迄今为止规模最大的灵长类基因组调控元素研究
虽然每个生物体都有一个独特的基因组，一个单一的基因序列，但每个个体都有许多表观基因组。表观基因组由化合物和蛋白质组成，它们可以与DNA结合并调节基因活动，可以激活或失活这些化合物和蛋白质，也可以产生器官或组织特异性蛋白质。由于它是一种高度动态的材料，它可以提供大量的信息来阐明组成身体的各种组织和器官的进化。 现在，来自西班牙国家研究委员会(CSIC)和庞培法布拉大学(Pompeu Fabra University)联合中心进化生物学研究所(IBE)的一个团队，对灵长类动物基因组的调控元素进行了迄今为止规模最大的研究。详尽分析托马斯Marques-Bonet领导的研究小组进行的比较基因组学研究小组的首席研究员IBE,分析了广泛的信号调节基因在类人猿和人类,包括弱活动信号,在先前的研究被忽视。这项由IBE研究员大卫·胡安(David Juan)共同领导的研究表明，在人类中，通常不被研究的最弱的调控信号在与大脑相关的基因调控中发......阅读全文
蓖麻胚乳基因组印记的表观调控机制研究获进展
被子植物特有的双受精事件产生了三倍体的胚乳（两份母源基因组和一份父源基因组，2m:1p），为胚的发育和种子的萌发提供了营养，为被子植物在陆地植被中占据主导地位奠定了重要的物质基础。同时，由于胚乳中父母源基因组剂量的失衡，产生了一系列非孟德尔遗传现象特别是基因组印记（genomic imprint
DNA甲基化参与调控大豆等表观遗传研究新进展
大豆胞囊线虫（Soybean cyst nematode, SCN； Heteroderaglycines）病是引起大豆减产的病害之一，研究大豆-线虫互作机制对提出新的病害防控策略、培育抗胞囊线虫病的大豆新品种具有重要意义。DNA甲基化（DNA methlation）是一种表观遗传标记，在植物生
表观基因组的概念
中文名称表观基因组英文名称epigenome定 义全基因组的甲基化图谱。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
迄今为止规模最大的灵长类基因组调控元素研究
虽然每个生物体都有一个独特的基因组，一个单一的基因序列，但每个个体都有许多表观基因组。表观基因组由化合物和蛋白质组成，它们可以与DNA结合并调节基因活动，可以激活或失活这些化合物和蛋白质，也可以产生器官或组织特异性蛋白质。由于它是一种高度动态的材料，它可以提供大量的信息来阐明组成身体的各种组织和
《Cell》文章：特殊的表观遗传调控
来自中科院生物物理所，美国哥伦比亚大学的研究人员发表了题为“Multisite Substrate Recognition in Asf1-Dependent Acetylation of Histone H3 K56 by Rtt109”的文章，报道了Rtt109-Asf1-H3-H4复合物的
庄小威院士：新成像方法测量染色质的表观遗传修饰
空间组学方法的最新发展使得单细胞转录组分析和三维基因组组织具有较高的空间分辨率。空间分辨单细胞表观基因组学方法将扩展空间组学工具的知识库，加速对细胞和组织功能的空间调节的理解。 2022年10月21日，哈佛大学庄小威团队在Cell 在线发表题为“Spatially resolved epige
不容忽视的表观基因组
肥胖有可能不仅写在基因之中，也写在基因之上。迄今为止最大型的一项探讨人类表观基因组(epigenome)的研究发现，某些表观遗传标记与身体质量指数(body mass index,BMI)相关。 科学家们报告称在2500多人的血液和脂肪细胞发现与新陈代谢相关的一个基因发生了化学改变。这
首次绘制小麦表观基因组图谱
最近，英国利物浦大学的科学家们，对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化，进行了首次全基因组范围的调查，这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读：权威期刊发布首个小麦单体型图谱。 表观遗传标记是一种化学标签，将自己附着在DNA上
Nature：不容忽视的表观基因组
肥胖有可能不仅写在基因之中，也写在基因之上。迄今为止最大型的一项探讨人类表观基因组（epigenome）的研究发现，某些表观遗传标记与身体质量指数（body mass index,BMI）相关。 在上个月的《柳叶刀》（The Lancet）杂志上，科学家们报告称在2500多人的血液
Science：揭示大脑回路的表观基因组成
表观基因组学的变化，包括DNA的化学修饰，可以作为基因组的一层额外信息。表观基因组学在学习和记忆及年龄相关的认知度方面扮演着重要的角色。新的研究发现DNA甲基化，一种特殊的表观基因组学修饰的形式。从出生到成年，DNA甲基化形式在大脑细胞中是动态变化的。从而帮助理解大脑细胞中基因组学的信息是如何控
表观基因组学研究指南（一）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
表观基因组学研究指南（三）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal
Nucleic－Acids－Research：脂肪生成的表观调控机制
肥胖和2型糖尿病的全球发病率在过去的30年中显著增加，已严重危害人们的生命健康。脂肪组织被认为与该类疾病相关，因此操纵脂肪细胞的分化和成熟有望用于临床治疗。大量研究已阐明转录和表观遗传（DNA和组蛋白修饰）在脂肪发生过程中的重要作用，但是对于转录后调控如何影响脂肪生成，尚不清楚。 近日，华
Nucleic－Acids－Research：脂肪生成的表观调控机制
肥胖和2型糖尿病的全球发病率在过去的30年中显著增加，已严重危害人们的生命健康。脂肪组织被认为与该类疾病相关，因此操纵脂肪细胞的分化和成熟有望用于临床治疗。大量研究已阐明转录和表观遗传（DNA和组蛋白修饰）在脂肪发生过程中的重要作用，但是对于转录后调控如何影响脂肪生成，尚不清楚。 近日，华中农业大
Nucleic－Acids－Research：脂肪生成的表观调控机制
肥胖和2型糖尿病的全球发病率在过去的30年中显著增加，已严重危害人们的生命健康。脂肪组织被认为与该类疾病相关，因此操纵脂肪细胞的分化和成熟有望用于临床治疗。大量研究已阐明转录和表观遗传（DNA和组蛋白修饰）在脂肪发生过程中的重要作用，但是对于转录后调控如何影响脂肪生成，尚不清楚。近日，华中农业大学的
Nature发布迄今为止表观遗传最全面图谱
30,000个人类疾病为什么出现的原因 二十年前的这个月，第一张人类基因组草图公布。这一项目带来的主要惊喜是，人们发现只有1.5％的人类基因组由蛋白质编码基因组成。 在过去的二十年间，那些最初被认为是“垃圾DNA”的非编码DNA片段被证明在发育和基因调控中起着至关重要的作用。而在一项最新研究
