DNA杂交动力学的有效调控新方法

生物大分子之间的静电相互作用一般认为是短程的。由于在生理条件的高离子强度(百毫摩尔级)下,大分子表面存在双电层屏蔽,使静电相互作用的传导距离局限在1-2 nm内。然后,如何调控双电层厚度来对生物大分子相互作用中的长程静电力开展研究是一个挑战性问题。近年来,一些研究表面,DNA双链的磷酸骨架可以作为高效的电荷传导线路,为研究高离子强度下的长程静电作用提供了新的思路。 受此启发,上海交通大学樊春海院士团队的刘小果副教授指导渠志倍博士等设计了基于DNA框架结构的长程静电作用调控体系,构建了DNA杂交动力学的有效调控新方法。通过定量化实验和多尺度的分子动力学模拟,证明了在DNA杂交的动力学过程中存在长程静电力并起到了主导作用。该机制还被拓展到了DNA-蛋白质、DNA-多糖等多种复合物体系中,证明了其普适性。 作者将带不同表面电荷的蛋白质颗粒或金纳米粒子通过共价偶联的方式包裹入DNA四面体框架结构中。通过定量毛细管电泳和ζ-电......阅读全文

无机物与生物大分子的作用

无机物与生物大分子的作用主要体现在金属离子及其配合物与生物大分子的作用。主要包括金属离子对生物大分子的探针和识别、配体与生物大分子对金属离子的竞争反应、离子和电子在生物大分子内或生物大分子间的传递等。金属离子与生物大分子结合后,常常会发生明显的生物化学效应。如一些金属氯化物和葡萄糖酸盐对葡萄糖氧化酶

大分子相互作用仪应用领域

生命科学,食品安全,环境检测,生物医学;毒素和抗生素快速检测;蛋白质组学;药物筛选及相关药物动力学实时检测;生物分子特殊肽段及相关偶合分子的检测;病毒及致病分子/蛋白及受体研究;分子识别,免疫调节,免疫测定等,尤其适于在高校、科研院所进行科学研究及教学实验使用。

用生物大分子来做模式识别

    分子水平的模式识别对于生物有机体实现其基本功能起着至关重要的作用,在此之前,研究者们已经报道了使用基于线性阈值环路和Hopfield环路的DNA的神经网络来处理这类问题,但是其能够处理的规模有限,仅能够识别不超过四个模式,其中每个模式由4种不同DNA分子构成的。在本篇文章中,作者采用的是被称

使用高速离心机分离生物大分子

        生物大分子包括核酸、蛋白质和多糖等。它们是一切生物机体形态结构和功能发挥zui重要的物质基础,其分子量巨大、分子结构复杂,分子中包含有生命活动的基本信息。近年来分子生物学研究的理论和实践飞速发展。特别是功能基因组学和蛋白质组学的研究在揭示生命现象本质中发挥着的积极作用。       

关于生物大分子的物种的形成介绍

  在原始地球条件下,有两条路径可以达到脱水缩合以形成高分子:其一是通过加热,将低相对分子量的构成物质加热使之脱水而聚合;其二是利用存在于原始地球上的脱水剂来缩合。前者常常是在近于无水的火山环境中进行,后者则可以在水的环境中进行。  生物大分子都可以在生物体内由简单的结构合成,也都可以在生物体内经过

生物大分子制备常用的样品浓缩方法

1、减压加温蒸发浓缩通过降低液面压力使液体沸点降低,减压的真空度愈高,液体沸点降得愈低,蒸发愈快,此法适用于一些不耐热的生物大分子的浓缩。 2、空气流动蒸发浓缩空气的流动可使液体加速蒸发,铺成薄层的溶液,表面不断通过空气流;或将生物大分子溶液装入透析袋内置于冷室,用电扇对准吹风,使透过膜外的溶剂不沁

无机物与生物大分子的作用

无机物与生物大分子的作用主要体现在金属离子及其配合物与生物大分子的作用。主要包括金属离子对生物大分子的探针和识别、配体与生物大分子对金属离子的竞争反应、离子和电子在生物大分子内或生物大分子间的传递等。金属离子与生物大分子结合后,常常会发生明显的生物化学效应。如一些金属氯化物和葡萄糖酸盐对葡萄糖氧化酶

大分子相互作用仪的技术原理

  表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)是一种光学物理传感技术。一束P偏振光在一定的角度范围内入射到棱镜端面,在棱镜与金属薄膜(Au或Ag)的界面将产生表面等离子波。当入射光波的传播常数与表面等离子波的传播常数相匹配时,引起金属膜内自由电子产生共振,即表面等离

大分子相互作用仪应用领域

生命科学,食品安全,环境检测,生物医学;毒素和抗生素快速检测;蛋白质组学;药物筛选及相关药物动力学实时检测;生物分子特殊肽段及相关偶合分子的检测;病毒及致病分子/蛋白及受体研究;分子识别,免疫调节,免疫测定等,尤其适于在高校、科研院所进行科学研究及教学实验使用。

生物大分子的浓缩干燥与保存方法

 一、样品的浓缩  生物大分子在制备过程中由于过柱纯化而样品变得很稀,为了保存和鉴定的目的,往往需要进行浓缩。常用的浓缩方法的:  1、减压加温蒸发浓缩  通过降低液面压力使液体沸点降低,减压的真空度愈高,液体沸点降得愈低,蒸发愈快,此法适用于一些不耐热的生物大分子的浓缩。  2、空气流动蒸发浓缩空

