DNA提取:为微生物研究扫清障碍

近年来,尽管测序技术在快速发展,但DNA提取方法却鲜有改进。对于宏基因组研究,这是必需的一步。然而,许多微生物无法在实验室中培养,这成为分析大量微生物样品的一个主要瓶颈。参与美国NIH的人类微生物组计划(Human Microbiome Project)以及地球微生物组计划(Earth Microbiome Project)的科学家们也面临这一问题。 参与这些计划及其他计划的微生物学家使用专门的试剂盒,他们利用机械和化学裂解以及DNA纯化步骤,接着对16S rRNA基因进行PCR扩增,最后测序。但是他们发现,并非所有方法都是相似的,这不但影响结果的质量,还让不同研究之间的结果难以比较。为了解决这些挑战,多个研究小组都在优化DNA提取的效率,并研究不同步骤如何影响DNA的质量和产量。 例如,在上月发表在《PLoS ONE》的一项研究中,科罗拉多大学的微生物学家Gilberto Flores及其同事检验了......阅读全文

美国著名进化生物学家乔治·威廉姆斯逝世

乔治·威廉姆斯(图片来源:《纽约时报》)   美国著名进化生物学家乔治·威廉姆斯(George C. Williams)9月8日因帕金森病在家中去世,享年83岁。   威廉姆斯是现代自然选择理论的主要创建者之一。该理论认为自然选择在基因和个体层面起作用,不是为了群体或种群的利益。   威廉

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

叶绿体基因组

叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组

多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-

全基因组的比较基因组杂交技术介绍

Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a

DNA提取试剂盒的分类

小量全血基因组DNA提取试剂盒、中量全血基因组DNA提取试剂盒、组织/细胞基因组DNA提取试剂盒、中量/大量组织/细胞基因组DNA提取试剂盒、全血/组织/细胞基因组DNA提取试剂盒、CTAB植物基因DNA提取试剂盒、新型植物基因组DNA提取试剂盒、酵母基因组DNA提取试剂盒、M13噬菌体单链基因组D

Nature:掌上测序仪表现令人惊艳

  今年四月份,伯明翰大学的Joshua Quick在行李中装了三个测序仪(MinION)然后登上了去几内亚的飞机。这在过去是难以想象的,因为绝大多数测序仪又大又重。在几内亚,Quick只用12天就测序了14名埃博拉患者的病毒基因组,收集样本之后48小时就能得到结果。  这对于流行病学家来说,是一个

美国生物学家发现激活一关键基因可延缓果蝇衰老进程

  美国加州大学洛杉矶分校的生物学家发现,当利用遥控手段将关键器官系统中一种名为AMPK的基因激活时,可以延缓整个机体的衰老进程。果蝇实验显示,如果提高其肠道中AMPK基因的水平,可使果蝇的寿命延长30%,存活期从通常的6周增加到大约8周,而且它们的健康状态也保持得更久。  AMPK基因是细胞中一个

美生物学家称21世纪2/3物种或将消失

  一位美国生物学家12日在北京说,21世纪可能将有三分之二的物种从地球上消失,而其中的绝大多数在消失之前还未被人类认识。   美国密苏里州植物园园长彼得·雷文在第23届国际保护生物学大会上作主旨演讲时说,由于世界人口的不断增长、人类消费水平的提高以及科技的发展造成了野生动植物栖息地的破

美国生物学家扁虫种间“换头”实验获得成功

  美国塔夫茨大学生物学家不改变基因组序列就成功诱导一种扁虫长出了另一种扁虫的头形和脑结构。这一成果表明生理线路可作为一种新的表观遗传信息,决定生物体内较大的结构。11月版的《国际分子科学》杂志对此研究做了详细介绍。   该研究发现,由基因组决定的头部形状并非固定不变,控制体内的电突触能改变基因表征

49位海外生物学家再次上书力推转基因商业化

  关于转基因的战争尚无停止的迹象。在“挺转”和“反转”背后,一个不可忽视的现象是,转基因大豆、菜籽油、玉米大量进口,孟山都、杜邦、拜耳等企业在我国发展种子业务的同时,与国内的科研院所合作开展转基因育种研究。无论是支持还是反对转基因主粮商业化的专家共同担忧的一点是我国的种子产业安全和粮食安全。  

美知名生物学家马古利斯逝世-曾提出内共生学说

  美国知名生物学家林恩·马古利斯(Lynn Margulis)于11月22日在美国麻省逝世,享年73岁。   Lynn Margulis,1938年3月5日出生于美国芝加哥,她14岁进入芝加哥大学学习,1960年从威斯康星大学获得遗传学与动物学硕士学位,1965年从加州大学伯

英生物学家开生育诊所亲自捐精-后代或达六百人

格兰茨(左)拿着其生父伯托尔德·威斯纳的照片,百感交集。  英国生物学家伯托尔德·威斯纳与妻子玛丽·巴顿20世纪40年代在伦敦建立一家生育诊所,使用“优秀男性”捐赠的精子帮助没有生育能力的夫妇实现育儿梦想。  如今,威斯纳和巴顿已经去世,诊所也早已停业。但在诊所出生的人发现,威斯纳治

微生物学家刘志恒:坎坷中成就科学人生

  一位德国哲学家说过:“如果艰难的经历没有摧毁我们,它就反而让我们更坚强。”这是一位“老外”对微生物学家刘志恒人生与科研的评价。  出生于1940年,上世纪60年代正式投身科学,刘志恒——这位从河南农村走出来的知识分子和很多同龄人一样,他前半生在战乱与政治动荡中

