搞定恒温扩增分子诊断(RPA/RAA)

分子诊断技术今日不同以往,着实借力突飞猛进,恒温扩增技术由于其扩增期间不需要特殊的仪器设备而更受瞩目。恒温扩增方法有多种,今天就回顾RPA/RAA,让大家一文通俗搞定!为了确保大家所认知的基本概念是一致的,请先了解以下名词解释重组酶聚合酶扩增技术,RPA, recombinase polymerase amplification重组酶介导的扩增技术,RAA, recombinase-aidamplification重组酶,recombinase,同引物形成蛋白-核酸复合物,指导引物与模板结合,起到定位作用;帮助DNA 模板的解链和促使模板与引物之间发生链替换。单链DNA结合蛋白,SSB, single stranded DNA binding。同置换出来的单链DNA结合,防止DAN配对两条链再次结合。DNA聚合酶,DNA polymerase,以DNA为模板,利用dNTP合成子代DNA。核酸内切酶,endonuclease,可水......阅读全文

CRISPR分子诊断技术(二)

6    Sherlock和Mammoth两家公司的技术并非横空出世,而是源于张锋和Doudna两家实验室于2015-2018年期间在知名期刊上发表的一系列科研成果。这场学术上的比拼犹如两个武林高手过招,精彩纷呈,让人目不暇接。两个团队互相竞争,也互相学习,开拓了CRISPR分子诊断这一全新

分子诊断之即时检验

    分子诊断越来越受关注,从诊断技术领域细分市场,生化,免疫,微生物,血液和临检等来分析,分子诊断的占比约18%,从多渠道的行业报告看趋势,预计未来5年后将达到30%。当然这部分还不包含POCT的分子诊断。    2020年初的新冠疫情以来,为了满足检测市场的需要,FDA首次开展EUA紧急情况下

分子诊断常用技术(三)

二、核酸序列测定测序反应是直接获得核酸序列信息的唯一技术手段,是分子诊断技术的一项重要分支。虽然分子杂交、分子构象变异或定量PCR 技术在近几年已得到了长足的发展,但其对于核酸的鉴定都仅仅停留在间接推断的假设上,因此对基于特定基因序列检测的分子诊断,核酸测序仍是技术上的金标准。( 一) 第1 代测序

CRISPR分子诊断技术(三)

13    或许是因为LbuC2c2的特异性和非特异性剪切活性远远高于LshC2c2的相应活性, Doudna团队意识到LbuC2c2可以被用来构建高特异性、高灵敏度的RNA检测方法。若想检测出某一特定序列的RNA分子,先将与其互补的crRNA和LbuC2c2蛋白组装,再加上一些报告RNA分

分子诊断技术大盘点

分子诊断技术盘点分子诊断技术是指以DNA和RNA为诊断材料,用分子生物学技术通过检测基因的存在、缺陷或表达异常,从而对人体状态和疾病作出诊断的技术。分子诊断技术为疾病的预测、诊断、预防、治疗和转归提供了信息和决策依据,已广泛应用于传染病的诊断、流行病的调查、食品卫生检查、肿瘤和遗传病的早期诊断及法医

CRISPR分子诊断技术(六)

34    不是所有的塞卡病毒都一样。2017年9月, 中科院遗传所的许执恒团队和军事医学科学院的秦成峰团队在Science上报导,prM蛋白的一个突变(S139N)增加了塞卡病毒的传染性,并引起更严重的小头症和更高的致死率。在该论文发表后一周内,Sabeti团队和张锋团队就设计、开发出几个能区分出

分子诊断的前生今世

什么是分子诊断狭义上来讲是指基于核酸的诊断,即对各种DNA和/或RNA样本的病原性突变的检测以便实现对疾病的检测和诊断。在广义上包括基因治疗和生物治疗以及针对某些信号转导分子的分子靶向治疗。在过去的几十年里,在治疗包括某些遗传性免疫缺陷尤其是肿瘤性疾病方面显示了独特的效果。蛋白组学的发展,也成为分子

CRISPR分子诊断技术(四)

19    由于其高灵敏度和特异性,CRISPR诊断技术或CRISPR-Dx可以有很多用途:病毒检测和病毒亚型区分,病菌识别和耐药性基因确认,即时检测(POCT), 患者基因分型,以及癌症突变分析和液体活检。这篇论文也初步展示了CRISPR-Dx在这些方面的应用前景。图片来源:参考资料320   比

