eLife：新方法来识别癌症发生过程中的突变标签
确定癌症突变的原因是当代癌症研究领域科学家们所面临的基本挑战之一，不同的突变过程会诱导不同类型的DNA突变，从而就会提供相应的突变特征来帮助解析癌症的病因，在评估基因组数据时研究人员最广泛使用的特征就是基于未监督的模式，随后才能追溯到与癌症的某些特征相关。日前，一篇发表在国际杂志eLife上的研究报告中，来自约翰霍普金斯基墨尔癌症中心等机构的科学家们通过研究成功利用机器学习技术来检测癌症患者机体的突变特征，这一算法优于当前的标准分析手段，同时还揭示了与肥胖相关的新型突变特征；如今癌症预防研究者预测，肥胖正在成为美国和大多数西方国家导致人群癌症发生的最重要的生活方式因素。图片来源：https://elifesciences.org/articles/61082 研究者Cristian Tomasetti博士表示，突变特征非常对于当前癌症研究非常重要，因为其能让我们看到潜在风险因素所留下的迹象，比如衰老、吸烟、饮酒、紫外线以及......阅读全文
癌症相关的基因突变类型及临床解释－BCR
断裂簇区域蛋白（BCR）也称为肾癌抗原NY-REN-26，是人类中由BCR基因编码的蛋白质。 BCR是BCR-ABL复合物中的两个基因之一，其与费城染色体相关。 已经发现了编码该基因的不同同种型的两种转录物变体。 虽然BCR-ABL融合蛋白已被广泛研究，但正常BCR基因产物的功能尚不清楚。 该蛋白质
癌症相关的基因突变类型及临床解释－ARAF
丝氨酸/苏氨酸 - 蛋白激酶A-Raf或简称A-Raf是人类中由ARAF基因编码的酶。[5] A-Raf是丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶的Raf激酶家族的成员。 与该家族的其他成员（Raf-1和B-Raf）相比，对A-Raf知之甚少。它似乎具有其他同种型的许多特性，但其生物学功能尚未得到彻底研究。所有
癌症相关的基因突变类型及临床解释BLK
该基因编码src原癌基因家族的一个非受体酪氨酸激酶，典型地参与细胞增殖和分化该蛋白在b细胞受体信号传导和b细胞发育中起作用。该蛋白还刺激胰岛素的合成和分泌，对葡萄糖作出反应，并增强一些胰腺β细胞转录因子的表达。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ACTB
这个基因编码六种不同的肌动蛋白中的一种。肌动蛋白是高度保守的蛋白质，参与细胞运动、结构、完整性和细胞间信号传导。编码蛋白是收缩装置的主要组成部分，也是两种广泛表达的非肌肉细胞骨架肌动蛋白之一。该基因突变导致Baraitser-Winter综合征1，其特征是人类患者的智力残疾和独特的面部外观。在整个人
癌症相关的基因突变类型及临床解释BPTF
该基因通过其编码蛋白与针对阿尔茨海默病患者脑匀浆制备的单克隆抗体的反应性进行鉴定。对原蛋白（胎儿alz-50活性克隆1，fac1）的分析表明，该蛋白可能参与转录调控，是一种含有dna结合区和锌指基序的810a a蛋白。胎儿脑和神经退行性疾病患者中检测到高水平的FAC1这个基因编码的蛋白质实际上比最初
癌症相关的基因突变类型及临床解释ASPM
该基因是果蝇“纺锤体异常”基因（asp）的人类同源基因，对胚胎神经母细胞的正常有丝分裂纺锤体功能至关重要在小鼠中的研究也表明该基因在有丝分裂纺锤体调控中的作用，在调节神经发生中具有优先作用。该基因突变与小头畸形原发性5型相关。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
同日两篇《自然》：基因突变可能抑制癌症？
今日，《自然》杂志在线发表了两篇来自日本科研团队的最新研究论文。研究中，科学家们使用一系列遗传学的手段，找到了溃疡性结肠炎背后的常见突变基因。令人意外的是，其中一些基因突变，看起来似乎有抑制癌症的效果！ 溃疡性结肠炎是一种常见的慢性炎症性疾病，病情常为带血的腹泻。如果患者的病情无法得到长期控制
癌症相关的基因突变类型及临床解释AFDN
该基因编码一个多域蛋白，参与胚胎发育过程中细胞连接的信号和组织该基因与t（6；11）（q27；q23）易位的急性髓系白血病（americ myeloid leukemia，all-1）基因融合。另外，编码不同亚型的剪接转录变体已经被描述用于该基因，然而，并不是所有的都已经被完全描述出来了。
关键癌症蛋白的突变或帮助开发新型靶向疗法
