揭示了m6ARNA修饰的新的进化意义
无义介导的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式，细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子（Premature Termination Codon, PTC）从而决定是否降解该RNA。因此经典的NMD通路是一种RNA剪接依赖的机制。假基因是一种失去了蛋白编码能力或者表达能力的基因，通常由基因重复产生，基因组上的DNA重复可以形成非加工型假基因，而逆转录形成的基因重复会形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白产生细胞毒性，因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC，因此大量的非加工型假基因可以通过NMD的方式降解。然而，加工型假基因由于缺少内含子而不能通过NMD的机制降解，那么加工型的假基因是否进化出其他的方式来进行降解并不清楚。 近日，中山大学王金凯教授课题组在Genome Bi......阅读全文
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
信使RNA的降解
同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命（稳定性）。在细菌细胞中，单个mRNA可以存活数秒至超过一小时，但平均寿命为1至3分钟，因此，细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高，从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够
Nature揭秘RNA降解机制
就好像我们利用碎纸机来销毁不再有用或包含有潜在破坏性信息的文件一样，细胞利用一些分子机器来降解不必要或有缺陷的大分子。来自马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的科学家们，现在揭示出了细胞核区室利用一种特异的RNA外来体（exosome）的机制——这一大分子机器负责了核糖核酸(RNAs)的降解和
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
Cell新文章解析RNA降解机制
如同我们利用碎纸机来销毁不再有用或是包含潜在破坏性信息的文件一样，细胞利用分子机器来降解不需要或有缺陷的大分子。来自马克思普朗克生物化学研究所的科学家们现在解码了在降解核糖核酸(RNA)过程中起至关重要作用的一个蛋白质复合物(Ski复合物)的结构。这项研究发表在8月15日的《细胞》(Cell)杂
避免RNA降解的方法有哪些？
(1)在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA。(2)运用良好无污染的技术分离RNA(3)将组织提取后立刻提取RNA，并将提取好的RNA反转录为cDNA进行低温保存。
RNA－和－DNA－提取的降解问题
降解问题是RNA制备中常常到的问题。因为在 RNA 提取过程中,样品储存不当或裂解效率低等情况都会导致降解。对于 DNA 提取,降解不是一个大问题,因为对于 PCR,DNA 可以被剪切并且工作正常,如果不希望有较多剪切的 DNA,可以使用弱裂解的方法。
m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星，也是国自然申请的大热点；究其原因，是因为最近一两年，RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展，病毒感染，神经发育，干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天，我们承接上一期的癌症篇，为您带来病毒领域的RNA甲基化研究
m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇
一个月发表30多篇10分以上的文章，到底是何方神圣？答案：RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰，在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答，母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个重要的生物学
揭示RNA－m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制
免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地，其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原，难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点，提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、
一月内三发国际顶刊，这所大学高产了
原文地址：https://www.cingta.com/detail/228745月23日晚，同济大学生命科学与技术学院高绍荣/高亚威教授团队与南京医科大学沈彬教授团队合作在《自然·细胞生物学》（Nature Cell Biology）在线发表了题为《RNA甲基化修饰m6A调控母源-合子转变过程中R
揭示了m6A－RNA修饰的新的进化意义
无义介导的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式，细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子（Premature Termination Codon, PTC）从而决
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
表观遗传研究热点：RNA－甲基化（m6A）研究
随着表观遗传学研究的不断深入，组蛋白修饰（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中，遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
表观遗传研究热点：RNA－甲基化（m6A）研究
随着表观遗传学研究的不断深入，组蛋白修饰（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中，遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
靶向干预m6A通路抑制癌细胞新策略被发现
近日，国际期刊美国《公共科学图书馆—生物学》（PLOS Biology）在线发表了最新研究成果。该成果揭示了RNA甲基化m6A阅读器YTHDF2在细胞周期中的作用，并阐明细胞周期通过影响YTHDF2蛋白稳定性形成前馈调控回路的分子机制，为通过靶向干预m6A通路抑制癌细胞增殖提供新的策略。 论文
一文了解RNA甲基化机制
1. 什么是RNA甲基化修饰？ 我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶（C）上的，而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）和尿苷化修饰（uridylation，U-tail）。 m6A修饰在70年代就发现了，是可以发生在mRNA、lncR
Science发现RNA全新结构，可抵抗酶降解
美国科罗拉多大学医学院的研究人员在黄病毒(flavivirus)中发现了一种全新的RNA结构，该结构允许RNA抵抗宿主核酸外切酶的降解。这一发现可以帮助人们开发治疗药物或疫苗，对抗那些致病性的黄病毒，例如登革热病毒、西尼罗病毒、黄热病病毒和乙型脑炎病毒等等。 据介绍，世界上约有40%的人面
科学家发现新的RNA降解机制
在任何时候，一个生物体中的全部RNA分子，都是一段微妙的舞蹈所产生的产物。基因必须是“打开”或表达的，以便于把DNA转化为RNA，然后RNA被转化成蛋白质，才能完成一个生物体的生理需求。但是，同样重要的是，那些RNA转录本一旦不再需要就必须被清除。 最近，宾夕法尼亚大学的研究人员对于后面这个过
m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所韩大力和同济
RNA－m6A甲基化修饰研究相关研究的应用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话，那么要数对RNA修饰的研究了，此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能，显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力？还是研究从细胞和组织中收集的R
广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展
9月8日，中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院
揭示：AML中相分离形成的nYACs的重要功能
RNA表观修饰是表观遗传学研究领域的前沿方向。截止目前，已经有超过100种RNA的化学修饰被鉴定出来，而作为真核生物mRNA内部丰度最高的RNA修饰，m6A的功能研究备受关注。m6A可以被甲基转移酶复合体（writer）复合体写入mRNA， 被去甲基化酶（eraser）去除，处于动态平衡当中。细
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（三）
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法，研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性，改善了体内肿 瘤生长，而ALK
样本抽提中RNA降解的解决方法
从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路，但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素，耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本，做个RNA抽提还常常…… 降解样本的RNA完整度低，长链RNA变成了短链，在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失，导致芯片结果的不
样本抽提中RNA降解的解决方法
从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路，但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素，耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本，做个RNA抽提还常常……降解样本的RNA完整度低，长链RNA变成了短链，在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失，导致芯片结果的不准确。遇到R