荧光定量pcr仪定量方法之绝对定量

在做qPCR实验时,我们经常会问:“你是做绝对定量还是相对定量呢?”,而定量方法的选择是取决于实验的目标。绝对定量可测定目标核酸分子的实际拷贝数,但也是最费力、最复杂的定量形式。此方法要求周密的实验方案和高度准确的标准曲线,常用于确定病毒滴度。 使用标准曲线进行绝对定量 绝对定量是通过样品的Cq值和标准曲线进行比较实现的。首先为了建立标准曲线,需要已知拷贝数浓度的标准品,对标准品进行5次以上的连续梯度稀释,将稀释的标准品进行实时荧光定量PCR扩增,最后根据各样品的拷贝数浓度及相应的Cq值绘制标准曲线,得到线性方程Cq= -klgX0+b,其中X0为起始模板量。然后将未知样本的Cq值与此标准曲线进行比较,确定其拷贝数浓度。 从图1可以发现,当模板起始浓度越大时,荧光达到阈值的循环数越少,即Cq值越小。反之,模板起始浓度越小时,Cq值越大。起始模板量的Log值与循环数Cq值呈线性关系,通过已知起始拷贝数的标准品......阅读全文

实时荧光定量PCR工作原理

  实时荧光定量 PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)   基本原理    qPCR 技术是在反应体系中加入荧光报告基团和荧光淬灭基团,随着 PCR 反应的进行,扩增产物不断积累,导致荧光信号不断积累, 从而利用荧光信号的变化实时监测整个 PCR 进程。

荧光定量PCR的操作步骤

荧光定量PCR 实验步骤: ①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相,中间层以及

实时荧光定量PCR技术2

qRT-PCR基因表达分析在384孔板上11ul/孔的总反应体积中,使用荧光Universal ProbeLibrary(UPL)探针(罗氏公司)和ABI 7900HT 实时仪器(美国应用生物系统公司)以及2X FastStart Universal Probe Master (Rox)PCR试剂(

荧光定量PCR实验指南5

您可以选择荧光染料SYBGREEN体系,具体请参照说明书。您可灵活使用20-50ul间其他体积,注意保证终浓度相同。A2010A0106试剂盒:反应体系终浓度(自配热启动荧光系统):1-2U的hotstartTaq酶、3-5.5mM的Mg2+ 、0.2mM的dNTPs、1×PCRbuffer(A

荧光定量PCR:简介、原理、应用

荧光定量PCR的应用分子生物学研究1、核酸定量分析。 对传染性疾病进行定量定性分析,病原微生物或病毒含量的检测 , 比如近期流行的甲型H1N1流感, 转基因动植物基因拷贝数的检测,RNAi 基因失活率的检测等。2 、基因表达差异分析。 比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异 ( 如药物处理、物理

实时荧光定量PCR的原理

所谓实时荧光定量PCR技术 ,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。检测方法1.SYBRGreenⅠ法:在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链

荧光定量PCR实验基本步骤

1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;    4、反应体系的配制;    5、反应条件的设定;    6、反应体系和条件的优化;    7、荧光曲线和数据分析;    8、标准品的制备;

荧光定量PCR实验指南4

3.8 防止残余(Carry-over)污染PCR易受污染的影响,因为它是一种敏感的扩增技术。小量的外源DNA污染可以与目的模板一块被扩增。当前一次扩增产物用来进行新的扩增反应时,会发生共同来源的污染。这称之为残余污染。从其他样品中纯化的DNA或克隆的DNA也会是污染源(非残余污染)。可以在PCR过

解析荧光定量PCR常用术语

 基线:基线是早期循环的噪点水平,通常在第3和第15循环之间测量,这是因为在此期间还检测不到扩增产物引起的荧光值增加。用于计算基线的循环数量是可以改变的,如果使用高模板量或者靶标基因的表达水平高则循环数量需要减少。设置基线需要查看线性度扩增曲线的荧光数据。设置基线,使得扩增曲线的增长所开始的循环圈数

荧光定量PCR的CT值

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是

荧光定量PCR实验设计

 设置对照组:荧光定量PCR检测一般流程如下图,选择检测靶标基因,进行引物筛选及体系构建,后续进行样本处理核酸提取,检测分析结果。对照组是实验的监控系统,监测实验是否有存在异常,也是排除实验异常关键所在;实验对照设置: 通常有阳性对照,阴性对照组等。      具体可根据实验类型进行对照组的设置;对

实时荧光定量PCR的原理

所谓实时荧光定量PCR技术 ,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。检测方法1.SYBRGreenⅠ法:在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链

荧光定量PCR实验指南2

2.3TaqmanMGB探针设计介绍MGB探针的优点:²MGB探针较短(14-20bp),更容易找到所有排序序列的较短片段的保守区。²短片段探针(14-20bp)加上MGB 后,Tm值将提高10℃,更容易达到荧光探针Tm值的要求。²MGB探针的设计原则²探针的5’端避免出现G,即使探针水解为单个碱基