多年来，科学家们一直在努力寻找阻断癌症关键蛋白的方法，这种名为STAT3的蛋白可以扮演一种转录因子，来帮助将DNA指令转换为RNA指令从而产生新的蛋白；当处于过度活跃阶段时，STAT3就会促进并加速异常细胞的生长和分裂，从而引发癌症，而科学家们进行了多种方法来选择性地阻断癌症中STAT3的表达，但至
癌症相关的基因突变类型及临床解释BLCAP
该基因编码一种通过刺激细胞凋亡来减少细胞生长的蛋白质。选择性剪接和选择性启动子的使用导致编码同一蛋白质的多个转录变体。该基因印在大脑中，每个亲本等位基因表达不同的转录变体。从上游启动子启动的转录变体优先从母体等位基因表达，而从散布的NNAT基因（GeneID:4826）下游启动的转录变体则从父等位基
癌症相关的基因突变类型及临床解释AHNAK
该基因编码的蛋白是一个大的（700kda）结构支架蛋白，由一个具有128个a a重复序列的中心结构域组成。编码蛋白可能在血脑屏障形成、细胞结构和迁移、心肌钙通道调节、肿瘤转移等多种过程中发挥作用。编码该基因的17 kDa亚型存在更短的变体，更短的异构体启动调节该基因的选择性剪接的反馈环。
癌症相关的基因突变类型及临床解释－ATRX
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域，因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化，它调节其核基质和染色质的结合，并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞（XLMR）综合征有关，通常伴有α-地中海贫血（ATR
癌症相关的基因突变类型及临床解释－BTK
Bruton的酪氨酸激酶（缩写为Btk或BTK）也称为酪氨酸 - 蛋白激酶BTK，是人类中由BTK基因编码的酶。 BTK是一种在B细胞发育中起关键作用的激酶。 BTK通过高亲和力IgE受体在B细胞成熟以及肥大细胞活化中起关键作用。 Btk含有结合磷脂酰肌醇（3,4,5） - 三磷酸（PIP3）的PH
癌症相关的基因突变类型及临床解释－AURKA
该基因编码的蛋白是一种细胞周期调节激酶，在染色体分离过程中似乎与纺锤体极的微管形成和/或稳定有关。编码蛋白存在于有丝分裂的间期细胞的中心体和纺锤体两极。该基因可能在肿瘤的发展和进展中起作用。在1号染色体上发现一个经过加工的假基因，在10号染色体上发现一个未经加工的假基因。已发现该基因的多个编码相同蛋
癌症相关的基因突变类型及临床解释－APLNR
该基因编码G蛋白偶联受体基因家族的一个成员编码蛋白与血管紧张素受体有关，但实际上是一种抑制腺苷酸环化酶活性的apelin受体，通过发挥高血压作用，对血管紧张素ii的压力作用起反调节作用。它在心血管和中枢神经系统、葡萄糖代谢、胚胎和肿瘤血管生成以及作为人类免疫缺陷病毒（HIV-1）受体发挥作用由选择性
癌症相关的基因突变类型及临床解释－AGK
该基因编码的蛋白质是一种参与脂质和甘油脂质代谢的线粒体膜蛋白。编码蛋白是一种脂质激酶，催化磷脂酸和溶血磷脂酸的形成这个基因的缺陷与线粒体DNA缺失综合征10有关。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ALK
ALK基因编码一种受体酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK)，为跨膜蛋白，属于胰岛素受体超家族，在大脑发育与及特定的神经元中起重要作用。最初在间变性大细胞淋巴瘤（anaplastic large cell lymphoma, ALCL）发现ALK-NPM1融合蛋白，目
癌症相关突变在正常人的食道中颇为常见
新的研究发现，与癌症相关的基因突变在人类捐赠者的正常食管组织中之常见令人惊讶，尤其是在那些中年和更年长的人中。这些结果加深了我们对癌症和老化的理解，但它们同时也凸显了我们对正常组织内体细胞突变的普遍性和演化的了解的是多么贫乏。人们随着年龄增大，他们在健康细胞中的突变会积累。这些突变的积累通常是被动性
生科院揭示体细胞同义突变在癌症发生中的作用
1月17日，中国科学院北京生命科学研究院孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）发表了题为Prevalence and architecture of posttranscriptionally impaired synonymo
