10月4日《自然》杂志内容精选
牡蛎基因组所显示的防卫机制 牡蛎是河口生态系统中的重要物种，也是世界范围内最重要的水产养殖物种之一。本期Nature报告了太平洋牡蛎基因组的测序结果和组成情况。与其他基因组所作的对比显示，它们的防卫基因有所增加，这是对作为潮间带中一种“固着物种”的生活方式的一种适应，是甲壳的形成及与幼虫发育相关基因的骤变的一个通道，这个通道的复杂程度令人吃惊，突显了它们在适应性方面对于海洋无脊椎动物的重要性。 糖尿病与肠道元基因组 Ⅱ型糖尿病的发病率已知与遗传因素和环境因素都有关系，曾有人提出，小肠微生物群发生的变化也可能牵涉其中。Jun Wang及其同事建立了一种新颖的研究方法，被称为“元基因组范围的关联研究”，用来比较健康人和糖尿病患者粪便微生物群的综合基因内容。他们识别出与其中任何一个人群相关的多种微生物和代谢通道，并且发现其中一些还可能用作生物标记。 乳腺癌中的基因变异 来自“癌症基因组图谱”联合体的这......阅读全文
PNAS：与珊瑚有关的微生物群的宏基因组学
对珊瑚礁相关微生物群落的一个大尺度宏基因组学调查表明，这些微生物的分类学组成最多地受到了珊瑚和水藻等深海底大生物体的影响，而它们的代谢特化随着局部海洋学状况而变化。微生物群落影响相关珊瑚礁的健康，但是支配微生物群落结构和基因流的机制在很大程度上仍然未知。 Linda Wegley Kelly
Nature：乳腺癌的第一次大规模蛋白组基因组研究成果
基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据，美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组（proteogenomic）”研究，将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行，包括贝勒医学院、MIT和哈佛的
世界宣传乳腺癌日|教你如何识别早期乳腺癌！
在乳腺癌中，异常基因导致乳腺细胞生长不受控制，并且不会正常死亡。 如果这些细胞生长缓慢且不侵入其他组织，它们就会形成良性肿瘤。这些通常是被认为对健康危害不大的肿块。 当异常细胞以更快的速率生长并开始侵入周围组织时，它们形成癌性肿瘤。这些团块会造成严重的风险，可以在整个身体内进行散播，形成新的
乳腺癌复发率
许多患者在积极配合治疗后，都会出现和这位患者相同的疑惑，本期乳腺肿瘤专家之声——胡震教授，就来和大家说一说，女性乳腺癌复发率到底高不高？ 虽然随着科技的进步，早期（I~II期）乳腺癌患者的5年生存率达到了90%以上，但仍有相当多的患者会发生复发和转移。 乳腺癌的复发一般跟3个因素相关 相
2月王牌聚焦：人体内微生物研究推陈出新
近年来人体肠道微生物组成为了研究“新宠”，这方面研究主要聚焦于细菌，那么人体内的病毒，噬菌体呢？2月的系列进展也许能给出部分答案。 芝加哥洛约拉大学的一组研究人员分析来自181位女性患者膀胱中收集到的序列数据，从他们研究的200个细菌基因组中鉴定出大部分细菌都有的450多种可能的噬菌体序列。超
只有基因组会决定你对药物的反应吗？微生物组也会
特殊微生物或酶的存在也许能够解释为什么某些治疗对特定人群不奏效。 在追寻个性化治疗的过程中，多数研究者关注的是个体的基因组如何控制机体对药物的应答。然而，越来越多的证据表明个体独特的微生物组，即存在于人体内的细菌及其他微生物种群，也许是决定药物在个体条件下能否起效的关键。 抗癌药对每个人的作
全基因组测序在微生物食品安全风险评估中应用会议召开
2016年11月10-11日，国家食品安全风险评估中心（以下简称“食品评估中心”）在北京召开了“全基因组测序在微生物食品安全风险评估中的应用国际研讨会”。食品评估中心预测微生物学技术团队外聘专家，爱尔兰都柏林大学食品安全中心主任SéamusFanning教授及其团队成员、食品评估中心主任助理李宁
中科院微生物所等在油棕基因组学研究获进展
中科院微生物所叶健课题组与中科院外籍院士、美国洛克菲勒大学教授蔡南海和新加坡淡马锡生命科学研究院教授岳根华等人合作，完成了高产母本厚壳Dura基因组的高质量的序列测定和多个种质资源的基因组重测序以及进化分析。研究为油棕分子辅助育种和基因组编辑抗性育种工作奠定了坚实基础，对日趋竞争激烈的全球食用
