多元变量统计分析平台最新版软件SIMCA16教程详解(三)

为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。第二步在Omics skin模式下进行P值的获取。S-plot图除了常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,也可以用S-plot来筛选Biomarkers。截图中Ctr或Par方式下是呈S型的,UV是做出来是直线功能小贴士在PCA或OPLS-DA得分图中右击选择Format plot即可对图中的细节进行修改,各个选项的功能如下: 1.Axis选项卡可对横纵坐标轴线条粗细和颜色、标尺字体大小、横纵坐标标题内容、......阅读全文

基于-QExactive-平台和-BioPharma-Finder-软件的简单快速抗体...

基于 Q-Exactive 平台和 BioPharma Finder 软件的简单快速抗体药物二硫键解析1. 前言目前,在全球范围内,单克隆抗体药物已经成为生物医药领域中最耀眼的一颗明珠。该类抗体药物具有靶向性专一、特异性高和毒副作用低等特点,代表了药物治疗领域的最新发展方向,并且在抗肿瘤和自身免疫系

预测蛋白相互作用软件的学术交流记录

  A:想请问一下预测两个蛋白之间的相互作用有什么方法吗?   殷赋科技:用蛋白-蛋白对接方法。蛋白-蛋白对接有好多软件都可以做,比如ZDOCK(Discovery Studio里边也整合了这个软件)、Hex、Rosetta。我们平台将来也会上线这个功能。   B:请问一下大家,做分子对接是怎么

常用引物设计工具大集合

Oligo 6作为目前最好、最为专业的引物设计软件,Oligo 的功能很强大,他主要功能有:普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估「引物对」质量的功能。如何使用Oligo6 请参看:「两分钟教你学会 Oligo 7」BLASTBLAST(Basic Local Alignment

第八章:常用引物设计工具大集合

Oligo 6作为目前最好、最为专业的引物设计软件,Oligo 的功能很强大,他主要功能有:普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估「引物对」质量的功能。如何使用Oligo6 请参看:「两分钟教你学会 Oligo 7」BLASTBLAST(Basic Local Alignment

高质量PyMOL软件作图教程绘制D7152441与PB2cap的结合模式图

  上一期,小编教大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com)重现了一篇2018年文献《【文献重现】D715-2441 抑制剂与PB2蛋白的结合模式研究》的分子对接计算结果。然而,要发表高质量SCI文章,还需要制作高质量的Figure。本期,我将带大家使用PyMOL软

药典委:化学计量学指导原则-适用于光谱、色谱等分析技术

  国家药典委员会拟制定《中国药典》化学计量学指导原则(以下简称“指导原则”),发布并公示。  与传统数据分析方法相比,化学计量学方法利用数学和统计学方法对多变量数据进行计算,通过多个变量的数学变换和统计分析得到样本的类别和特征进而实现定性和定量分析。美国药典、欧洲药典均收录了化学计量学指导原则将化

Aivia软件更新提供了改进的AI图像分析功能

  显微镜和科学仪器领域的领导者 Leica Microsystems 发布了 Aivia 10.5,这是其基于 AI 的图像可视化、分析和解释平台的最新版本。由于引入了自主图像分析参数预测系统的新模块,该版本使神经科学家在分析和重建 3D 数据集中的神经元时可以节省多达 74% 的时间。  其他增

网构化软件协同生产和运行演化集成平台课题召开

  2013年10月27日,“十二五”863计划“网构化软件协同生产和运行演化集成平台及服务环境”课题中期检查会在长沙召开。科技部高新司、高技术中心相关同志及中期检查专家组、各课题负责人和主要研究人员参加了会议。   该课题由国防科技大学、北京邮电大学和总参第六十一研究所共同承担,主要面向软件产业

成都生物所成功开发用于非目标型筛查的软件平台

  食品安全是社会公共安全的重要环节,近年来,食品安全事件中出现的危害物种类逐年增加,从三聚氰胺毒奶粉和苏丹红事件,到各种添加剂的使用、农药残留、瘦肉精滥用、转基因作物的种植与安全、塑化剂和地沟油事件,无论深度和广度,涉及的危害物已不拘泥于食品添加剂和农兽药残留物质。   食品危害物种类繁多,如何

