揭秘NGS全自动文库制备系统MagnisBR

近年来,NGS技术的进步加速了基因组学研究的脚步,也为肿瘤等疾病的精准诊断提供极大助力。NGS检测的推广既是客观需要,也是大势所趋。作为NGS的前期关键步骤,文库制备的质量对测序结果可产生决定性的影响。近日,第九届中国病理年会上,广州燃石医学检验所有限公司(以下简称“燃石医学”)与安捷伦科技有限公司(以下简称“安捷伦”)合作研发的NGS全自动文库制备系统“Magnis BR”正式发布。据悉,Magnis BR是中国首款可支持探针捕获法的NGS全自动文库制备系统,在检测通量上的灵活性以及检测流程的自动化程度上均超越了既有的NGS自动化解决方案,有望将高质量的NGS检测平台带入更多医院的检测实验室。Magnis BR由燃石医学和安捷伦历时两年共同研发,这背后有怎样的研发故事?燃石医学和安捷伦分别承担了哪些工作?未来该产品在中国将有怎样的应用场景和市场规划?带着这些疑问,测序中国近日采访了燃石医学首席技术官张之宏博士和安捷伦诊断与基因......阅读全文

cDNA文库组标准流程四:载体制备

1.pBlueScriptII的提取1.取1ul商品的pBlueScriptII,转化入大肠杆菌宿主菌中,取5ul转化产物均匀涂布在含AMP的LB平板上,37℃培养过夜。2.第二天取一只无菌的50ml离心管,加入10ml AMP抗性的LB液体培养基,挑单克隆于离心管中,37℃,250rpm,培养过夜

文库甘油储存料中噬菌体抗体的制备

实验概要本实验从文库甘油储存料中制备了噬菌体抗体。主要试剂1. 2×TY/amp/glu培养基2. TYE/amp/glu平板3. 含有25ug/ml卡那霉素和2%葡萄糖的TYE平板(TYE/kan/glu)4. 含100ug/ml氨苄青霉素和25ug/ml卡那霉素的2×TY培养基(2×TY/amp

珀金埃尔默新品-EnVison-Nexus多功能酶标仪-专为高通量设计

  美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市2023年3月3日  --作为致力于创造更健康世界的全球领导者,珀金埃尔默公司(NYSE:PKI)于2月24日在美国推出EnVision® Nexus™系统。此系统是珀金埃尔默迄今为止速度最快、灵敏度最高的多功能酶标仪,专为要求苛刻的高通量筛选(HTS)应用而设计,可加速

从ccfDNA中挖掘深度信息,你需要这个一体化方案

  如今,癌症研究人员的手头又有了一件让人激动不已的新工具:循环游离DNA(ccfDNA)——只需通过侵入性极小的液体活检即可采集得到。与从存档的FFPE肿瘤标本中采集的静态DNA相比,ccfDNA可提供原发和转移性肿瘤的实时突变信息。这将大大改善治疗决策和监控,对癌症及其他疾病的生物标志物的检测和

政府贴息帝肯临床自动化解决方案助力医疗设备升级

  近日,国家卫健委发布《国家卫建委开展财政贴息贷款更新改造医疗设备的通知》,对医疗机构设备购置和更新改造新增贷款实施阶段性鼓励政策,主要用于开展诊疗、临床检验、重症、康复、科研转化等医疗设备购置。  帝肯是在全球范围提供自动化决解方案的供应商,在40多年间我们的发开、生产、销售和支持自动化解决方案

Fluidigm推出自动化文库制备体系-可同时检测53个基因突变

  首个商业化的靶向NGS文库制备方法上市啦。利用微流控技术,通过高效的NGS文库制备工作流程,可同时检测体细胞中53个实体瘤相关基因的突变。  Fluidigm公司近日推出了AdvantaTM Solid Tumor NGS Library Prep Assay,该方法根据目前肿瘤治疗方法和已发表

Illumina推出Nextera-DNA-Flex全基因组测序制备产品

  近日,Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex,它让全血和唾液样本省去了样本制备,也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤,比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程,适合广泛的应用,

下一代测序干货:如何选择NGS自动化系统?

  大规模NGS应用带来不仅仅是技术上的革新,相对传统更加复杂和精细操作,注定了这一技术将会更多地依赖自动化设备来完成。作为临检机构和近期崛起的众多第三方检测公司,在将NGS设备收入囊中之后,必然要考虑开始自动化样品制备系统的投入。只有将整个样品准备流程通过可靠的系统来完成,才能真正配得上是高质量的

Verogen基于NGS新一代测序技术的法医基因组学解决方案...

Verogen基于NGS新一代测序技术的法医基因组学解决方案的应用NGS新一代测序技术VS传统CE测序技术在过去的30年中,法医DNA检测一直依赖于CE毛细管电泳测序技术进行片段长度多态性的检测。然而CE测序技术具有检测位点少、样品消耗量大、不能检测线粒体DNA等缺点,当DNA样本量有限时,法医分析

Agilent-SureSelectQXT-WGS-文库制备的质量控制(一)

摘要本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完整性

Agilent-SureSelectQXT-WGS-文库制备的质量控制(二)

gDNA 的数量和完整性SureSelectQXT WGS 方案需要高质量的 DNA 样品,以获得最佳性能和 gDNA 起始材料的精确定量结果。按照该方案使用配有 dsDNA BR 分析试剂盒的 Qubit 仪器进行系列定量分析。将相同的样品在 4200 TapeStation 系统和 Nano

Agilent-SureSelectQXT-WGS-文库制备的质量控制(三)

不同 gDNA 起始量的电泳叠加图显示,使用 2100 生物分析仪 (A) 和 4200 TapeStation (B) 系统,文库片段分子量分布(图 5)呈现出不同的弥散条带曲线。50 ng 的最佳 gDNA 起始量可得到平均分子量在 600–1000 bp 之间的文库曲线。最小的 gDN