大分子物质的水解实验——油脂水解试验

实验方法原理脂肪水解后产生脂肪酸可改变培养基的 pH, 使 pH 降低, 加入培养基的中性红指示剂会使培养基从淡红色变为深红色,说明胞外存在着脂肪酶。实验材料芽孢杆菌大肠杆菌金黄色葡萄球菌铜绿假单胞菌(Pseudomonas Aeruginosa)试剂、试剂盒固体油脂培养基仪器、耗材无菌平皿接种环和

生物大分子X射线小角散射实验指南

    导读:基于同步辐射的X射线小角散射实验可以实现高通量以及更高的分辨率和信噪比。本文简单介绍了生物大分子小角散射(BioSAXS)的数据收集策略以及样品准备要求,看完这篇就可以准备样品直接去BL19U2收集小角数据了!BioSAXS的目标    生物分子的小角X射线散射(以下简称生物小角,Bi

生物大分子的离心分离实验(三)

例(6)用Cs2SO4 及尿素作梯度材料分离生物大分子样品:初步离心后的蛋白-核酸混合液梯度液:3.00g Cs2SO4 2.5ml 8M 尿素(经过混合床去离子处理的)50μl 1.0M Tris-HCl(PH7.4)25μl 0.2M EDTA(PH7.4)1.25ml 样品的水溶液以上各项充分

原位鉴定细胞或组织内生物大分子

原位鉴定细胞或组织内生物大分子、观察细胞及亚细胞形态结构:检测核酸、检测蛋白质细胞定位、检测细胞凋亡、细胞器的观察及测定、检测细胞融合、观察细胞骨架、检测细胞间缝隙连接通讯、检测细胞内脂肪;

大分子相互作用仪SPR技术原理

表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)是一种光学物理传感技术。如图1所示,一束P偏振光在一定的角度范围内入射到棱镜端面,在棱镜与金属薄膜(Au或Ag)的界面将产生表面等离子波。当入射光波的传播常数与表面等离子波的传播常数相匹配时,引起金属膜内自由电子产生共振

大分子物质的水解实验——石蕊牛奶试验

实验方法原理有些微生物能水解牛奶中的蛋白质酪素,酪素的水解可用石蕊牛奶来检测。石蕊培养基由脱脂牛奶和石蕊组成,是昏浊的蓝色。酪素水解成氨基酸和肽后, 培养基就会变得透明。 石蕊牛奶也常被用来检测乳糖发酵,因为在酸存在下,石蕊会转变为粉红色,而过量的酸可引起牛奶的固化(凝乳形成),氨基酸的分解会引起碱

细胞转染脂质体转染法

阳离子脂质体表面带正电荷,能与核酸的磷酸根通过静电作用,将DNA分子包裹入内,形成DNA脂复合物,也能被表面带负电的细胞膜吸附,再通过融合或细胞内吞进入细胞。脂质体转染适用于把DNA转染入悬浮或贴壁培养细胞中,是目前实验室最方便的转染方法之一,其转染率较高,优于磷酸钙法。由于脂质体对细胞有一定的毒性

哪些废水水质条件有利于壳聚糖的絮凝作用?

下这些废水水质条件通常有利于壳聚糖的絮凝作用:较低的浊度:浊度较低意味着废水中悬浮颗粒较少,壳聚糖能够更有效地与主要污染物相互作用,减少干扰。适中的有机物浓度:如果有机物浓度过高,可能会消耗大量的壳聚糖,影响其对关键污染物的絮凝;而浓度过低则可能导致絮凝效果不明显。酸性 pH 值:一般在 pH 为

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3

2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同

DNA重组技术(DNA-Recombination)

一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定2

(1)CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子(如Ca2+、Mg2+等)低渗溶液中时,细菌细胞膨胀成球形,处于感受态;此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面,在丰富培养基中生长数小时后,球状细胞恢复原

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定1

重组DNA是在体外用限制性内切酶,将不同来源的DNA分子进行特异地切割,获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接,从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞,在宿主细胞中进行无性增殖,获得大量的目的基因或DNA片段,此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定3

当多克隆位点有外源DNA片段插入时,破坏此酶的N端阅读框架,产生无α互补功能的N端片段,因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色,见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短,不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框,有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体2

二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体3

在作为载体时,这些噬菌体有一个很大的优点,即克隆到M13mp载体的外源DNA片段(双链),在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆,可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板:①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板;②制备仅有一条

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体1

载体(vector)是携带靶DNA(目的DNA)片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型,亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下

CPSA-2013分会:大分子的生物分析

  2013年4月24~26日,第四届中国上海化学与药物结构分析会议 (CPSA Shanghai 2013)在上海浦东新区淳大万丽酒店召开,来自国际知名药企、跨国大制药公司、中国CRO、生物医药研究所和高校的高管、专家、学者两百余人参加了本次会议。其中在4月25日的分

生物大分子药物口腔黏膜递送研究进展

摘要生物大分子药物的替代给药方式一直是生物大分子药物研究的热点。口腔黏膜因其“柔和”的给药环境、无肝首过效应以及患者依从性好等优点,是生物大分子药物理想的给药部位。由于相对分子质量大、亲水性强的特点,生物大分子药物存在口腔黏膜渗透吸收差、生物利用度低的问题。黏膜促透技术的发展,为生物大分子药物的口腔