清华大学仪器共享平台行为学软件分析加密狗

仪器名称:行为学软件分析加密狗仪器编号:09003742产地:荷兰生产厂家:NOLDUS公司型号:ETHOVISION PRO出厂日期:200603购置日期:200903所属单位:医研院>动物中心放置地点:实验动物中心109D室固定电话:62798506-1014固定手机:固定email:yanji

863“复杂装备状态监测与运维服务支撑软件平台开发”验收

   复杂装备是大国博弈的砝码,是一个国家制造业的脊梁。复杂装备状态监测与运维服务支撑平台,对于推动我国大型装备制造业实现从价值链低端到高端转移、保证大型装备安全运行、降低运行成本,对促进我国制造服务业实现跨越式发展有着重要的意义。   8月15日,863计划“复杂装备状态监测与运维服务支撑软件平台

朱正江:软件平台自主创新-破冰代谢组学研究难点

  近期,中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员、刘南研究员课题组合作的最新学术成果发表在《自然·通讯》期刊(Nature Communications),应用基于稳定同位素标记的非靶向代谢流组学技术MetTracer,在系统层面上揭示了果蝇衰老过程中发生的代谢稳态变化,其中

全球首款GISLCA-软件平台获评国际领先水平

近日,“基于地理信息的生命周期评价软件系统(GIS-LCA 软件平台)的研究及应用”科技成果评价会在北京召开,该成果由中国科学院青岛生物能源与过程研究所泛能源大数据与战略研究中心名誉主任、中国工程院院士谢克昌,主任田亚峻团队完成。经国家工业信息安全发展研究中心组织专家评审,评价委员会一致认为该成果技

粉尘浓度检测仪三大技术详解

粉尘浓度检测仪是目前zui常用的一种检测仪器,但不同的粉尘浓度检测仪采用的技术也同,接下来我们分别针对粉尘浓度检测仪的三个不同的技术进行一下了解: 粉尘浓度检测技术: 阻光度技术:利用光传输(更具体来说就是 光吸收)作为一种手段来测量颗粒密度,用穿过烟气管道的窄光束测量光吸收。 光散射技术: 光散射

临床化验单详解甘油三酯介绍

甘油三酯介绍: 甘油三酯是由甘油和脂肪酸所构成的酯。各种甘油三酯的甘油部分都相同,而脂肪酸部分可相同也可不同。甘油三酯正常值: 

粉尘浓度检测仪三大技术详解

粉尘浓度检测仪是目前zui常用的一种检测仪器,但不同的粉尘浓度检测仪采用的技术也同,接下来我们分别针对粉尘浓度检测仪的三个不同的技术进行一下了解: 粉尘浓度检测技术: 阻光度技术:利用光传输(更具体来说就是 光吸收)作为一种手段来测量颗粒密度,用穿过烟气管道的窄光束测量光吸收。 光散射技术: 光散射

镜头的选择和主要参数详解(三)

6、镜头的主要性能指标有以下几个:(1) 焦距  焦距的大小决定着视场角的大小,焦距数值小,视场角大,所观察的范围也大,但距离远的物体分辨不很清楚;焦距数值大,视场角小,观察范围小,只要焦距选择合适,即便距离很远的物体也可以看得清清楚楚。由于焦距和视场角是一一对应的,一个确定的焦距就意味着一个确定的

HFSS端口应用详解:Wave-Port-、Lumped-Port(三)

4)替代RLC无源器件:3.Lumped Port注意:1)Lumped Port所在端面的长和宽需要远小于信号波长,一般以1/10波长为界;2)因为Lumped Port端口的两侧默认都是Perfect H边界,因此两个Lumped Port的边缘不能相接;3)Lumped Port的两端必须和P

HPLC基础知识教程(七)

 几种检测器的主要性能全屏显示表格UV荧光安培质谱蒸发光散射信号吸光度荧光强度电流离子流强度散射光强噪音10-510-310-9线性范围105104105宽选择性是是是否否流速影响无无有无温度影响小小大小