Genes－Dev解析致癌组蛋白突变引发癌症的分子机制
来自清华大学医学院李海涛教授课题组7月31日在《基因与发育》(Genes&Development)杂志上发表了题为《Molecular basis for oncohistone H3 recognition by SETD2 methyltransferase》(甲基转移酶SETD2识别致癌组
Nature子刊：检测癌症特异性突变的新探针
来自美国宾州大学，东南大学的研究人员发表了题为“Rapid magnetic isolation of extracellular vesicles via lipid-based nanoprobes”的文章，研发出了一种新颖的脂质纳米探针方法，可以快速、经济且高效地分离纳米级的胞外囊泡（nE
PNAS颠覆性观点：癌症是进化产物，而非突变而来
7月21日发表在《Proceedings of National Academy of Sciences》上的研究颠覆了累积突变导致肿瘤的观点，支持细胞数量受进化压力影响的观点。该文章阐述了健康的组织生态系统促使健康细胞战胜癌变细胞，当组织生态系统发生变化如老化、吸烟或者受其他压力影响时，癌变细
数字PCR在－癌症标志物稀有突变检测的应用
在一份给定的样本中，相比于野生型DNA，癌症相关的突变序列比例较低，经常无法检测。而凭借其超高灵敏度，dPCR系统可以很容易地定量分析低至0.001%-0.0001%的突变频率。之前用任何方法都无法实现准确稳定检测的样本，现在可以使用dPCR轻松进行定量分析。例如，已实现肺癌相关的表皮生长因子受体
Cell：有些被忽视的癌症“乘客突变子”很重要！
近日，一篇发表在国际杂志Cell上的研究报告中，来自耶鲁大学等机构的科学家们通过对38种不同类型的2658名患者进行完整基因组的大规模分析后发现，179个基因和基因调节子（驱动子）的突变或会导致癌症的发生。 这项研究是PCAWG(Pan-Cancer Analysis of Whole Gen
Cell首揭秘：引发癌症需要多少突变？肝癌仅4个！
150多年前，著名的查尔斯•达尔文（Charles Darwin）描述了不同的物种是如何通过自然选择的过程来实现进化的。事实上，癌症也是由自然选择产生的。随着时间的流逝，突变会在我们身体的细胞内积累。在这篇新论文中，来自英国Wellcome Trust Sanger Institute的科学家们
Nat－Genet：更多的癌症突变，更好的免疫治疗结果
根据一项新的大规模研究，免疫检查点抑制剂通常对具有更多基因突变的肿瘤最为有效，不过这种关联性并非适用于所有癌症。 在这项新的研究中，来自美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员发现肿瘤基因组中的突变数量可能能够预测患者从激活免疫系统的免疫检查点抑制剂治疗中获益的程度。尽管之前的研究已表明较高的肿
癌症突变影响自噬选择性的作用机制
细胞自噬（Autophagy）是重要的生物学过程，通过形成双层膜结构的自噬体，将包裹在其中的胞质内容物投递到溶酶体中，从而降解损坏的细胞器、错误折叠的蛋白质、聚集体和病原体等。2016年日本著名生物学家大隅良典（Yoshinori Ohsumi）教授因“细胞自噬机制的发现”获颁诺贝尔生理学或医学
Nature子刊：检测癌症特异性突变的新探针
来自美国宾州大学，东南大学的研究人员发表了题为“Rapid magnetic isolation of extracellular vesicles via lipid-based nanoprobes”的文章，研发出了一种新颖的脂质纳米探针方法，可以快速、经济且高效地分离纳米级的胞外囊泡（nE
癌症相关的基因突变类型及临床解释－ACOT13
这个基因编码硫酯酶超家族的一个成员在人类中，这种蛋白质与微管共同定位，是维持细胞增殖所必需的同源小鼠蛋白形成同四聚体，与线粒体有关。小鼠蛋白具有中、长链酰基辅酶A硫酯酶的功能。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
癌症相关的基因突变类型及临床解释ANGPT2
该基因编码的蛋白是血管生成素1（angiopoietin 1，ANGPT1）和内皮细胞TEK酪氨酸激酶（TIE-2，TEK）的拮抗剂编码蛋白破坏血管重塑能力，可能诱导内皮细胞凋亡。已经发现了三个编码三种不同亚型的转录变体。