青藏高原水生微生物基因组和基因目录初步建立
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517774.shtm 中国科研人员搜集来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川等六种水生生态系统的498个水体环境DNA样本，并进行宏基因组测序，初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录。相关成果于近日发表在国际学术期刊《自然-通讯》。 这项工作由中国科学院水生生物研究所研究员缪炜与华中科技大学团队合作完成。缪炜21日受访时表示，上述基因组和基因目录作为高海拔水生微生物资源的重要资源库，蕴藏着发现新的微生物谱系和功能的潜力，有助于拓展对全球微生物物种、遗传和功能多样性的认识。 青藏高原是世界海拔最高的高原，独特地形特征使其成为众多河流的主要源头，被誉为“亚洲水塔”。其类型多样的水生态系统，孕育着丰富的水生微生物。 研究团队耗时4年，初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录(Ti......阅读全文
青藏高原水生微生物基因组和基因目录初步建立
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517774.shtm 中国科研人员搜集来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川等六种水生生态系统的498个水体环境DNA样本，并进行宏基因组测序，初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录
首个草鱼肠道微生物基因目录构建
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515836.shtm10日，记者从中国农业科学院获悉，该院饲料研究所水产微生物与饲料创新团队成功构建了首个草鱼肠道微生物基因目录。该成果日前发表于国际期刊《微生物组》。肠道菌群在鱼类的新陈代谢过程和免疫系
首个草鱼肠道微生物基因目录构建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516186.shtm近日，中国农业科学院饲料研究所水产微生物与饲料创新团队构建了首个草鱼肠道微生物基因目录，并解析了草鱼肠道微生物组的主要互作模式和功能特征，为鱼类肠道菌群调控提供了理论基础。相关研究成果
Nature印发：中外科学家构建全球微生物基因目录
复旦大学类脑研究院青年研究员路易斯·佩德罗·科埃略、教授赵兴明、名誉教授皮尔·伯克与来自德国、西班牙、美国、英国等多国科学家合作，基于全球微生物组的概念，将地球上不同栖息地的微生物作为统一系统，运用人工智能技术对1.3万个公开宏基因组样本进行挖掘，构建了迄今为止最全面的全球微生物基因目录，为全
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的全球首个青藏高原冰川微生物
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
微生物果胶酶基因
近10年来，已从不同属的真菌、细菌和放线菌中克隆和测序的果胶酶基因至少有70个(表1)，其中来自真菌的超过40个，且大多是多聚半乳糖醛酸酶基因。从中克隆到果胶酶基因的真菌主要有曲霉菌、炭疽菌、镰刀菌和灰霉菌等。例如目前已从黑曲霉(Aspergillus niger)中克隆到6个多聚半乳糖醛酸酶基因，
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”)，将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定，并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序，以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
微生物基因检测——基因检测新蓝海产业简析
一、抗生素“退潮”，抗生素“精准应用”成难题 1. 高昂的研发成本及不匹配的市场前景，曾拯救全人类的抗生素正在被众多药企“抛弃”。 2018年6月，美国FDA批准Achaogen新一代氨基糖苷类抗生素Plazomicin用于治疗成人复杂性尿路感染，包括由肠杆菌科细菌、假单胞菌属等引起的肾盂肾
华大基因构建全球首个小鼠肠道微生物参考基因集
2015年9月28日，中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集，为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。 人类的肠道中居住着种类繁多，数量惊人的微生物，而在这些微生物中，细菌的比例高达90%
微生物基因有助昆虫生存繁衍
数亿年前，微生物和植物可能通过水平基因转移将基因传递给了昆虫，从而给昆虫带来了进化优势。浙江大学与美国范德堡大学科学家合作发现，蝴蝶、飞蛾等218种昆虫的1400多个基因来自细菌、病毒、真菌和植物。这项研究认为，这些基因可能对昆虫的进化至关重要，使它们在交配、营养、生长和适应环境变化等方面发展出有益
研究发现青藏高原植物须弥芥的基因组奥秘
近日，中国科学院昆明植物研究所副研究员张体操联合西藏大学、云南大学及国外多个实验室，对青藏高原特有分布的须弥芥进行了基因组适应性进化研究，为青藏高原植物适应极端环境的分子机制提供了新的线索。相关研究结果在线发表于《美国科学院院刊》。 据了解，须弥芥原本归在拟南芥属，1999年Ihsan Al-
从亲戚家“拿来”个基因，山羊成功登上青藏高原
青藏高原被誉为“地球第三极”，其寒冷、低氧、低压和强紫外线的极端环境造就了独特的生物多样性。伴随着人类迁徙与生产活动，一批家养动物也逐渐适应了青藏高原恶劣的生态条件，成为藏区居民不可或缺的生产和生活资料。 近日，西北农林科技大学教授王小龙和姜雨，以及中国农业科学院—国际家畜研究所研究员韩建林等
科学家揭示青藏高原冰川抗性基因分布特征
抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes，简称抗性基因）被世界卫生组织（WHO）列为21世纪威胁人类健康的重大挑战之一。目前，全球变暖导致冰川加速消融，冰川环境中存留的耐药菌及其携带的抗性基因有可能随冰川消融输出到下游湖泊、河流等环境中，对下游环境的生态安全和居民健康产
解码－“基因宝藏”！科学家揭示海洋微生物基因资源利用潜力
9月5日，记者在“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建设及应用成果联合发布会上获悉，华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学等机构，构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库，并从中发现大量具有应用潜力的基因资源。该研究为开发抗菌肽、新型基因编辑工具、PET塑料降解酶等提
解码“基因宝藏”：最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚，华大生命科学研究院（简称“华大”）联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构，在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘，构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库，并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
研究揭示黄牛适应青藏高原的多基因协同效应奥秘
青藏高原被誉为地球的“第三极”，以低氧、低温、强紫外辐射等著称。黄牛大约在3700年前迁徙到青藏高原，是最早进入青藏高原的家养动物之一，也是目前中国乃至全世界最古老、最原始的黄牛种质资源，更是培育我国高原环境新品种的重要战略资源。 但目前《国家畜禽遗传资源志—牛志》只有4个西藏黄牛品种，与青藏
研究揭示黄牛适应青藏高原的多基因协同效应奥秘
青藏高原被誉为地球的“第三极”，以低氧、低温、强紫外辐射等著称。黄牛大约在3700年前迁徙到青藏高原，是最早进入青藏高原的家养动物之一，也是目前中国乃至全世界最古老、最原始的黄牛种质资源，更是培育我国高原环境新品种的重要战略资源。但目前《国家畜禽遗传资源志—牛志》只有4个西藏黄牛品种，与青藏高原广袤
“超级增强子”调控关键基因－科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道，最近，美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器，能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出，超级增强子富集在基因组的变异区，而这些变异区与多种疾病谱系密切相关，所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发
青藏高原世居藏族人群高原适应关键基因被发现
近日，记者从华南理工大学获悉，深圳华大基因研究院科研人员和华南理工大学本科创新班学生共同发现青藏高原世居藏族人群高原适应的关键基因。该成果的研究论文《50个全外显子测序揭示人类的高原适应机制》发表在最新一期的美国《科学》（Science）杂志上。华南理工大学生物学院本科生金鑫参与组
科学家发现与青藏高原青稞早熟性相关等位基因
青稞是青藏高原极具特色的作物类型。研究青稞早熟性形成的遗传机制对于揭示青稞对青藏高原极短生育期条件的适应和进化过程具有重要的科学意义。日前，中科院西北高原生物研究所和四川大学合作，在青稞早熟适应性方面取得重要进展，相关成果发布于《理论与应用遗传学》。 科研人员在青海西宁和四川温江两地的表型鉴定
微生物实验室技术基因探针技术
基因探针技术基因探针技术利用具有同源性序列的核酸单链在适当条件下互补形成稳定的DNA?RNA或DNADNA链的原理,采用高度特异性基因片段制备基因探针来识别细菌。基因探针的优点是减少了基因片段长度多态性所需要分析的条带数。如法国生物一梅里埃公司的GEN?PROBE基因探针检测系统,对于分离到的单个菌
PNAS：从基因到植物微生物群
像人类和动物一样，植物也有微生物群。一个由芝加哥大学领导的研究小组，包括INRAE，研究了一种植物物种内的遗传变异是否控制其叶片微生物群的组成。研究人员在两年多的时间里在四个地点的实验装置中种植了3万多株植物，以分析一株模型植物的200个基因型的叶片微生物群的变异和繁殖成功率(通过种子产量估计)。7
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告，近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组，这个有48000年历史的微生物的基因组，是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图，研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲，从1
母亲与婴儿肠道微生物可共享基因
近日，研究人员发现了一种母婴微生物群垂直传播的新模式。从围产期一直延续到出生后的几周，母体肠道中的微生物与婴儿肠道中的微生物共享基因。相关研究近日发表于《细胞》杂志。 研究表明，这种水平基因转移使母体微生物菌株能够在其没有持续转移的情况下，影响婴儿微生物组的功能。这项大规模综合分析，提供了一系列
微生物基因的转移和重组都有哪些？
基因的突变 ◇基因突变的规律 （1）自发突变和诱导 一般细菌每分裂106～109次即可发生一次。 （2）随机突变和选择 突变是随机和不定向的，细菌染色体上数千个基因中哪个基因发生突变、导致何种性状的改变均不是由外界因素决定。 （3）突变和回复突变 某种细菌在自然环境下大多数所具有的
基因测序找出肠道核心微生物群
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素
细胞和基因技术有望揭开海洋微生物之谜
全球50%的氧气都是由海洋微生物产生。然而，这些微小的海洋生物在很大程度上仍然是科学界的一个谜。4月6日发表在《自然—方法学》的研究称，在全球100多名研究人员的努力下，科学家们找到了一种通过细胞和基因技术解开部分海洋生物细胞基因组的方法。添加到海洋原生生物（左）的基因在荧光显微镜下显示为绿点（