SYBR-实时荧光定量PCR技术

优博生物技术有限公司开发的SYBR实时荧光定量PCR(Real-time PCR)就是在PCR反应体系中加入荧光染料与DNA双链的结合的原理,实时监测整个PCR进程,判定即时测定特异性产物的量和推断出初始基因的量,可快速、灵敏的检测样本的RNA和DNA,在动物病原体基因的检测,畜禽产品的检验检疫,生

荧光定量PCR的操作步骤

荧光定量PCR 实验步骤: ①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相,中间层以及

荧光定量PCR染料法介绍

     荧光定量PCR仪负责监控反应体系中荧光强度的变化,记录检测荧光达到阈值时的循环数。从理论上说,每一个qPCR循环会使目标序列翻倍,因此人们可以在Ct值的基础上对样本进行定量。         荧光定量PCR主要分为染料法和探针法两种。染料法一般采用DNA染料,这种方法不仅使用简单,成本也z

实时荧光定量pcr结果分析

  实时荧光定量PCR技术是指在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光集团,利用荧光信号来实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板浓度进行定量分析。  病原学检测是动物疾病确诊的关键点,而聚合酶链式反应(PCR)是目前病原检测的最常用的分子生物学技术,具有高敏感性的特征。PCR技术发展已日趋完

荧光定量PCR技术的应用

    1、绝对定量分析    这是荧光定量PCR技术的直接应用,可用于检测病毒及细菌的浓度!        2、相对定量分析及实验方案    基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子. 遗传物质DNA

荧光定量PCR应用——病毒篇

诺如病毒诺如病毒(Norovirus,NVs)属于杯状病毒科诺如病毒属,是引起非细菌性急性胃肠炎的主要病原体,世界50%以上的胃肠炎暴发均由它引起,可在医院、学校、餐馆等人群密集地爆发急性胃肠炎。根据病毒RNA 聚合酶和衣壳蛋白核苷酸序列的差异,诺如病毒分为5个基因型,其中GI、GII 型诺如病

实时荧光定量PCR技术介绍

实时荧光定量PCR (real time fluorogenetic quantitative PCR, FQ-PCR),是在PCR定性技术基础上发展起来的核酸定量技术。它是一种在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时检测整个PCR过程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方

荧光定量PCR的操作步骤

荧光定量PCR 实验步骤: ①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相,中间层以及

荧光定量PCR检查的分类

  荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。现将其原理简述如下:  1)TaqMan荧光探针:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩

MicroRNA(miRNA)荧光定量PCR原理

一、什么是miRNA?MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。据推测,这些非编码小分子RNA(miRNAs)参与调控基

qpcr中的相对定量和绝对定量的区别

绝对定量是用已知浓度的标准品绘制标准曲线来推算未知样品的量,绝对定量不同于相对定量,我们是验室用BIOG KIT做PCR实验检测目标RNA,做下来CT值在28左右,S型曲线比较典型

qpcr中的相对定量和绝对定量的区别

荧光绝对定量中标准品:指用含有目的基因的质粒,知道质粒的分子量和浓度计算出拷贝数,然后倍比稀释就作为绝对定量的标准品。获取:把目的基因p出来,然后接到质粒上,转染摇菌扩增,然后再抽质粒,酶切纯化。最后把纯化的目的基因做个鉴定。

普通PCR仪与荧光定量PCR仪有什么差异?

PCR仪根据DNA扩增的目的和检测的标准可以将PCR仪分为普通PCR仪,梯度PCR仪,原位PCR仪,实时荧光定量PCR仪四类,其中普通PCR仪与荧光定量PCR仪有什么差异?上海巴玖实业有限公司请到了刘师傅来讲述普通PCR仪与荧光定量PCR仪的差异。普通的PCR仪比荧光定量PCR仪少了荧光信号采集系统

荧光PCR/实时定量PCR技术应用简介

一.荧光PCR原理1.荧光共振能量传递 (FRET)某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光,当另一屏蔽基团与其距离合适时,原发射光将会被屏蔽基团所吸收,并转化为其他波长的发射光或热能,称之为FRET。2.荧光化学:荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加

荧光定量PCR仪的操作流程与结果分析方法

  荧光定量PCR仪的操作流程:确立实验方案,样品制备,设计引物及探针,预实验,标准品及标准曲线的建立,定量PCR检测,分析数据。    1、样品的制备    DNA样品,主要是DNA提取,提取的DNA可TE缓冲液溶解后-20度保存;对于RNA样品,抽提RNA后要迅速反转录,将RNA反转录为cDNA

绝对定量pcr,ct值一般多少合适

绝对定量是用已知浓度的标准品绘制标准曲线来推算未知样品的量,绝对定量不同于相对定量,我们是验室用BIOG 技术做PCR实验,做下来扩增曲线的起跳值在28左右,算是不错的数据了