QIAGEN透露测序仪的更多细节

  AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。QIAGEN公司在这次会议上向客户介绍了其新一代测序(NGS)的流程,旨在将这一突破性的技术常规应用在生命科学研究之外的领域,如临床研究和诊断。   QIAGEN的CEO Peer M

揭秘纯水系统漏电现象

不久前,上海乐枫收到一位用户的投诉,用户发现刚购买的Direct-Pure adept超纯水机漏电!这是乐枫头一次收到这种投诉。乐枫的纯水设备已通过CE认证,出厂前还有严格检测;追溯生产记录,也未发现这台设备在生产中有任何异常之处!虽然觉得有点离谱,但为不耽误用户使用,乐枫马上给用户更换了一套全

应新于变·创未来-珀金埃尔默3款亚洲首发新品亮相进博会

  2022年11月5-10日,第五届中国国际进口博览会(以下简称“进博会”)在上海国家会展中心隆重举行。经过五年发展,进博会已经成为全球新品的首发地、前沿技术的首选地、创新服务的首推地,进博会持续展现出“不一般”的魅力,六大展区精品荟萃、亮点纷呈。  珀金埃尔默以 “应新于变·创未来” 为主题,携

燃石医学发布2022年Q4及全年业绩:全年实现营收5.632亿元

  2023年3月28日,燃石医学(纳斯达克代码/伦敦交易所代码:BNR)发布2022年四季报及2022年全年业绩。2022年全年总营收达5.632亿元,同比增长10.9%,创年度营收新高,其中第四季度营收为1.422亿元,同比保持稳定。  从全年维度来看,公司三大业务板块稳步发展,均有亮眼表现。癌

全基因组测序溯源在三文鱼水产病毒防控的应用

坚守50多天的北京零本地报告新增被打破。人们还来不及享受太多复工复产、神兽回笼、生活的常态化,防疫形式骤然严峻。拎着菜篮子一头雾水,三文鱼、水产会传播冠状病毒吗?病毒究竟从哪里来? 流行病学调查和病毒毒株溯源尤为重要。新冠病毒在传播过程中会发生突变。基因测序能够找出这些突变差异。将病例与已知毒株比对

美国BR公司

1988年MJ Research发布了第一款半导体帕尔贴效应PCR仪PTC-100,这种简洁可靠的仪器可提供高精度温控并易于使用, 新型帕尔帖加热和冷却技术因创新性和多功能性而赢得广泛的声誉。直到2004年因为ZL纠纷被美国BR公司收购,2011年BR公司发布了第三代PCR技术-ddPCR,并且在这

胚胎植入前染色体筛查的新技术

 如今,一系列分子遗传学技术被开发出,能够对单个或少量细胞中的24条染色体进行分析,如比较基因组杂交芯片(aCGH)、单核苷酸多态性芯片(SNP)和定量PCR反应(qPCR)。新一代测序(NGS)技术则有望带来更多的突变数据。    安捷伦的SurePrint G3 human CGH 8 × 

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚仪器、耗材 热循环仪水浴箱琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备实验步骤 第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

            试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 仪器、耗材

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

一次双向消减,需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试

ngs是什么意思

ngs是高通量测序技术。高通量测序技术(High-throughputsequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation”,sequencingtechnology),简称“Ngs”,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序技

Agilent针对新一代测序技术推出高灵敏度DNA试剂盒

安捷伦科技公司推出针对新一代测序技术流程中DNA文库检测的高灵敏度DNA试剂盒       2009年4月30日,北京 ——安捷伦科技公司(NYSE:A)正式推出了一种新型的高灵敏度DNA试剂盒,可以用于新一代测序(NGS)技术流程中的DNA剪切和文库构建等关键步骤的质量控制、DNA片段

揭秘食草动物如何“驯化”植被系统

近日,华东师范大学教授刘权兴团队在《生态学快报》上发表了最新研究成果,提出了食草动物-植被系统的新型理论模型,并发现该模型所具备的动力学过程受控于一个令人意想不到的原理——物理与化学中的“相分离”机制。大型食草动物喜食高适口植物的选择摄食行为,一直是科学家理解放牧生态系统的“钥匙”,然而这一选择摄食

胚胎植入前染色体筛查的新技术

  尽管体外受精(IVF)已经彻底改变了不孕不育的治疗,但这个过程本身不够高效,成功率很低。染色体非整倍体,是造成体外受精失败的主要原因,因为大多数非整倍体胚胎无法植入,或在孕早期流产。因此,提高成功率的关键,是选择染色体数目正常的胚胎。为此,人们开始采用胚胎植入前染色体筛查(PGS)。  他们最早

康宁推出一系列产品,简化NGS样品制备

  康宁公司近日宣布,它近日推出了新的Axygen® 品牌的IMAG™手持式磁珠分离设备,用于新一代测序。   这种新型的磁珠分离设备彻底改变了生物学研究所用的手动磁珠分离过程。其应用包括核酸纯化、细胞分析、抗体纯化和蛋白纯化。IMAG磁珠分离设备可将整个分离过程的时间和劳动减少50%以上。  

高通量测序技术核酸片段分选

近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量

DNA和RNA定量利器:Qubit-4

新一代测序(NGS)实验中,我们需要将精确量的DNA文库分子上样到测序仪中。如果测序运行时的文库分子过多或过少,都会使数据质量受损。这不仅浪费宝贵的样本和试剂,也浪费我们和仪器的时间。对于芯片分析(Microarray)和实时定量PCR(qPCR)而言,精确测定样本中的DNA或RNA也是必需的。以往