10月4日《自然》杂志内容精选
牡蛎基因组所显示的防卫机制 牡蛎是河口生态系统中的重要物种，也是世界范围内最重要的水产养殖物种之一。本期Nature报告了太平洋牡蛎基因组的测序结果和组成情况。与其他基因组所作的对比显示，它们的防卫基因有所增加，这是对作为潮间带中一种“固着物种”的生活方式的一种适应，是甲壳的形成及与幼虫发育相关基因的骤变的一个通道，这个通道的复杂程度令人吃惊，突显了它们在适应性方面对于海洋无脊椎动物的重要性。 糖尿病与肠道元基因组 Ⅱ型糖尿病的发病率已知与遗传因素和环境因素都有关系，曾有人提出，小肠微生物群发生的变化也可能牵涉其中。Jun Wang及其同事建立了一种新颖的研究方法，被称为“元基因组范围的关联研究”，用来比较健康人和糖尿病患者粪便微生物群的综合基因内容。他们识别出与其中任何一个人群相关的多种微生物和代谢通道，并且发现其中一些还可能用作生物标记。 乳腺癌中的基因变异 来自“癌症基因组图谱”联合体的这......阅读全文
2型糖尿病新发现：肠道微生物作用大
糖尿病是由遗传因素、免疫功能紊乱、微生物感染及其毒素、自由基毒素、精神因素等等各种致病因子作用于机体导致胰岛功能减退、胰岛素抵抗等而引发的糖、蛋白质、脂肪、水和电解质等一系列代谢紊乱综合征，临床上以高血糖为主要特点。 芬兰东部大学的一项研究表示，血清中高浓度的吲哚丙酸（indolepropio
PNAS：肠道微生物肽与触发1型糖尿病有关
在1型糖尿病中，身体发育的免疫细胞以胰腺β细胞为目标，后者在胰岛素的产生和分泌中起着关键作用。这种免疫反应的最早目标之一是胰岛素分子内的特定氨基酸或肽序列。触发这种自身免疫反应的原因尚不清楚。现在，乔斯林糖尿病中心和波士顿学院的研究人员已经发现了一种人类肠道细菌，它能产生一种含有氨基酸序列的蛋白质，
微生物研究新突破，用益生菌或抗生素预防乳腺癌！
在一项最新发表的研究中，克利夫兰诊所的研究人员揭示了健康女性与乳腺癌女性乳腺组织中细菌组成的差异。相关内容于10月5日在线发表在Oncotarget，该项研究由Doris Duke慈善基金会、肿瘤外科基金会、克利夫兰Taussig癌症研究所、Earlier.org等共同资助完成。 微生物——
《时代周刊》评2012年十大医学突破
北京时间12月5日，综合过去近12个月在医学界所取得各种成就，时代杂志评出了2012年的十大医学突破，其中不仅有对传统观点的挑战，也不乏鼓舞人心的新型药物和技术。 1. “垃圾DNA”有大作用 以往认为，人体内98%的基因组序列都是无用的垃圾基因，如今看来这一观点已经过时。事实上，这
Cell重磅发布15万人体微生物基因组！－揭示微生物新物种
微生物宏基因组是当今世界最热门的科研领域之一。越来越多的研究表明，人体微生物发挥着重要的健康作用，但大部分多样性仍未得到充分探索，尤其是在除肠道以外的身体部位及非西方人群。 在今日发表在Cell期刊的一项研究中，由意大利特伦托大学Nicola Segata领导的研究团队利用来自不同地理位置、生
Cancer－Res：乳腺癌为什么转移？可能是肠道微生物在作怪
弗吉尼亚大学癌症中心的一项新研究表明，不健康的、发炎的肠道会使乳腺癌变得更具侵袭性，并更快地扩散到身体的其他部位。 弗吉尼亚大学微生物、免疫学和癌症生物学部门的Melanie Rutkowski博士发现，破坏小鼠体内的微生物群会导致激素受体阳性的乳腺癌变得更具侵略性。改变微生物群，即生活在肠道
Nature揭示糖尿病新型预测标记物
在人体内微生物的数量比人类细胞要多10多倍。其中大多数的微生物都是正常的肠道菌群。这些微生物的编码基因总量是是人类编码基因数目的50-100倍，被统称为宏基因组(metagenome)。出生后进入人体并对人体代谢产生重要影响的这些微生物是后天禀赋的重要承载者,调控人体的生命健康。 现在一项
中美携手合作“十万食源性病原微生物基因组计划”
5月28日，北京诺赛基因组研究中心（国家人类基因组北方研究中心）、北京师范大学、中国科学院微生物研究所与美国加州大学戴维斯分校在北京师范大学就“十万食源性病原微生物基因组计划”达成合作协议。据悉，中美双方将共同参与十万食源性病原微生物基因组计划的研发，建立重要的食源性致病微生物基因序列综合数据库
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA
概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则