基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果
近日，国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据，并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基
新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控（一）
几十年来，DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质，但是近些年不断的研究表明，生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的，比如科学家们发现，可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰，这种改变不仅影响个体的发育，而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起，且与DNA和组蛋白修饰
表观遗传之DNA甲基化（一）
俗话说，龙生龙，凤生凤，老鼠的儿子会打洞。 这句话什么意思呢？想必很多人有不同的看法~~ 从传统的社会认知角度看，就是“出生决定论”，一个人的出生是什么样的，以后就会有什么样的作为和成就，家庭决定着个人的前途和发展方向。龙凤阶层的人自出生以来便是龙凤，若是草根阶层，也很难上升到龙凤圈层，即使有这样的
表观遗传之DNA甲基化（二）
二 DNA甲基化 DNA甲基化：DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的，从而产生5-甲基胞嘧啶（5-mC），在体细胞中，几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC，而在胚胎干（ES）细胞中，在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC作为表型和
两篇Cell文章发现精子的作用远不止DNA遗传
一般认为胚胎早期发育过程中，精子仅仅提供DNA遗传信息，其它方面主要由卵细胞决定，然而最新一期(5月10日)Cell杂志上接连公布了两项研究成果，指出精子的表观遗传学信息也会影响子代胚胎发育，这颠覆了传统上认为早期胚胎发育主要是由卵子决定的观念，也对于发育生物学和癌症生物学具有重要的意义。
Cell子刊颠覆经典教条，癌症表观遗传有新说
由澳大利亚Garvan医学研究所Susan Clark教授领导的一个研究小组在新研究中揭示：前列腺癌中基因组的大片区域(约达到2%)受到了表观遗传调控激活。这一成果发表在12月13日的《癌细胞》(Cancer cell)杂志上。 激活区域包含许多前列腺癌特异基因，例如前列腺癌最常见
中国学者连发Science，GenomeRes参与国际基因组项目
生物通报道：在2001年，人类基因组计划产生了近乎完整的人类DNA。但是研究人员还希望了解这些GS，CS，和TS是如何利用，控制或组织，比它们少得多的编码区域，造就活生生的人。9月，一个聚集了422位科学家的国际团队，在经过十年的努力后，完成了解析基因组剩余部分(非编码区域)的工作，宣布了
只需100个细胞的表观基因组分析
近年来，表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点，但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案，最终实现个性化医疗。问题在于，表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说，检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细
Nature子刊：用CRISPR操控表观基因组
杜克大学的研究人员开发出了一种新方法，可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白，来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。 研究人员说，拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用
GenomeResearch：双生子表观基因组研究
基因决定了人生命中的方方面面，不过环境也能对基因产生强烈的影响，这种影响在人出生前就已产生，而且其造成的影响将会伴随人的一生。日前，研究人员首次展示了子宫内环境对新生儿表观遗传学图谱的影响，即我们出生时就带有的DNA化学修饰，这项研究将为人们提供宝贵的疾病风险信息。文章发表在7月16日的Geno
解析小麦多倍化的表观遗传调控分子机制
近日，南京农业大学农学院教授宋庆鑫课题组在《基因组生物学》（Genome Biology）上发表了研究论文。该研究利用OCEAN-C技术绘制了不同倍性小麦的开放染色质互作图谱，并整合了染色质可及性、组蛋白修饰和转录组，深入解析了六倍体小麦多倍化过程中开放元件远距离互作调控基因表达的分子机制。
表观遗传调控水稻重要农艺性状研究获进展
转座子(transposon)是一段自身能够插入到基因组上的DNA片段，上世纪40年代，芭芭拉·麦克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中发现了转座子。从简单的细菌到复杂的人类，转座子广泛存在。转座子随机插入到重要基因中，会引发疾病、癌症和其他生理缺陷。DNA甲基化、组蛋
大豆进化与驯化表观遗传调控规律获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454973.shtm 近日，南京农业大学多倍体团队在《植物细胞》上发表研究论文。该研究整合三维基因组、染色质可及性、组蛋白修饰、DNA甲基化和转录组，深入解析了在大豆多倍化、二倍化与人工驯化过程中，三
干细胞多能性与表观遗传调控的综述
7月23日，Nature Review Molecular Cell Biology杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所刘光慧研究员同美国索尔科生物学研究所(The Salk institute for Biological Studies)研究人员合作的关于干细胞多能性与表观遗传调控