员介绍说，如果在培养皿中培养胰腺β细胞，只能形成平面组织，制造胰岛素的能力很低，而他们通过旋转盛有培养液的容器，让容器内部出现微重力环境，并在这种环境下培养小鼠的胰腺β
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日，国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
北京基因组研究所Plant－cell基因组研究新成果
来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组，通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现，作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白（C2H2-ZF）实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究，有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员，是规模最大的一种人类蛋白。然而，人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
研究揭示环境对人肠道菌群和耐药基因组影响
华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室和国家兽医微生物耐药性风险评估实验室刘雅红教授团队与中外合作者，发现人体和环境间存在广泛的菌株和基因交换，而且环境对人肠道菌群的影响可能会持续4~6个月。相关研究3月18日在线发表于《自然—通讯》。 生物圈中的微生物种类众多，其分布无处不在。同样
英农业官员抨击某些反转基因组织
英国环境、食品和农村事务大臣欧文·佩特森日前表示，一些组织极力反对转基因农业技术应用于亚非欠发达地区，这种行为是“不道德的”，这可能导致数百万人由于食物不足而过早死亡。 据英国媒体10月14日报道，佩特森指出，转基因技术有助于解决粮食供应危机，但一些非政府组织和个人近年来一直反对使用这种技