我国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
近日，深圳华大基因研究院宣布，我国科学家将参与全球最大微生物基因组研究项目，对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或宏基因组测序，从而建立一个全球性的基因图谱，并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性研究全球范围内微生物群落功能及进化多样性，以便更好地造福社会及人类。 与以往的微
高脂肪饮食导致糖尿病，肠道微生物或是罪魁祸首
研究人员发现，我们的饮食选择会削弱我们的肠道免疫系统，导致糖尿病的发展。 越来越多的研究表明，在肥胖期间，我们的免疫系统经常对通过肠道组织"渗漏"并导致炎症的细菌成分做出反应。反过来，炎症会导致胰岛素抵抗，从而使人容易患糖尿病。 在一项近日发表在《Nature Communications》
丹麦新发现－调节肠道微生物可治疗糖尿病和肥胖
丹麦科技大学的科学家日前确定了此前未知的500种人体肠道微生物以及多达800种能够感染人体肠道细菌的病毒（噬菌体）。研究人员称，该发现让人们看到了人体肠道内此前从未见过的宏伟图景。随着更多的肠道微生物被发现以及各个菌落之前的关系被理清，未来科学家将有望通过增加或删除某些细菌的方式来治疗糖尿病、哮
《时代》杂志评出2012年十大医学突破
美国《时代》杂志评选的各领域年度“十大”排名已于近日陆续出炉，医学领域“十大”突破也深入人心。涵盖了生命基础研究、艾滋病与癌症治疗突破、干细胞与再生医学、青少年健康等多方面公众关心的热点。1.“垃圾DNA”才是掌控者 人体基因组中98%是没有编码的基因，以往它们被当作无用的“垃圾”。
IJC：糖尿病药物二甲双胍或能有效治疗特定类型的乳腺癌
近日，一项刊登在国际杂志International Journal of Cancer上的研究报告中，来自路易斯安那州立大学的科学家们通过研究发现，一种常用于治疗2型糖尿病的药物—二甲双胍或能有效治疗缺少Nischarin蛋白的癌症。图片来源：LSU Health 研究者Alahari博士表示
青藏高原水生微生物基因组和基因目录初步建立
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517774.shtm 中国科研人员搜集来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川等六种水生生态系统的498个水体环境DNA样本，并进行宏基因组测序，初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA（一）
基因组DNA的提取概 述基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DN
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA（二）
5. 仔细移取上清液至另一50ml离心管,加入1倍体积异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。 6. 在1.5ml eppendorf中加入1ml TE。用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。 7. 如DNA不形成絮状沉淀,则可用500
微生物所在古菌基因组复制起始领域取得新进展
基因组复制是生命得以存在和延续的最重要和最基本的遗传过程。与细菌染色体通常只有一个复制起点不同，真核生物和许多古菌的染色体均具有多个复制起始位点。这些复制起始元件可能具有不同的活性以适应体内外环境的变化，如在真核生物中普遍存在休眠状态的复制起始位点，如何解析这些休眠复制起点的激活机制及
人类基因组计划对人类疾病贡献介绍
人类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。对于单基因病，采用“定位克隆”和“定位候选克隆”的全新思路，导致了亨廷顿氏舞蹈症、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现，为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。对于心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病（老年性痴呆