美国生物学家:你的肚脐眼里有一个新世界

  一群来自北卡罗来纳州立大学和北卡罗来纳州自然科学博物馆的科学家团队近日宣布成立一个新的科研组织,名为名为“肚脐生物多样性(BBB)”,该组织的目的除了研究人类肚脐眼附近的菌落外,还承担了一定的科普重任,他们试图消除人们对于细菌的误解――认为所有的细菌都是有害的。   为此,数百名科学家、学者以

GenomeWeb:在美国当生物学家,今年比去年平均少8000美元

  美国GenomeWeb网站近日发布了一年一度的薪酬调查结果。根据今年的调查,生物行业的研究人员、技术人员拿回家的薪水比五年前要多,但却比去年要少。调查显示,这个行业的薪水中位数是7.50万美元,而去年是8.30万美元。  在去年的调查中,身份为资深科学家、高级研究人员、高级技术人员的受访者的薪水

灰鲸迁徙数千公里抵达地中海震惊生物学家

一头灰鲸在以色列附近地中海海域浮出水面这头灰鲸的出现让海洋生物学家大为吃惊。从它的栖息地出发,要经过西北通道,然后进入大西洋,最后才能到达地中海。这头灰鲸可能是沿着这条路线到达地中海的或许是为了寻找温暖的海域,它又来到了地中海。  据《每日邮报》报道,一头灰鲸在地

生物学家利用荧光寿命成像显微镜技术使活精子发光

  雌性昆虫如何在交配后的几个月内保持精子的活性?这是由应用动物学系主席Klaus Reinhardt教授领导的精子生物学家们关心的一个中心问题。现在科学家们在《Scientific Reports》杂志上发表了他们的第一个有希望的结果。  Cornelia Wetzker博士从癌症研究中借用了一种

突发:著名生物学家李晓江在美被判重刑-罚款35089美元

  5月11日,美国司法部发布新闻称,在上周五宣判了著名华人生物学家、前美国埃默里大学终身教授、国家QIANREN特聘教授—李晓江一案。美方指控李晓江参与国内人才计划未如实披露个人税收,因而被判重罪,缓刑一年,罚款35089美元。美国司法部发布的新闻  起诉书称,李晓江在一年时间里(2014年9月1

生物化学与分子生物学家张友尚逝世

中国科学院院士、生物化学与分子生物学家张友尚因病医治无效,于2022年12月23日在上海逝世,享年97岁。 张友尚,1925年11月2日生于湖南长沙。1948年毕业于浙江大学化工系,1961年中国科学院上海生物化学研究所研究生毕业,后任中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所研究员。2001年当

病理学和肿瘤分子生物学家顾健人逝世

9月27日,澎湃新闻记者从上海交通大学医学院附属仁济医院获悉,中国共产党优秀党员,中国工程院院士,中国医学科学院首届学部委员,癌基因与相关基因国家重点实验室创始人,著名病理学和肿瘤分子生物学家,上海交通大学教授、博士研究生导师,上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所名誉所长顾健人同志,因病于

著名细胞生物学家、中科院院士、北大教授翟中和逝世

  翟中和院士讣告  中国共产党优秀党员,著名细胞生物学家,杰出的教育家,中国科学院院士,北京大学教授翟中和先生,因病医治无效,于2023年2月10日14点42分在北京逝世,享年93岁。  翟中和先生1930年8月18日出生于江苏省溧阳县。1950年考入清华大学生物学系,1951年被派往前苏联留学,

临床样本核酸提取全攻略

¤ 临床检验样本RNA的提取人和动物全血、血清、血浆、脑脊液、人淋巴细胞中提取总RNA或病毒RNA——血液(液体样本)总RNA快速提取试剂盒(离心柱型)货号:RP4001  700元/50次血清、血浆、全血(或其他含病毒的液体)中同时提取病毒基因组和RNA——病毒基因组DNA/RNA快速提取试剂盒(

Nature:实时、便携式基因组测序

  埃博拉病毒(EBOV)感染人类会引起致命的出血热,发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了严重的疫情,死亡人数已经超过11,000人。今年一月份,就在人们以为这场疫情正式结束之际,塞拉利昂又出现了新的病例。  本期Nature杂志发表的一项新研究展示了便携式基因组测序仪在这次疫情中起到

中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动

  为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检

《基因组研究》:首张猫基因组草图绘就

猫是研究人类失明和艾滋病模型之一,因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”(Cinnamon)的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》(Genome Research)杂

美呼吁启动大型RNA研究项目,堪比人类基因组计划

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519700.shtm2021年以来,随着一种新型疫苗保护数百万人免受新冠肺炎的感染,信使RNA(mRNA)开始被更多人熟知。这种分子将DNA的密码从细胞核中转移出来,以指导蛋白质的产生。它只是深刻影响细胞

德国助力测序受忽视生物体

  近日,德国的一个州为那些希望解密那些不太受关注的生物体基因的生物学家提供了一个大帮助。黑森州日前宣布为当地研究机构提供1760万欧元经费。这个为期7年的项目前一半将主要测序植物、动物和真菌。该项目还包括高通量测序约700种生物体,以及部分或重新测序数千种生物。  “德国科学家正在向了解生命的基因

古老橡树有年轻基因

  古老橡树的基因数百年来保持稳定。图片来源:Abaddon1337/CC BY-SA 4.0  瑞士洛桑大学校园里有一颗古老的橡树,已经矗立了234年。当1800年拿破仑的军队经过这座城市时,它还只是一颗小树,现在已经成长为这座城市的地标。但令人惊讶的是,一路走来,它的基因组几乎没有变化。  研究