分子诊断的基本流程

多年来,大部分分子诊断实验室的核心技术都主要集中在检测特异性、相对较短的DNA或RNA片段上。该技术能诊断传染性疾病、鉴别影响药物代谢的特殊基因变异型或检测与疾病有关的基因,如与癌症有关的基因。这些检测的核心是实时定量聚合酶链反应(PCR)、转录调节扩增(TMA)、靶向扩增和信号扩增等类似技术的应用

分子诊断常用技术(一)

分子诊断技术即是利用分子生物学方法对人类及病原体的各类遗传物质进行检测,以帮助对疾病进行诊断。以技术原理出发对分子诊断技术进行归类与评价,以对目前临床常用技术的沿革进行回顾。1961 年Hall 建立的液相分子杂交法标志着人类掌握分子生物学技术对特定核酸序列进行检测,开启了对疾病分子诊断的大门。19

CRISPR分子诊断技术(一)

本篇为“连环画”系列中的第二篇。“连环画”中的每一篇都会介绍一个最新生物医药技术或趋势。以图画为主,文字为辅。虽然无法做到系统全面,但希望能给读者带来一些启发。每篇文章只代表作者个人的观点或解读,与礼来亚洲基金的投资决定无关。1    脊椎动物的免疫系统分为先天免疫(或非特异性免疫),和获得性免疫(

分子诊断前沿科技概述

按照常规分类,分子诊断技术主要分为两大类:核酸检测以及生物芯片。核酸检测技术具体包括聚合酶链式反应技术(PCR)、荧光原位杂交技术(FISH)以及基因测序技术;生物芯片主要包括基因芯片和蛋白芯片技术。同时,分子诊断设备已越来越向数字化、自动化、高通量转型,基于杂交的检测技术逐渐被数字 PCR、下一代

CRISPR分子诊断技术(五)

25   DETECTR达到了aM水平的灵敏度和≤7个碱基的特异性。例如,它能准确地检测出受试者携带的是哪种亚型的HPV。图片来源:参考资料2和1026   在同期Science论文中,张锋团队从三个方面着手完善SHERLOCK:多重化、定量化和去荧光。先说多重化:他们挑选了来自两个不同菌株的Cas

CRISPR可以做分子诊断

CRISPR-Cas系统背景回放面对噬菌体的威胁,细菌进化出了一套专门针对噬菌体或外源性遗传物质的CRISPR-Cas免疫系统。CRISPR全称为“簇状、规律间隔的、短回文重复序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repe

血液肿瘤的分子诊断

随着分子生物学及其相关技术的迅速发展,血液系统肿瘤的诊断已进入“精确诊断”时代。目前血液学实验室中主要的分子生物学平台包括聚合酶链反应(PCR)技术、测序技术和基因芯片等;这些技术具有灵敏度高、特异性强、重复性好等优点,在血液肿瘤的诊断、分型、预后判断、疗效评估、微小残留病的监测及个体化治疗等多个方

CRISPR分子诊断技术(七)

39   加上Cas9,它们为分子诊断和基因编辑提供了多样灵活的工具。图片来源:参考资料240    CRISPR分子诊断技术并不是只有Doudna和张锋两家在开发。2019年3月,在Keck Graduate Institute任职的Kiana Aran博士与合作者在Nature Biomedic

恒温扩增荧光检测仪能应用到哪些领域?

  应用领域  □ 基础科学研究  □ 病原体检测  □ 肉制品掺假  □ 转基因检测  □ 食品安全检测  □ 药物开发及合理用药  □ 基因表达  □ 水体监测

实验室基因扩增诊断的质量保证

基因扩增诊断实验室质量保证涉及整个基因扩增检测的所有阶段,即测定分析前的标本采集处理、测定中的核酸提取、扩增和产物分析以及测定后的结果报告等。1、污染(1)污染的来源  在实际工作中,常见有以下几种污染类型:PCR 片段的污染(产物污染);天然基因组 DNA 的污染;试剂污染(贮存液或工作液)以及交

基因诊断的扩增片段长度方法的介绍

  多态性小卫星DNA和微卫星DNA的长度多态性可以通过PCR扩增后电泳来检出,并用于致病基因的连锁分析,这种诊断方法称为扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,Amp-FLP)连锁分析法。PCR扩增后,产物即等位片段之间的差别有时只有几个核

