3DIonTorrent(TM)文库定量CN

下一代测序(NGS) 工作流程中,模板制备步骤是在Ion PGM™ 和Ion Proton™ 平台上获得最佳测序产量的关键,文库输入量是其中的决定性因素。文库浓度过高或过低都会导致总读取数下降,从而降低系统的总通量。因此,在模板制备之前,精确的高质量文库定量方法是使测序通量最大化的关键。数字PCR (dPCR) 提供了一种高度精确的定量方法,无需参照或标准曲线即可进行核酸样本的绝对定量。将基于芯片的QuantStudio™ 3D 数字PCR 系统与预先经过验证的Ion Torrent™ 文库定量Assay 相结合,是该应用领域的最佳选择。QuantStudio™ 3D 数字PCR 芯片将一个标准的PCR 反应混合物分成20,000 个单独的PCR 反应。这种直接的样本稀释过程可以使众多反应中的一部分反应含有目标分子,另一部分则不含有目标分子,分别代表阳性和阴性反应。在双槽式PCR 仪上扩增后,利用定量样本中阴......阅读全文

3D-Ion-Torrent(TM)-文库定量CN

下一代测序(NGS) 工作流程中,模板制备步骤是在Ion PGM™ 和Ion Proton™ 平台上获得最佳测序产量的关键,文库输入量是其中的决定性因素。文库浓度过高或过低都会导致总读取数下降,从而降低系统的总通量。因此,在模板制备之前,精确的高质量文库定量方法是使测序通量最大化的关键。数字

-赛默飞Ion-S5首批数据公布,玩爆前任PGM™系列

  北美时间9月1日,赛默飞发布了两款最新的NGS系统Ion S5 和Ion S5XL,旨在提供更加简捷的靶向测序流程。10月29日Ion S5测序仪的首批实验数据产生于阜外医院。阜外医院研究人员选用了主动脉基因疾病组合测序,该基因组合包括15个与主动脉疾病相关的致病疾病,研究人员通过文库构建——模

Ion-Torrent新一代测序仪介绍

引言      整个或部分基因组测序的研究问题已解决,研究者的研究重点向着遗传密码如何编码调控细胞功能方向转移。同样,在分子水平了解人类健康状况,基因序列数据则显得更加重要。大多数的测序都是针对部分基因序列或是一段目标区域,提供必需的数据来解释给定假说。利用PCR技术很容易从基因组中扩增得

赛默飞Ion-Torrent-Reporter软件获得CEIVD标志

  赛默飞世尔科技近日表示,其 Ion Torrent Reporter 软件非整倍体 Dx 工作流程已获得 CE-IVD 标志。  CE-IVD 标志涵盖两个工作流程:低通全基因组非整倍体 Dx w1.0 和低通全基因组非整倍体 Mosaic Dx 1.0。这些工作流程将与一般的非体外诊断产品结合

-Life-Tech高通量测序仪Ion-Torrent获欧盟CE认证

  近日,Thermo Fisher公司宣布他们旗下子公司Life Tech高通量测序系统Ion PGM Dx获欧洲CE标示,这也就意味着Ion PGM Dx系统获得了进入欧洲市场的许可。  欧盟CE标志是安全合格标志而非质量合格标志,被视为制造商打开并进入欧洲市场的护照。CE代表欧洲统一(CONF

Thermo-Fisher-Scientific发布Ion-Torrent技术更新和新产品预览

  上周,基因组生物学技术进展年会(AGBT) 在佛罗里达州马可岛举行,Thermo Fisher Scientific公司在会上发布了Ion Torrent测序技术的最新进展情况。  在周六召开的公司工作会议上,Ion Torrent 研发副总裁Allan Williams提前预告公司正在筹备Io

3D-CNV鉴定实验CN

拷贝数变异 (CNV) 是基因座的野生型拷贝数相比参考基因组增加或减少造成的基因组失衡。这些基因组改变从小的 (小于10 kb) 插入或缺失到大的 (超过1 Mb)、复杂的多等位基因复制均有。CNV是人类基因组中最常见的遗传变异,与多种疾病有关,包括癌症或遗传性疾病易感性 [1, 2]。

3D-CNV鉴定(Sucess-Story)CN

HER2 (人表皮生长因子2,又称为ERBB2) 是一种原癌基因,在特定的情况下会促进癌症细胞的增殖。原癌基因促进肿瘤发生的机制有三种:(1) 染色体重排导致超活性基因融合,(2) 编码序列上的点突变或缺失导致超活性蛋白生成,(3) 基因扩增导致蛋白质过表达。HER2基因扩增多年来一直被视作

赛默飞于进博会首发基因测序新品-Ion-Torrent-Genexus-系统

  在11月8日第二届进博会展示发布平台上,科学服务领域的世界领导者——赛默飞世尔科技(以下简称赛默飞)发布了其全球首款能在一天内自动完成样本制备到结果报告流程的高通量基因测序(NGS)平台——Ion Torrent™ Genexus™系统,并发布了配套的Oncomine™ Precision As

罗氏454起诉赛默飞Ion-Torrent-三项ZL侵权

  近日,罗氏454将赛默飞世尔告上法庭,他们起诉赛默飞旗下的Ion Torrent侵犯了他们的3项ZL。这3项ZL都与测序前样本处理使用到的一项技术——微乳液PCR有关,ZL号(美国)分别为7323305、8748102、8765380。  赛默飞和罗氏都拒绝对诉讼发表评论。值得注意的是

如何快速发现肿瘤中的热点突变

  去年10月,Ion Torrent推出了Ion AmpliSeq™ Cancer Panel,它覆盖了46个癌基因的相关区域。如今,Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2如今经过扩展,靶定50个癌基因和肿瘤抑制

