单细胞技术画像一览

一、单细胞的应用根据单细胞的应用方向主要可以分为三大类:生长发育方向:胚胎、组织器官发育、细胞分化等肿瘤方向:肿瘤分子标志物,肿瘤异质性和微环境特征。免疫细胞方向:自身免疫疾病、血液系统病等免疫相关的疾病(重点关注T细胞和B细胞)具体可以分为8个方向:摘自单细胞scRNA-seq学习笔记1-单细胞测序基础知识(https://www.jianshu.com/p/12ee857dfeda) 二、单细胞发文现状分别以“single cell,single cell RNA,single cell RNA seq, scRNA-seq”为关键词在PubMed上搜索,均可以看到近10年来,近5年来单细胞相关的文章数量增长迅速,web of science 检索的结果也是同样的趋势。说明随着技术的进步,单细胞测序成本的进一步降低,单细胞的门槛更加降低。再加上各个公司和新媒体的作用,单细胞的热度一直在增加。未来会有更多的新......阅读全文

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

质谱流式技术——蛋白水平的单细胞技术

摘要:在蛋白质水平,流式一直是最为常用的单细胞分析手段。但是由于串色等问题的困扰,流式通常只能进行6~10种蛋白的同时检测。质谱流式技术的出现给研究者带来了惊喜。利用分辨力超强的质谱技术以及独特的金属标记抗体,CyTOF2质谱流式细胞仪在检测通道数量和信号质量两方面都有了质的提升。单细胞技术在近年来

化学发光免疫分析技术可检测项目一览

化学发光免疫分析技术 (chemiluminescence immunoassay, CLIA) 起步于20世纪80年代初,快速发展于20世纪90年代,成为继荧光免疫技术、放射免疫技术及酶联免疫技术后发展的一项新兴免疫检测技术。化学发光免疫分析技术是利用化学反应释放的自由能激发中间体,使其从

生物工程技术促进人类健康进展一览

  1. NEJM:工程胰岛细胞移植让一名糖尿病患者恢复胰岛素产生能力  1型糖尿病让一名43岁的女性依赖于胰岛素。如今,在一项新的研究中,医生们通过将工程胰岛细胞移植到她的腹部恢复了她的身体产生这种激素的能力。这名病人在接受移植一年后仍然保持胰岛素不依赖性,而且根据一篇新闻稿的报道,她是测试这种糖

北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术

  来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法,这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,提高单细胞全转录组分析的准

Nature子刊:癌症单细胞测序新技术

  只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画,你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点,从远处看就形成了一幅图像。与之相似,生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱,然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。   发布在7月22日《自然生物技术》(

北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术

  来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法,这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,提高单细胞全转录组分析的准

幽门螺杆菌单细胞精准诊疗技术来了

  幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)是人类最常见的慢性感染细菌,它生长缓慢且培养条件苛刻,因此临床合理用药和精准溯源均面临挑战。中国科学院青岛生物能源与过程研究所与中国疾病预防控制中心传染病预防控制所(中国疾控中心传染病所)、青岛市立医院、青岛星赛生物等医产学研联合团队,依托原创

2016值得关注的技术:综合单细胞图谱

  《Nature Methods》盘点2015年度技术,选出了最受关注的技术成果:单粒子低温电子显微镜(cryo-EM)技术。 除此之外,也整理出了2016年最值得关注的几项技术,分别为:细胞内蛋白标记(Protein labeling in cells)、细胞核结构(Unraveling nuc

同济大学发布单细胞测序新技术

  单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而,在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异,又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。  加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在五月五日的Geno

单细胞培养技术的定义及介绍

单细胞培养(single cell culture)是指从植物器官、愈伤组织或悬浮培养物中游离出单个细胞,在无菌条件下,进行体外生长、发育的技术。人们分离和培养植物单细胞的设想和实践都比较早,但成功地进行单细胞培养是随着更有效的培养基的发展以及从愈伤组织悬浮培养物分离单细胞的专门技术的建立才实现的。

单细胞测序技术(single-cell-sequencing)-综述(二)

DroNC-seq10月,Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章,提出了一个新的测

单细胞测序技术(single-cell-sequencing)-综述(一)

单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞,得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是,就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样,没有两个细胞是完全相同的。所以,单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以

新型单细胞扩增技术有助避免遗传病

  中美研究人员在新一期美国《科学》杂志上报告说,他们研制出一种新型单细胞全基因组扩增技术,在此基础上不仅有望避免许多遗传性疾病遗传给后代,从基因组角度更深入地认识癌症也将成为可能。  单细胞研究是当前生命科学研究的重要方向之一。许多关键的生命活动都和细胞间个体差异密切相关;许多重要的生命科学和医学

-Nat-Met:新型单细胞技术助力表观遗传研究

  跨学科组织的专家们首次为临床医生实现“无艾滋病时代”的目标设计了最新的改进方案,方案融合了尖端的生物医学技术以及基础的行为干预方法。该研究发表在《美国医学协会杂志》上。  这项方案是由国际抗病毒组织IAS-USA召集的专家志愿者小组提出的,为临床医生实施新型HIV预防方法提供了指导方针。专家们对