分子诊断是医学诊断的发展趋势

  独立医学实验室(ICL):又称第三方检验,是独立于医疗机构之外独立提供医学检验服务的公司。其核心是规模经济,即通过规模经济降低单位成本、获取成本优势、质量优势、技术优势,从而达到多方的共赢,减少医疗费用支出。它的出现不仅解决中小型医疗机构检验外包的问题,同时也为大医院解决因社会需要而不得不开展亏

传染病新型分子现场快速检测领域取得重要进展

  近日,广东省农业科学院动物卫生研究所(以下简称动卫所)联合华南农业大学等单位在传染病新型分子现场快速检测领域取得重要进展。相关研究发表于Sensors and Actuators B: Chemical。动卫所为该论文第一署名单位,广东省农业科学院教授廖明和华南农业大学兽医学院副教授张建民为共同

分子实验方法8:聚合酶链式反应(PCR)扩增和扩增产物克隆

第八章 聚合酶链式反应(PCR)扩增和扩增产物克隆第一节 概 述  PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链反应)是一种选择性体外扩增DNA或RNA的方法.它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA片段在94℃下解链; (2) 退火(Annea

【硬菜】分子诊断工具介绍

  因分子技术具有内在准确性、敏感性、特异性和周转迅速的特点,带来了分子诊断行业的快速发展。此外,因为分子诊断技术具有准确性、敏感性和特异性,实验室人员能够从很小量的样本中就可获得有效的结果。这对法医检测领域来说是非常有用的,但同时该技术也可以检测到目标物质的极低浓度,从而使临床医生在极早期阶段就能

漫谈分子诊断常用技术沿革

一、基于分子杂交的分子诊断技术  上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年,由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增,人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现,为基于分子杂交的体外诊断方法进行了最初

IVD新星分子诊断产业解析

  分子诊断——监管与分类  监管体系  根据下游应用领域的不同,分子诊断监管分为医疗器械和药品两种。临床分子诊断产品按照第三类医疗器械(共三类,第三类是最严格的一类)监管。用于红十字血液中心血源筛查的产品按照药品监管。预计未来卫计委在应用层面逐渐推开LDT模式。  产品分类分子诊断(基因诊断)从技

分子诊断试剂的相关介绍

  分子诊断试剂主要有临床已经使用的核酸扩增技术(PCR)产品和当前国内外正在大力研究开发的基因芯片产品。PCR产品灵敏度高、特异性强、诊断窗口期短,可进行定性、定量检测,曾广泛用于肝炎、性病、肺感染性疾病、优生优育、遗传病基因、肿瘤等的检测,但由于市场混乱和交叉污染等原因,卫生部严令禁止了荧光电泳

分子诊断POCT类产品分析

自从1983年Mullis发明聚合酶链式反应(PCR)以后,PCR技术很快成为学术研究和临床诊断的热点技术。相比于其他体外诊断方法,使用PCR技术利用样本在两个或三个温区内的反复升降温过程,实现对于核酸信号的指数级成倍放大,再通过特定的检测手段读取信号进行分析判读的方法大大提高了疾病检测的灵敏度与特

分子诊断与微流控

  对于生化和免疫检测,目前的自动化程度已经很高,很多企业的重点已经转变为模块化,流水线。传统PCR检测具有免疫检测所无法比拟的优越性和应用潜力,但它超高的灵敏度使得它对实验环境有苛刻的要求。即便在已经建立的PCR实验室内,检测操作也只能由经过严格训练的实验人员来进行。因此,我认为未来分子诊断一定会

现有分子诊断技术大盘点

感染性疾病如今出现了很多新的变化,旧的疾病有了新的特点,也出现了诸如埃博拉病毒之类新的疾病。传统的病原学检测以分离、培养、染色、生物化学鉴定为主,但是有操作复杂、检测周期长、干扰因素多、敏感性与特异性有限等缺点。虽然自动化技术缩短了检测时间,但并没有解决根本性问题,临床应用中急需一种新的,更有效的诊

盘点:分子诊断常用技术(二)

( 五 ) 生物芯片1991年Affymetrix公司的Fordor利用其所研发的光蚀刻技术制备了首个以玻片为载体的微阵列,标志着生物芯片正式成为可实际应用的分子生物学技术。时至今日,芯片技术已经得到了长足的发展,如果按结构对其进行分类,基本可分为基于微阵列( microarray) 的杂交芯片