DNA测序技术

目前还有一种基于半导体芯片的新一代革命性测序技术——Ion Torrent。该技术使用了一种布满小孔的高密度半导体芯片, 一个小孔就是一个测序反应池。当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸中的DNA链上时,会释放出一个氢离子,反应池中的PH发生改变,位于池下的离子感受器感受到H+离子信号,H+离子信号再直

相比一代测序技术,二代测序技术具有哪些优点

相比一代测序技术,二代测序技术优点如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势:Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题,它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短(200bp-500bp)也让其应用有所局

一代测序技术,二代测序技术具有哪些优点

相比一代测序技术,二代测序技术优点如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势:Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题,它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短(200bp-500bp)也让其应用有所局

全新一代测序技术:没有光的测序

  至今,新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心   ――明斯特大学Dag Harmsen   在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过

IonPGM测序仪读长达到400bp

  Life Technologies公司近日宣布,适用于Ion PGM™测序仪的400 bp测序试剂盒已上市。读长的改善使产量增加,也带来了更完整的细菌de novo组装。目前Ion 318™芯片上的400 bp运行的产量可达1-2 Gb。   德国明斯特大学的Dag Harmsen教授去年

LifeTech扩大突变筛查产品线

  Life Technologies公司近日宣布,它将扩大Ion AmpliSeq™ 产品线,推出Comprehensive Cancer Panel和Inherited Disease Panel。这些独一无二的分析板,再加上Ion AmpliSeq Designer V1.2、I

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

LifeTech正式参与X奖的角逐

  X奖基金会(X Prize Foundation)近日宣布,Life Technologies公司已经报名参加基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize)的角逐。   Archon X奖是由X奖基金会设立的。第一支在30天内快速准确地对100个人类基因组

LIFE-金牌赞助第六届国际基因组学大会

第六届国际基因组学大会(ICG-6)在2011年11月12日至15日在深圳东部华侨城隆重召开。本次会议由华大基因(BGI)主办,召集了世界各地400多名从事基因组学研究的科学家,生物制药业界,学术刊物编辑。来自各方的专家在汇报基因组学领域最新科研进展的同时将会深入讨论农业育种,医疗健

九大测序平台对比(六)

8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™(2010年)样品要求: 5 μg DNA,起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子

液体处理专家如何自动化、标准化捕获测序文库制备

目标区域捕获测序技术,是根据已知特定基因组区域序列设计寡核苷酸探针,通过杂交将目标区域捕获富集进行二代测序。其针对目标区域深度测序,增加了检查灵敏度和准确性。既满足研究需求,又降低测序成本,在科研、临床中均备受关注。液体处理专家贝克曼库尔特推出Biomek 自动化捕获测序方案,帮助您实现自动化、标准

赛默飞推出一系列临床研究的产品

  一年一度的美国分子病理学会(AMP)年会于11月5-7日举行。赛默飞世尔也将在此次会议上推出一系列临床研究的产品,让研究人员去发现有意义的遗传信息,以便更好地了解疾病。早前,在美国人类遗传学协会年会上,它也是推出多款重量级产品。  实体瘤分析  对于临床研究人员而言,FFPE样本是宝贵的资源,它

年度创新:Ion-PGM半导体测序仪

【导读】Rothberg博士的梦想是打造测序领域的“数码相机”,既实惠又易用,还能快速得到结果。他确实做到了。与其他测序平台相比,Ion PGM™ 测序仪快速、简捷,扩展性好,更关键的一点是,价格实惠。它让测序平民化,让每个实验室都触手可及。  半导体技术已经改变了它所触及的每一个行业,从计算到摄影

基于epMotion-5075t及KAPA文库定量试剂盒的全自动NGS文库...1

基于epMotion 5075t及KAPA文库定量试剂盒的全自动NGS文库定量操作Automated KAPA® Library Quantifcation Kit with the epMotion® 5075tMaud Brasseur¹, Jennifer Pavlica², Marsha M

基于epMotion-5075t及KAPA文库定量试剂盒的全自动NGS文库...2

Results and DiscussionAutomated qPCR Setup Accuracy and PrecisionThe accuracy and precision of the qPCR setup was evalu ated based on standard curve

专访赛默飞:Ion-S5和Ion-S5XL系统,未来一切皆有可能

  测序技术的发展经历了很长的时间,下一代测序(NGS)技术的发展彻底地改变了人类基因组测序的方式。自实现第一个人类基因组测序以来(项目前后耗时十年时间,投入30亿美元),随着技术的发展,测序所需的费用和时间大幅度降低,NGS的发展为临床诊断开启了新的窗口。  北美时间9月1日,赛默飞发布了两款最新

Life-Technologies发布个人化操作基因组测序仪

  2010年3月17日,Life Technologies在其于北京举办的2011年生命科学新技术报告会上发布了利用半导体芯片实现高通量测序的Ion Torrent个人化操作基因组测序仪。报告会还介绍了Life Technologies包括分子生物体系、细胞体系与基因体系在内的三大业务领域

DNA靶向测序panel:七个你不可不知的问答

在之前举办的NGS系列讲座中,我们邀请专家为您介绍了从样本制备到数据解读报告的全面NGS技术应用。讲座收到了众多反馈与咨询,在此我们总结出最受关注的7大问题,与您分享。1 QIAGEN的靶向基因扩增试剂盒能用在哪些NGS平台?GeneRead DNAseq Targeted Panels V2适用于

一代测序、二代测序及三代测序的应用对比

  一、初现庐山真面目  一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆)  历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用