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解析荧光定量PCR常用术语

基线:基线是早期循环的噪点水平,通常在第3和第15循环之间测量,这是因为在此期间还检测不到扩增产物引起的荧光值增加。用于计算基线的循环数量是可以改变的,如果使用高模板量或者靶标基因的表达水平高则循环数量需要减少。设置基线需要查看线性度扩增曲线的荧光数据。设置基线,使得扩增曲线的增长所开始的循环圈数大于基线循环zui高圈数。对每个靶标序列都需要单独设置基线。早期循环检测到的平均荧光值需要从扩增产物中获得的荧光值中减去。各种real-timePCR软件的zui新版本允许单个样品自动优化基线设置。本底:是指反应中的非特异性荧光值,例如,低效率的荧光淬灭,或由于使用SYBR Green造成的大量双链DNA模板。信号的本底分量由real-time PCR软件算法数学除去。报告基因信号 :在real-time PCR过程中由SYBR Green或荧光标记的序列特异性探针产生的荧光信号。归一化报告信号(RN):这是报告染料荧光强度......阅读全文

Troubleshooting for PCR and multiplex PCR

Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE

多重PCR(Multiplex PCR)

一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同.    多

多重PCR(Multiplex PCR)

一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同.    多

PCR简介/PCR仪

PCR的要素基本的PCR须具备PCR仪图册1.要被复制的DNA模板 Template2.界定复制范围两端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四种脱氧核苷酸)及水。 PCR仪工作原理利用升温使DNA变性,在聚合酶的作用下使单链复制成双链,进而达到基因复制

重叠PCR—overlap PCR

1、简介 重叠PCR也是基本的PCR原理:变性-退火-延伸。不同的是在重叠PCR过程是两个或者几个片段重叠延伸之后,再进行指数扩增的PCR过程。  2、基本原理*步:PCR产生两个或者几个片段,这几个片段之间必须有重叠区。 第二步:以两个片段为例,见上图,*步产生的两个片段,A D链之间有互补,B

普通PCR梯度PCR 原位PCR 荧光定量PCR仪的区别

  普通PCR仪:   一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,称之为普通PCR仪,也就是传统的PCR仪。如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。如;(ABI 2720)   梯度PCR仪:   一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(通常12种温度梯度)的称

反转录PCR(RT-PCR, Reversed Transcript PCR)

1 原理   RT—PCR是一种将cDNA合成与PCR技术结合分析基因表达的快速灵敏的方法,主要用于对表达信息进行检测或定量分析,还可以用来检测基因表达差异而不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR的模板可以为总RNA或poly(A)+选择性RNA。逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、ol

直接原位PCR(In situ PCR)

原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。一、组织切片和细胞样品的制备试剂与配置10%福尔马林;二甲苯;PBS操

菌落PCR(Colony PCR)方法

菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。具体方法:1、PCR混合物的制备T

反向PCR(inverse PCR)简介

反向PCR是一种多聚合酶链式反应(PCR)应用的方法,可使已知序列的核心区边侧的未知DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区的末端序列,但其方向可使链的延长经过环上的未知区而不是分开