科学家有望揭开微生物组与乳腺癌发病之间的神秘关联！
近些年来，随着科学家们对人类微生物组深入的研究，他们发现越来越多的人类疾病或许与微生物组有密切关联；最近研究人员就开始进一步研究微生物组与癌症的关联了，但仍然有很多问题亟待解决；尤其是当提及微生物组在乳腺组织中扮演的角色，以及是否其会促进侵袭性乳腺癌的发展时。 近日，一项由Windsong
人类基因组计划的主要内容和意义
主要内容：HGP的主要任务是人类的DNA测序，此外还有测序技术、人类基因组序列变异、功能基因组技术、比较基因组学、社会、法律、伦理研究、生物信息学和计算生物学、教育培训等目的。意义：人类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。对于单基因病，采用“定位克隆”和“定位候选克隆”的全新
科学家发现20多种与糖尿病肥胖等疾病有关－新基因组变异
最近，一篇发表在国际领先期刊《自然》上的论文报道了27种与血压、2型糖尿病和肥胖等疾病相关的新基因变异。这些基因变异的发现将为今后的治疗提供更有效的基础。这项研究是对来自不同种族的近50000人进行的全基因组关联研究（GWAS）的结果。 研究小组发现，一些基因变异存在于多个族群中，而另一些
《自然》子刊：肠道菌群与糖尿病关系实锤了！
现在发现的肠道微生物与疾病的关系可谓数不胜数，癌症、心血管疾病、肥胖等各种常见的疾病都与它相关，不仅如此，前不久我们还刚报道了肠道微生物竟然还与抑郁症有关系。 不过，之前大部分研究都只是证明肠道微生物与疾病可能有关，并不能说明就是肠道微生物导致了这些疾病。 可是就在今天，科学家终于敲下了肠道
PNAS：与珊瑚有关的微生物群的宏基因组学
对珊瑚礁相关微生物群落的一个大尺度宏基因组学调查表明，这些微生物的分类学组成最多地受到了珊瑚和水藻等深海底大生物体的影响，而它们的代谢特化随着局部海洋学状况而变化。微生物群落影响相关珊瑚礁的健康，但是支配微生物群落结构和基因流的机制在很大程度上仍然未知。 Linda Wegley Kelly
数百微生物基因组草图绘成－全新抗生素或由此产生
英国《自然》杂志14日在线发表的一项微生物学最新成果，美国科学家团队绘制完成数百个非培养且未被研究过的微生物基因组草图，并鉴定出了一千多个生物合成基因簇。研究表明，土壤中的细菌极有可能代表了一种有待开发的新型抗生素，以及其他药用化合物的来源。图片来源于网络 细菌在与抗生素的博弈中，已经变得越
中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展
中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展，研究首次以基因组学大数据为依托，深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律，对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》，并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员
赵立平专访：人类微生物组研究，解密人体第二基因组
2007年12月美国《科学》杂志预测：人体共生微生物的研究将可能是国际科学研究在2008年取得突破的7个重要领域之一。就如何研究共生微生物与人体健康的关系等问题，4月刚刚出席了巴黎国际人类微生物组研究联盟筹委会会议的上海交通大学生命科学技术学院教授赵立平接受了《科学时报》的采访。 深圳华大基因
药典委|微生物全基因组测序技术指导原则标准草案公示
近日，国家药典委员会拟定微生物全基因组测序技术指导原则标准草案并公示。其中提到实验室需具备高通量核酸测序仪、核酸扩增仪、片段分析仪、核酸定量仪、生物安全柜、混匀器、高速离心机、水浴或加热模块、冰箱、微量加样器等分子生物学检验常用仪器设备。影响测序质量的仪器设备应定期进行性能确认和维护，以保证仪器处于
“万能”的肠道微生物
公元前300多年，西方“医学之父”希波克拉底曾扬言：“所有疾病始于肠道”。 两千多年后，医学工作者们发表了众多研究成果，他的观点正在一点一点地被证实。当我们谈到许多慢性疾病的发病机制时（比如慢性肠炎、糖尿病，甚至阿尔茨海默症、衰老、肥胖症、药物疗效等），我们逐渐意识到，肠道微生物几乎是绕不开