中科院、云南大学Nature子刊miRNA研究新成果
近日来自中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中国科学院研究生院和云南大学等机构的研究人员发表了题为“Evolution of the human-specific microRNA miR-941”的论文,揭示了一种特异性MicroRNA miR-941在人类进化中所起的作用。相关论文发布在10月23日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 来自中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所的Philipp Khaitovich研究员和云南大学的俞海菁(Haijing Yu)副教授为这篇文章的共同通讯作者。 基因表达改变被认为是导致物种间表型差异,包括语言、工具制造能力及寿命延长等人类专有特征的一个重要基本原因。突变可以影响如转录因子(TFs)和microRNAs (miRNAs)等调控因子的表达或结构,从而导致成百上千的基因错误调控,因此也代表着人类表达进化的一个强有力的潜在机制。从前针对转录......阅读全文
启动子与转录因子/基因表达调控蛋白
目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类
基因表达的转录机制介绍
转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。 基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点
关于基因表达的转录机制介绍
基因表达的转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。 基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转
基因表达的转录调控的介绍
可分为三种主要途径: 1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用); 2)调控转录因子与转录机制相互作用; 3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合
基因表达转录调控的主要途径
基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。
关于基因表达的转录调控介绍
基因表达的转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白
Cell-reports:转录激活因子抑制基因表达——一切皆有可能
近日,来自韩国的科学家在国际学术期刊cell reports在线发表了他们的最新研究进展,他们发现Hippo肿瘤抑制途径下游一直作为转录共激活因子的YAP和YAZ,也能够通过与具有TEA结构域的转录因子相互作用发挥转录共抑制因子活性,促进肿瘤进展。 YAP和TAZ是位于Hippo肿瘤抑制途径下
基因转录因子的相关介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点
T细胞基因的转录激活及其表达
TCR/CD3复合物与配体结合后,经多种信号转导途径传递信号,最终导致T细胞活化和增殖。信号转导中所涉及的基因根据其活化时间可以分为早早期、早期、晚期基因三种类型(表8-5)。早早期基因的转录不需蛋白的合成,而早期及晚期基因的转录则需蛋白的合成。早早期及早期基因转录在有丝分裂期之前,而晚期基因转
基因表达的转录后调控的介绍
真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。 携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在
基因表达的转录后调控的相关介绍
基因表达的转录后调控:真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。 携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的
tDEG(转录组差异表达基因深度分析)
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程,对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化;对两个以上生物学样本之间的差异表达基因进行可信分析;对差异表达所揭示出的重要科学问题进行中肯分析;让您快速“发现”所关注生物学问题,医学问题和农业问题
如何证明基因需要转录调控元件调控表达
如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3)
PNAS:研究人员开发癌症基因表达分析新技术
密歇根大学综合癌症中心的研究人员开发了一项新技术,可更好地了解癌细胞与正常细胞中RNA有可能存在差异的原因,并将推动更深入地了解肿瘤全基因组测序检测。研究人员将这一成果发布在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。 当研究人员测序癌细胞的RNA时,他们可以将之与正常细胞进行比较,看看哪里存在
中科院、云南大学Nature子刊miRNA研究新成果
近日来自中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中国科学院研究生院和云南大学等机构的研究人员发表了题为“Evolution of the human-specific microRNA miR-941”的论文,揭示了一种特异性MicroRNA miR-941在人类进化中所起的作用。相关论文发布在1
CCAAT转录因子
中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定 义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
辅助转录因子
中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定 义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
转录因子组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复
Cell:精子保持基因组稳定性的秘密
纽约大学Langone医学中心的研究人员近日在Cell上发表了一篇题为"Widespread Transcriptional Scanning in the Testis Modulates Gene Evolution Rates"的研究,揭示了广泛的转录扫描如何调控睾丸中的基因表达和进化。
关于重塑因子调节基因表达机制的假设
机制1:1 个转录因子独立地与核小体DNA 结合(DNA 可以是核小体或核小体之间的),然后,这个转录因子再结合1 个重塑因子,导致附近核小体结构发生稳定性的变化,又导致其他转录因子的结合,这是一个级联反应的过程——重建;机制2: 由重塑因子首先独立地与核小体结合,不改变其结构,但使其松动并发生滑动
神经所发现转录因子Tlx1/3与Ptf1a调控基因的特异性表达
6月20日,《神经科学杂志》(The Journal of Neuroscience) 发表了中科院上海生命科学研究院神经所神经发育及其调控机理研究组的论文Tlx1/3 and Ptf1a control the expression of distinct
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
转录因子活性ELISA
转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法,比EMSA的灵敏度高l0倍,在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳,安全简便,而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活
揭示新小鼠巨细胞病毒转录激活因子病毒晚期蛋白表达
2020年1月2日,病毒学期刊Journal of Virology 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所钱志康课题组的最新研究“Murine Cytomegalovirus Protein pM49 Interacts with pM95 and Is Critical for Vira
转录因子和转录因子之间可以有相互作用吗
可以转录因子真核生物转录起始十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡ
研究人员发现随机单等位基因表达新机制
最近,来自法国的科学家对单等位基因体内表达机制进行了研究,发现一些随机单等位基因表达在发育和常染色体显性失调症中发挥着重要的作用。相关研究成果发表在2014年2月的《Developmental Cell》杂志上。 与嗅觉受体和免疫球蛋白基因座相关的X染色体失活(X chromosome ina
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变,这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez,Trey Ideker,在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
研究人员发现促进间充质干细胞骨形成的新型转录因子
成骨分化是由细胞内信号和外部微环境信号共同调控的复杂生物学过程。在适当的刺激下,间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)通过多个转录因子驱动的多步调控过程向成骨细胞分化,其特征是大量骨特征蛋白的表达。近日,来自意大利和西班牙的研究人员共同发现了小鼠体内一种新的转录因