单细胞转录组制备仪的技术指标

  将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序,可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库,在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括: 高通量  -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备, 引入条形码序列标记(Barcode),可将测序

用ICPMS分析单细胞的新技术

  【摘要】当DVS Sciences公司的技术总监Scott Tanner第一次与斯坦福大学遗传学家Garry Nolan探讨一种新型的质谱分析仪器的时候,Nolan就认为这一想法也许会成为一种热卖的产品,在这之后DVS Sciences公司推出了一个新型细胞分析方法平台:CyTOF Mass C

谢晓亮院士Science单细胞测序新技术

  人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性,那么测序单个细胞的DNA无疑更难。   为了获得足够的DNA进行测序,通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的,只存在于少数细胞(如早期癌细胞)中的突变也基本

单细胞分析技术研究呈“井喷”式增长

近年来,单细胞测序逐渐大众化,相关的论文发表数量在2010年后呈指数增长之势,在高品质期刊上发表的单细胞研究成果屡见不鲜。其产生的影响深远,以致Nature Methods将单细胞测序选为2013年度重大技术,并在2014年首刊专述。  学理工的人大概都有这样的感觉,很多规律和现象都可以用理论、公式

更便宜、更全面的单细胞RNA测序技术

康奈尔大学生物医学工程学院助理教授Iwijn De Vlaminck课题组开发了一款更健全的、低成本的方法解决了这个问题,不仅推动了单细胞基因组学发展,而且为感染和免疫生物学研究提供了一条新途径。这篇题为“Simultaneous Multiplexed Amplicon Sequencing

科学家为研究单细胞代谢夯实技术

  Renato Zenobi坐在一楼的办公室里,这是一间通往牧场的工业实验室。这位分析化学家解释了细胞生物学家正面临的一个基本问题。他在跟踪代表理论细胞群中分子平均集中度的一条曲线—— 一条简单的钟形分布曲线。他解释说,这样的分布会隐藏复杂性。为了证明这一点,他画了两条与单峰的每一边相重合的曲线,

单细胞测序技术“遍地开花”,精准医疗“如虎添翼”!

作者:Carrie  单细胞测序技术  基因测序在体外诊断市场中的重要性日益突出。其中,单细胞测序技术自2009年问世,2013年被Nature Methods评为年度技术以来,越来越多地被应用在科研领域。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-

新技术分析单细胞的染色质构象

  分析染色质构象的技术不少,但有的需要大量细胞,有的则分辨率太低。这阻碍了我们对于单细胞中染色质构象的了解。近日,瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员在《Biotechniques》上介绍了一种新方法,能够高分辨率地分析单细胞中染色质的接近程度。   对于理解基因调控、DNA复制和修复来说,研究染色体的

2015重大技术进展:单细胞分析、成像

  每到年终,The scientist会对本年度的创新产品、年度科学人物和学术界丑闻等进行一系列的盘点。在发表于12月24日的“Top Technical Advances 2015”文章中,该期刊总结了今年CRISPR、光遗传学、单细胞分析和成像技术领域取得的一些重大进展。  上接:2015重大

益生菌单细胞质检新技术助力产业发展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502913.shtm近日,记者从中国科学院青岛生物能源与过程研究所获悉,该所单细胞中心联合中国食品发酵工业研究院等单位,开发出了基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术SCIVVS,为益生菌质检提供了全新的解

华人先锋Nature发布CRISPR与单细胞技术突破

  加州理工学院的研究人员研发出了一种新技术: MEMOIR ,这种技术能读取单个细胞的历史与“家族进化树”,也就是说,能记录下来动物细胞的生活历史,比如它们与其它细胞的关系,与其它细胞的交流,还有在它身上发生的影响力事件。  这一研究成果公布在11月21日的Nature杂志上,文章的通讯作者是加州

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞凝胶电泳技术的试验步骤

试剂及材料:1)PBS2)0.8%正常熔点凝胶(PBS配制)3)0.6%低熔点凝胶(PBS配制)4)毛玻璃片5)盖玻片6)碱性裂解液(2.5mol/L NaCl;100mmol/L Na2EDTA;10mmol/L Tris;1%肌氨酸钠),临用前加10%DNMSO,1%Triton X-1007)

深圳先进院等建立单细胞轨迹推断技术

  7月31日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所胡政课题组与厦门大学数学科学学院周达课题组合作,在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上,发表了题为PhyloVelo enhances transcriptomic velocity field mapping

百花齐放的单细胞分析技术

世界上没有完全相同的两片树叶,世界上也没有两个相同的细胞,单个细胞都是dute的,它们在大小、蛋白质水平和所表达的RNA转录子方面都可能相差甚远。单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)即是对单个细胞进行研究,研究单个细胞不仅可以很好的认识到细胞异质性,而且可以更好的对疾病进