蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(一)

每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲刺:打通菌群多样性与功能的研究策略),本周我们再抓紧时间为各位老师分享一下国自然中各类修饰的趋势分析及组学研究的注意事项,以期为各位老师提供帮助。下面我们主要关注三种最常规研究的修饰类型——磷酸化修饰、泛素化修饰和乙酰化修饰。 表现稳定:磷酸化——全能调控之王 磷酸化是修饰中的全能调控之王,其研究最早,且分布广,修饰量最多。在真核细胞中,约1/3的蛋白随时都可以被磷酸化,几乎参与所有的生理、病理过程。因此,磷酸化修饰是所有修饰中最被广泛认知和重点研究的。 ▲ 磷酸化修饰在历年国自然基金中的申请情况 ......阅读全文

蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(一)

每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析

蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(一)

每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲刺:打通菌群

蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(二)

由此可见,泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近,甚至从重点项目数看,18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明,泛素化研究资助项目在医学部中一共98项,总资助金额高达4700万元。由此可见,泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”,基金申请的一大热点。图2.国自然基金项

国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点

  每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。   继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲

国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点

每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。   继上周的肠道微生物研究方案

翻译后修饰

中文名翻译后修饰外文名Post-translational modification定义翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的较后步骤。

中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰

  来自密西根大学,中科院上海药物研究所,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(一)

一、引言蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T M ) 在 细 胞 生 物 调 节 中 发 挥 着 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻译 后 蛋 白 质 的 酶 促 共 价 化 学 修 饰 。蛋 白 质 化 学 修 饰 非 常 重 要 ,因 为 它 们 会 潜 在 地

蛋白质翻译后修饰的验证问题

Why are proteins, detected by mass spectrometry, not validated by site-specific antibodies?The modified motif could be detected by mass spectrometry (

关于翻译后修饰蛋白质的介绍

  前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、

罗元明副研究员:生物质谱与蛋白翻译后修饰研究方法学

  2013年12月8日,由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办的第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动,分析测试百科

水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展

  蛋白质的翻译后修饰,如磷酸化、乙酰化等,是调节蛋白质生物学功能的关键步骤,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广,其研究极具挑战性。近期,中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方

细菌类组蛋白HNS翻译后修饰研究取得进展

  基因组压缩与动态调控是生命体共通的科学问题。细菌缺乏真核生物核小体结构,依赖H-NS等核结合蛋白实现基因组的压缩与调控功能。H-NS可沉默原噬菌体、毒力岛等外来基因元件,维持基因组稳定性。此前研究发现,细菌能在特定环境下解除H-NS的沉默并激活外源基因表达,这一过程是细菌环境适应的关键过程。但细

关于翻译后修饰的蛋白质的基本介绍

  前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、

典型CASE分享-蛋白产品常见翻译后修饰(PTM)

翻译后修饰(PTM)是指蛋白质在翻译后发生的化学修饰。抗体在生产、贮存及临床使用过程中,均可能产生各类翻译后修饰变异体。翻译后修饰可能导致抗体所带的电荷乃至结构发生变化,从而影响其与抗原及Fc受体的亲和力,进而影响抗体药物的活性等关键质量属性。因此,对抗体药物的各类翻译后修饰进行表征和工艺控制是有必

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

蛋白质翻译后修饰 (PTM) 在细胞生物调节中发挥着基本作用。PTM 是 mRNA 翻译后蛋白质的酶促共价化学修饰。蛋白质化学修饰非常重要,因为它们会潜在地改变蛋白质的物理或化学性质、组成、活性、细胞定位或稳定性。实际上,在氨基酸或蛋白质的 N 端或 C 端加入或移除化学基团会导致大部分蛋白质发生变

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验             实验步骤 一、引言 蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验5

六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列,再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离(collision induced dissociation,C I D ) ( S w a n

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验4

五、质 谱 分 析质谱仪器的多种设计和配置都支持蛋白质组的动态性质及其相关 P T M 的研究工作 。对 鉴 定 PTM 而言,质谱仪的最重要的两个特征(feature) 就是其质量准确度和分辨率 。与蛋白质鉴定不同 (其通常是基于鉴定同一蛋白质中的多个独立肽段)P T M 必须通过单独的 MS/M

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6

七、P T M 的定量分析当研究 P T M 的生物学意义时,如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助深人了解 P T M 在

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6

七、P T M 的定量分析 当研究 P T M 的生物学意义时,如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验2

二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程,如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白质翻译(W

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(五)

六、CID、ECD和 ETD的对比 基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列,再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离(collision induced dissociation,C I

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验3

三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的(Yeo et al.,2008)。活性氮和活性氧能够靶向于DNA、脂

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(三)

2.2 糖基化糖 基 化 是 一 种 常 见 的 P T M , 并 且 已 经 证 明 能 够 影 响 酶 的 活 性 、蛋 白 质 定 位 、稳 定 性 、信 号 转 导 、细 胞 黏 附 和 蛋 白 质 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 经 发 现 在 肿 瘤 恶

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(二)

二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程,如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(五)

六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列,再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离(collision induced dissociation,C I D ) ( S w

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(四)

三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的(Yeo et al.,2008)。活性氮和活性氧能够靶向于D

Molecular-Cell:蛋白质翻译后修饰调控植物胁迫反应

  甲基化修饰与一氧化氮(nitric oxide; NO)依赖的亚硝基化修饰是高度保守的蛋白质翻译后修饰,这两类修饰参与调控众多生物学过程,包括调控非生物胁迫反应。但二者调控非生物胁迫的分子机制不甚清楚。   中国科学院遗传与发育生物学研究所左建儒研究组在亚硝基化蛋白质组学研究中发现拟南芥蛋白质

新方法分析临床样本中的组蛋白翻译后修饰

  欧洲肿瘤研究所(EIO)等机构的研究人员开发出一种基于质谱的流程,可分析FFPE临床样本中的组蛋白翻译后修饰。他们于上周在《Molecular & Cellular Proteomics》上详细介绍了这种技术。  利用这种技术,研究人员分析了一系列乳腺癌样本,发现Luminal A型乳腺癌和三阴