CHL(仓鼠肺细胞)培养教程

  细胞名称:CHL(仓鼠肺细胞)  细胞别称:Chinese Hamster Lung  细胞货号:SNL-009  生长特性:贴壁  培养条件:DMEM+10%FBS+1%P/S  培养环境:空气,95%;二氧化碳(CO2),5%;37℃  细胞简介:CHL细胞来源于1日龄雌性中国仓鼠肺组织,细

HPLC基础知识教程(十一)

全屏显示表格硅胶氧化铝苯乙烯-二乙烯苯甲基丙烯酸酯耐有机溶剂++++++++++适用pH范围++++++++抗膨胀/收缩++++++++耐压+++++++++表面化学性质+++++++++效能+++++++注:+++好 ++一般 +差

HPLC基础知识教程(八)

全屏显示表格UV荧光安培质谱蒸发光散射全屏显示表格检测限(g/ml)10-1010-1310-13<10-9g/s10-9池体积(ul)2~10~7<1————梯度洗脱适宜适宜不宜适宜适宜细管径柱难难适宜适宜适宜样品破坏无无无有无

HPLC基础知识教程(十四)

  V.HPLC应用  一、样品测定  1.流动相比例调整:由于我国药品标准中没有规定柱的长度及填料的粒度,因此每次新开检新品种时几乎都须调整流动相(按经验,主峰一般应调至保留时间为6~15分钟为宜)。所以建议第一次检验时请少配流动相,以免浪费。弱电解质的流动相其重现性更不容易达到,请注意充分平衡柱

HPLC基础知识教程(四)

  III.HPLC系统  HPLC系统一般由输液泵、进样器、色谱柱、检测器、数据记录及处理装置等组成。其中输液泵、色谱柱、检测器是关键部件。有的仪器还有梯度洗脱装置、在线脱气机、自动进样器、预柱或保护柱、柱温控制器等,现代HPLC仪还有微机控制系统,进行自动化仪器控制和数据处理。制备型HPLC仪还

HPLC基础知识教程(五)

   2.泵的使用和维护注意事项  为了延长泵的使用寿命和维持其输液的稳定性,必须按照下列注意事项进行操作:  ①、防止任何固体微粒进入泵体,因为尘埃或其它任何杂质微粒都会磨损柱塞、密封环、缸体和单向阀,因此应预先除去流动相中的任何固体微粒。流动相最好在玻璃容器内蒸馏,而常用的方法是滤过,可采用Mi

生物信息学教程

Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes

HPLC基础知识教程(一)

  I.概论  一、液相色谱理论发展简况  色谱法的分离原理是:溶于流动相(mobilephase)中的各组分经过固定相时,由于与固定相(stationaryphase)发生作用(吸附、分配、离子吸引、排阻、亲和)的大小、强弱不同,在固定相中滞留时间不同,从而先后从固定相中流出。又称为色层法、层析法

HPLC基础知识教程(十二)

  二、化学键合固定相  将有机官能团通过化学反应共价键合到硅胶表面的游离羟基上而形成的固定相称为化学键合相。这类固定相的突出特点是耐溶剂冲洗,并且可以通过改变键合相有机官能团的类型来改变分离的选择性。  1.键合相的性质  目前,化学键合相广泛采用微粒多孔硅胶为基体,用烷烃二甲基氯硅烷或烷氧基硅烷

HPLC基础知识教程(十)

  一、基质(担体)  HPLC填料可以是陶瓷性质的无机物基质,也可以是有机聚合物基质。无机物基质主要是硅胶和氧化铝。无机物基质刚性大,在溶剂中不容易膨胀。有机聚合物基质主要有交联苯乙烯-二乙烯苯、聚甲基丙烯酸酯。有机聚合物基质刚性小、易压缩,溶剂或溶质容易渗入有机基质中,导致填料颗粒膨胀,结果减少

HPLC基础知识教程(十三)

  3.流动相的pH值  采用反相色谱法分离弱酸(3≤pKa≤7)或弱碱(7≤pKa≤8)样品时,通过调节流动相的pH值,以抑制样品组分的解离,增加组分在固定相上的保留,并改善峰形的技术称为反相离子抑制技术。对于弱酸,流动相的pH值越小,组分的k值越大,当pH值远远小于弱酸的pKa值时,弱酸主要以分