药典委：《微生物全基因组测序技术指导原则》二次公示
近日，国家药典委员会发布了《微生物全基因组测序技术指导原则》的第二次公示稿，以征求社会各界的意见和建议。公示期为一个月，从即日起至2024年7月1日结束。 《微生物全基因组测序技术指导原则》旨在为药品微生物控制提供通用性技术规范，指导药用原料、辅料、制药用水、中间产品、终产品、包装材料、环境、
赵立平撰文谈肠道菌群与慢性病的关系
6月17日出版的《自然》（Nature）杂志，在NEWS and VIEWS栏目刊登了上海交通大学教授的文章。 应该刊编辑部的邀请，针对《自然》和《科学》杂志最近发表的有关人体元基因组的论文，赵教授评价了这些论文在理解肠道菌群与慢性病的关系的意义。文章指出，下一阶段人体元基因组学研究
二甲双胍可降低乳腺癌风险，抑制艾滋病毒
二甲双胍是2型糖尿病治疗的经典一线药物。除了经典降糖药的角色，二甲双胍在其他疾病领域的潜在健康功效也始终受到关注，先前我们介绍过其在肺癌、乳腺癌、阿尔兹海默病等多种疾病中的研究。今年来又有多项有意思的研究发表，我们与各位读者分享二甲双胍的这些学术新进展。 常见乳腺癌风险降低 发表在肿瘤学年鉴
大数据分析预测常见致命疾病风险－基因检测时代来临！
图片来源： Lauren Solomon这些测试利用基因组中数百万个地方的信息来确定五种疾病的风险，可以在症状出现之前就预示更有可能发展成潜在的致命疾病。虽然这项研究数据源自英国，但它表明，仅根据基因变异，美国就有高达2500万人患冠状动脉疾病的风险可能比正常人高出3倍以上。此外，还有数百万人患其他
华大基因斥资千万美元建华大欧洲
华大基因将斥资1000万美元，在丹麦哥本哈根建立欧洲总部，并计划最终雇佣150名科学家及员工。 丹麦时间2010年5月17日下午，中丹经贸合作论坛暨商务合同签字仪式在哥本哈根举行。在中国商务部长陈德铭和丹麦经济商业部大臣布莱恩·米克尔森的共同见证下，深圳华大基因研究院副院长李松岗教授
甲基乙二醛：一种新型的DNA甲基化上游调节因子
甲基乙二酮（MG）是一种高反应性的二羰基分子。在糖酵解癌症细胞中，MG主要由磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛沿糖酵化途径的自发转化形成。细胞MG浓度显著受乙二醛酶系统的解毒活性调节，乙二醛蛋白酶1（GLO1）是限速酶。代谢重编程和DNA超甲基化异常相互独立地在癌症中进行了广泛的研究。然而，迄今为止，
化妆品易致乳腺癌？盘点乳腺癌7大诱因
统计数据显示，多达1/8的女性在一生中的某个时间会患上乳腺癌。但是，乳腺癌风险存在很大的个体差异，美国“福克斯新闻网”11月3日载文，刊出“乳腺癌的风险因素”，并提醒所有女性每年查一次乳房X光片，以提早发现乳腺癌征兆。 1.体重超标。体重超标或肥胖会导致乳腺癌风险增加30%~60%。其原因是，
乳腺癌三联疗法获FDA批准，用于早期乳腺癌
近日，罗氏（Roche）集团成员基因泰克（Genentech）公司宣布，美国FDA已批准Perjeta（pertuzumab，帕妥珠单抗）加赫赛汀（trastuzumab,曲妥珠单抗）和化疗（简称基于Perjeta的治疗方案）的三联疗法，作为HER2阳性、有高复发风险的早期乳腺癌（EBC）患者的
NGS检测干什么用的
NGS 检测：高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（"Next-generation" sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。1、高通量测序在精准医学的应用：包
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Nature－Genetics：更年期的早晚由什么来决定
女性更年期出现的早晚，对乳腺癌等疾病风险有着明显的影响，但其内在机制却不为人知。英国剑桥大学等机构的研究人员通过近七万名妇女的分析，发现基因组中有40多个区域与妇女的更年期年龄存在关联。这项成果于周一发表在《Nature Genetics》上。 “我们已经知道，女性何时经历更年期，在一定程度上