样本抽提中RNA降解的解决方法

从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常…… 降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不准确。 遇到RNA降解了怎么办? 有条件的话,重新收样一定是更佳选择。样本取材时注意操作迅速稳定,尽快液氮速冻。也可以选用RNAlater等RNA保存试剂,但也需要严格按照此类试剂的操作规范进行,否则也达不到对RNA的保护效果。比如浸泡RNAlater前,组织样本尽量切割成任一方向小于0.5cm的小块,以保证浸泡尽可能充分。 但是珍贵样本怎么可能轻易重新取到呢?降解的珍贵样本真的只能扔了么?No! 针对降解样本Affymetrix官方推出了一款表现优秀的降解RNA扩增标记试剂盒:SensationPlus™ F......阅读全文

样本抽提中RNA降解的解决方法

从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不准确。遇到R

样本抽提中RNA降解的解决方法

  从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……   降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不

RNA抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?   组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降

血与泪的RNA抽提抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降解和组

RNA抽提指南(TRIZOL法)

RNA抽提指南(TRIZOL法)注意事项:* 全程佩戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。* 使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。例如,使用RNA探针的实验室

WB生物样本总蛋白抽提

一、贴壁细胞蛋白提取A1..将水浴锅的温度调至100℃,等水浴锅达到100℃温度后,取出需要收样的细胞的培养皿或者孔板。2.将缓冲液(1Xloading buffer)置于100℃水浴锅中预热10min。(loding buffer: 是5Xloding buffer用纯水稀释到1Xlodingbu

罗氏FFPET组织样本抽提RNA试剂盒实验结果分析

High Pure FFPET RNA Isolation Kit基于离心柱法的抽提原理,在柱上直接进行高效DNase消化,在整合的实验流程中方便地去除残留DNA。图1:抽提获得宽泛的RNA片段范围,FFPET RNA抽提物片段长度范围在100-4000bp 使用3中不同的方法从乳腺癌组织的5um 

RNA抽提和标记实验

实验材料从组织培养收获的细胞在组织培养中的细胞冻存的整个组织试剂、试剂盒磷酸盐缓冲液(PBS)TRIzol 试剂乙醇乙酸钠EDTANaOHTris-ClTE 缓冲液固定化的 oligo-dT 引物仪器、耗材组织匀浆器热循环仪荧光扫描仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1a.

RNA抽提和标记实验

实验方法原理 实验材料 从组织培养收获的细胞在组织培养中的细胞冻存的整个组织试剂、试剂盒 磷酸盐缓冲液(PBS)TRIzol 试剂乙醇乙酸钠EDTA NaOHTris-ClTE 缓冲液固定化的 oligo-dT 引物仪器、耗材 组织匀浆器热循环仪荧光扫描仪实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材

RNA抽提-成功经验法则

本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。Lab 的经验和客户

RNA抽提和标记实验

            实验方法原理 实验材料 从组织培养收获的细胞 在组织培养中的细胞 冻存的整个组织

哺乳动物组织样品RNA的抽提

哺乳动物组织样品RNA的抽提最基本的要素是防止RNA在抽提过程中降解,以及尽可能得到最高的RNA抽提效率。以下介绍我们实验室认为最符合以上两个要素的抽提方法。一、实验材料:Trizol试剂(Invitrogen公司)研钵,匀浆器,镊子,铝箔都高温灭菌即可;二、具体过程:1、样品在离体后应迅速冷冻在液

微量RNA的抽提RNeasy-MinElute-Spin-Column

·为了更好地裂解,细胞数不能大于5×105,细胞过多会减低产率和纯度。 准备工作: 1.在 24 ml 96-100%乙醇 中加入 6 ml 去RNA酶的水。 2.在每 1 ml Buffer RLT 中加入10 ml β-ME (加入β-ME的Buffer RLT可在室温下放置1

RNA-抽提中自备有机溶液的配制及保存问题

看了离心机的配平讨论帖,才决定发起该帖的。该帖的问题也比较简单,但人人都会遇到,所以帖之。实验者,5 成用心,3+ 成用脑,2- 成用手是也。假定你抽提 RNA 时使用到的有机试剂 - 氯仿、异丙醇、无水乙醇 - 都是国产的 (这是完全可以使用的)。我的问题是:你采取了什么措施来降低或者杜绝 RNa

基本方案2-RNA-抽提和标记

试剂、试剂盒TRIzol 试剂PBS氣仿乙醇乙酸钠引物Superscript Ⅱ RNase H反转录酶10 X low-T dNTP 混合物EDTATE 缓冲液仪器、耗材RNeasy Maxi 试剂盒组织匀浆机圆底离心管圆锥底离心管水平离心机薄壁 PCR 管热循环仪荧光扫描仪实验步骤展

【锐赛小课堂】WB生物样本总蛋白抽提

  锐赛小课堂1222-158   一、贴壁细胞蛋白提取   A   1..将水浴锅的温度调至100℃,等水浴锅达到100℃温度后,取出需要收样的细胞的培养皿或者孔板。   2.将缓冲液(1Xloading buffer)置于100℃水浴锅中预热10min。   (loding buffe

RNA抽提注意事项和经验指南1

背景介绍实验前方法/试剂的选择问题解答 (外源性污染导致的问题不在本解答考虑中)RNA 抽提的“三大纪律八项注意”Rnase 污染的10大来源RNase 和 DEPC 处理RNA 抽提的10大窍门提高 RNA 得率经典抽提小技巧特殊组织的抽提样品冻融的影响RNA 质量的判断RNAguard:使降解成

RNA抽提注意事项和经验指南3

RNA 抽提的“三大纪律八项注意” 纪律一:杜绝外源酶的污染。注意一:严格戴好口罩,手套。注意二:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保 RNase-Free。纪律二:阻止内源酶的活性注意四:选择合适的匀浆方法。注意

RNA抽提-成功经验法则大公开!

  本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。   Lab 的经验和

RNA抽提注意事项和经验指南2

3:裂解液的选择 – 影响操作方便程度,内源杂质残留的因素常用的裂解液几乎都能抑制 Rnase 活性,因此,选择裂解液的重点是要结合纯化方法一起考虑。只有一个例外:高内源酶含量的样品建议使用含苯酚的裂解液,以增加灭活内源酶的能力。 4:纯化方法的选择 – 影响内源杂质残留。抽提速度的因素对于干净的样

RNA抽提注意事项和经验指南1

背景介绍实验前方法/试剂的选择问题解答 (外源性污染导致的问题不在本解答考虑中)RNA 抽提的“三大纪律八项注意”Rnase 污染的10大来源RNase 和 DEPC 处理RNA 抽提的10大窍门提高 RNA 得率经典抽提小技巧特殊组织的抽提样品冻融的影响RNA 质量的判断RNAguard:使降解成

RNA抽提注意事项和经验指南4

经典抽提小技巧 1: Phenol 纯化:将等体积的 1:1 Phenol/Chloroform 加入,剧烈混允 1-2 分钟。高速离心 2 分钟。小心取上清 (80-90%)。决不能取到中间层。可以使用等体积的反应液加入 Phenol/Chloroform 中,同样再取出上清。将两次的上清

核酸抽提

mRNA的分离 与rRNA和tRNA不同的是,哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3'端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNAdmonds等,1971;At Leder,1972)。在构建cDNA文库时, 必须经上述纯化步骤制

核酸抽提

最糟糕的心态 - 实验失败了,抱怨试剂不好。实验人员本来是应该拥有修正主义、机会主义、怀疑论等诸多“不完美的”意识,所以一定要用“完美的”自我批评意识来平衡。我为什么没有一双慧眼选择可靠的供应商?我为什么不做预实验检测所购试剂?最糟糕的知识 - RNase A 的作用。RNase A 是内切酶,内切

DNA抽提

DNA抽提(主要内容如下)·   Working with DNA·   DNA Extraction from Bacteria and Other Organisms·   DNA Extraction from Cell and Tissue·   Mitochondria DNA Isola

在抽提RNA时,有色素污染,怎样去除色

用Trizol法沉淀RNA容易有一些杂质的。部分色素是会和RNA一起沉下来。这种情况可以用75%冷的乙醇多洗几遍。对后续qRT-PCR多数情况下没什么影响。另外可以用硅胶柱法纯化RNA,色素残留会少一些。RNase 污染的10大来源1:手指头 – 手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换

脂肪抽提仪开展脂肪抽提的四个步骤

脂肪抽提仪是 基于索氏抽提法原理研发生产的一款脂肪测定仪器。由于索氏抽提具有方便快捷的特点,因此脂肪抽提仪采用该原理来测定食品中的脂肪含量等,会更有优势,应用 会更加广泛。脂肪抽提仪的工作过程是通过在适当的温度下试剂对样品的浸提,最终实现目标物(如脂肪)的分离。应用脂肪抽提仪开展脂肪抽提,主要可以为

抽提萃取的特点

  提取亲水性强的皂甙则多选用正丁醇、异戊醇和水作两相萃取。不过,一般有机溶剂亲水性越大,与水作两相萃取的效果就越不好,因为能使较多的亲水性杂质伴随而出,对有效成分进一步精制影响很大。

细菌的核酸抽提

DNA Extraction·         DNA Extraction from Bacteria (Julie B. Wolf,UMBC)Phenol/chloroform method·         DNA Extraction From Bacteria (Triton Method

抽提萃取的分类

  萃取的机理既有物理的溶解作用,又有化学的配合作用,是一个复杂的物理溶解过程 。一般而言,萃取那些简单的不带电荷的共价分子时为物理溶解过程。但在大多数情况下,被萃取物与有机相中一种或多种组分发生化学变化,生成新的化学物种后被萃入有机相,这便属于化学过程。按照萃取机理的不同,可分为五种类型:  (1